MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 1134

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013205	CG	3	6	2680612	2680617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1002	NC_013205	GC	3	6	2682628	2682633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_013205	GA	4	8	2685360	2685367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_013205	CG	3	6	2687063	2687068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1005	NC_013205	CG	3	6	2687092	2687097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1006	NC_013205	CG	3	6	2687106	2687111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_013205	GC	3	6	2687141	2687146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_013205	GA	4	8	2689396	2689403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_013205	CG	3	6	2692911	2692916	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1010	NC_013205	CG	3	6	2693524	2693529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1011	NC_013205	TC	3	6	2694679	2694684	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1013	NC_013205	AT	3	6	2701130	2701135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1015	NC_013205	CT	3	6	2705838	2705843	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1021	NC_013205	TG	3	6	2720528	2720533	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_013205	GA	3	6	2720600	2720605	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1024	NC_013205	CG	3	6	2720632	2720637	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1025	NC_013205	CG	3	6	2721578	2721583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1046	NC_013205	CG	3	6	2765032	2765037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1047	NC_013205	CA	3	6	2789517	2789522	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1068	NC_013205	CG	3	6	2843645	2843650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1077	NC_013205	CG	3	6	2863367	2863372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1103	NC_013205	GC	4	8	2947126	2947133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1106	NC_013205	CG	3	6	2959346	2959351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_013205	AT	3	6	2962707	2962712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_013205	AC	4	8	2962747	2962754	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1109	NC_013205	TC	3	6	2966601	2966606	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_013205	AT	3	6	2970735	2970740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_013205	AG	3	6	2978367	2978372	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_013205	GC	3	6	2981092	2981097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1114	NC_013205	GC	3	6	2985614	2985619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_013205	GC	3	6	2985653	2985658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1116	NC_013205	GC	3	6	2985702	2985707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1117	NC_013205	GC	3	6	2985984	2985989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_013205	CG	3	6	2986784	2986789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_013205	GC	4	8	2987003	2987010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_013205	GC	3	6	2987477	2987482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1122	NC_013205	CG	3	6	2992719	2992724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_013205	GC	3	6	2999731	2999736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_013205	CG	4	8	2999740	2999747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1125	NC_013205	CG	3	6	3000502	3000507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1126	NC_013205	GC	3	6	3001392	3001397	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_013205	TG	3	6	3001406	3001411	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_013205	GC	3	6	3002803	3002808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1129	NC_013205	AC	3	6	3003051	3003056	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_013205	TC	3	6	3010675	3010680	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_013205	AC	3	6	3011632	3011637	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1132	NC_013205	CA	3	6	3014360	3014365	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1133	NC_013205	GC	3	6	3017601	3017606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1134	NC_013205	AC	3	6	3018423	3018428	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.