MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01 plasmid pAPA01-020

Total Repeats: 2267

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_013211	CTT	2	6	161165	161170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258513247
2002	NC_013211	ATT	2	6	161175	161180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258513247
2003	NC_013211	TCG	2	6	161217	161222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258513247
2004	NC_013211	CAA	2	6	161257	161262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258513247
2005	NC_013211	ACG	2	6	161347	161352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513247
2006	NC_013211	TCA	2	6	161359	161364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258513247
2007	NC_013211	CAT	2	6	161382	161387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2008	NC_013211	CGA	2	6	161443	161448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513248
2009	NC_013211	CAG	2	6	161453	161458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513248
2010	NC_013211	ACA	2	6	161625	161630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258513248
2011	NC_013211	CAC	2	6	161691	161696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2012	NC_013211	GCC	2	6	161735	161740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2013	NC_013211	GGC	2	6	161747	161752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2014	NC_013211	ACG	2	6	161800	161805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513249
2015	NC_013211	CCG	2	6	161936	161941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258513249
2016	NC_013211	CAG	3	9	162078	162086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513249
2017	NC_013211	TCT	2	6	162120	162125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258513250
2018	NC_013211	CTC	2	6	162199	162204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258513250
2019	NC_013211	TCG	2	6	162282	162287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258513250
2020	NC_013211	ATC	2	6	162292	162297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258513250
2021	NC_013211	CTG	2	6	162415	162420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258513250
2022	NC_013211	CGC	2	6	162433	162438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258513250
2023	NC_013211	TCA	3	9	162521	162529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258513250
2024	NC_013211	GCG	2	6	162696	162701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258513250
2025	NC_013211	CCA	2	6	162743	162748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258513250
2026	NC_013211	AAT	2	6	162760	162765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258513250
2027	NC_013211	CAC	2	6	162876	162881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258513250
2028	NC_013211	GCA	2	6	162995	163000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513250
2029	NC_013211	ATC	2	6	163034	163039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258513250
2030	NC_013211	CTC	2	6	163210	163215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2031	NC_013211	CCG	2	6	163263	163268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2032	NC_013211	GCG	2	6	163329	163334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2033	NC_013211	GGC	2	6	163339	163344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2034	NC_013211	AGC	2	6	163426	163431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513251
2035	NC_013211	ATC	2	6	163432	163437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258513251
2036	NC_013211	GGA	2	6	163738	163743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258513251
2037	NC_013211	ACT	2	6	163745	163750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258513251
2038	NC_013211	CTG	2	6	163780	163785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258513251
2039	NC_013211	ACC	2	6	163913	163918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258513251
2040	NC_013211	GTG	2	6	163919	163924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258513251
2041	NC_013211	GCC	2	6	163976	163981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258513251
2042	NC_013211	ATC	2	6	164059	164064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258513251
2043	NC_013211	AGC	2	6	164258	164263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513251
2044	NC_013211	TGG	2	6	164271	164276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258513251
2045	NC_013211	CTG	2	6	164290	164295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258513251
2046	NC_013211	ATG	2	6	164363	164368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258513251
2047	NC_013211	CGA	2	6	164373	164378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513251
2048	NC_013211	GAT	2	6	164394	164399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258513251
2049	NC_013211	GCT	2	6	164415	164420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258513251
2050	NC_013211	GCT	2	6	164510	164515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258513251
2051	NC_013211	ATC	2	6	164648	164653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258513251
2052	NC_013211	ATC	2	6	164747	164752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258513251
2053	NC_013211	TCA	2	6	164774	164779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258513251
2054	NC_013211	CAT	2	6	164826	164831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258513251
2055	NC_013211	TCA	2	6	164832	164837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258513251
2056	NC_013211	ATG	2	6	164846	164851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258513251
2057	NC_013211	GAC	2	6	164868	164873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513251
2058	NC_013211	CTG	2	6	164914	164919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258513251
2059	NC_013211	TCT	2	6	164933	164938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258513251
2060	NC_013211	CCA	2	6	164949	164954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258513251
2061	NC_013211	TCA	2	6	165008	165013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258513251
2062	NC_013211	GGC	2	6	165148	165153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258513251
2063	NC_013211	CTT	2	6	165286	165291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258513251
2064	NC_013211	TGG	2	6	165372	165377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258513251
2065	NC_013211	ATC	2	6	165454	165459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258513251
2066	NC_013211	GGC	2	6	165466	165471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258513251
2067	NC_013211	CTT	2	6	165498	165503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258513251
2068	NC_013211	ATC	2	6	165590	165595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258513251
2069	NC_013211	ATG	2	6	165647	165652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258513251
2070	NC_013211	CGC	2	6	165673	165678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258513251
2071	NC_013211	CAC	2	6	165799	165804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258513251
2072	NC_013211	ATG	2	6	165845	165850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258513251
2073	NC_013211	TGA	2	6	165941	165946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258513251
2074	NC_013211	GCC	2	6	166106	166111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258513251
2075	NC_013211	CGT	2	6	166244	166249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258513251
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2077	NC_013211	TCA	2	6	166550	166555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258513251
2078	NC_013211	CAG	2	6	166651	166656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513251
2079	NC_013211	CTC	2	6	166810	166815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258513251
2080	NC_013211	CCA	2	6	166824	166829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258513251
2081	NC_013211	ATC	2	6	166843	166848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258513251
2082	NC_013211	GTG	2	6	166919	166924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258513251
2083	NC_013211	GCT	2	6	166986	166991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258513251
2084	NC_013211	GCA	2	6	167157	167162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513251
2085	NC_013211	CAA	2	6	167172	167177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258513251
2086	NC_013211	CCT	2	6	167187	167192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258513251
2087	NC_013211	TGC	2	6	167209	167214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258513251
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2089	NC_013211	CGG	2	6	167337	167342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258513251
2090	NC_013211	GTC	2	6	167378	167383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258513251
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2092	NC_013211	GAA	2	6	167728	167733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258513251
2093	NC_013211	CGT	2	6	168118	168123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258513251
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2095	NC_013211	GTA	2	6	168476	168481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258513251
2096	NC_013211	GCG	2	6	168684	168689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2097	NC_013211	ATT	2	6	168798	168803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2098	NC_013211	TAA	2	6	168966	168971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2099	NC_013211	TCT	2	6	168977	168982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2100	NC_013211	AGG	2	6	168988	168993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2101	NC_013211	GTC	2	6	169003	169008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2102	NC_013211	AAG	2	6	169194	169199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2103	NC_013211	TAT	2	6	169390	169395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2104	NC_013211	GAA	2	6	169490	169495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2105	NC_013211	ATC	2	6	169719	169724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2106	NC_013211	TGC	2	6	169824	169829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2107	NC_013211	GAA	2	6	169906	169911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2108	NC_013211	GAA	2	6	169936	169941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2109	NC_013211	TGA	2	6	170013	170018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2110	NC_013211	CTT	2	6	170021	170026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2111	NC_013211	TGC	2	6	170043	170048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2112	NC_013211	AGA	2	6	170073	170078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2113	NC_013211	CAT	2	6	170133	170138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2114	NC_013211	TGC	2	6	170184	170189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2115	NC_013211	AGC	2	6	170240	170245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2116	NC_013211	TGA	2	6	170289	170294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2117	NC_013211	TAA	2	6	170299	170304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2118	NC_013211	GTC	2	6	170348	170353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258513252
2119	NC_013211	GAT	3	9	170364	170372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258513252
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2121	NC_013211	CAA	2	6	170468	170473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258513252
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2242	NC_013211	CAG	2	6	180915	180920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2243	NC_013211	GTG	2	6	181096	181101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2244	NC_013211	GAT	2	6	181112	181117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2245	NC_013211	CCA	2	6	181148	181153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2246	NC_013211	GCG	2	6	181161	181166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2247	NC_013211	AGG	2	6	181196	181201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2248	NC_013211	GGC	2	6	181230	181235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2249	NC_013211	TCA	2	6	181337	181342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2250	NC_013211	TCG	2	6	181465	181470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2251	NC_013211	ACG	2	6	181526	181531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2252	NC_013211	CTT	2	6	181739	181744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2253	NC_013211	TCC	2	6	181748	181753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2254	NC_013211	CGG	2	6	181846	181851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2255	NC_013211	TTC	2	6	181896	181901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2256	NC_013211	GAC	2	6	181976	181981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2257	NC_013211	CTG	2	6	182003	182008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2258	NC_013211	CTG	2	6	182147	182152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2259	NC_013211	ATC	3	9	182194	182202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2260	NC_013211	GCC	2	6	182396	182401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2261	NC_013211	CTT	2	6	182424	182429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2262	NC_013211	TCG	2	6	182443	182448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2263	NC_013211	GAC	2	6	182499	182504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2264	NC_013211	CTG	2	6	182550	182555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2265	NC_013211	GCG	2	6	182678	182683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2266	NC_013211	TCA	2	6	182756	182761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2267	NC_013211	AGA	2	6	182917	182922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.