MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01 plasmid pAPA01-020

Total Repeats: 305

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013211	GC	3	6	96	101	0 %	0 %	50 %	50 %	258513089
2	NC_013211	AT	3	6	2210	2215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013211	GC	3	6	2411	2416	0 %	0 %	50 %	50 %	258513094
4	NC_013211	GC	3	6	4931	4936	0 %	0 %	50 %	50 %	258513099
5	NC_013211	AG	3	6	6479	6484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013211	GT	3	6	6966	6971	0 %	50 %	50 %	0 %	258513100
7	NC_013211	GC	3	6	7200	7205	0 %	0 %	50 %	50 %	258513100
8	NC_013211	GC	3	6	8169	8174	0 %	0 %	50 %	50 %	258513101
9	NC_013211	GT	3	6	8533	8538	0 %	50 %	50 %	0 %	258513101
10	NC_013211	TC	3	6	9223	9228	0 %	50 %	0 %	50 %	258513101
11	NC_013211	TC	3	6	9387	9392	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_013211	GA	3	6	10031	10036	50 %	0 %	50 %	0 %	258513102
13	NC_013211	TG	3	6	10408	10413	0 %	50 %	50 %	0 %	258513102
14	NC_013211	CG	3	6	11184	11189	0 %	0 %	50 %	50 %	258513103
15	NC_013211	AG	3	6	12220	12225	50 %	0 %	50 %	0 %	258513104
16	NC_013211	AG	3	6	12433	12438	50 %	0 %	50 %	0 %	258513104
17	NC_013211	CA	3	6	12578	12583	50 %	0 %	0 %	50 %	258513104
18	NC_013211	AT	3	6	12789	12794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013211	CA	3	6	13021	13026	50 %	0 %	0 %	50 %	258513105
20	NC_013211	GC	3	6	13163	13168	0 %	0 %	50 %	50 %	258513105
21	NC_013211	AG	3	6	13644	13649	50 %	0 %	50 %	0 %	258513105
22	NC_013211	GC	3	6	13682	13687	0 %	0 %	50 %	50 %	258513105
23	NC_013211	GA	3	6	13807	13812	50 %	0 %	50 %	0 %	258513105
24	NC_013211	AT	3	6	14167	14172	50 %	50 %	0 %	0 %	258513106
25	NC_013211	GT	3	6	14231	14236	0 %	50 %	50 %	0 %	258513106
26	NC_013211	CA	3	6	14381	14386	50 %	0 %	0 %	50 %	258513106
27	NC_013211	GC	3	6	14471	14476	0 %	0 %	50 %	50 %	258513106
28	NC_013211	AG	3	6	14692	14697	50 %	0 %	50 %	0 %	258513106
29	NC_013211	CG	3	6	14794	14799	0 %	0 %	50 %	50 %	258513106
30	NC_013211	GC	3	6	15363	15368	0 %	0 %	50 %	50 %	258513107
31	NC_013211	CA	3	6	15593	15598	50 %	0 %	0 %	50 %	258513107
32	NC_013211	GC	3	6	16011	16016	0 %	0 %	50 %	50 %	258513107
33	NC_013211	CG	3	6	16671	16676	0 %	0 %	50 %	50 %	258513107
34	NC_013211	CA	3	6	16694	16699	50 %	0 %	0 %	50 %	258513107
35	NC_013211	GC	3	6	17186	17191	0 %	0 %	50 %	50 %	258513108
36	NC_013211	CA	3	6	17422	17427	50 %	0 %	0 %	50 %	258513108
37	NC_013211	AG	3	6	17557	17562	50 %	0 %	50 %	0 %	258513108
38	NC_013211	GC	3	6	18015	18020	0 %	0 %	50 %	50 %	258513108
39	NC_013211	GC	3	6	20276	20281	0 %	0 %	50 %	50 %	258513110
40	NC_013211	TG	3	6	20871	20876	0 %	50 %	50 %	0 %	258513111
41	NC_013211	GA	3	6	21414	21419	50 %	0 %	50 %	0 %	258513111
42	NC_013211	CG	3	6	22099	22104	0 %	0 %	50 %	50 %	258513112
43	NC_013211	GC	3	6	22280	22285	0 %	0 %	50 %	50 %	258513112
44	NC_013211	AT	3	6	22532	22537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013211	CT	3	6	23000	23005	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_013211	GC	3	6	23263	23268	0 %	0 %	50 %	50 %	258513113
47	NC_013211	AG	3	6	24754	24759	50 %	0 %	50 %	0 %	258513115
48	NC_013211	AT	3	6	26281	26286	50 %	50 %	0 %	0 %	258513117
49	NC_013211	CG	3	6	26301	26306	0 %	0 %	50 %	50 %	258513117
50	NC_013211	TC	3	6	29016	29021	0 %	50 %	0 %	50 %	258513117
51	NC_013211	GC	3	6	29551	29556	0 %	0 %	50 %	50 %	258513118
52	NC_013211	GT	3	6	30594	30599	0 %	50 %	50 %	0 %	258513120
53	NC_013211	AG	3	6	30900	30905	50 %	0 %	50 %	0 %	258513121
54	NC_013211	AT	3	6	31598	31603	50 %	50 %	0 %	0 %	258513121
55	NC_013211	AG	3	6	32163	32168	50 %	0 %	50 %	0 %	258513121
56	NC_013211	GT	3	6	33694	33699	0 %	50 %	50 %	0 %	258513122
57	NC_013211	TC	3	6	33795	33800	0 %	50 %	0 %	50 %	258513122
58	NC_013211	TG	3	6	34459	34464	0 %	50 %	50 %	0 %	258513123
59	NC_013211	TA	3	6	35882	35887	50 %	50 %	0 %	0 %	258513124
60	NC_013211	GC	3	6	35897	35902	0 %	0 %	50 %	50 %	258513124
61	NC_013211	TG	3	6	36418	36423	0 %	50 %	50 %	0 %	258513125
62	NC_013211	AT	3	6	37155	37160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013211	AT	4	8	37583	37590	50 %	50 %	0 %	0 %	258513126
64	NC_013211	GC	3	6	38062	38067	0 %	0 %	50 %	50 %	258513127
65	NC_013211	GC	3	6	38879	38884	0 %	0 %	50 %	50 %	258513127
66	NC_013211	GC	3	6	39633	39638	0 %	0 %	50 %	50 %	258513128
67	NC_013211	CG	4	8	40227	40234	0 %	0 %	50 %	50 %	258513129
68	NC_013211	AC	3	6	43335	43340	50 %	0 %	0 %	50 %	258513130
69	NC_013211	GA	3	6	43608	43613	50 %	0 %	50 %	0 %	258513130
70	NC_013211	GC	3	6	43805	43810	0 %	0 %	50 %	50 %	258513130
71	NC_013211	GA	3	6	43897	43902	50 %	0 %	50 %	0 %	258513130
72	NC_013211	AC	3	6	44176	44181	50 %	0 %	0 %	50 %	258513130
73	NC_013211	TG	3	6	44705	44710	0 %	50 %	50 %	0 %	258513131
74	NC_013211	CG	3	6	44720	44725	0 %	0 %	50 %	50 %	258513131
75	NC_013211	AT	3	6	45217	45222	50 %	50 %	0 %	0 %	258513131
76	NC_013211	GA	3	6	46585	46590	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013211	AG	3	6	46748	46753	50 %	0 %	50 %	0 %	258513134
78	NC_013211	AC	3	6	47439	47444	50 %	0 %	0 %	50 %	258513134
79	NC_013211	TC	3	6	48045	48050	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_013211	AC	3	6	48189	48194	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_013211	GC	3	6	48457	48462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_013211	TC	3	6	48569	48574	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_013211	TC	3	6	48795	48800	0 %	50 %	0 %	50 %	258513135
84	NC_013211	CG	3	6	49016	49021	0 %	0 %	50 %	50 %	258513135
85	NC_013211	GC	3	6	49069	49074	0 %	0 %	50 %	50 %	258513135
86	NC_013211	GC	3	6	49148	49153	0 %	0 %	50 %	50 %	258513135
87	NC_013211	CA	3	6	49307	49312	50 %	0 %	0 %	50 %	258513136
88	NC_013211	GT	3	6	49706	49711	0 %	50 %	50 %	0 %	258513136
89	NC_013211	CG	3	6	50654	50659	0 %	0 %	50 %	50 %	258513137
90	NC_013211	GA	3	6	50829	50834	50 %	0 %	50 %	0 %	258513137
91	NC_013211	AG	3	6	51826	51831	50 %	0 %	50 %	0 %	258513138
92	NC_013211	TC	3	6	53074	53079	0 %	50 %	0 %	50 %	258513140
93	NC_013211	TA	3	6	54099	54104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013211	AG	3	6	54298	54303	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013211	AG	3	6	54530	54535	50 %	0 %	50 %	0 %	258513143
96	NC_013211	CG	3	6	55013	55018	0 %	0 %	50 %	50 %	258513143
97	NC_013211	GC	3	6	55118	55123	0 %	0 %	50 %	50 %	258513143
98	NC_013211	GA	3	6	55817	55822	50 %	0 %	50 %	0 %	258513144
99	NC_013211	CG	3	6	56033	56038	0 %	0 %	50 %	50 %	258513144
100	NC_013211	CT	3	6	57475	57480	0 %	50 %	0 %	50 %	258513146
101	NC_013211	GC	3	6	57885	57890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_013211	CG	3	6	58067	58072	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_013211	AT	3	6	58184	58189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013211	CG	3	6	60492	60497	0 %	0 %	50 %	50 %	258513148
105	NC_013211	TG	3	6	60743	60748	0 %	50 %	50 %	0 %	258513148
106	NC_013211	GT	3	6	62130	62135	0 %	50 %	50 %	0 %	258513148
107	NC_013211	TA	3	6	63175	63180	50 %	50 %	0 %	0 %	258513149
108	NC_013211	AT	3	6	63441	63446	50 %	50 %	0 %	0 %	258513149
109	NC_013211	AT	3	6	63501	63506	50 %	50 %	0 %	0 %	258513149
110	NC_013211	CG	3	6	64583	64588	0 %	0 %	50 %	50 %	258513150
111	NC_013211	GT	3	6	64808	64813	0 %	50 %	50 %	0 %	258513150
112	NC_013211	CA	3	6	64921	64926	50 %	0 %	0 %	50 %	258513150
113	NC_013211	CT	3	6	65844	65849	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_013211	CG	3	6	66887	66892	0 %	0 %	50 %	50 %	258513153
115	NC_013211	GC	3	6	67333	67338	0 %	0 %	50 %	50 %	258513154
116	NC_013211	CG	3	6	67633	67638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_013211	GC	3	6	67815	67820	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_013211	AG	3	6	68225	68230	50 %	0 %	50 %	0 %	258513155
119	NC_013211	GA	3	6	69017	69022	50 %	0 %	50 %	0 %	258513157
120	NC_013211	GA	3	6	69041	69046	50 %	0 %	50 %	0 %	258513157
121	NC_013211	GT	3	6	69245	69250	0 %	50 %	50 %	0 %	258513158
122	NC_013211	GC	3	6	69324	69329	0 %	0 %	50 %	50 %	258513158
123	NC_013211	AG	3	6	70274	70279	50 %	0 %	50 %	0 %	258513159
124	NC_013211	CA	3	6	70412	70417	50 %	0 %	0 %	50 %	258513159
125	NC_013211	AC	3	6	70725	70730	50 %	0 %	0 %	50 %	258513159
126	NC_013211	AG	3	6	71024	71029	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013211	AG	3	6	71431	71436	50 %	0 %	50 %	0 %	258513160
128	NC_013211	AC	3	6	71910	71915	50 %	0 %	0 %	50 %	258513160
129	NC_013211	CT	3	6	72749	72754	0 %	50 %	0 %	50 %	258513161
130	NC_013211	CT	3	6	73030	73035	0 %	50 %	0 %	50 %	258513161
131	NC_013211	GA	3	6	73297	73302	50 %	0 %	50 %	0 %	258513161
132	NC_013211	GA	4	8	73907	73914	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013211	AG	3	6	74299	74304	50 %	0 %	50 %	0 %	258513163
134	NC_013211	AT	3	6	74654	74659	50 %	50 %	0 %	0 %	258513163
135	NC_013211	TC	3	6	75749	75754	0 %	50 %	0 %	50 %	258513164
136	NC_013211	CT	3	6	76403	76408	0 %	50 %	0 %	50 %	258513165
137	NC_013211	AG	3	6	76553	76558	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013211	GA	3	6	76587	76592	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013211	CT	3	6	76721	76726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_013211	AT	3	6	76743	76748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013211	GC	3	6	77478	77483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_013211	TG	3	6	77607	77612	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013211	GT	3	6	77970	77975	0 %	50 %	50 %	0 %	258513166
144	NC_013211	TG	3	6	78283	78288	0 %	50 %	50 %	0 %	258513167
145	NC_013211	CT	3	6	78421	78426	0 %	50 %	0 %	50 %	258513167
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287	NC_013211	TC	3	6	174862	174867	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
288	NC_013211	GC	3	6	175053	175058	0 %	0 %	50 %	50 %	258513256
289	NC_013211	GT	3	6	175417	175422	0 %	50 %	50 %	0 %	258513256
290	NC_013211	TC	3	6	176107	176112	0 %	50 %	0 %	50 %	258513256
291	NC_013211	TC	3	6	176271	176276	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
292	NC_013211	GT	3	6	176446	176451	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
293	NC_013211	CG	3	6	176863	176868	0 %	0 %	50 %	50 %	258513257
294	NC_013211	GA	3	6	177133	177138	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
295	NC_013211	AG	3	6	177318	177323	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
296	NC_013211	CT	3	6	177860	177865	0 %	50 %	0 %	50 %	258513258
297	NC_013211	GC	3	6	178005	178010	0 %	0 %	50 %	50 %	258513259
298	NC_013211	GC	3	6	179035	179040	0 %	0 %	50 %	50 %	258513260
299	NC_013211	CA	3	6	179113	179118	50 %	0 %	0 %	50 %	258513260
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301	NC_013211	GC	3	6	180326	180331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
302	NC_013211	CG	3	6	181208	181213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
303	NC_013211	GA	3	6	181494	181499	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
304	NC_013211	AG	3	6	181657	181662	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
305	NC_013211	AC	3	6	182348	182353	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.