MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01 plasmid pAPA01-020

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013211	ACAG	2	8	978	985	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013211	ACAG	2	8	6590	6597	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_013211	TTCC	2	8	6742	6749	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_013211	GGAA	2	8	6753	6760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013211	CTCA	2	8	9447	9454	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013211	CTGT	2	8	10675	10682	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013211	TCTG	2	8	12061	12068	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_013211	CTTC	2	8	12940	12947	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_013211	TTCC	2	8	18167	18174	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013211	TTTA	2	8	22468	22475	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013211	TTCC	2	8	22817	22824	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_013211	GTCA	2	8	37054	37061	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_013211	GAAA	2	8	46053	46060	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013211	CATC	2	8	46129	46136	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_013211	GTGA	2	8	46522	46529	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013211	GACA	2	8	52454	52461	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_013211	TACG	2	8	54136	54143	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_013211	GGCG	2	8	54166	54173	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_013211	AAAG	2	8	54180	54187	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013211	GTCG	2	8	54287	54294	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013211	GTCC	2	8	58089	58096	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_013211	TGGA	2	8	67093	67100	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013211	CGGA	2	8	67608	67615	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_013211	GTCC	2	8	67848	67855	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_013211	GACG	2	8	70121	70128	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_013211	AATG	2	8	71054	71061	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013211	ACGG	2	8	75213	75220	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_013211	GGCA	2	8	76464	76471	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_013211	TAGT	2	8	76813	76820	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013211	AAAG	2	8	76911	76918	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013211	ACGA	2	8	77083	77090	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_013211	GCTG	2	8	77300	77307	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_013211	GAGC	2	8	77570	77577	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_013211	CCAG	2	8	83639	83646	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_013211	CGGG	2	8	83666	83673	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_013211	ACAG	2	8	87394	87401	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_013211	ACCT	2	8	87604	87611	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_013211	CTGT	2	8	88956	88963	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_013211	TTCT	2	8	98197	98204	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_013211	GCGG	2	8	98407	98414	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41	NC_013211	GTGG	2	8	98472	98479	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013211	CTGT	2	8	105462	105469	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_013211	ACGG	2	8	108597	108604	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_013211	GTGA	2	8	110842	110849	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013211	CTGT	2	8	112622	112629	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_013211	GCGG	2	8	119419	119426	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
47	NC_013211	AAAT	2	8	136703	136710	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013211	TGAG	2	8	137548	137555	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013211	AATC	2	8	137557	137564	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_013211	GTAT	2	8	139361	139368	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013211	ATAA	2	8	139544	139551	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013211	GGGC	2	8	139970	139977	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_013211	ATTC	2	8	142555	142562	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_013211	TCGC	2	8	148984	148991	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_013211	CGTC	2	8	149563	149570	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013211	AAGG	2	8	149596	149603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013211	GCGA	2	8	151137	151144	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_013211	CCGC	2	8	154171	154178	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
59	NC_013211	CTGG	2	8	154201	154208	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_013211	ACAG	2	8	157061	157068	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_013211	TAAA	2	8	159770	159777	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013211	GCCC	2	8	163350	163357	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
63	NC_013211	GTGG	2	8	168669	168676	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013211	ACCA	2	8	168746	168753	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_013211	AATG	2	8	169447	169454	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013211	ATCA	2	8	170151	170158	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_013211	TCAT	2	8	170307	170314	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_013211	ATGC	2	8	171578	171585	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_013211	AATG	2	8	171703	171710	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013211	CTCA	2	8	176331	176338	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_013211	TGGA	2	8	176605	176612	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013211	CATT	2	8	177094	177101	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_013211	TGAG	2	8	177368	177375	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013211	GAAA	2	8	177392	177399	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013211	TGGC	2	8	179787	179794	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_013211	GCAC	2	8	179914	179921	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_013211	GAAG	2	8	180091	180098	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013211	CTGT	2	8	180699	180706	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_013211	GACG	2	8	180803	180810	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_013211	GGTC	2	8	181073	181080	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_013211	GTGA	2	8	181431	181438	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013211	GCGT	2	8	182111	182118	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_013211	CATC	2	8	182592	182599	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_013211	AGCG	2	8	182707	182714	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_013211	CTTC	2	8	182857	182864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.