MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01 plasmid pAPA01-020

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013211	CATCCA	2	12	67	78	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	258513089
2	NC_013211	AGATCA	2	12	4106	4117	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	258513097
3	NC_013211	GCCTTG	2	12	6177	6188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258513099
4	NC_013211	GATGCC	2	12	8361	8372	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258513101
5	NC_013211	CATCCA	2	12	11568	11579	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	258513103
6	NC_013211	TCACCA	2	12	27401	27412	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	258513117
7	NC_013211	CATCTG	2	12	31441	31452	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	258513121
8	NC_013211	CAATGC	2	12	33604	33615	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	258513122
9	NC_013211	AGATGA	2	12	37376	37387	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	258513126
10	NC_013211	TGCCAC	2	12	38748	38759	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	258513127
11	NC_013211	CTGCGG	2	12	43815	43826	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	258513130
12	NC_013211	GAAGAT	2	12	44917	44928	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	258513131
13	NC_013211	TGTACG	2	12	46395	46406	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	258513133
14	NC_013211	GGCATC	2	12	47605	47616	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258513134
15	NC_013211	AGCATG	2	12	48675	48686	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_013211	CCATGA	2	12	50738	50749	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	258513137
17	NC_013211	TATCGC	2	12	52583	52594	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	258513139
18	NC_013211	TGCCCG	2	12	61100	61111	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	258513148
19	NC_013211	GTCGCC	2	12	67116	67127	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_013211	GCGATG	2	12	74903	74914	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258513163
21	NC_013211	GCTGAT	2	12	80495	80506	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	258513170
22	NC_013211	AGTTCC	2	12	82425	82436	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	258513171
23	NC_013211	GGATGG	2	12	84327	84338	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	258513174
24	NC_013211	TGGATG	2	12	86497	86508	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	258513177
25	NC_013211	CATCCA	2	12	89849	89860	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	258513180
26	NC_013211	TCAAGG	2	12	93859	93870	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	258513183
27	NC_013211	TGCAGG	2	12	94063	94074	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258513183
28	NC_013211	AGCCTG	2	12	103742	103753	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258513194
29	NC_013211	CATCCA	2	12	106355	106366	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	258513197
30	NC_013211	CATCCA	2	12	113515	113526	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	258513204
31	NC_013211	TGCGCC	2	12	116503	116514	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	258513207
32	NC_013211	GCAAAG	2	12	116546	116557	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	258513207
33	NC_013211	AGTTCC	2	12	117289	117300	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	258513208
34	NC_013211	GTGATT	2	12	120140	120151	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	258513213
35	NC_013211	CGTCAG	2	12	128127	128138	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258513219
36	NC_013211	TTCGGC	2	12	128679	128690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013211	GGACAT	2	12	137954	137965	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	258513226
38	NC_013211	ATTATC	2	12	139560	139571	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_013211	TTCCAG	2	12	140624	140635	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	258513228
40	NC_013211	TCTCGG	2	12	141094	141105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258513228
41	NC_013211	CCTTTG	2	12	141243	141254	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	258513228
42	NC_013211	CGCCGT	2	12	147423	147434	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	258513232
43	NC_013211	TCTTCA	2	12	147517	147528	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	258513232
44	NC_013211	TGGATG	2	12	156164	156175	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	258513243
45	NC_013211	GGCATC	2	12	158012	158023	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258513244
46	NC_013211	GGATGG	2	12	160850	160861	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	258513247
47	NC_013211	TTCGCC	2	12	161895	161906	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	258513249
48	NC_013211	GACATG	2	12	168506	168517	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	258513251
49	NC_013211	TTATTG	2	12	169221	169232	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013211	GATGCC	2	12	175245	175256	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258513256
51	NC_013211	AAACGT	2	12	176890	176901	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	258513257
52	NC_013211	GATGCC	2	12	178197	178208	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258513259
53	NC_013211	TGGATG	2	12	179937	179948	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013211	GGCATC	2	12	182514	182525	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.