MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Eggerthella lenta DSM 2243 chromosome

Total Repeats: 151

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013204	ATCGTG	2	12	15943	15954	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_013204	TCTGCG	2	12	23797	23808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013204	GCTGCA	2	12	30910	30921	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013204	AACGAC	2	12	76066	76077	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013204	GCGCCC	2	12	93328	93339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_013204	AGATGC	2	12	132900	132911	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_013204	CCCGGT	2	12	150742	150753	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8	NC_013204	ACGCGA	2	12	164872	164883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013204	TTCTCG	2	12	192034	192045	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013204	CTTTTC	2	12	199942	199953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013204	GATGGG	2	12	233274	233285	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013204	CGAGCG	2	12	258857	258868	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013204	GATGCG	2	12	283983	283994	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_013204	GTGCGG	2	12	287424	287435	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_013204	CGTGCG	2	12	301663	301674	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013204	GTGGGC	2	12	304499	304510	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_013204	TCCCGC	2	12	309012	309023	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_013204	CTCGCG	2	12	309041	309052	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013204	CCCCCT	2	12	328734	328745	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
20	NC_013204	ATCGAC	2	12	333430	333441	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013204	GCGGGA	2	12	372212	372223	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_013204	CGTTTG	2	12	396974	396985	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_013204	ACCCTT	2	12	397027	397038	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013204	GAAGCG	2	12	448359	448370	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_013204	GCATCC	2	12	487054	487065	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
26	NC_013204	CTGCGC	2	12	506754	506765	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_013204	CGCTGG	2	12	512369	512380	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_013204	CTGCCG	2	12	579155	579166	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_013204	CGTTCG	2	12	580234	580245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013204	CCTCTC	2	12	588680	588691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_013204	GGGGGA	2	12	600427	600438	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013204	CTTCGC	2	12	609579	609590	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_013204	TCGCCC	2	12	615668	615679	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_013204	CGGCCC	2	12	647564	647575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_013204	GCGACG	2	12	663528	663539	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013204	GGCCGG	2	12	668309	668320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013204	TTCCCG	2	12	677271	677282	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
38	NC_013204	CGCGGG	2	12	682100	682111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013204	CCTTGT	2	12	693501	693512	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013204	GCGCGA	2	12	754746	754757	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_013204	CATGCT	2	12	802024	802035	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013204	GATTTT	2	12	823119	823130	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013204	GCGCTT	2	12	838751	838762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013204	GCTCGC	2	12	838777	838788	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
45	NC_013204	TTCGGT	2	12	846941	846952	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_013204	CATCGC	2	12	863256	863267	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
47	NC_013204	AGGGGG	2	12	890765	890776	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013204	CGTTCG	2	12	903661	903672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013204	TTGGTG	2	12	948739	948750	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013204	CTTCGT	2	12	954572	954583	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013204	GATCCT	2	12	962355	962366	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013204	CGCGAG	2	12	963319	963330	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_013204	TCGAGG	2	12	967382	967393	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_013204	AGGGCA	2	12	967793	967804	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_013204	CCGCTC	2	12	970536	970547	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_013204	GTCCAT	2	12	975406	975417	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_013204	AAAGCA	2	12	980309	980320	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_013204	GCGGGC	2	12	1003713	1003724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_013204	TCCGCA	2	12	1008446	1008457	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
60	NC_013204	GCACAT	2	12	1008794	1008805	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_013204	CCCGCC	2	12	1020933	1020944	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
62	NC_013204	TATATG	2	12	1022479	1022490	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013204	TTCCGT	2	12	1027083	1027094	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013204	CGGGGG	2	12	1084697	1084708	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_013204	CGGTGG	2	12	1121410	1121421	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_013204	GGCGCG	2	12	1121427	1121438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013204	GCAGTT	2	12	1121489	1121500	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_013204	CGTGCG	2	12	1128504	1128515	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013204	GCGCAT	2	12	1128539	1128550	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013204	GGTTCA	2	12	1129429	1129440	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_013204	ATCGGC	2	12	1215112	1215123	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013204	CGGGGG	2	12	1233879	1233890	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_013204	CGCCGG	2	12	1265850	1265861	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_013204	CAGCGC	2	12	1327465	1327476	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_013204	GTTCAA	2	12	1339441	1339452	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_013204	CGAAGG	2	12	1339715	1339726	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_013204	GATGCG	2	12	1423554	1423565	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_013204	GAGGCG	2	12	1509774	1509785	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_013204	TGCGGT	2	12	1591023	1591034	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_013204	TCGCCG	2	12	1670523	1670534	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_013204	ACGCGC	2	12	1692659	1692670	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
82	NC_013204	GGCCGC	2	12	1738388	1738399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_013204	ATATGA	2	12	1834194	1834205	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013204	ACATCG	2	12	1835635	1835646	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013204	CCTTCG	2	12	1839641	1839652	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
86	NC_013204	CCTTGC	2	12	1860275	1860286	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_013204	GGTAAA	2	12	1867203	1867214	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013204	AGGGGG	2	12	1902441	1902452	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013204	GGAAGA	2	12	1908110	1908121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013204	CGACTC	2	12	1960302	1960313	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
91	NC_013204	GCTCGC	2	12	1960706	1960717	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
92	NC_013204	TCCTTC	2	12	2038709	2038720	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_013204	CCCGTT	2	12	2052808	2052819	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
94	NC_013204	CCGTCC	2	12	2084107	2084118	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_013204	CGTTTC	2	12	2138161	2138172	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013204	CCGCGC	2	12	2229101	2229112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_013204	TGCTCC	2	12	2273644	2273655	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
98	NC_013204	TCCTTT	2	12	2287461	2287472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_013204	CTCCTT	2	12	2294361	2294372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_013204	CGGTTG	2	12	2298204	2298215	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_013204	GCACAA	2	12	2408272	2408283	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_013204	TCGCGC	2	12	2416243	2416254	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
103	NC_013204	TTCCGC	2	12	2418959	2418970	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
104	NC_013204	GAGGGC	2	12	2446909	2446920	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_013204	CTTTCC	2	12	2486974	2486985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_013204	TCGTGC	2	12	2504883	2504894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_013204	ACGGAT	3	18	2539460	2539477	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_013204	GAATTC	2	12	2561787	2561798	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_013204	TTCGAC	2	12	2561832	2561843	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_013204	CGTTGG	2	12	2562313	2562324	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_013204	GAGGGC	2	12	2632189	2632200	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_013204	ACAAGA	2	12	2656186	2656197	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_013204	CAGACG	2	12	2688253	2688264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_013204	GCGCAG	2	12	2736163	2736174	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_013204	TTCGCG	2	12	2775596	2775607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_013204	GTGCGC	2	12	2793384	2793395	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_013204	GAGCGC	2	12	2818869	2818880	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_013204	CATGCG	2	12	2848759	2848770	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_013204	CAACAT	2	12	2849162	2849173	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_013204	TCCTAT	2	12	2854659	2854670	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_013204	GAAACG	2	12	2870185	2870196	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_013204	GAGGGC	2	12	2885882	2885893	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_013204	CGCCAG	2	12	2910231	2910242	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
124	NC_013204	CTTCTG	2	12	2911055	2911066	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_013204	CAAGGA	2	12	3003002	3003013	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_013204	AGATTC	2	12	3030912	3030923	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_013204	ATTTTT	2	12	3063657	3063668	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013204	TGGTAG	2	12	3079566	3079577	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013204	CGCGCC	2	12	3087382	3087393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_013204	CGCCCG	2	12	3087403	3087414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_013204	CGAAGC	2	12	3156117	3156128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_013204	CTGCGC	2	12	3192195	3192206	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
133	NC_013204	GAATCG	2	12	3214117	3214128	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_013204	GAGGGC	2	12	3226998	3227009	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_013204	TCGTCT	2	12	3238167	3238178	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_013204	TCGCGC	2	12	3268833	3268844	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
137	NC_013204	TTCCGC	2	12	3271549	3271560	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
138	NC_013204	ACGGAA	2	12	3285485	3285496	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_013204	GGTTCT	2	12	3329403	3329414	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_013204	CGCGTC	2	12	3395684	3395695	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
141	NC_013204	CTTCGT	2	12	3409469	3409480	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_013204	AGAAAG	2	12	3427386	3427397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013204	CTTTCT	2	12	3432946	3432957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_013204	CCTCTC	2	12	3444778	3444789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_013204	GAGAGG	2	12	3453834	3453845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013204	CTTGCG	2	12	3498658	3498669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_013204	GCAAAA	2	12	3513844	3513855	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_013204	AGAGGG	2	12	3514137	3514148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013204	GAAGCC	2	12	3551414	3551425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_013204	ATTGCA	2	12	3560072	3560083	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_013204	CGAGGG	2	12	3578761	3578772	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.