MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01 plasmid pAPA01-011

Total Repeats: 2325

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_013210	AGA	2	6	165197	165202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258513067
2002	NC_013210	TGC	2	6	165450	165455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258513067
2003	NC_013210	CCT	2	6	165469	165474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258513067
2004	NC_013210	GAC	2	6	165479	165484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513067
2005	NC_013210	GCA	2	6	165634	165639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513067
2006	NC_013210	GCG	2	6	165642	165647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258513067
2007	NC_013210	TCA	2	6	165664	165669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258513067
2008	NC_013210	AGG	2	6	165746	165751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258513067
2009	NC_013210	TGA	2	6	165802	165807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2010	NC_013210	TGC	2	6	165890	165895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2011	NC_013210	GCT	2	6	166026	166031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258513068
2012	NC_013210	CGC	2	6	166086	166091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258513068
2013	NC_013210	AGG	2	6	166139	166144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258513068
2014	NC_013210	CAC	2	6	166173	166178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258513068
2015	NC_013210	GGT	2	6	166296	166301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258513068
2016	NC_013210	GGT	2	6	166396	166401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258513069
2017	NC_013210	CGA	2	6	166413	166418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513069
2018	NC_013210	CTT	2	6	166425	166430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258513069
2019	NC_013210	GAA	2	6	166484	166489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258513069
2020	NC_013210	GAT	2	6	166600	166605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258513069
2021	NC_013210	TGA	2	6	166647	166652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258513069
2022	NC_013210	CAT	2	6	166653	166658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258513069
2023	NC_013210	TCA	2	6	166736	166741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258513069
2024	NC_013210	TTC	2	6	166772	166777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258513069
2025	NC_013210	GCC	2	6	166884	166889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258513069
2026	NC_013210	GAA	2	6	166933	166938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258513069
2027	NC_013210	CCA	2	6	166972	166977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258513069
2028	NC_013210	CGA	2	6	167202	167207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513069
2029	NC_013210	GCG	2	6	167232	167237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258513069
2030	NC_013210	CAA	2	6	167259	167264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258513069
2031	NC_013210	GTA	2	6	167282	167287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258513069
2032	NC_013210	AAG	2	6	167288	167293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258513069
2033	NC_013210	GCC	2	6	167353	167358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258513069
2034	NC_013210	CGT	2	6	167389	167394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258513069
2035	NC_013210	ACG	2	6	167438	167443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513069
2036	NC_013210	ATG	2	6	167502	167507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258513069
2037	NC_013210	TGC	2	6	167515	167520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258513069
2038	NC_013210	CAT	2	6	167571	167576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258513069
2039	NC_013210	CAT	2	6	167652	167657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258513069
2040	NC_013210	CGT	2	6	167663	167668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258513069
2041	NC_013210	GCC	2	6	167815	167820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258513069
2042	NC_013210	CTG	2	6	167866	167871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258513069
2043	NC_013210	TGG	2	6	167877	167882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258513069
2044	NC_013210	CAT	2	6	168090	168095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258513069
2045	NC_013210	GCA	2	6	168187	168192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513070
2046	NC_013210	GCG	2	6	168398	168403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258513070
2047	NC_013210	TCG	2	6	168523	168528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258513070
2048	NC_013210	GAA	2	6	168548	168553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258513070
2049	NC_013210	TCA	2	6	168565	168570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258513070
2050	NC_013210	CTT	2	6	168605	168610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258513070
2051	NC_013210	CGA	2	6	168836	168841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513070
2052	NC_013210	CAC	2	6	169035	169040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258513070
2053	NC_013210	CCG	2	6	169342	169347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258513070
2054	NC_013210	GAT	2	6	169353	169358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258513070
2055	NC_013210	TGC	2	6	169726	169731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258513071
2056	NC_013210	TGC	2	6	169734	169739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258513071
2057	NC_013210	CGG	2	6	169792	169797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258513071
2058	NC_013210	CAC	2	6	169894	169899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258513071
2059	NC_013210	GGT	2	6	169933	169938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258513071
2060	NC_013210	CAC	3	9	169947	169955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258513071
2061	NC_013210	CAG	2	6	170151	170156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513071
2062	NC_013210	CGA	2	6	170200	170205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513071
2063	NC_013210	GCT	2	6	170246	170251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258513071
2064	NC_013210	GAT	2	6	170294	170299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258513071
2065	NC_013210	GCC	3	9	170443	170451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258513071
2066	NC_013210	TGG	2	6	170506	170511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258513071
2067	NC_013210	GCA	2	6	170591	170596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513071
2068	NC_013210	ACG	2	6	170640	170645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513071
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2070	NC_013210	GAA	2	6	170715	170720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258513071
2071	NC_013210	CGT	2	6	170756	170761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258513071
2072	NC_013210	CAC	2	6	170802	170807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258513071
2073	NC_013210	GCC	2	6	170808	170813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258513071
2074	NC_013210	CAG	2	6	171029	171034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513072
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2079	NC_013210	CCA	2	6	171535	171540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258513072
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2082	NC_013210	CAG	2	6	171656	171661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513072
2083	NC_013210	GTG	2	6	171804	171809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258513072
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2085	NC_013210	GCA	2	6	171855	171860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513073
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2087	NC_013210	GCA	2	6	172186	172191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513073
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2089	NC_013210	ATG	2	6	172199	172204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258513073
2090	NC_013210	TCA	2	6	172217	172222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258513073
2091	NC_013210	CGG	2	6	172277	172282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258513073
2092	NC_013210	ACA	2	6	172328	172333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258513073
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2100	NC_013210	CAG	2	6	172985	172990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513074
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2102	NC_013210	TGC	2	6	173302	173307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258513074
2103	NC_013210	GCC	2	6	173400	173405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258513074
2104	NC_013210	GCC	2	6	173560	173565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258513075
2105	NC_013210	CAT	2	6	173618	173623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258513075
2106	NC_013210	AGC	2	6	173734	173739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513075
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2118	NC_013210	GCA	2	6	174438	174443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513075
2119	NC_013210	ACG	2	6	174524	174529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258513076
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2124	NC_013210	TCA	2	6	174708	174713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258513076
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2231	NC_013210	ATC	2	6	182672	182677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2238	NC_013210	TCT	2	6	183278	183283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258513083
2239	NC_013210	CCG	2	6	183357	183362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258513083
2240	NC_013210	TGA	2	6	183443	183448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258513083
2241	NC_013210	GCC	2	6	183550	183555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258513083
2242	NC_013210	CCT	2	6	183584	183589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258513083
2243	NC_013210	CGC	2	6	183619	183624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258513083
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2321	NC_013210	CCT	2	6	191357	191362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2322	NC_013210	TGT	2	6	191420	191425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2323	NC_013210	CTG	2	6	191445	191450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2325	NC_013210	ATC	2	6	191655	191660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.