MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 plasmid pAACI01

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013206	T	7	7	3147	3153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013206	C	6	6	6924	6929	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3	NC_013206	C	6	6	7919	7924	0 %	0 %	0 %	100 %	257792956
4	NC_013206	C	6	6	11030	11035	0 %	0 %	0 %	100 %	257792958
5	NC_013206	T	6	6	12369	12374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013206	T	6	6	15351	15356	0 %	100 %	0 %	0 %	257792963
7	NC_013206	A	6	6	24960	24965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013206	T	6	6	25122	25127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013206	G	7	7	25483	25489	0 %	0 %	100 %	0 %	257792974
10	NC_013206	T	6	6	26793	26798	0 %	100 %	0 %	0 %	257792975
11	NC_013206	A	6	6	29498	29503	100 %	0 %	0 %	0 %	257792980
12	NC_013206	T	6	6	30251	30256	0 %	100 %	0 %	0 %	257792980
13	NC_013206	T	7	7	30473	30479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013206	A	7	7	31050	31056	100 %	0 %	0 %	0 %	257792981
15	NC_013206	T	7	7	31162	31168	0 %	100 %	0 %	0 %	257792981
16	NC_013206	A	6	6	33389	33394	100 %	0 %	0 %	0 %	257792983
17	NC_013206	A	7	7	33860	33866	100 %	0 %	0 %	0 %	257792983
18	NC_013206	A	6	6	33872	33877	100 %	0 %	0 %	0 %	257792983
19	NC_013206	T	6	6	34775	34780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013206	A	6	6	36734	36739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013206	G	7	7	38100	38106	0 %	0 %	100 %	0 %	257792987
22	NC_013206	T	6	6	45643	45648	0 %	100 %	0 %	0 %	257792996
23	NC_013206	T	6	6	45688	45693	0 %	100 %	0 %	0 %	257792996
24	NC_013206	C	6	6	45935	45940	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
25	NC_013206	G	6	6	45953	45958	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013206	A	6	6	47742	47747	100 %	0 %	0 %	0 %	257792999
27	NC_013206	T	6	6	52666	52671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013206	T	6	6	54167	54172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013206	A	7	7	70417	70423	100 %	0 %	0 %	0 %	257793023
30	NC_013206	T	6	6	70503	70508	0 %	100 %	0 %	0 %	257793023
31	NC_013206	T	6	6	71511	71516	0 %	100 %	0 %	0 %	257793024
32	NC_013206	T	6	6	82914	82919	0 %	100 %	0 %	0 %	257793032
33	NC_013206	T	7	7	88646	88652	0 %	100 %	0 %	0 %	257793039
34	NC_013206	T	6	6	89197	89202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.