MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01 plasmid pAPA01-011

Total Repeats: 229

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013210	CG	3	6	422	427	0 %	0 %	50 %	50 %	258512910
2	NC_013210	GC	3	6	1642	1647	0 %	0 %	50 %	50 %	258512913
3	NC_013210	CG	3	6	3554	3559	0 %	0 %	50 %	50 %	258512914
4	NC_013210	TG	3	6	3679	3684	0 %	50 %	50 %	0 %	258512914
5	NC_013210	TG	3	6	3870	3875	0 %	50 %	50 %	0 %	258512914
6	NC_013210	GC	3	6	4264	4269	0 %	0 %	50 %	50 %	258512915
7	NC_013210	TA	3	6	5601	5606	50 %	50 %	0 %	0 %	258512917
8	NC_013210	CG	3	6	5616	5621	0 %	0 %	50 %	50 %	258512917
9	NC_013210	TG	3	6	6660	6665	0 %	50 %	50 %	0 %	258512917
10	NC_013210	AG	3	6	6796	6801	50 %	0 %	50 %	0 %	258512917
11	NC_013210	GA	3	6	10492	10497	50 %	0 %	50 %	0 %	258512921
12	NC_013210	CG	3	6	10969	10974	0 %	0 %	50 %	50 %	258512921
13	NC_013210	CG	3	6	12404	12409	0 %	0 %	50 %	50 %	258512921
14	NC_013210	AG	3	6	12499	12504	50 %	0 %	50 %	0 %	258512921
15	NC_013210	TC	3	6	12843	12848	0 %	50 %	0 %	50 %	258512921
16	NC_013210	CG	3	6	13042	13047	0 %	0 %	50 %	50 %	258512921
17	NC_013210	AG	3	6	13316	13321	50 %	0 %	50 %	0 %	258512921
18	NC_013210	GC	3	6	15254	15259	0 %	0 %	50 %	50 %	258512922
19	NC_013210	CG	3	6	16079	16084	0 %	0 %	50 %	50 %	258512923
20	NC_013210	AC	3	6	17325	17330	50 %	0 %	0 %	50 %	258512924
21	NC_013210	CG	3	6	19455	19460	0 %	0 %	50 %	50 %	258512926
22	NC_013210	GC	3	6	19868	19873	0 %	0 %	50 %	50 %	258512926
23	NC_013210	AG	4	8	20557	20564	50 %	0 %	50 %	0 %	258512927
24	NC_013210	TC	3	6	20622	20627	0 %	50 %	0 %	50 %	258512927
25	NC_013210	AC	3	6	20787	20792	50 %	0 %	0 %	50 %	258512927
26	NC_013210	GC	3	6	21198	21203	0 %	0 %	50 %	50 %	258512928
27	NC_013210	TC	3	6	22255	22260	0 %	50 %	0 %	50 %	258512930
28	NC_013210	GA	4	8	22334	22341	50 %	0 %	50 %	0 %	258512930
29	NC_013210	CT	4	8	24088	24095	0 %	50 %	0 %	50 %	258512931
30	NC_013210	GC	3	6	24239	24244	0 %	0 %	50 %	50 %	258512931
31	NC_013210	GT	3	6	26885	26890	0 %	50 %	50 %	0 %	258512934
32	NC_013210	AG	3	6	27127	27132	50 %	0 %	50 %	0 %	258512934
33	NC_013210	CT	3	6	27964	27969	0 %	50 %	0 %	50 %	258512935
34	NC_013210	GA	3	6	27991	27996	50 %	0 %	50 %	0 %	258512935
35	NC_013210	GC	3	6	29495	29500	0 %	0 %	50 %	50 %	258512936
36	NC_013210	CA	3	6	31304	31309	50 %	0 %	0 %	50 %	258512938
37	NC_013210	AG	3	6	31555	31560	50 %	0 %	50 %	0 %	258512938
38	NC_013210	AC	3	6	32382	32387	50 %	0 %	0 %	50 %	258512939
39	NC_013210	AG	3	6	35004	35009	50 %	0 %	50 %	0 %	258512942
40	NC_013210	GC	3	6	35084	35089	0 %	0 %	50 %	50 %	258512942
41	NC_013210	AC	3	6	35107	35112	50 %	0 %	0 %	50 %	258512942
42	NC_013210	CG	3	6	35285	35290	0 %	0 %	50 %	50 %	258512942
43	NC_013210	CG	3	6	36137	36142	0 %	0 %	50 %	50 %	258512942
44	NC_013210	GT	3	6	36145	36150	0 %	50 %	50 %	0 %	258512942
45	NC_013210	CA	3	6	36677	36682	50 %	0 %	0 %	50 %	258512942
46	NC_013210	CA	3	6	38310	38315	50 %	0 %	0 %	50 %	258512943
47	NC_013210	CA	3	6	38631	38636	50 %	0 %	0 %	50 %	258512944
48	NC_013210	GC	3	6	41477	41482	0 %	0 %	50 %	50 %	258512948
49	NC_013210	GC	3	6	43146	43151	0 %	0 %	50 %	50 %	258512949
50	NC_013210	AC	3	6	45495	45500	50 %	0 %	0 %	50 %	258512951
51	NC_013210	GC	3	6	46538	46543	0 %	0 %	50 %	50 %	258512952
52	NC_013210	CA	3	6	47460	47465	50 %	0 %	0 %	50 %	258512953
53	NC_013210	CG	3	6	48000	48005	0 %	0 %	50 %	50 %	258512953
54	NC_013210	GT	3	6	48678	48683	0 %	50 %	50 %	0 %	258512954
55	NC_013210	TG	3	6	48991	48996	0 %	50 %	50 %	0 %	258512955
56	NC_013210	CT	3	6	49129	49134	0 %	50 %	0 %	50 %	258512955
57	NC_013210	AG	3	6	49811	49816	50 %	0 %	50 %	0 %	258512956
58	NC_013210	AC	3	6	50502	50507	50 %	0 %	0 %	50 %	258512956
59	NC_013210	GT	3	6	51427	51432	0 %	50 %	50 %	0 %	258512957
60	NC_013210	AG	3	6	54255	54260	50 %	0 %	50 %	0 %	258512959
61	NC_013210	CG	3	6	55740	55745	0 %	0 %	50 %	50 %	258512960
62	NC_013210	CG	3	6	56078	56083	0 %	0 %	50 %	50 %	258512960
63	NC_013210	CG	3	6	56821	56826	0 %	0 %	50 %	50 %	258512960
64	NC_013210	CA	3	6	59419	59424	50 %	0 %	0 %	50 %	258512962
65	NC_013210	GC	3	6	59990	59995	0 %	0 %	50 %	50 %	258512962
66	NC_013210	CT	3	6	60161	60166	0 %	50 %	0 %	50 %	258512962
67	NC_013210	TC	3	6	60453	60458	0 %	50 %	0 %	50 %	258512962
68	NC_013210	CG	3	6	60900	60905	0 %	0 %	50 %	50 %	258512963
69	NC_013210	GC	3	6	61732	61737	0 %	0 %	50 %	50 %	258512964
70	NC_013210	CA	3	6	61763	61768	50 %	0 %	0 %	50 %	258512964
71	NC_013210	GC	3	6	61787	61792	0 %	0 %	50 %	50 %	258512964
72	NC_013210	CT	4	8	61813	61820	0 %	50 %	0 %	50 %	258512964
73	NC_013210	AC	3	6	63075	63080	50 %	0 %	0 %	50 %	258512965
74	NC_013210	AC	3	6	63770	63775	50 %	0 %	0 %	50 %	258512965
75	NC_013210	CG	3	6	64464	64469	0 %	0 %	50 %	50 %	258512966
76	NC_013210	TC	3	6	66316	66321	0 %	50 %	0 %	50 %	258512967
77	NC_013210	CA	3	6	67278	67283	50 %	0 %	0 %	50 %	258512968
78	NC_013210	AG	3	6	67556	67561	50 %	0 %	50 %	0 %	258512968
79	NC_013210	AT	3	6	68312	68317	50 %	50 %	0 %	0 %	258512969
80	NC_013210	CT	3	6	68385	68390	0 %	50 %	0 %	50 %	258512969
81	NC_013210	TC	3	6	69102	69107	0 %	50 %	0 %	50 %	258512969
82	NC_013210	TA	3	6	69845	69850	50 %	50 %	0 %	0 %	258512969
83	NC_013210	AG	3	6	70827	70832	50 %	0 %	50 %	0 %	258512970
84	NC_013210	GC	3	6	70938	70943	0 %	0 %	50 %	50 %	258512970
85	NC_013210	GC	3	6	71523	71528	0 %	0 %	50 %	50 %	258512970
86	NC_013210	TG	3	6	71879	71884	0 %	50 %	50 %	0 %	258512971
87	NC_013210	GA	3	6	72023	72028	50 %	0 %	50 %	0 %	258512971
88	NC_013210	GC	3	6	73175	73180	0 %	0 %	50 %	50 %	258512973
89	NC_013210	CT	4	8	74621	74628	0 %	50 %	0 %	50 %	258512974
90	NC_013210	TC	3	6	74691	74696	0 %	50 %	0 %	50 %	258512974
91	NC_013210	CG	3	6	76032	76037	0 %	0 %	50 %	50 %	258512975
92	NC_013210	CG	4	8	80190	80197	0 %	0 %	50 %	50 %	258512977
93	NC_013210	GA	3	6	80563	80568	50 %	0 %	50 %	0 %	258512977
94	NC_013210	GC	3	6	80805	80810	0 %	0 %	50 %	50 %	258512977
95	NC_013210	CA	3	6	82966	82971	50 %	0 %	0 %	50 %	258512979
96	NC_013210	TG	3	6	83334	83339	0 %	50 %	50 %	0 %	258512980
97	NC_013210	CA	3	6	85579	85584	50 %	0 %	0 %	50 %	258512982
98	NC_013210	CG	3	6	89422	89427	0 %	0 %	50 %	50 %	258512985
99	NC_013210	GC	3	6	89835	89840	0 %	0 %	50 %	50 %	258512985
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102	NC_013210	GC	3	6	95994	95999	0 %	0 %	50 %	50 %	258512992
103	NC_013210	GA	3	6	96522	96527	50 %	0 %	50 %	0 %	258512993
104	NC_013210	GA	3	6	96852	96857	50 %	0 %	50 %	0 %	258512993
105	NC_013210	TG	3	6	97021	97026	0 %	50 %	50 %	0 %	258512993
106	NC_013210	AT	3	6	97613	97618	50 %	50 %	0 %	0 %	258512993
107	NC_013210	GC	3	6	98303	98308	0 %	0 %	50 %	50 %	258512994
108	NC_013210	CT	3	6	98489	98494	0 %	50 %	0 %	50 %	258512994
109	NC_013210	GA	3	6	98517	98522	50 %	0 %	50 %	0 %	258512995
110	NC_013210	TG	3	6	98562	98567	0 %	50 %	50 %	0 %	258512995
111	NC_013210	CT	3	6	99457	99462	0 %	50 %	0 %	50 %	258512995
112	NC_013210	GC	3	6	101061	101066	0 %	0 %	50 %	50 %	258512996
113	NC_013210	GC	3	6	101733	101738	0 %	0 %	50 %	50 %	258512996
114	NC_013210	GC	3	6	102186	102191	0 %	0 %	50 %	50 %	258512996
115	NC_013210	TG	3	6	103270	103275	0 %	50 %	50 %	0 %	258512998
116	NC_013210	GC	3	6	106075	106080	0 %	0 %	50 %	50 %	258513001
117	NC_013210	AG	3	6	106188	106193	50 %	0 %	50 %	0 %	258513001
118	NC_013210	CT	3	6	107082	107087	0 %	50 %	0 %	50 %	258513002
119	NC_013210	TG	3	6	107449	107454	0 %	50 %	50 %	0 %	258513003
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122	NC_013210	AC	3	6	108624	108629	50 %	0 %	0 %	50 %	258513004
123	NC_013210	GC	3	6	110647	110652	0 %	0 %	50 %	50 %	258513006
124	NC_013210	CA	3	6	110725	110730	50 %	0 %	0 %	50 %	258513006
125	NC_013210	TC	3	6	110930	110935	0 %	50 %	0 %	50 %	258513007
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127	NC_013210	AC	3	6	114314	114319	50 %	0 %	0 %	50 %	258513011
128	NC_013210	TC	3	6	115664	115669	0 %	50 %	0 %	50 %	258513012
129	NC_013210	GA	3	6	116146	116151	50 %	0 %	50 %	0 %	258513012
130	NC_013210	GC	3	6	116172	116177	0 %	0 %	50 %	50 %	258513012
131	NC_013210	CT	3	6	117031	117036	0 %	50 %	0 %	50 %	258513012
132	NC_013210	CG	3	6	117962	117967	0 %	0 %	50 %	50 %	258513013
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138	NC_013210	CT	3	6	120741	120746	0 %	50 %	0 %	50 %	258513016
139	NC_013210	CA	3	6	120918	120923	50 %	0 %	0 %	50 %	258513016
140	NC_013210	CG	3	6	121485	121490	0 %	0 %	50 %	50 %	258513017
141	NC_013210	CA	3	6	122305	122310	50 %	0 %	0 %	50 %	258513018
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.