MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01 plasmid pAPA01-020

Total Repeats: 116

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013211	TGTCC	2	10	886	895	0 %	40 %	20 %	40 %	258513091
2	NC_013211	CCAAT	2	10	4003	4012	40 %	20 %	0 %	40 %	258513097
3	NC_013211	GCGGA	2	10	4420	4429	20 %	0 %	60 %	20 %	258513098
4	NC_013211	TGAGA	2	10	5929	5938	40 %	20 %	40 %	0 %	258513099
5	NC_013211	GGCAC	2	10	8920	8929	20 %	0 %	40 %	40 %	258513101
6	NC_013211	CACCC	2	10	9786	9795	20 %	0 %	0 %	80 %	258513102
7	NC_013211	TGATA	2	10	9944	9953	40 %	40 %	20 %	0 %	258513102
8	NC_013211	GGACA	2	10	10765	10774	40 %	0 %	40 %	20 %	258513103
9	NC_013211	AAAAG	2	10	13311	13320	80 %	0 %	20 %	0 %	258513105
10	NC_013211	TTTTA	2	10	13991	14000	20 %	80 %	0 %	0 %	258513106
11	NC_013211	GGAAA	2	10	15512	15521	60 %	0 %	40 %	0 %	258513107
12	NC_013211	CAATG	2	10	17635	17644	40 %	20 %	20 %	20 %	258513108
13	NC_013211	CCTGC	2	10	19626	19635	0 %	20 %	20 %	60 %	258513110
14	NC_013211	CAGCA	2	10	20035	20044	40 %	0 %	20 %	40 %	258513110
15	NC_013211	ATAGG	2	10	20290	20299	40 %	20 %	40 %	0 %	258513110
16	NC_013211	CATGC	2	10	21389	21398	20 %	20 %	20 %	40 %	258513111
17	NC_013211	CACAC	2	10	21974	21983	40 %	0 %	0 %	60 %	258513112
18	NC_013211	CCAGC	2	10	23410	23419	20 %	0 %	20 %	60 %	258513114
19	NC_013211	GTGGC	2	10	23919	23928	0 %	20 %	60 %	20 %	258513114
20	NC_013211	AAGGC	2	10	27123	27132	40 %	0 %	40 %	20 %	258513117
21	NC_013211	CATTC	2	10	27215	27224	20 %	40 %	0 %	40 %	258513117
22	NC_013211	GGCCC	2	10	28995	29004	0 %	0 %	40 %	60 %	258513117
23	NC_013211	AGGAT	2	10	30340	30349	40 %	20 %	40 %	0 %	258513120
24	NC_013211	TGTGG	2	10	33958	33967	0 %	40 %	60 %	0 %	258513123
25	NC_013211	GGAAA	2	10	34169	34178	60 %	0 %	40 %	0 %	258513123
26	NC_013211	GAAAA	2	10	35455	35464	80 %	0 %	20 %	0 %	258513123
27	NC_013211	CTGAT	2	10	39730	39739	20 %	40 %	20 %	20 %	258513128
28	NC_013211	AGGCA	2	10	40730	40739	40 %	0 %	40 %	20 %	258513129
29	NC_013211	GTTGG	2	10	43343	43352	0 %	40 %	60 %	0 %	258513130
30	NC_013211	GCCAT	2	10	43394	43403	20 %	20 %	20 %	40 %	258513130
31	NC_013211	ACCAT	2	10	43592	43601	40 %	20 %	0 %	40 %	258513130
32	NC_013211	CCCTG	2	10	45133	45142	0 %	20 %	20 %	60 %	258513131
33	NC_013211	AAATC	2	10	49246	49255	60 %	20 %	0 %	20 %	258513136
34	NC_013211	TGCGC	2	10	50463	50472	0 %	20 %	40 %	40 %	258513137
35	NC_013211	AGGCA	2	10	51467	51476	40 %	0 %	40 %	20 %	258513138
36	NC_013211	ACGAC	2	10	53050	53059	40 %	0 %	20 %	40 %	258513140
37	NC_013211	CGGGT	2	10	55158	55167	0 %	20 %	60 %	20 %	258513143
38	NC_013211	TGCCG	2	10	55770	55779	0 %	20 %	40 %	40 %	258513144
39	NC_013211	GGTCG	2	10	55882	55891	0 %	20 %	60 %	20 %	258513144
40	NC_013211	GCGCC	2	10	57008	57017	0 %	0 %	40 %	60 %	258513145
41	NC_013211	CCATC	2	10	58345	58354	20 %	20 %	0 %	60 %	258513147
42	NC_013211	GCGTT	2	10	58683	58692	0 %	40 %	40 %	20 %	258513147
43	NC_013211	GCAGG	2	10	60057	60066	20 %	0 %	60 %	20 %	258513148
44	NC_013211	CCGTC	2	10	60828	60837	0 %	20 %	20 %	60 %	258513148
45	NC_013211	ATTTT	2	10	63376	63385	20 %	80 %	0 %	0 %	258513149
46	NC_013211	GCTGG	2	10	65314	65323	0 %	20 %	60 %	20 %	258513151
47	NC_013211	GTCCA	2	10	65541	65550	20 %	20 %	20 %	40 %	258513151
48	NC_013211	GCCAC	2	10	66228	66237	20 %	0 %	20 %	60 %	258513152
49	NC_013211	GCTGG	2	10	66737	66746	0 %	20 %	60 %	20 %	258513152
50	NC_013211	GGCGC	2	10	68688	68697	0 %	0 %	60 %	40 %	258513156
51	NC_013211	CATGA	2	10	71467	71476	40 %	20 %	20 %	20 %	258513160
52	NC_013211	GCATT	2	10	71970	71979	20 %	40 %	20 %	20 %	258513160
53	NC_013211	GACTG	2	10	72835	72844	20 %	20 %	40 %	20 %	258513161
54	NC_013211	GTCCT	2	10	74718	74727	0 %	40 %	20 %	40 %	258513163
55	NC_013211	TGATC	2	10	75423	75432	20 %	40 %	20 %	20 %	258513164
56	NC_013211	TGCTC	2	10	76204	76213	0 %	40 %	20 %	40 %	258513165
57	NC_013211	TATTG	2	10	76431	76440	20 %	60 %	20 %	0 %	258513165
58	NC_013211	CCAGC	2	10	79259	79268	20 %	0 %	20 %	60 %	258513169
59	NC_013211	TTTCC	2	10	80722	80731	0 %	60 %	0 %	40 %	258513170
60	NC_013211	GCTGG	2	10	82687	82696	0 %	20 %	60 %	20 %	258513171
61	NC_013211	GCCCG	2	10	83988	83997	0 %	0 %	40 %	60 %	258513174
62	NC_013211	TGAGG	2	10	85064	85073	20 %	20 %	60 %	0 %	258513175
63	NC_013211	TGTCC	2	10	87302	87311	0 %	40 %	20 %	40 %	258513177
64	NC_013211	GGACA	2	10	89046	89055	40 %	0 %	40 %	20 %	258513180
65	NC_013211	AGCGG	2	10	90658	90667	20 %	0 %	60 %	20 %	258513181
66	NC_013211	TCGCC	2	10	90767	90776	0 %	20 %	20 %	60 %	258513181
67	NC_013211	GCATG	2	10	90953	90962	20 %	20 %	40 %	20 %	258513181
68	NC_013211	ATTCC	2	10	91458	91467	20 %	40 %	0 %	40 %	258513181
69	NC_013211	AGCGA	2	10	93876	93885	40 %	0 %	40 %	20 %	258513183
70	NC_013211	CAAAG	2	10	96047	96056	60 %	0 %	20 %	20 %	258513186
71	NC_013211	CAGCC	2	10	96867	96876	20 %	0 %	20 %	60 %	258513187
72	NC_013211	GTTGG	2	10	100432	100441	0 %	40 %	60 %	0 %	258513191
73	NC_013211	TTTTC	2	10	101545	101554	0 %	80 %	0 %	20 %	258513191
74	NC_013211	GTGCC	2	10	102071	102080	0 %	20 %	40 %	40 %	258513191
75	NC_013211	CCAGC	2	10	102558	102567	20 %	0 %	20 %	60 %	258513193
76	NC_013211	GTGGC	2	10	103067	103076	0 %	20 %	60 %	20 %	258513193
77	NC_013211	CACTG	2	10	103983	103992	20 %	20 %	20 %	40 %	258513195
78	NC_013211	TGGAC	2	10	104346	104355	20 %	20 %	40 %	20 %	258513195
79	NC_013211	GGACA	2	10	105552	105561	40 %	0 %	40 %	20 %	258513197
80	NC_013211	TGCGC	2	10	110147	110156	0 %	20 %	40 %	40 %	258513202
81	NC_013211	GGACA	2	10	112712	112721	40 %	0 %	40 %	20 %	258513204
82	NC_013211	CCATG	2	10	114613	114622	20 %	20 %	20 %	40 %	258513205
83	NC_013211	GATAC	2	10	116689	116698	40 %	20 %	20 %	20 %	258513207
84	NC_013211	GCTGG	2	10	117551	117560	0 %	20 %	60 %	20 %	258513208
85	NC_013211	CTGAC	2	10	118186	118195	20 %	20 %	20 %	40 %	258513211
86	NC_013211	TTTTC	2	10	118980	118989	0 %	80 %	0 %	20 %	258513212
87	NC_013211	CGTTT	2	10	119631	119640	0 %	60 %	20 %	20 %	258513213
88	NC_013211	CACTG	2	10	121386	121395	20 %	20 %	20 %	40 %	258513213
89	NC_013211	TTATT	2	10	126656	126665	20 %	80 %	0 %	0 %	258513218
90	NC_013211	CGTTC	2	10	127203	127212	0 %	40 %	20 %	40 %	258513219
91	NC_013211	CGGTC	2	10	128949	128958	0 %	20 %	40 %	40 %	258513220
92	NC_013211	GAAGC	2	10	132093	132102	40 %	0 %	40 %	20 %	258513221
93	NC_013211	TCAAG	2	10	133131	133140	40 %	20 %	20 %	20 %	258513222
94	NC_013211	CAGGA	2	10	134251	134260	40 %	0 %	40 %	20 %	258513223
95	NC_013211	CGGAC	2	10	135105	135114	20 %	0 %	40 %	40 %	258513223
96	NC_013211	GAGCA	2	10	137241	137250	40 %	0 %	40 %	20 %	258513225
97	NC_013211	GACAG	2	10	138415	138424	40 %	0 %	40 %	20 %	258513227
98	NC_013211	AGCGG	2	10	142650	142659	20 %	0 %	60 %	20 %	258513229
99	NC_013211	AGGTC	2	10	147737	147746	20 %	20 %	40 %	20 %	258513233
100	NC_013211	CATCG	2	10	149288	149297	20 %	20 %	20 %	40 %	258513234
101	NC_013211	GGCAG	2	10	149790	149799	20 %	0 %	60 %	20 %	258513235
102	NC_013211	CGGCA	2	10	150231	150240	20 %	0 %	40 %	40 %	258513235
103	NC_013211	CCTCA	2	10	152774	152783	20 %	20 %	0 %	60 %	258513238
104	NC_013211	CCGGG	2	10	153849	153858	0 %	0 %	60 %	40 %	258513239
105	NC_013211	CGTTT	2	10	154790	154799	0 %	60 %	20 %	20 %	258513241
106	NC_013211	TGTCC	2	10	156969	156978	0 %	40 %	20 %	40 %	258513243
107	NC_013211	GCCAT	2	10	159119	159128	20 %	20 %	20 %	40 %	258513245
108	NC_013211	AGCTG	2	10	160166	160175	20 %	20 %	40 %	20 %	258513246
109	NC_013211	CGTTC	2	10	162714	162723	0 %	40 %	20 %	40 %	258513250
110	NC_013211	CCCTG	2	10	166572	166581	0 %	20 %	20 %	60 %	258513251
111	NC_013211	CTGCT	2	10	168244	168253	0 %	40 %	20 %	40 %	258513251
112	NC_013211	GAGGG	2	10	168396	168405	20 %	0 %	80 %	0 %	258513251
113	NC_013211	TTGAA	2	10	172596	172605	40 %	40 %	20 %	0 %	258513254
114	NC_013211	GCGTT	2	10	172737	172746	0 %	40 %	40 %	20 %	258513254
115	NC_013211	GGGCA	2	10	174165	174174	20 %	0 %	60 %	20 %	258513255
116	NC_013211	GGCAC	2	10	175804	175813	20 %	0 %	40 %	40 %	258513256

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.