MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01 plasmid pAPA01-011

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013210	CTTC	2	8	1376	1383	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_013210	ACGG	2	8	2750	2757	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_013210	GATC	3	12	2946	2957	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_013210	TCGT	2	8	4657	4664	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_013210	AGCC	2	8	5215	5222	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013210	CGGT	2	8	8856	8863	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013210	TTGC	2	8	13612	13619	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_013210	CGAT	2	8	13746	13753	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_013210	GACT	2	8	13860	13867	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013210	ACAG	2	8	15762	15769	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013210	TAAC	2	8	18368	18375	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_013210	TTTG	2	8	18403	18410	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013210	CTGT	2	8	18946	18953	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_013210	TCTT	2	8	25758	25765	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_013210	ACTG	2	8	28228	28235	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_013210	ACAG	2	8	30003	30010	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_013210	GACT	2	8	30803	30810	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_013210	CCAC	2	8	34495	34502	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_013210	CCAT	2	8	37490	37497	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_013210	CCGT	2	8	38723	38730	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_013210	ATCC	2	8	38860	38867	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_013210	ATCC	2	8	39047	39054	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013210	ACAG	2	8	41985	41992	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_013210	ACAG	2	8	43654	43661	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_013210	AATA	2	8	45593	45600	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013210	AGGC	2	8	48483	48490	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_013210	CTTC	2	8	49489	49496	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_013210	GTGA	2	8	49585	49592	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013210	GGTA	2	8	50973	50980	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013210	AAAT	2	8	61296	61303	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013210	CTGT	2	8	63955	63962	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_013210	GGAA	2	8	65498	65505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013210	CTGA	2	8	67826	67833	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_013210	TTTA	2	8	67938	67945	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013210	GTCA	2	8	70253	70260	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_013210	CTTA	2	8	74935	74942	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_013210	CCAG	2	8	75145	75152	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_013210	GATA	2	8	75182	75189	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013210	CTGT	2	8	75523	75530	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_013210	CCTG	2	8	80950	80957	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013210	GTGG	2	8	82014	82021	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013210	CAGG	2	8	82112	82119	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_013210	GAAT	2	8	84634	84641	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013210	CCAT	2	8	84759	84766	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_013210	CAAG	2	8	85912	85919	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_013210	CCGG	2	8	87003	87010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_013210	ATTG	2	8	87048	87055	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013210	CCAG	2	8	88079	88086	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_013210	CGTC	2	8	88279	88286	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_013210	AACT	2	8	88450	88457	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_013210	CTGT	2	8	88913	88920	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_013210	GTTC	2	8	91421	91428	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_013210	AAAG	2	8	91557	91564	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013210	ACTT	2	8	92714	92721	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_013210	TACC	2	8	92748	92755	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013210	ACAG	2	8	94881	94888	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_013210	CTTT	2	8	96125	96132	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_013210	TGTT	2	8	96160	96167	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013210	AGTA	2	8	96300	96307	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013210	AAAT	2	8	96387	96394	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013210	GATG	2	8	100686	100693	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013210	ATTG	2	8	103885	103892	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013210	GTAA	2	8	104096	104103	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013210	GGTA	2	8	104704	104711	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013210	AGAT	2	8	104907	104914	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013210	TTCT	2	8	105239	105246	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_013210	TATT	2	8	105787	105794	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013210	CTTG	2	8	105818	105825	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_013210	GTGA	2	8	107707	107714	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013210	CAAT	2	8	111443	111450	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_013210	CCGC	2	8	124038	124045	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
72	NC_013210	GTGC	2	8	126872	126879	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_013210	TGGA	2	8	128840	128847	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013210	CTGT	2	8	130023	130030	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_013210	TTGA	2	8	132419	132426	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013210	TTGA	2	8	132461	132468	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013210	AGCA	2	8	135885	135892	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_013210	GCCG	2	8	136994	137001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_013210	GGCG	2	8	139043	139050	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
80	NC_013210	ACGA	2	8	140030	140037	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_013210	CTGT	2	8	141125	141132	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_013210	GAAC	2	8	144410	144417	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_013210	ACAG	2	8	146336	146343	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_013210	GCAG	2	8	147021	147028	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_013210	CTGT	2	8	149889	149896	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_013210	CTCA	2	8	152573	152580	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_013210	TCAA	2	8	153996	154003	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_013210	CAAC	2	8	154039	154046	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_013210	GATA	2	8	157701	157708	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013210	ACAG	2	8	161790	161797	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_013210	TGCT	2	8	162115	162122	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_013210	ATTC	2	8	162664	162671	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_013210	CTGT	2	8	164394	164401	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_013210	TCGC	2	8	169535	169542	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_013210	ACGC	2	8	169666	169673	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_013210	TCCT	2	8	174473	174480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_013210	CCAG	2	8	174997	175004	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_013210	TGTA	2	8	175067	175074	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013210	GATA	2	8	180406	180413	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013210	TGAG	2	8	180543	180550	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013210	GTGA	2	8	180609	180616	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013210	ACAG	2	8	182398	182405	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_013210	ACAG	2	8	184079	184086	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_013210	GCCA	2	8	189369	189376	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_013210	GACA	2	8	189788	189795	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_013210	CGGG	2	8	190156	190163	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
107	NC_013210	GAAG	2	8	190703	190710	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013210	TGGA	2	8	191118	191125	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013210	CAAA	2	8	191381	191388	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_013210	TGAC	2	8	191515	191522	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_013210	TCCA	2	8	191688	191695	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.