MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 plasmid pAACI01

Total Repeats: 1138

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013206	CCG	2	6	41282	41287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257792990
502	NC_013206	TTC	2	6	41405	41410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257792991
503	NC_013206	TTC	2	6	41498	41503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257792991
504	NC_013206	CCA	2	6	41512	41517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257792991
505	NC_013206	AGT	2	6	41589	41594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257792991
506	NC_013206	GTT	2	6	41599	41604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257792991
507	NC_013206	CCA	2	6	42097	42102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257792991
508	NC_013206	GCC	2	6	42137	42142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257792991
509	NC_013206	TCG	2	6	42426	42431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257792992
510	NC_013206	CGC	2	6	42468	42473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257792992
511	NC_013206	GTG	2	6	42489	42494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257792992
512	NC_013206	TCG	2	6	42508	42513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257792992
513	NC_013206	CAT	2	6	42645	42650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257792992
514	NC_013206	TCG	2	6	42692	42697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257792992
515	NC_013206	TGA	2	6	42862	42867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257792992
516	NC_013206	CAG	2	6	42873	42878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257792992
517	NC_013206	AGA	2	6	42886	42891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257792992
518	NC_013206	CTT	2	6	42896	42901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257792992
519	NC_013206	CTG	2	6	43135	43140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257792992
520	NC_013206	GAA	2	6	43149	43154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257792992
521	NC_013206	GAG	2	6	43158	43163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257792992
522	NC_013206	TGT	2	6	43166	43171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257792992
523	NC_013206	CAT	2	6	43275	43280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257792992
524	NC_013206	CAT	2	6	43341	43346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257792992
525	NC_013206	GCC	2	6	43350	43355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257792992
526	NC_013206	CGT	2	6	43406	43411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257792992
527	NC_013206	AGT	2	6	43424	43429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257792992
528	NC_013206	GTA	2	6	43440	43445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257792992
529	NC_013206	ACC	2	6	43456	43461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257792992
530	NC_013206	GAA	2	6	43761	43766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257792992
531	NC_013206	TCG	2	6	43800	43805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257792993
532	NC_013206	CTT	2	6	43841	43846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257792993
533	NC_013206	GCG	2	6	43887	43892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257792993
534	NC_013206	CAA	2	6	43944	43949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257792993
535	NC_013206	GGA	2	6	43960	43965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257792993
536	NC_013206	GAG	2	6	44075	44080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257792993
537	NC_013206	TTC	2	6	44082	44087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257792993
538	NC_013206	CAA	2	6	44117	44122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257792993
539	NC_013206	GAT	2	6	44149	44154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257792993
540	NC_013206	GTG	2	6	44277	44282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257792994
541	NC_013206	GAT	2	6	44389	44394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_013206	TCA	2	6	44609	44614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_013206	TCT	2	6	44673	44678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257792995
544	NC_013206	CTT	2	6	44752	44757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257792995
545	NC_013206	CTC	2	6	44801	44806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257792995
546	NC_013206	TCT	2	6	44909	44914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257792995
547	NC_013206	AAG	2	6	45005	45010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_013206	CTC	2	6	45034	45039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_013206	AGT	2	6	45192	45197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257792996
550	NC_013206	AGC	2	6	45455	45460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257792996
551	NC_013206	GAT	2	6	45571	45576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257792996
552	NC_013206	TCC	2	6	45590	45595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257792996
553	NC_013206	TTC	2	6	45604	45609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257792996
554	NC_013206	ATG	2	6	45761	45766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257792996
555	NC_013206	AGC	2	6	45767	45772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257792996
556	NC_013206	TGC	2	6	45799	45804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257792996
557	NC_013206	GAA	2	6	45813	45818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257792996
558	NC_013206	GAG	2	6	45841	45846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257792996
559	NC_013206	GCT	2	6	45878	45883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257792996
560	NC_013206	CAC	2	6	45920	45925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_013206	TGA	2	6	45947	45952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_013206	TCC	2	6	45961	45966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_013206	TCT	2	6	46139	46144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257792997
564	NC_013206	GAT	2	6	46170	46175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257792997
565	NC_013206	GCA	2	6	46196	46201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257792997
566	NC_013206	TGC	2	6	46366	46371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257792997
567	NC_013206	GAC	2	6	46441	46446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257792997
568	NC_013206	TCC	2	6	46470	46475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_013206	GAG	2	6	46578	46583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257792998
570	NC_013206	CTT	2	6	46612	46617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257792998
571	NC_013206	AGA	2	6	46632	46637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257792998
572	NC_013206	AAG	2	6	46892	46897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257792998
573	NC_013206	ACC	2	6	46911	46916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257792998
574	NC_013206	CAT	2	6	46999	47004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257792998
575	NC_013206	CTT	2	6	47050	47055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257792998
576	NC_013206	CCG	2	6	47191	47196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257792998
577	NC_013206	GGT	2	6	47318	47323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257792998
578	NC_013206	TGA	2	6	47404	47409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257792998
579	NC_013206	TCG	2	6	47644	47649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257792998
580	NC_013206	CAC	2	6	47657	47662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257792998
581	NC_013206	AGC	2	6	47667	47672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257792998
582	NC_013206	CCT	2	6	47729	47734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257792999
583	NC_013206	TCG	2	6	47775	47780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257792999
584	NC_013206	CAC	2	6	47851	47856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257792999
585	NC_013206	CGC	2	6	48066	48071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_013206	TGA	2	6	48079	48084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_013206	TGA	2	6	48108	48113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_013206	CGC	2	6	48244	48249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793000
589	NC_013206	CTT	2	6	48263	48268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793000
590	NC_013206	ACG	2	6	48306	48311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793000
591	NC_013206	GGC	2	6	48325	48330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793000
592	NC_013206	GAT	2	6	48335	48340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793000
593	NC_013206	GGA	2	6	48473	48478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257793001
594	NC_013206	TCG	2	6	48490	48495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793001
595	NC_013206	GAA	2	6	48501	48506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793001
596	NC_013206	CGC	2	6	48585	48590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793002
597	NC_013206	TCT	2	6	48716	48721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793002
598	NC_013206	GCT	2	6	48845	48850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793002
599	NC_013206	TCT	2	6	48943	48948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793002
600	NC_013206	CGT	2	6	49082	49087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793002
601	NC_013206	TCG	2	6	49138	49143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793002
602	NC_013206	GCC	2	6	49207	49212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793002
603	NC_013206	CGC	2	6	49442	49447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793002
604	NC_013206	TCT	2	6	49624	49629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793002
605	NC_013206	GAG	2	6	49782	49787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257793002
606	NC_013206	GAC	2	6	49944	49949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793002
607	NC_013206	ATC	2	6	50078	50083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_013206	AAG	2	6	50224	50229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793003
609	NC_013206	TCC	2	6	50456	50461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257793003
610	NC_013206	GAC	2	6	50540	50545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_013206	TTC	2	6	50588	50593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_013206	ACC	2	6	50810	50815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_013206	CCT	2	6	50955	50960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
614	NC_013206	CGG	2	6	51000	51005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793004
615	NC_013206	TCG	2	6	51025	51030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793004
616	NC_013206	GTT	2	6	51072	51077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257793004
617	NC_013206	GGC	2	6	51215	51220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793004
618	NC_013206	GAC	2	6	51285	51290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793004
619	NC_013206	TGA	2	6	51296	51301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793004
620	NC_013206	CGG	2	6	51368	51373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793004
621	NC_013206	GTT	2	6	51378	51383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257793004
622	NC_013206	GGA	2	6	51618	51623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257793005
623	NC_013206	AAC	2	6	51752	51757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257793005
624	NC_013206	GTC	2	6	51835	51840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793005
625	NC_013206	TCG	2	6	51845	51850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793005
626	NC_013206	TCT	2	6	51969	51974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793005
627	NC_013206	ATG	2	6	52004	52009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793005
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634	NC_013206	GGC	2	6	52590	52595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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