MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 plasmid pAACI03

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013208	TG	3	6	275	280	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013208	GC	3	6	969	974	0 %	0 %	50 %	50 %	257793137
3	NC_013208	CG	3	6	1124	1129	0 %	0 %	50 %	50 %	257793137
4	NC_013208	AG	3	6	2125	2130	50 %	0 %	50 %	0 %	257793137
5	NC_013208	AG	3	6	2731	2736	50 %	0 %	50 %	0 %	257793137
6	NC_013208	AC	3	6	2764	2769	50 %	0 %	0 %	50 %	257793137
7	NC_013208	CG	3	6	3466	3471	0 %	0 %	50 %	50 %	257793137
8	NC_013208	CA	3	6	3592	3597	50 %	0 %	0 %	50 %	257793137
9	NC_013208	AC	3	6	3938	3943	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013208	AG	3	6	3990	3995	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013208	GA	4	8	4059	4066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013208	TG	3	6	4206	4211	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013208	GC	3	6	4990	4995	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_013208	CG	3	6	5044	5049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_013208	CG	3	6	5176	5181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013208	GC	3	6	5512	5517	0 %	0 %	50 %	50 %	257793138
17	NC_013208	AT	3	6	6650	6655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013208	CG	3	6	7214	7219	0 %	0 %	50 %	50 %	257793140
19	NC_013208	AC	3	6	7376	7381	50 %	0 %	0 %	50 %	257793141
20	NC_013208	GT	3	6	7571	7576	0 %	50 %	50 %	0 %	257793141
21	NC_013208	GC	3	6	7868	7873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_013208	GC	3	6	7877	7882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.