MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01 plasmid pAPA01-011

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013210	GGCGCG	2	12	2182	2193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512913
2	NC_013210	GGCTGG	2	12	2206	2217	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	258512913
3	NC_013210	GATAAT	2	12	8047	8058	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013210	ATTGTC	2	12	12936	12947	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	258512921
5	NC_013210	CCTGTC	2	12	12956	12967	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	258512921
6	NC_013210	TGGATG	2	12	14865	14876	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	258512922
7	NC_013210	CATCCA	2	12	19839	19850	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	258512926
8	NC_013210	GGAACT	2	12	21605	21616	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	258512929
9	NC_013210	CATGCT	2	12	24615	24626	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	258512931
10	NC_013210	TAAGGG	2	12	27692	27703	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	258512934
11	NC_013210	TGGATG	2	12	29106	29117	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	258512936
12	NC_013210	AACAAG	2	12	30351	30362	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	258512937
13	NC_013210	GTCAGG	2	12	31120	31131	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_013210	TCCTGA	2	12	39493	39504	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	258512946
15	NC_013210	TGGATG	2	12	41088	41099	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	258512948
16	NC_013210	TGGATG	2	12	42757	42768	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	258512949
17	NC_013210	GTGCTT	2	12	45738	45749	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	258512952
18	NC_013210	GGCATC	2	12	50668	50679	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258512956
19	NC_013210	CGTCAG	2	12	52721	52732	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258512958
20	NC_013210	TTCGGC	2	12	53273	53284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013210	GGCGTG	2	12	62034	62045	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	258512964
22	NC_013210	CATCCA	2	12	64848	64859	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	258512966
23	NC_013210	ATTTTA	2	12	68139	68150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013210	CATTAT	2	12	69801	69812	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	258512969
25	NC_013210	GAGGAC	2	12	73481	73492	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	258512973
26	NC_013210	CATCCA	2	12	76416	76427	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	258512975
27	NC_013210	AACCAG	2	12	77751	77762	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	258512976
28	NC_013210	CATCCA	2	12	89806	89817	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	258512985
29	NC_013210	TGGATG	2	12	93984	93995	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	258512990
30	NC_013210	GAATAA	2	12	96474	96485	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	258512993
31	NC_013210	TCTTAA	2	12	96727	96738	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	258512993
32	NC_013210	TTTGCC	2	12	103010	103021	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	258512998
33	NC_013210	GGCATC	2	12	108790	108801	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258513004
34	NC_013210	CAGCCG	2	12	109840	109851	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	258513005
35	NC_013210	CTTCCT	2	12	113934	113945	0 %	50 %	0 %	50 %	258513010
36	NC_013210	AGCGGA	2	12	114670	114681	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	258513012
37	NC_013210	GGGCCA	2	12	117690	117701	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	258513013
38	NC_013210	TGCAGG	2	12	120243	120254	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258513015
39	NC_013210	CCAAAA	2	12	124912	124923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013210	CATCCA	2	12	130916	130927	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	258513028
41	NC_013210	CCCCCT	2	12	132356	132367	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	258513030
42	NC_013210	CCAGAA	2	12	139218	139229	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	258513039
43	NC_013210	GAGGAA	2	12	140263	140274	50 %	0 %	50 %	0 %	258513040
44	NC_013210	CATCCA	2	12	142018	142029	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	258513041
45	NC_013210	TGGATG	2	12	145439	145450	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	258513044
46	NC_013210	CCCACG	2	12	149219	149230	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	258513045
47	NC_013210	GATGCC	2	12	151487	151498	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258513049
48	NC_013210	CTTCCT	2	12	153894	153905	0 %	50 %	0 %	50 %	258513050
49	NC_013210	TGGATG	2	12	160893	160904	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	258513063
50	NC_013210	GATGCC	2	12	163896	163907	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258513066
51	NC_013210	CATCCA	2	12	165287	165298	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	258513067
52	NC_013210	GCCATC	2	12	171668	171679	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	258513072
53	NC_013210	CCCAAA	2	12	175293	175304	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_013210	TGGATG	2	12	181501	181512	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	258513082
55	NC_013210	TGGATG	2	12	183182	183193	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	258513083
56	NC_013210	TCCAGC	2	12	186179	186190	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	258513085
57	NC_013210	ATTCTG	2	12	186989	187000	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	258513085
58	NC_013210	ATACCG	2	12	188303	188314	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	258513086
59	NC_013210	TCAGTT	2	12	188470	188481	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	258513086
60	NC_013210	TATCGC	2	12	189917	189928	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.