MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01 plasmid pAPA01-020

Total Repeats: 405

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013211	CGGG	2	8	87	94	0 %	0 %	75 %	25 %	258513089
2	NC_013211	TCTG	2	8	561	568	0 %	50 %	25 %	25 %	258513090
3	NC_013211	CGTC	2	8	874	881	0 %	25 %	25 %	50 %	258513091
4	NC_013211	AACA	2	8	1292	1299	75 %	0 %	0 %	25 %	258513092
5	NC_013211	TGGC	2	8	2514	2521	0 %	25 %	50 %	25 %	258513094
6	NC_013211	TCGT	2	8	3343	3350	0 %	50 %	25 %	25 %	258513096
7	NC_013211	CCAT	2	8	3600	3607	25 %	25 %	0 %	50 %	258513096
8	NC_013211	ATAA	2	8	3657	3664	75 %	25 %	0 %	0 %	258513096
9	NC_013211	TGGG	2	8	4569	4576	0 %	25 %	75 %	0 %	258513098
10	NC_013211	CCTT	2	8	4594	4601	0 %	50 %	0 %	50 %	258513098
11	NC_013211	CATG	2	8	4908	4915	25 %	25 %	25 %	25 %	258513099
12	NC_013211	CGGC	2	8	7116	7123	0 %	0 %	50 %	50 %	258513100
13	NC_013211	GCCT	2	8	7360	7367	0 %	25 %	25 %	50 %	258513100
14	NC_013211	GGGC	2	8	7433	7440	0 %	0 %	75 %	25 %	258513100
15	NC_013211	GCCA	2	8	7656	7663	25 %	0 %	25 %	50 %	258513100
16	NC_013211	GATG	2	8	8287	8294	25 %	25 %	50 %	0 %	258513101
17	NC_013211	ACGC	2	8	8768	8775	25 %	0 %	25 %	50 %	258513101
18	NC_013211	GTGC	2	8	9582	9589	0 %	25 %	50 %	25 %	258513102
19	NC_013211	CACC	2	8	10017	10024	25 %	0 %	0 %	75 %	258513102
20	NC_013211	CCAT	2	8	10099	10106	25 %	25 %	0 %	50 %	258513102
21	NC_013211	GACG	2	8	10779	10786	25 %	0 %	50 %	25 %	258513103
22	NC_013211	CTTC	2	8	11418	11425	0 %	50 %	0 %	50 %	258513103
23	NC_013211	CGGG	2	8	11588	11595	0 %	0 %	75 %	25 %	258513103
24	NC_013211	GCCA	2	8	11722	11729	25 %	0 %	25 %	50 %	258513103
25	NC_013211	TCGA	2	8	12627	12634	25 %	25 %	25 %	25 %	258513104
26	NC_013211	ATGG	2	8	13366	13373	25 %	25 %	50 %	0 %	258513105
27	NC_013211	TATC	2	8	13486	13493	25 %	50 %	0 %	25 %	258513105
28	NC_013211	ACCC	2	8	13601	13608	25 %	0 %	0 %	75 %	258513105
29	NC_013211	AGAC	2	8	13721	13728	50 %	0 %	25 %	25 %	258513105
30	NC_013211	TCCT	2	8	14307	14314	0 %	50 %	0 %	50 %	258513106
31	NC_013211	TGCG	2	8	14597	14604	0 %	25 %	50 %	25 %	258513106
32	NC_013211	AGTG	2	8	14704	14711	25 %	25 %	50 %	0 %	258513106
33	NC_013211	CAAT	2	8	15055	15062	50 %	25 %	0 %	25 %	258513106
34	NC_013211	AGAT	2	8	15129	15136	50 %	25 %	25 %	0 %	258513106
35	NC_013211	CAGC	2	8	15743	15750	25 %	0 %	25 %	50 %	258513107
36	NC_013211	AACC	2	8	15848	15855	50 %	0 %	0 %	50 %	258513107
37	NC_013211	AAAC	2	8	16914	16921	75 %	0 %	0 %	25 %	258513108
38	NC_013211	CAGA	2	8	17163	17170	50 %	0 %	25 %	25 %	258513108
39	NC_013211	ACAT	2	8	17816	17823	50 %	25 %	0 %	25 %	258513108
40	NC_013211	GTCA	2	8	18151	18158	25 %	25 %	25 %	25 %	258513108
41	NC_013211	GGGC	2	8	18324	18331	0 %	0 %	75 %	25 %	258513109
42	NC_013211	AGAT	2	8	18582	18589	50 %	25 %	25 %	0 %	258513109
43	NC_013211	CAGA	2	8	19019	19026	50 %	0 %	25 %	25 %	258513110
44	NC_013211	CCGC	2	8	19208	19215	0 %	0 %	25 %	75 %	258513110
45	NC_013211	GTAT	2	8	20679	20686	25 %	50 %	25 %	0 %	258513111
46	NC_013211	GACA	2	8	20979	20986	50 %	0 %	25 %	25 %	258513111
47	NC_013211	TGAA	2	8	21102	21109	50 %	25 %	25 %	0 %	258513111
48	NC_013211	GAAC	2	8	21813	21820	50 %	0 %	25 %	25 %	258513112
49	NC_013211	GAAG	2	8	23380	23387	50 %	0 %	50 %	0 %	258513113
50	NC_013211	GATG	2	8	23793	23800	25 %	25 %	50 %	0 %	258513114
51	NC_013211	GTCA	2	8	23968	23975	25 %	25 %	25 %	25 %	258513114
52	NC_013211	TTTG	2	8	24102	24109	0 %	75 %	25 %	0 %	258513114
53	NC_013211	CATC	2	8	24507	24514	25 %	25 %	0 %	50 %	258513115
54	NC_013211	CGCA	2	8	25688	25695	25 %	0 %	25 %	50 %	258513116
55	NC_013211	ATCA	2	8	25916	25923	50 %	25 %	0 %	25 %	258513116
56	NC_013211	TGCC	2	8	25988	25995	0 %	25 %	25 %	50 %	258513116
57	NC_013211	TCAC	2	8	26123	26130	25 %	25 %	0 %	50 %	258513117
58	NC_013211	AGCC	3	12	26574	26585	25 %	0 %	25 %	50 %	258513117
59	NC_013211	TCCA	2	8	27262	27269	25 %	25 %	0 %	50 %	258513117
60	NC_013211	TGGC	2	8	27494	27501	0 %	25 %	50 %	25 %	258513117
61	NC_013211	GTCC	2	8	27542	27549	0 %	25 %	25 %	50 %	258513117
62	NC_013211	CGGA	2	8	29386	29393	25 %	0 %	50 %	25 %	258513117
63	NC_013211	TGGC	2	8	29654	29661	0 %	25 %	50 %	25 %	258513118
64	NC_013211	CATC	2	8	31929	31936	25 %	25 %	0 %	50 %	258513121
65	NC_013211	AACC	2	8	32208	32215	50 %	0 %	0 %	50 %	258513121
66	NC_013211	AGCC	2	8	33025	33032	25 %	0 %	25 %	50 %	258513121
67	NC_013211	CTGC	2	8	34244	34251	0 %	25 %	25 %	50 %	258513123
68	NC_013211	CCAA	2	8	34290	34297	50 %	0 %	0 %	50 %	258513123
69	NC_013211	TTGT	2	8	34645	34652	0 %	75 %	25 %	0 %	258513123
70	NC_013211	ATCC	2	8	34709	34716	25 %	25 %	0 %	50 %	258513123
71	NC_013211	TGCC	2	8	34783	34790	0 %	25 %	25 %	50 %	258513123
72	NC_013211	CAGC	2	8	35597	35604	25 %	0 %	25 %	50 %	258513124
73	NC_013211	AAGC	2	8	35822	35829	50 %	0 %	25 %	25 %	258513124
74	NC_013211	ACGA	2	8	35937	35944	50 %	0 %	25 %	25 %	258513124
75	NC_013211	AAAT	2	8	36012	36019	75 %	25 %	0 %	0 %	258513125
76	NC_013211	AGCC	2	8	36032	36039	25 %	0 %	25 %	50 %	258513125
77	NC_013211	AAGC	2	8	36262	36269	50 %	0 %	25 %	25 %	258513125
78	NC_013211	AACA	2	8	36440	36447	75 %	0 %	0 %	25 %	258513125
79	NC_013211	AAAG	2	8	36661	36668	75 %	0 %	25 %	0 %	258513125
80	NC_013211	GCAA	2	8	36672	36679	50 %	0 %	25 %	25 %	258513125
81	NC_013211	ATTT	2	8	37196	37203	25 %	75 %	0 %	0 %	258513126
82	NC_013211	CTGC	2	8	37669	37676	0 %	25 %	25 %	50 %	258513126
83	NC_013211	CCAG	2	8	37740	37747	25 %	0 %	25 %	50 %	258513126
84	NC_013211	TTTC	2	8	37873	37880	0 %	75 %	0 %	25 %	258513126
85	NC_013211	TGGA	2	8	38696	38703	25 %	25 %	50 %	0 %	258513127
86	NC_013211	CACG	2	8	39350	39357	25 %	0 %	25 %	50 %	258513128
87	NC_013211	GCCT	2	8	39607	39614	0 %	25 %	25 %	50 %	258513128
88	NC_013211	TTCA	2	8	39663	39670	25 %	50 %	0 %	25 %	258513128
89	NC_013211	TCAC	2	8	40248	40255	25 %	25 %	0 %	50 %	258513129
90	NC_013211	CCAT	2	8	40713	40720	25 %	25 %	0 %	50 %	258513129
91	NC_013211	GGCT	2	8	41097	41104	0 %	25 %	50 %	25 %	258513129
92	NC_013211	TGCG	3	12	41172	41183	0 %	25 %	50 %	25 %	258513129
93	NC_013211	CAGC	2	8	41461	41468	25 %	0 %	25 %	50 %	258513129
94	NC_013211	GTGC	2	8	42249	42256	0 %	25 %	50 %	25 %	258513129
95	NC_013211	CCAC	2	8	42398	42405	25 %	0 %	0 %	75 %	258513129
96	NC_013211	CTCA	2	8	42446	42453	25 %	25 %	0 %	50 %	258513129
97	NC_013211	GCAT	2	8	43157	43164	25 %	25 %	25 %	25 %	258513130
98	NC_013211	TATC	2	8	43212	43219	25 %	50 %	0 %	25 %	258513130
99	NC_013211	CAGA	2	8	43518	43525	50 %	0 %	25 %	25 %	258513130
100	NC_013211	CTGC	2	8	43734	43741	0 %	25 %	25 %	50 %	258513130
101	NC_013211	CCTG	2	8	43752	43759	0 %	25 %	25 %	50 %	258513130
102	NC_013211	ACCA	2	8	43789	43796	50 %	0 %	0 %	50 %	258513130
103	NC_013211	GCAG	2	8	44295	44302	25 %	0 %	50 %	25 %	258513131
104	NC_013211	CTGC	2	8	44309	44316	0 %	25 %	25 %	50 %	258513131
105	NC_013211	AAGC	2	8	44504	44511	50 %	0 %	25 %	25 %	258513131
106	NC_013211	CTGG	2	8	44804	44811	0 %	25 %	50 %	25 %	258513131
107	NC_013211	CCCT	2	8	45165	45172	0 %	25 %	0 %	75 %	258513131
108	NC_013211	CGAA	2	8	45401	45408	50 %	0 %	25 %	25 %	258513131
109	NC_013211	CCGG	2	8	45658	45665	0 %	0 %	50 %	50 %	258513132
110	NC_013211	GGCA	2	8	45743	45750	25 %	0 %	50 %	25 %	258513132
111	NC_013211	GCGT	2	8	47202	47209	0 %	25 %	50 %	25 %	258513134
112	NC_013211	CATC	2	8	47683	47690	25 %	25 %	0 %	50 %	258513134
113	NC_013211	AGCG	2	8	47798	47805	25 %	0 %	50 %	25 %	258513134
114	NC_013211	GACA	2	8	48781	48788	50 %	0 %	25 %	25 %	258513135
115	NC_013211	TGGT	2	8	48824	48831	0 %	50 %	50 %	0 %	258513135
116	NC_013211	CTGA	2	8	48857	48864	25 %	25 %	25 %	25 %	258513135
117	NC_013211	GAAC	2	8	48912	48919	50 %	0 %	25 %	25 %	258513135
118	NC_013211	CATC	2	8	49130	49137	25 %	25 %	0 %	50 %	258513135
119	NC_013211	CAAC	2	8	49859	49866	50 %	0 %	0 %	50 %	258513136
120	NC_013211	CTGA	2	8	49936	49943	25 %	25 %	25 %	25 %	258513136
121	NC_013211	GCCA	2	8	49986	49993	25 %	0 %	25 %	50 %	258513136
122	NC_013211	ATCA	2	8	50310	50317	50 %	25 %	0 %	25 %	258513136
123	NC_013211	CGGG	2	8	50494	50501	0 %	0 %	75 %	25 %	258513137
124	NC_013211	AATG	2	8	51414	51421	50 %	25 %	25 %	0 %	258513138
125	NC_013211	GATC	2	8	52992	52999	25 %	25 %	25 %	25 %	258513140
126	NC_013211	CAGT	2	8	53754	53761	25 %	25 %	25 %	25 %	258513142
127	NC_013211	GCCC	2	8	54389	54396	0 %	0 %	25 %	75 %	258513143
128	NC_013211	CGTC	2	8	54765	54772	0 %	25 %	25 %	50 %	258513143
129	NC_013211	CACC	2	8	54871	54878	25 %	0 %	0 %	75 %	258513143
130	NC_013211	ACAA	2	8	54945	54952	75 %	0 %	0 %	25 %	258513143
131	NC_013211	GGGT	2	8	55844	55851	0 %	25 %	75 %	0 %	258513144
132	NC_013211	CGGG	2	8	56177	56184	0 %	0 %	75 %	25 %	258513145
133	NC_013211	CAGG	2	8	56655	56662	25 %	0 %	50 %	25 %	258513145
134	NC_013211	CAGC	2	8	56840	56847	25 %	0 %	25 %	50 %	258513145
135	NC_013211	CGGA	2	8	57511	57518	25 %	0 %	50 %	25 %	258513146
136	NC_013211	ACGC	2	8	58813	58820	25 %	0 %	25 %	50 %	258513147
137	NC_013211	TTCC	2	8	59185	59192	0 %	50 %	0 %	50 %	258513148
138	NC_013211	CTGG	2	8	59622	59629	0 %	25 %	50 %	25 %	258513148
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140	NC_013211	GACC	2	8	60534	60541	25 %	0 %	25 %	50 %	258513148
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.