MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 plasmid pAACI01

Total Repeats: 971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013206	GGC	2	6	48325	48330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793000
502	NC_013206	GAT	2	6	48335	48340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793000
503	NC_013206	GGA	2	6	48473	48478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257793001
504	NC_013206	TCG	2	6	48490	48495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793001
505	NC_013206	GAA	2	6	48501	48506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793001
506	NC_013206	CGC	2	6	48585	48590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793002
507	NC_013206	TCT	2	6	48716	48721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793002
508	NC_013206	GCT	2	6	48845	48850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793002
509	NC_013206	TCT	2	6	48943	48948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793002
510	NC_013206	CGT	2	6	49082	49087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793002
511	NC_013206	TCG	2	6	49138	49143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793002
512	NC_013206	GCC	2	6	49207	49212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793002
513	NC_013206	CGC	2	6	49442	49447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793002
514	NC_013206	TCT	2	6	49624	49629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793002
515	NC_013206	GAG	2	6	49782	49787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257793002
516	NC_013206	GAC	2	6	49944	49949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793002
517	NC_013206	AAG	2	6	50224	50229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793003
518	NC_013206	TCC	2	6	50456	50461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257793003
519	NC_013206	CGG	2	6	51000	51005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793004
520	NC_013206	TCG	2	6	51025	51030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793004
521	NC_013206	GTT	2	6	51072	51077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257793004
522	NC_013206	GGC	2	6	51215	51220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793004
523	NC_013206	GAC	2	6	51285	51290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793004
524	NC_013206	TGA	2	6	51296	51301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793004
525	NC_013206	CGG	2	6	51368	51373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793004
526	NC_013206	GTT	2	6	51378	51383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257793004
527	NC_013206	GGA	2	6	51618	51623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257793005
528	NC_013206	AAC	2	6	51752	51757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257793005
529	NC_013206	GTC	2	6	51835	51840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793005
530	NC_013206	TCG	2	6	51845	51850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793005
531	NC_013206	TCT	2	6	51969	51974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793005
532	NC_013206	ATG	2	6	52004	52009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793005
533	NC_013206	TGA	2	6	52029	52034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793005
534	NC_013206	TCG	2	6	52079	52084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793005
535	NC_013206	GAT	2	6	52180	52185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793005
536	NC_013206	CTC	2	6	52234	52239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257793005
537	NC_013206	TCA	2	6	52699	52704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793006
538	NC_013206	TCA	2	6	52729	52734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793006
539	NC_013206	CAT	2	6	52772	52777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793006
540	NC_013206	TTG	2	6	52821	52826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257793006
541	NC_013206	CTT	2	6	52836	52841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793006
542	NC_013206	AGC	2	6	52964	52969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793007
543	NC_013206	TTC	2	6	53020	53025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793007
544	NC_013206	CGT	2	6	53107	53112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793007
545	NC_013206	GCG	2	6	53135	53140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793007
546	NC_013206	CGC	2	6	53250	53255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793007
547	NC_013206	ACA	2	6	53382	53387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257793007
548	NC_013206	CTT	2	6	53409	53414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793007
549	NC_013206	CAT	2	6	54327	54332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793008
550	NC_013206	ATA	2	6	54336	54341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257793008
551	NC_013206	GAA	2	6	54404	54409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793008
552	NC_013206	GAC	2	6	54561	54566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793008
553	NC_013206	CTC	2	6	54609	54614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257793008
554	NC_013206	CTT	2	6	54798	54803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793008
555	NC_013206	AGA	2	6	54811	54816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793008
556	NC_013206	TCT	2	6	54850	54855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793008
557	NC_013206	CTG	2	6	55002	55007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793008
558	NC_013206	TCA	2	6	55075	55080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793008
559	NC_013206	GAG	2	6	55210	55215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257793009
560	NC_013206	TTG	2	6	55234	55239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257793009
561	NC_013206	GCG	2	6	55392	55397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793009
562	NC_013206	TCA	2	6	55479	55484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793009
563	NC_013206	ATC	2	6	55682	55687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793009
564	NC_013206	TAC	2	6	55822	55827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793009
565	NC_013206	TTG	2	6	55859	55864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257793009
566	NC_013206	GCA	2	6	55894	55899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793009
567	NC_013206	CAT	2	6	56113	56118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793010
568	NC_013206	TTC	2	6	56122	56127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793010
569	NC_013206	CGG	2	6	56211	56216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793010
570	NC_013206	TCT	2	6	56254	56259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793010
571	NC_013206	GCC	2	6	56404	56409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793010
572	NC_013206	CGA	2	6	56555	56560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793010
573	NC_013206	GAA	2	6	56625	56630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793010
574	NC_013206	ACG	2	6	56663	56668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793010
575	NC_013206	TCC	2	6	56752	56757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257793010
576	NC_013206	TTC	2	6	56863	56868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793010
577	NC_013206	AAG	2	6	56890	56895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793010
578	NC_013206	CAT	2	6	56900	56905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793010
579	NC_013206	TTG	2	6	56932	56937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257793010
580	NC_013206	ACG	2	6	56953	56958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793010
581	NC_013206	CTT	2	6	56967	56972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793010
582	NC_013206	CAT	2	6	57012	57017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793010
583	NC_013206	TCG	2	6	57085	57090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793010
584	NC_013206	GTT	2	6	57230	57235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257793010
585	NC_013206	CGG	2	6	57270	57275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793010
586	NC_013206	TCG	2	6	57314	57319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793010
587	NC_013206	GAC	2	6	57330	57335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793010
588	NC_013206	TTC	2	6	57529	57534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793010
589	NC_013206	CTT	2	6	57545	57550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793010
590	NC_013206	TGC	2	6	57572	57577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793010
591	NC_013206	AAG	2	6	57625	57630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793010
592	NC_013206	GTC	2	6	57681	57686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793010
593	NC_013206	GAA	2	6	57699	57704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793010
594	NC_013206	TCT	2	6	57722	57727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793010
595	NC_013206	GCA	2	6	57736	57741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793010
596	NC_013206	GAT	2	6	57753	57758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793010
597	NC_013206	ATG	3	9	57823	57831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793010
598	NC_013206	CCG	2	6	57880	57885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793010
599	NC_013206	CGA	2	6	58079	58084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793010
600	NC_013206	TCA	2	6	58105	58110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793010
601	NC_013206	CGA	2	6	58111	58116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793010
602	NC_013206	GAA	2	6	58197	58202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793010
603	NC_013206	TGA	2	6	58331	58336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793010
604	NC_013206	GGT	2	6	58356	58361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257793010
605	NC_013206	GCA	2	6	58385	58390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793010
606	NC_013206	CAC	2	6	58428	58433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257793010
607	NC_013206	GAC	2	6	58539	58544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793010
608	NC_013206	CAA	2	6	58742	58747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257793011
609	NC_013206	CCA	2	6	58765	58770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257793011
610	NC_013206	CCG	2	6	58865	58870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793011
611	NC_013206	CAG	2	6	58980	58985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793011
612	NC_013206	TCG	2	6	59018	59023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793011
613	NC_013206	CCA	2	6	59024	59029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257793011
614	NC_013206	GCG	2	6	59035	59040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793011
615	NC_013206	TGG	2	6	59071	59076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257793011
616	NC_013206	CTG	2	6	59286	59291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793011
617	NC_013206	ACC	2	6	59317	59322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257793011
618	NC_013206	GAC	3	9	59346	59354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793011
619	NC_013206	GTG	2	6	59426	59431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257793011
620	NC_013206	CGC	2	6	59433	59438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793011
621	NC_013206	CAT	2	6	59478	59483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793011
622	NC_013206	ACG	2	6	59690	59695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793012
623	NC_013206	GCA	2	6	59707	59712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793012
624	NC_013206	CCG	2	6	59836	59841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793012
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742	NC_013206	GGT	2	6	70380	70385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257793023
743	NC_013206	TCA	2	6	70425	70430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793023
744	NC_013206	AAC	2	6	70526	70531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257793023
745	NC_013206	TTC	2	6	70736	70741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793023
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