MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 plasmid pAACI01

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013206	TCTT	2	8	3129	3136	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013206	CTAC	2	8	3377	3384	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013206	GGTG	2	8	3407	3414	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013206	ATTG	2	8	4412	4419	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013206	CACC	2	8	14737	14744	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6	NC_013206	GCAT	2	8	14779	14786	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013206	ATGC	2	8	15013	15020	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_013206	CTTG	2	8	22366	22373	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_013206	ACTT	2	8	23250	23257	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013206	GCAG	2	8	28374	28381	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013206	ACGA	2	8	28630	28637	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_013206	TTTG	2	8	28800	28807	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013206	TGGC	2	8	32679	32686	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_013206	CATT	2	8	34594	34601	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_013206	TCGT	2	8	34736	34743	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_013206	ATTT	2	8	34785	34792	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013206	AAAG	2	8	36238	36245	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013206	TAGG	2	8	36394	36401	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013206	AGTG	2	8	37655	37662	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013206	AGGC	2	8	37675	37682	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013206	ATGG	2	8	38589	38596	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013206	TCTG	2	8	40109	40116	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_013206	TCGC	2	8	40124	40131	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013206	GCCC	2	8	44473	44480	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_013206	GTGG	2	8	50090	50097	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013206	GTCC	2	8	52637	52644	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_013206	CCCA	2	8	54047	54054	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
28	NC_013206	ATAC	2	8	54235	54242	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_013206	CTAG	2	8	58649	58656	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013206	GCCG	2	8	62369	62376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013206	GTTC	2	8	62383	62390	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_013206	CCGT	2	8	65409	65416	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_013206	CGAT	2	8	67453	67460	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_013206	CATG	2	8	67995	68002	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_013206	AAAC	2	8	68336	68343	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_013206	TCAA	2	8	75165	75172	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_013206	AACA	2	8	77485	77492	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_013206	CCAT	2	8	89168	89175	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.