MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01 plasmid pAPA01-011

Total Repeats: 106

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013210	GGAAA	2	10	2241	2250	60 %	0 %	40 %	0 %	258512913
2	NC_013210	TGCCA	2	10	3472	3481	20 %	20 %	20 %	40 %	258512914
3	NC_013210	CGATC	2	10	3587	3596	20 %	20 %	20 %	40 %	258512914
4	NC_013210	GAGCT	2	10	4178	4187	20 %	20 %	40 %	20 %	258512915
5	NC_013210	CTGTG	2	10	5906	5915	0 %	40 %	40 %	20 %	258512917
6	NC_013210	ATCCG	2	10	9094	9103	20 %	20 %	20 %	40 %	258512920
7	NC_013210	AAGCC	2	10	9435	9444	40 %	0 %	20 %	40 %	258512921
8	NC_013210	TACGC	2	10	11629	11638	20 %	20 %	20 %	40 %	258512921
9	NC_013210	GGACA	2	10	19036	19045	40 %	0 %	40 %	20 %	258512926
10	NC_013210	ACCAC	2	10	20876	20885	40 %	0 %	0 %	60 %	258512927
11	NC_013210	CCAGC	2	10	21345	21354	20 %	0 %	20 %	60 %	258512929
12	NC_013210	CTGGC	2	10	23176	23185	0 %	20 %	40 %	40 %	258512931
13	NC_013210	TGCAA	2	10	23742	23751	40 %	20 %	20 %	20 %	258512931
14	NC_013210	CTGGT	2	10	24033	24042	0 %	40 %	40 %	20 %	258512931
15	NC_013210	TGTCC	2	10	29911	29920	0 %	40 %	20 %	40 %	258512936
16	NC_013210	CACCT	2	10	32879	32888	20 %	20 %	0 %	60 %	258512939
17	NC_013210	GCAGG	2	10	36596	36605	20 %	0 %	60 %	20 %	258512942
18	NC_013210	GCTGT	2	10	37645	37654	0 %	40 %	40 %	20 %	258512943
19	NC_013210	CATGC	2	10	39830	39839	20 %	20 %	20 %	40 %	258512946
20	NC_013210	TGTCC	2	10	41893	41902	0 %	40 %	20 %	40 %	258512948
21	NC_013210	TGTCC	2	10	43562	43571	0 %	40 %	20 %	40 %	258512949
22	NC_013210	ATGGC	2	10	46264	46273	20 %	20 %	40 %	20 %	258512952
23	NC_013210	CCTGA	2	10	46798	46807	20 %	20 %	20 %	40 %	258512952
24	NC_013210	TTATT	2	10	51250	51259	20 %	80 %	0 %	0 %	258512957
25	NC_013210	CGTTC	2	10	51797	51806	0 %	40 %	20 %	40 %	258512958
26	NC_013210	CGGTC	2	10	53543	53552	0 %	20 %	40 %	40 %	258512959
27	NC_013210	GAAGC	2	10	56687	56696	40 %	0 %	40 %	20 %	258512960
28	NC_013210	TCAAG	2	10	57725	57734	40 %	20 %	20 %	20 %	258512961
29	NC_013210	CAGGA	2	10	58845	58854	40 %	0 %	40 %	20 %	258512962
30	NC_013210	CGGAC	2	10	59699	59708	20 %	0 %	40 %	40 %	258512962
31	NC_013210	CACAT	2	10	63134	63143	40 %	20 %	0 %	40 %	258512965
32	NC_013210	ACACA	2	10	65898	65907	60 %	0 %	0 %	40 %	258512967
33	NC_013210	TTACA	2	10	69296	69305	40 %	40 %	0 %	20 %	258512969
34	NC_013210	ACTGT	2	10	69401	69410	20 %	40 %	20 %	20 %	258512969
35	NC_013210	CAACG	2	10	70813	70822	40 %	0 %	20 %	40 %	258512970
36	NC_013210	CCGTC	2	10	71798	71807	0 %	20 %	20 %	60 %	258512971
37	NC_013210	AGCAG	2	10	74211	74220	40 %	0 %	40 %	20 %	258512973
38	NC_013210	GGACA	2	10	75613	75622	40 %	0 %	40 %	20 %	258512975
39	NC_013210	CACAC	2	10	77427	77436	40 %	0 %	0 %	60 %	258512976
40	NC_013210	ACGCC	2	10	81578	81587	20 %	0 %	20 %	60 %	258512978
41	NC_013210	CCGCG	2	10	82493	82502	0 %	0 %	40 %	60 %	258512979
42	NC_013210	GCACA	2	10	83388	83397	40 %	0 %	20 %	40 %	258512980
43	NC_013210	GCTGT	2	10	84914	84923	0 %	40 %	40 %	20 %	258512982
44	NC_013210	CCGAG	2	10	87329	87338	20 %	0 %	40 %	40 %	258512984
45	NC_013210	GGACA	2	10	89003	89012	40 %	0 %	40 %	20 %	258512985
46	NC_013210	TTTCT	2	10	90336	90345	0 %	80 %	0 %	20 %	258512986
47	NC_013210	TCCTC	2	10	92390	92399	0 %	40 %	0 %	60 %	258512988
48	NC_013210	TGTCC	2	10	94789	94798	0 %	40 %	20 %	40 %	258512990
49	NC_013210	ATGCA	2	10	98357	98366	40 %	20 %	20 %	20 %	258512994
50	NC_013210	CCTGA	2	10	100784	100793	20 %	20 %	20 %	40 %	258512996
51	NC_013210	CATTG	2	10	100824	100833	20 %	40 %	20 %	20 %	258512996
52	NC_013210	CAAGG	2	10	101882	101891	40 %	0 %	40 %	20 %	258512996
53	NC_013210	CTGGG	2	10	102128	102137	0 %	20 %	60 %	20 %	258512996
54	NC_013210	AGGGG	2	10	102372	102381	20 %	0 %	80 %	0 %	258512996
55	NC_013210	CTATT	2	10	105536	105545	20 %	60 %	0 %	20 %	258513000
56	NC_013210	GTCAC	2	10	114904	114913	20 %	20 %	20 %	40 %	258513012
57	NC_013210	TTGGA	2	10	118256	118265	20 %	40 %	40 %	0 %	258513013
58	NC_013210	CGGTT	2	10	119364	119373	0 %	40 %	40 %	20 %	258513014
59	NC_013210	CGTCC	2	10	126111	126120	0 %	20 %	20 %	60 %	258513022
60	NC_013210	TTTCA	2	10	126352	126361	20 %	60 %	0 %	20 %	258513022
61	NC_013210	TTATT	2	10	129084	129093	20 %	80 %	0 %	0 %	258513026
62	NC_013210	GGACA	2	10	130113	130122	40 %	0 %	40 %	20 %	258513028
63	NC_013210	GCCCT	2	10	132104	132113	0 %	20 %	20 %	60 %	258513030
64	NC_013210	GCCAC	2	10	133706	133715	20 %	0 %	20 %	60 %	258513032
65	NC_013210	GCTGG	2	10	134215	134224	0 %	20 %	60 %	20 %	258513032
66	NC_013210	AGCGA	2	10	134650	134659	40 %	0 %	40 %	20 %	258513034
67	NC_013210	TCCGT	2	10	137303	137312	0 %	40 %	20 %	40 %	258513038
68	NC_013210	CTGCG	2	10	138031	138040	0 %	20 %	40 %	40 %	258513038
69	NC_013210	TCGCG	2	10	138566	138575	0 %	20 %	40 %	40 %	258513038
70	NC_013210	CGTCC	2	10	140713	140722	0 %	20 %	20 %	60 %	258513040
71	NC_013210	GGACA	2	10	141215	141224	40 %	0 %	40 %	20 %	258513041
72	NC_013210	CATGG	2	10	143332	143341	20 %	20 %	40 %	20 %	258513043
73	NC_013210	AATTA	2	10	143497	143506	60 %	40 %	0 %	0 %	258513043
74	NC_013210	TGTCC	2	10	146244	146253	0 %	40 %	20 %	40 %	258513044
75	NC_013210	ACCGT	2	10	147346	147355	20 %	20 %	20 %	40 %	258513045
76	NC_013210	GATCA	2	10	147978	147987	40 %	20 %	20 %	20 %	258513045
77	NC_013210	TGGGG	2	10	149924	149933	0 %	20 %	80 %	0 %	258513047
78	NC_013210	GGCAC	2	10	152046	152055	20 %	0 %	40 %	40 %	258513049
79	NC_013210	CCAAC	2	10	157944	157953	40 %	0 %	0 %	60 %	258513056
80	NC_013210	CTGCC	2	10	159061	159070	0 %	20 %	20 %	60 %	258513060
81	NC_013210	GCCAT	2	10	159413	159422	20 %	20 %	20 %	40 %	258513061
82	NC_013210	GCCAC	2	10	160235	160244	20 %	0 %	20 %	60 %	258513062
83	NC_013210	TGTCC	2	10	161698	161707	0 %	40 %	20 %	40 %	258513063
84	NC_013210	TGCCC	2	10	163247	163256	0 %	20 %	20 %	60 %	258513065
85	NC_013210	GGACA	2	10	164484	164493	40 %	0 %	40 %	20 %	258513067
86	NC_013210	CATCT	2	10	165977	165986	20 %	40 %	0 %	40 %	258513068
87	NC_013210	ATCGC	2	10	166236	166245	20 %	20 %	20 %	40 %	258513068
88	NC_013210	CCAAC	2	10	166436	166445	40 %	0 %	0 %	60 %	258513069
89	NC_013210	TCCGG	2	10	167675	167684	0 %	20 %	40 %	40 %	258513069
90	NC_013210	TCCGG	2	10	172164	172173	0 %	20 %	40 %	40 %	258513073
91	NC_013210	TCGCG	2	10	172224	172233	0 %	20 %	40 %	40 %	258513073
92	NC_013210	CCCGG	2	10	172431	172440	0 %	0 %	40 %	60 %	258513074
93	NC_013210	GTCCG	2	10	173035	173044	0 %	20 %	40 %	40 %	258513074
94	NC_013210	TGATC	2	10	173785	173794	20 %	40 %	20 %	20 %	258513075
95	NC_013210	ACACC	2	10	175358	175367	40 %	0 %	0 %	60 %	258513077
96	NC_013210	AGTAG	2	10	175991	176000	40 %	20 %	40 %	0 %	258513077
97	NC_013210	CGATG	2	10	177569	177578	20 %	20 %	40 %	20 %	258513078
98	NC_013210	GGAAA	2	10	178457	178466	60 %	0 %	40 %	0 %	258513079
99	NC_013210	TGTCC	2	10	182306	182315	0 %	40 %	20 %	40 %	258513082
100	NC_013210	TGTCC	2	10	183987	183996	0 %	40 %	20 %	40 %	258513083
101	NC_013210	GCCCA	2	10	185290	185299	20 %	0 %	20 %	60 %	258513085
102	NC_013210	TGCTC	2	10	186099	186108	0 %	40 %	20 %	40 %	258513085
103	NC_013210	CCGAG	2	10	186696	186705	20 %	0 %	40 %	40 %	258513085
104	NC_013210	CATGC	2	10	187243	187252	20 %	20 %	20 %	40 %	258513086
105	NC_013210	CCTGC	2	10	187823	187832	0 %	20 %	20 %	60 %	258513086
106	NC_013210	ACGAC	2	10	190383	190392	40 %	0 %	20 %	40 %	258513087

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.