MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 plasmid pAACI02

Total Repeats: 136

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013207	CG	3	6	84	89	0 %	0 %	50 %	50 %	257793043
2	NC_013207	CG	3	6	230	235	0 %	0 %	50 %	50 %	257793043
3	NC_013207	GA	3	6	266	271	50 %	0 %	50 %	0 %	257793043
4	NC_013207	TC	3	6	3224	3229	0 %	50 %	0 %	50 %	257793048
5	NC_013207	CG	3	6	3385	3390	0 %	0 %	50 %	50 %	257793048
6	NC_013207	CG	3	6	3571	3576	0 %	0 %	50 %	50 %	257793048
7	NC_013207	GC	3	6	4125	4130	0 %	0 %	50 %	50 %	257793048
8	NC_013207	GC	3	6	4696	4701	0 %	0 %	50 %	50 %	257793048
9	NC_013207	GC	4	8	5427	5434	0 %	0 %	50 %	50 %	257793049
10	NC_013207	GC	3	6	5712	5717	0 %	0 %	50 %	50 %	257793049
11	NC_013207	CG	3	6	9433	9438	0 %	0 %	50 %	50 %	257793051
12	NC_013207	AG	3	6	9891	9896	50 %	0 %	50 %	0 %	257793051
13	NC_013207	GC	3	6	9985	9990	0 %	0 %	50 %	50 %	257793051
14	NC_013207	AG	3	6	11841	11846	50 %	0 %	50 %	0 %	257793052
15	NC_013207	CA	3	6	12248	12253	50 %	0 %	0 %	50 %	257793052
16	NC_013207	AT	3	6	12930	12935	50 %	50 %	0 %	0 %	257793053
17	NC_013207	TC	3	6	14060	14065	0 %	50 %	0 %	50 %	257793055
18	NC_013207	CG	3	6	20548	20553	0 %	0 %	50 %	50 %	257793061
19	NC_013207	TG	3	6	20556	20561	0 %	50 %	50 %	0 %	257793061
20	NC_013207	AG	3	6	21706	21711	50 %	0 %	50 %	0 %	257793062
21	NC_013207	GA	3	6	22466	22471	50 %	0 %	50 %	0 %	257793064
22	NC_013207	CG	3	6	22593	22598	0 %	0 %	50 %	50 %	257793064
23	NC_013207	CT	3	6	23044	23049	0 %	50 %	0 %	50 %	257793064
24	NC_013207	TG	3	6	23928	23933	0 %	50 %	50 %	0 %	257793065
25	NC_013207	AG	3	6	24099	24104	50 %	0 %	50 %	0 %	257793065
26	NC_013207	CG	3	6	27984	27989	0 %	0 %	50 %	50 %	257793066
27	NC_013207	GA	3	6	29247	29252	50 %	0 %	50 %	0 %	257793067
28	NC_013207	TA	3	6	29406	29411	50 %	50 %	0 %	0 %	257793067
29	NC_013207	AG	3	6	29878	29883	50 %	0 %	50 %	0 %	257793068
30	NC_013207	AT	3	6	29977	29982	50 %	50 %	0 %	0 %	257793068
31	NC_013207	GC	4	8	30846	30853	0 %	0 %	50 %	50 %	257793068
32	NC_013207	TG	3	6	35978	35983	0 %	50 %	50 %	0 %	257793073
33	NC_013207	CA	3	6	36028	36033	50 %	0 %	0 %	50 %	257793073
34	NC_013207	AT	3	6	36544	36549	50 %	50 %	0 %	0 %	257793073
35	NC_013207	CG	3	6	37326	37331	0 %	0 %	50 %	50 %	257793074
36	NC_013207	GC	3	6	40392	40397	0 %	0 %	50 %	50 %	257793075
37	NC_013207	CA	3	6	40407	40412	50 %	0 %	0 %	50 %	257793075
38	NC_013207	AC	3	6	40413	40418	50 %	0 %	0 %	50 %	257793075
39	NC_013207	TG	3	6	41865	41870	0 %	50 %	50 %	0 %	257793079
40	NC_013207	GC	3	6	41933	41938	0 %	0 %	50 %	50 %	257793079
41	NC_013207	GC	4	8	42701	42708	0 %	0 %	50 %	50 %	257793080
42	NC_013207	GT	3	6	42709	42714	0 %	50 %	50 %	0 %	257793080
43	NC_013207	GT	3	6	42755	42760	0 %	50 %	50 %	0 %	257793080
44	NC_013207	GC	3	6	43020	43025	0 %	0 %	50 %	50 %	257793081
45	NC_013207	GC	3	6	43029	43034	0 %	0 %	50 %	50 %	257793081
46	NC_013207	TG	3	6	43190	43195	0 %	50 %	50 %	0 %	257793081
47	NC_013207	GC	4	8	44224	44231	0 %	0 %	50 %	50 %	257793083
48	NC_013207	AG	3	6	44391	44396	50 %	0 %	50 %	0 %	257793083
49	NC_013207	AG	3	6	46159	46164	50 %	0 %	50 %	0 %	257793085
50	NC_013207	GC	3	6	47051	47056	0 %	0 %	50 %	50 %	257793086
51	NC_013207	GC	3	6	49291	49296	0 %	0 %	50 %	50 %	257793087
52	NC_013207	AT	3	6	50915	50920	50 %	50 %	0 %	0 %	257793087
53	NC_013207	GC	3	6	54002	54007	0 %	0 %	50 %	50 %	257793091
54	NC_013207	CG	3	6	54103	54108	0 %	0 %	50 %	50 %	257793091
55	NC_013207	CG	4	8	55087	55094	0 %	0 %	50 %	50 %	257793093
56	NC_013207	GT	3	6	55861	55866	0 %	50 %	50 %	0 %	257793094
57	NC_013207	CG	3	6	56025	56030	0 %	0 %	50 %	50 %	257793094
58	NC_013207	CG	3	6	56051	56056	0 %	0 %	50 %	50 %	257793094
59	NC_013207	AC	3	6	57199	57204	50 %	0 %	0 %	50 %	257793096
60	NC_013207	GC	3	6	57375	57380	0 %	0 %	50 %	50 %	257793097
61	NC_013207	CG	3	6	58969	58974	0 %	0 %	50 %	50 %	257793099
62	NC_013207	GC	3	6	59972	59977	0 %	0 %	50 %	50 %	257793102
63	NC_013207	CG	3	6	60030	60035	0 %	0 %	50 %	50 %	257793102
64	NC_013207	GC	3	6	60129	60134	0 %	0 %	50 %	50 %	257793102
65	NC_013207	CA	3	6	60302	60307	50 %	0 %	0 %	50 %	257793102
66	NC_013207	GC	4	8	60683	60690	0 %	0 %	50 %	50 %	257793102
67	NC_013207	CG	3	6	60691	60696	0 %	0 %	50 %	50 %	257793102
68	NC_013207	GC	3	6	60982	60987	0 %	0 %	50 %	50 %	257793102
69	NC_013207	GC	3	6	61010	61015	0 %	0 %	50 %	50 %	257793102
70	NC_013207	GA	3	6	61781	61786	50 %	0 %	50 %	0 %	257793102
71	NC_013207	GT	3	6	62017	62022	0 %	50 %	50 %	0 %	257793102
72	NC_013207	GA	3	6	62899	62904	50 %	0 %	50 %	0 %	257793103
73	NC_013207	CG	3	6	63200	63205	0 %	0 %	50 %	50 %	257793103
74	NC_013207	TC	3	6	63413	63418	0 %	50 %	0 %	50 %	257793103
75	NC_013207	GC	3	6	63995	64000	0 %	0 %	50 %	50 %	257793103
76	NC_013207	CG	3	6	64195	64200	0 %	0 %	50 %	50 %	257793103
77	NC_013207	GC	3	6	64271	64276	0 %	0 %	50 %	50 %	257793103
78	NC_013207	GA	3	6	64475	64480	50 %	0 %	50 %	0 %	257793103
79	NC_013207	TG	3	6	65382	65387	0 %	50 %	50 %	0 %	257793104
80	NC_013207	TG	3	6	65496	65501	0 %	50 %	50 %	0 %	257793104
81	NC_013207	GC	3	6	66111	66116	0 %	0 %	50 %	50 %	257793104
82	NC_013207	GC	4	8	66266	66273	0 %	0 %	50 %	50 %	257793104
83	NC_013207	AC	4	8	66933	66940	50 %	0 %	0 %	50 %	257793105
84	NC_013207	GC	3	6	67064	67069	0 %	0 %	50 %	50 %	257793105
85	NC_013207	CG	3	6	67337	67342	0 %	0 %	50 %	50 %	257793105
86	NC_013207	GC	3	6	67877	67882	0 %	0 %	50 %	50 %	257793106
87	NC_013207	CG	4	8	68006	68013	0 %	0 %	50 %	50 %	257793106
88	NC_013207	CG	4	8	68645	68652	0 %	0 %	50 %	50 %	257793107
89	NC_013207	GC	3	6	68673	68678	0 %	0 %	50 %	50 %	257793107
90	NC_013207	GC	3	6	68901	68906	0 %	0 %	50 %	50 %	257793107
91	NC_013207	GC	3	6	69195	69200	0 %	0 %	50 %	50 %	257793107
92	NC_013207	GC	3	6	69548	69553	0 %	0 %	50 %	50 %	257793107
93	NC_013207	CG	3	6	69661	69666	0 %	0 %	50 %	50 %	257793107
94	NC_013207	GC	3	6	69879	69884	0 %	0 %	50 %	50 %	257793107
95	NC_013207	GC	3	6	70401	70406	0 %	0 %	50 %	50 %	257793108
96	NC_013207	GA	3	6	70572	70577	50 %	0 %	50 %	0 %	257793108
97	NC_013207	GA	4	8	70783	70790	50 %	0 %	50 %	0 %	257793108
98	NC_013207	GT	3	6	71063	71068	0 %	50 %	50 %	0 %	257793109
99	NC_013207	GC	3	6	71374	71379	0 %	0 %	50 %	50 %	257793109
100	NC_013207	GA	3	6	72039	72044	50 %	0 %	50 %	0 %	257793110
101	NC_013207	GT	3	6	72474	72479	0 %	50 %	50 %	0 %	257793111
102	NC_013207	GT	3	6	73066	73071	0 %	50 %	50 %	0 %	257793113
103	NC_013207	GC	3	6	73088	73093	0 %	0 %	50 %	50 %	257793113
104	NC_013207	TG	3	6	73327	73332	0 %	50 %	50 %	0 %	257793114
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106	NC_013207	CG	4	8	73828	73835	0 %	0 %	50 %	50 %	257793116
107	NC_013207	TG	3	6	75096	75101	0 %	50 %	50 %	0 %	257793118
108	NC_013207	TC	3	6	75462	75467	0 %	50 %	0 %	50 %	257793119
109	NC_013207	TG	3	6	76316	76321	0 %	50 %	50 %	0 %	257793119
110	NC_013207	GC	3	6	76920	76925	0 %	0 %	50 %	50 %	257793120
111	NC_013207	CG	3	6	77021	77026	0 %	0 %	50 %	50 %	257793120
112	NC_013207	AG	3	6	77066	77071	50 %	0 %	50 %	0 %	257793120
113	NC_013207	CG	3	6	77364	77369	0 %	0 %	50 %	50 %	257793121
114	NC_013207	GC	3	6	77370	77375	0 %	0 %	50 %	50 %	257793121
115	NC_013207	GC	3	6	77416	77421	0 %	0 %	50 %	50 %	257793121
116	NC_013207	GC	3	6	78411	78416	0 %	0 %	50 %	50 %	257793122
117	NC_013207	GT	3	6	79092	79097	0 %	50 %	50 %	0 %	257793123
118	NC_013207	CG	3	6	79835	79840	0 %	0 %	50 %	50 %	257793125
119	NC_013207	CG	3	6	80032	80037	0 %	0 %	50 %	50 %	257793125
120	NC_013207	CG	3	6	80170	80175	0 %	0 %	50 %	50 %	257793125
121	NC_013207	GC	3	6	80280	80285	0 %	0 %	50 %	50 %	257793126
122	NC_013207	GA	3	6	80504	80509	50 %	0 %	50 %	0 %	257793126
123	NC_013207	CG	3	6	80887	80892	0 %	0 %	50 %	50 %	257793126
124	NC_013207	GT	3	6	81158	81163	0 %	50 %	50 %	0 %	257793126
125	NC_013207	GC	4	8	82101	82108	0 %	0 %	50 %	50 %	257793128
126	NC_013207	GC	3	6	82143	82148	0 %	0 %	50 %	50 %	257793128
127	NC_013207	CA	3	6	83133	83138	50 %	0 %	0 %	50 %	257793128
128	NC_013207	CG	3	6	83247	83252	0 %	0 %	50 %	50 %	257793128
129	NC_013207	CG	3	6	83416	83421	0 %	0 %	50 %	50 %	257793129
130	NC_013207	GC	3	6	83829	83834	0 %	0 %	50 %	50 %	257793129
131	NC_013207	AC	3	6	84703	84708	50 %	0 %	0 %	50 %	257793130
132	NC_013207	GC	3	6	84875	84880	0 %	0 %	50 %	50 %	257793130
133	NC_013207	TC	3	6	85323	85328	0 %	50 %	0 %	50 %	257793131
134	NC_013207	CA	3	6	85426	85431	50 %	0 %	0 %	50 %	257793131
135	NC_013207	TG	3	6	85498	85503	0 %	50 %	50 %	0 %	257793131
136	NC_013207	GC	4	8	85860	85867	0 %	0 %	50 %	50 %	257793132

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.