MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 plasmid pAACI02

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013207	TATG	2	8	1267	1274	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013207	TTTG	2	8	2947	2954	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013207	GTAT	2	8	3000	3007	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013207	ATGG	2	8	7251	7258	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013207	ATGG	2	8	8892	8899	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013207	GATG	2	8	12482	12489	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013207	ACCA	2	8	14585	14592	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_013207	GGTA	2	8	14750	14757	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013207	AAGG	2	8	14809	14816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013207	ATGC	2	8	15462	15469	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013207	CGAG	2	8	15534	15541	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_013207	GACC	2	8	15731	15738	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_013207	GGAA	2	8	15916	15923	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013207	TGAA	2	8	16643	16650	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013207	GTAC	2	8	17074	17081	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_013207	GCGG	2	8	17369	17376	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17	NC_013207	CTTC	2	8	17433	17440	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_013207	CATA	2	8	17619	17626	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_013207	ACGT	2	8	23473	23480	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_013207	ATAG	2	8	23634	23641	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013207	ATCG	2	8	23793	23800	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_013207	CGTC	2	8	25118	25125	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013207	GAAA	2	8	26799	26806	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013207	GCAC	2	8	27237	27244	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_013207	GATA	2	8	27366	27373	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013207	TTGA	2	8	27397	27404	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013207	GGTG	2	8	27528	27535	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013207	TGAG	2	8	28545	28552	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013207	GCTG	2	8	28618	28625	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013207	ACAA	2	8	28958	28965	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_013207	TCCA	2	8	31540	31547	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013207	TGGA	2	8	32042	32049	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013207	TTTG	2	8	32067	32074	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013207	CCCT	2	8	32087	32094	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
35	NC_013207	TCCC	2	8	32247	32254	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
36	NC_013207	TTCC	2	8	32480	32487	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013207	ATTG	2	8	33114	33121	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013207	AACG	2	8	33252	33259	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_013207	GAAT	2	8	33307	33314	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013207	TGCC	2	8	33438	33445	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013207	CAAG	2	8	33724	33731	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_013207	TCGA	2	8	33850	33857	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_013207	TGCC	2	8	33961	33968	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_013207	AACG	2	8	34142	34149	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_013207	CGGA	2	8	34708	34715	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_013207	GGTT	2	8	34720	34727	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013207	TAAA	2	8	34998	35005	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013207	TCCC	2	8	41055	41062	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
49	NC_013207	GTGG	2	8	41571	41578	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013207	GTTT	2	8	43419	43426	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013207	GACA	2	8	43671	43678	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_013207	GTGC	2	8	44971	44978	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_013207	TCTG	2	8	44983	44990	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_013207	GGGA	2	8	52227	52234	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013207	TTTG	2	8	52899	52906	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013207	GAGG	2	8	55415	55422	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013207	CTTT	2	8	55724	55731	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_013207	GGAG	2	8	70952	70959	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013207	GAGG	2	8	73530	73537	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013207	TCGG	2	8	75105	75112	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_013207	GGAT	2	8	77919	77926	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013207	GCTG	2	8	78209	78216	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_013207	GCGA	2	8	78261	78268	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_013207	TGAG	2	8	79512	79519	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.