Tetra-nucleotide Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 plasmid pAACI02
Total Repeats: 160
S.No. | Genome ID | Motif | Iterations | Length | Start | End | A% | T% | G% | C% | Protein ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | NC_013207 | AGTA | 2 | 8 | 356 | 363 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 257793043 |
2 | NC_013207 | CAGT | 2 | 8 | 2115 | 2122 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 257793045 |
3 | NC_013207 | GTCG | 2 | 8 | 2220 | 2227 | 0 % | 25 % | 50 % | 25 % | 257793045 |
4 | NC_013207 | TCAT | 2 | 8 | 3408 | 3415 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 257793048 |
5 | NC_013207 | CACG | 2 | 8 | 3748 | 3755 | 25 % | 0 % | 25 % | 50 % | 257793048 |
6 | NC_013207 | GAAG | 2 | 8 | 3814 | 3821 | 50 % | 0 % | 50 % | 0 % | 257793048 |
7 | NC_013207 | CCGA | 2 | 8 | 4199 | 4206 | 25 % | 0 % | 25 % | 50 % | 257793048 |
8 | NC_013207 | CCAT | 2 | 8 | 4817 | 4824 | 25 % | 25 % | 0 % | 50 % | 257793048 |
9 | NC_013207 | CGTG | 2 | 8 | 4902 | 4909 | 0 % | 25 % | 50 % | 25 % | 257793049 |
10 | NC_013207 | CGAG | 2 | 8 | 5265 | 5272 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 257793049 |
11 | NC_013207 | TGGA | 2 | 8 | 5855 | 5862 | 25 % | 25 % | 50 % | 0 % | 257793049 |
12 | NC_013207 | CGGA | 2 | 8 | 6273 | 6280 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 257793049 |
13 | NC_013207 | CAGT | 2 | 8 | 8293 | 8300 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 257793050 |
14 | NC_013207 | TCCA | 2 | 8 | 8370 | 8377 | 25 % | 25 % | 0 % | 50 % | 257793050 |
15 | NC_013207 | CATC | 2 | 8 | 9219 | 9226 | 25 % | 25 % | 0 % | 50 % | 257793051 |
16 | NC_013207 | GGCA | 2 | 8 | 9521 | 9528 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 257793051 |
17 | NC_013207 | TTCG | 2 | 8 | 10454 | 10461 | 0 % | 50 % | 25 % | 25 % | 257793051 |
18 | NC_013207 | GCTG | 2 | 8 | 10475 | 10482 | 0 % | 25 % | 50 % | 25 % | 257793051 |
19 | NC_013207 | GATG | 2 | 8 | 11833 | 11840 | 25 % | 25 % | 50 % | 0 % | 257793052 |
20 | NC_013207 | CCGG | 2 | 8 | 11960 | 11967 | 0 % | 0 % | 50 % | 50 % | 257793052 |
21 | NC_013207 | ATGT | 2 | 8 | 12308 | 12315 | 25 % | 50 % | 25 % | 0 % | 257793052 |
22 | NC_013207 | TCGC | 2 | 8 | 13109 | 13116 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 257793053 |
23 | NC_013207 | CGCT | 2 | 8 | 13433 | 13440 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 257793053 |
24 | NC_013207 | CATT | 2 | 8 | 13528 | 13535 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 257793054 |
25 | NC_013207 | GACG | 2 | 8 | 14206 | 14213 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 257793055 |
26 | NC_013207 | AATG | 2 | 8 | 14243 | 14250 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 257793055 |
27 | NC_013207 | CCCT | 2 | 8 | 14260 | 14267 | 0 % | 25 % | 0 % | 75 % | 257793055 |
28 | NC_013207 | GGTT | 2 | 8 | 14533 | 14540 | 0 % | 50 % | 50 % | 0 % | 257793055 |
29 | NC_013207 | AGCG | 2 | 8 | 16168 | 16175 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 257793057 |
30 | NC_013207 | CGAT | 2 | 8 | 17021 | 17028 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 257793058 |
31 | NC_013207 | GGCC | 2 | 8 | 18031 | 18038 | 0 % | 0 % | 50 % | 50 % | 257793059 |
32 | NC_013207 | TCGA | 2 | 8 | 18042 | 18049 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 257793059 |
33 | NC_013207 | ATCA | 2 | 8 | 18294 | 18301 | 50 % | 25 % | 0 % | 25 % | 257793059 |
34 | NC_013207 | CCCG | 2 | 8 | 19126 | 19133 | 0 % | 0 % | 25 % | 75 % | 257793059 |
35 | NC_013207 | GACG | 2 | 8 | 19635 | 19642 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 257793060 |
36 | NC_013207 | GGAC | 2 | 8 | 19892 | 19899 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 257793060 |
37 | NC_013207 | AGTC | 2 | 8 | 19940 | 19947 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 257793060 |
38 | NC_013207 | TCAT | 2 | 8 | 20347 | 20354 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 257793060 |
39 | NC_013207 | GGCG | 2 | 8 | 20508 | 20515 | 0 % | 0 % | 75 % | 25 % | 257793061 |
40 | NC_013207 | CATG | 2 | 8 | 20840 | 20847 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 257793062 |
41 | NC_013207 | TCCG | 2 | 8 | 21133 | 21140 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 257793062 |
42 | NC_013207 | CGTC | 2 | 8 | 21295 | 21302 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 257793062 |
43 | NC_013207 | CTTA | 2 | 8 | 21357 | 21364 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 257793062 |
44 | NC_013207 | GCCA | 2 | 8 | 22202 | 22209 | 25 % | 0 % | 25 % | 50 % | 257793064 |
45 | NC_013207 | GCAT | 2 | 8 | 22498 | 22505 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 257793064 |
46 | NC_013207 | TGCC | 2 | 8 | 22660 | 22667 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 257793064 |
47 | NC_013207 | GTTT | 2 | 8 | 23177 | 23184 | 0 % | 75 % | 25 % | 0 % | 257793064 |
48 | NC_013207 | TTGT | 2 | 8 | 24043 | 24050 | 0 % | 75 % | 25 % | 0 % | 257793065 |
49 | NC_013207 | GGCC | 2 | 8 | 24114 | 24121 | 0 % | 0 % | 50 % | 50 % | 257793065 |
50 | NC_013207 | GTCG | 2 | 8 | 24489 | 24496 | 0 % | 25 % | 50 % | 25 % | 257793065 |
51 | NC_013207 | AATA | 2 | 8 | 28061 | 28068 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 257793066 |
52 | NC_013207 | GAAA | 2 | 8 | 29388 | 29395 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 257793067 |
53 | NC_013207 | TTCG | 2 | 8 | 29505 | 29512 | 0 % | 50 % | 25 % | 25 % | 257793067 |
54 | NC_013207 | GCGG | 2 | 8 | 29745 | 29752 | 0 % | 0 % | 75 % | 25 % | 257793067 |
55 | NC_013207 | AATC | 2 | 8 | 29938 | 29945 | 50 % | 25 % | 0 % | 25 % | 257793068 |
56 | NC_013207 | ACAG | 2 | 8 | 30020 | 30027 | 50 % | 0 % | 25 % | 25 % | 257793068 |
57 | NC_013207 | TGAA | 2 | 8 | 30623 | 30630 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 257793068 |
58 | NC_013207 | TCAT | 2 | 8 | 30812 | 30819 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 257793068 |
59 | NC_013207 | TCAT | 2 | 8 | 31235 | 31242 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 257793068 |
60 | NC_013207 | GATG | 2 | 8 | 32919 | 32926 | 25 % | 25 % | 50 % | 0 % | 257793071 |
61 | NC_013207 | ATTC | 2 | 8 | 33064 | 33071 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 257793071 |
62 | NC_013207 | CATG | 2 | 8 | 35343 | 35350 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 257793072 |
63 | NC_013207 | TGTT | 2 | 8 | 35410 | 35417 | 0 % | 75 % | 25 % | 0 % | 257793072 |
64 | NC_013207 | GACC | 2 | 8 | 35597 | 35604 | 25 % | 0 % | 25 % | 50 % | 257793073 |
65 | NC_013207 | GAAG | 2 | 8 | 36083 | 36090 | 50 % | 0 % | 50 % | 0 % | 257793073 |
66 | NC_013207 | TCTT | 2 | 8 | 36456 | 36463 | 0 % | 75 % | 0 % | 25 % | 257793073 |
67 | NC_013207 | ATCG | 2 | 8 | 37478 | 37485 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 257793074 |
68 | NC_013207 | ATCC | 2 | 8 | 37986 | 37993 | 25 % | 25 % | 0 % | 50 % | 257793074 |
69 | NC_013207 | AGGA | 2 | 8 | 38070 | 38077 | 50 % | 0 % | 50 % | 0 % | 257793074 |
70 | NC_013207 | TGGA | 2 | 8 | 38775 | 38782 | 25 % | 25 % | 50 % | 0 % | 257793074 |
71 | NC_013207 | TTCT | 2 | 8 | 38871 | 38878 | 0 % | 75 % | 0 % | 25 % | 257793074 |
72 | NC_013207 | GTGG | 2 | 8 | 39028 | 39035 | 0 % | 25 % | 75 % | 0 % | 257793074 |
73 | NC_013207 | TCGT | 2 | 8 | 39666 | 39673 | 0 % | 50 % | 25 % | 25 % | 257793074 |
74 | NC_013207 | TCGG | 2 | 8 | 40892 | 40899 | 0 % | 25 % | 50 % | 25 % | 257793076 |
75 | NC_013207 | ACGA | 2 | 8 | 41506 | 41513 | 50 % | 0 % | 25 % | 25 % | 257793078 |
76 | NC_013207 | TGGG | 2 | 8 | 42726 | 42733 | 0 % | 25 % | 75 % | 0 % | 257793080 |
77 | NC_013207 | GGCT | 2 | 8 | 43747 | 43754 | 0 % | 25 % | 50 % | 25 % | 257793082 |
78 | NC_013207 | GAAA | 2 | 8 | 43838 | 43845 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 257793082 |
79 | NC_013207 | TTTG | 2 | 8 | 44138 | 44145 | 0 % | 75 % | 25 % | 0 % | 257793083 |
80 | NC_013207 | GTCG | 2 | 8 | 44568 | 44575 | 0 % | 25 % | 50 % | 25 % | 257793083 |
81 | NC_013207 | ATGG | 2 | 8 | 44589 | 44596 | 25 % | 25 % | 50 % | 0 % | 257793083 |
82 | NC_013207 | TTCA | 2 | 8 | 44662 | 44669 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 257793083 |
83 | NC_013207 | ATGA | 2 | 8 | 45408 | 45415 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 257793084 |
84 | NC_013207 | GCAT | 2 | 8 | 45532 | 45539 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 257793084 |
85 | NC_013207 | CCGT | 2 | 8 | 45603 | 45610 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 257793084 |
86 | NC_013207 | CCTT | 2 | 8 | 45611 | 45618 | 0 % | 50 % | 0 % | 50 % | 257793084 |
87 | NC_013207 | GCCT | 2 | 8 | 45687 | 45694 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 257793084 |
88 | NC_013207 | CGGG | 2 | 8 | 45949 | 45956 | 0 % | 0 % | 75 % | 25 % | 257793085 |
89 | NC_013207 | GCAG | 2 | 8 | 47358 | 47365 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 257793086 |
90 | NC_013207 | GAGC | 2 | 8 | 47522 | 47529 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 257793086 |
91 | NC_013207 | GTGG | 2 | 8 | 47913 | 47920 | 0 % | 25 % | 75 % | 0 % | 257793086 |
92 | NC_013207 | AATC | 2 | 8 | 48222 | 48229 | 50 % | 25 % | 0 % | 25 % | 257793086 |
93 | NC_013207 | ATCA | 2 | 8 | 48731 | 48738 | 50 % | 25 % | 0 % | 25 % | 257793087 |
94 | NC_013207 | ATGT | 2 | 8 | 48957 | 48964 | 25 % | 50 % | 25 % | 0 % | 257793087 |
95 | NC_013207 | GTGG | 2 | 8 | 49422 | 49429 | 0 % | 25 % | 75 % | 0 % | 257793087 |
96 | NC_013207 | ACCA | 2 | 8 | 49671 | 49678 | 50 % | 0 % | 0 % | 50 % | 257793087 |
97 | NC_013207 | AGCC | 2 | 8 | 49917 | 49924 | 25 % | 0 % | 25 % | 50 % | 257793087 |
98 | NC_013207 | ACGA | 2 | 8 | 50775 | 50782 | 50 % | 0 % | 25 % | 25 % | 257793087 |
99 | NC_013207 | ATGT | 2 | 8 | 51243 | 51250 | 25 % | 50 % | 25 % | 0 % | 257793087 |
100 | NC_013207 | AAGC | 2 | 8 | 51796 | 51803 | 50 % | 0 % | 25 % | 25 % | 257793089 |
101 | NC_013207 | TGAA | 2 | 8 | 52161 | 52168 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 257793089 |
102 | NC_013207 | GCGG | 2 | 8 | 53765 | 53772 | 0 % | 0 % | 75 % | 25 % | 257793091 |
103 | NC_013207 | GTTG | 2 | 8 | 54801 | 54808 | 0 % | 50 % | 50 % | 0 % | 257793092 |
104 | NC_013207 | GACG | 2 | 8 | 55951 | 55958 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 257793094 |
105 | NC_013207 | ACAT | 2 | 8 | 56879 | 56886 | 50 % | 25 % | 0 % | 25 % | 257793096 |
106 | NC_013207 | TTCT | 2 | 8 | 57290 | 57297 | 0 % | 75 % | 0 % | 25 % | 257793096 |
107 | NC_013207 | TGCC | 2 | 8 | 58911 | 58918 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 257793099 |
108 | NC_013207 | TGGC | 2 | 8 | 59494 | 59501 | 0 % | 25 % | 50 % | 25 % | 257793101 |
109 | NC_013207 | CGAT | 2 | 8 | 60367 | 60374 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 257793102 |
110 | NC_013207 | CTTG | 2 | 8 | 61703 | 61710 | 0 % | 50 % | 25 % | 25 % | 257793102 |
111 | NC_013207 | CGTC | 2 | 8 | 62286 | 62293 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 257793102 |
112 | NC_013207 | CATC | 2 | 8 | 62564 | 62571 | 25 % | 25 % | 0 % | 50 % | 257793103 |
113 | NC_013207 | GACG | 2 | 8 | 63880 | 63887 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 257793103 |
114 | NC_013207 | ACGC | 2 | 8 | 64393 | 64400 | 25 % | 0 % | 25 % | 50 % | 257793103 |
115 | NC_013207 | CGTC | 2 | 8 | 65199 | 65206 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 257793103 |
116 | NC_013207 | CGTC | 2 | 8 | 65733 | 65740 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 257793104 |
117 | NC_013207 | GCGG | 2 | 8 | 65918 | 65925 | 0 % | 0 % | 75 % | 25 % | 257793104 |
118 | NC_013207 | TGAT | 2 | 8 | 66909 | 66916 | 25 % | 50 % | 25 % | 0 % | 257793105 |
119 | NC_013207 | GATT | 2 | 8 | 68495 | 68502 | 25 % | 50 % | 25 % | 0 % | 257793107 |
120 | NC_013207 | TTCA | 2 | 8 | 69090 | 69097 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 257793107 |
121 | NC_013207 | TCGA | 2 | 8 | 69688 | 69695 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 257793107 |
122 | NC_013207 | GGCG | 2 | 8 | 70210 | 70217 | 0 % | 0 % | 75 % | 25 % | 257793108 |
123 | NC_013207 | GATG | 2 | 8 | 70257 | 70264 | 25 % | 25 % | 50 % | 0 % | 257793108 |
124 | NC_013207 | CGTC | 2 | 8 | 70282 | 70289 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 257793108 |
125 | NC_013207 | GTTG | 2 | 8 | 71094 | 71101 | 0 % | 50 % | 50 % | 0 % | 257793109 |
126 | NC_013207 | GTTG | 2 | 8 | 71130 | 71137 | 0 % | 50 % | 50 % | 0 % | 257793109 |
127 | NC_013207 | TATG | 2 | 8 | 71175 | 71182 | 25 % | 50 % | 25 % | 0 % | 257793109 |
128 | NC_013207 | TCAT | 2 | 8 | 71208 | 71215 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 257793109 |
129 | NC_013207 | ATGG | 2 | 8 | 71429 | 71436 | 25 % | 25 % | 50 % | 0 % | 257793109 |
130 | NC_013207 | CGGA | 2 | 8 | 72058 | 72065 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 257793110 |
131 | NC_013207 | TCGG | 2 | 8 | 72068 | 72075 | 0 % | 25 % | 50 % | 25 % | 257793110 |
132 | NC_013207 | TCGC | 2 | 8 | 72214 | 72221 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 257793110 |
133 | NC_013207 | TTCA | 2 | 8 | 72494 | 72501 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 257793111 |
134 | NC_013207 | ACGA | 2 | 8 | 72852 | 72859 | 50 % | 0 % | 25 % | 25 % | 257793112 |
135 | NC_013207 | AAGC | 2 | 8 | 73707 | 73714 | 50 % | 0 % | 25 % | 25 % | 257793115 |
136 | NC_013207 | CATC | 2 | 8 | 73839 | 73846 | 25 % | 25 % | 0 % | 50 % | 257793116 |
137 | NC_013207 | GGAT | 2 | 8 | 74410 | 74417 | 25 % | 25 % | 50 % | 0 % | 257793117 |
138 | NC_013207 | GCAG | 2 | 8 | 74964 | 74971 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 257793118 |
139 | NC_013207 | ACGG | 2 | 8 | 75306 | 75313 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 257793119 |
140 | NC_013207 | TGCG | 2 | 8 | 75790 | 75797 | 0 % | 25 % | 50 % | 25 % | 257793119 |
141 | NC_013207 | ACGC | 2 | 8 | 75814 | 75821 | 25 % | 0 % | 25 % | 50 % | 257793119 |
142 | NC_013207 | CTCG | 2 | 8 | 75877 | 75884 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 257793119 |
143 | NC_013207 | TCCG | 2 | 8 | 76331 | 76338 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 257793119 |
144 | NC_013207 | GGGC | 2 | 8 | 76899 | 76906 | 0 % | 0 % | 75 % | 25 % | 257793120 |
145 | NC_013207 | GGGA | 2 | 8 | 77565 | 77572 | 25 % | 0 % | 75 % | 0 % | 257793121 |
146 | NC_013207 | GGCG | 2 | 8 | 80304 | 80311 | 0 % | 0 % | 75 % | 25 % | 257793126 |
147 | NC_013207 | TGGC | 2 | 8 | 80638 | 80645 | 0 % | 25 % | 50 % | 25 % | 257793126 |
148 | NC_013207 | AGCG | 2 | 8 | 81014 | 81021 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 257793126 |
149 | NC_013207 | GCGA | 2 | 8 | 81222 | 81229 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 257793126 |
150 | NC_013207 | AGCG | 2 | 8 | 81267 | 81274 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 257793126 |
151 | NC_013207 | CCGC | 2 | 8 | 81984 | 81991 | 0 % | 0 % | 25 % | 75 % | 257793127 |
152 | NC_013207 | TCGA | 2 | 8 | 82126 | 82133 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 257793128 |
153 | NC_013207 | CGAT | 2 | 8 | 82365 | 82372 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 257793128 |
154 | NC_013207 | TGGC | 2 | 8 | 83910 | 83917 | 0 % | 25 % | 50 % | 25 % | 257793129 |
155 | NC_013207 | TGGT | 2 | 8 | 84249 | 84256 | 0 % | 50 % | 50 % | 0 % | 257793130 |
156 | NC_013207 | ATGG | 2 | 8 | 84725 | 84732 | 25 % | 25 % | 50 % | 0 % | 257793130 |
157 | NC_013207 | ATCC | 2 | 8 | 85439 | 85446 | 25 % | 25 % | 0 % | 50 % | 257793131 |
158 | NC_013207 | GGCT | 2 | 8 | 85975 | 85982 | 0 % | 25 % | 50 % | 25 % | 257793132 |
159 | NC_013207 | TTGT | 2 | 8 | 86431 | 86438 | 0 % | 75 % | 25 % | 0 % | 257793133 |
160 | NC_013207 | ATCT | 2 | 8 | 86687 | 86694 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 257793133 |