MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Atopobium parvulum DSM 20469 chromosome

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013203	TCCTGT	2	12	17946	17957	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013203	ATTATC	2	12	47688	47699	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_013203	CATTTG	2	12	136598	136609	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_013203	TTGTGA	2	12	156149	156160	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013203	AAAATA	2	12	157060	157071	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013203	GTGTTT	2	12	176341	176352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013203	GACTGC	2	12	216937	216948	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013203	ACTGCT	2	12	216962	216973	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013203	GTAACC	2	12	218481	218492	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013203	CTTGAG	2	12	232297	232308	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_013203	CTTAGT	2	12	249586	249597	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_013203	TGGTAA	2	12	249887	249898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013203	AAGTAA	2	12	309965	309976	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013203	GTATTT	2	12	310724	310735	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013203	CTAAGC	2	12	383634	383645	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013203	GTTTAT	2	12	385575	385586	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013203	AATAAG	2	12	390833	390844	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013203	AATACG	2	12	393377	393388	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_013203	GTAAAT	2	12	476629	476640	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013203	TATAAA	2	12	630251	630262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013203	TAAAGC	2	12	764197	764208	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_013203	ACTTAT	2	12	797216	797227	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_013203	TTTTGA	2	12	836628	836639	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013203	GAAAAA	2	12	850019	850030	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013203	ACTATG	2	12	897069	897080	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_013203	AGGTTT	2	12	940054	940065	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013203	TTAAAA	2	12	940231	940242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013203	TAAAAA	2	12	976613	976624	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013203	CAATAA	2	12	1018235	1018246	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_013203	AACAGC	2	12	1088595	1088606	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_013203	AAAATA	2	12	1113829	1113840	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013203	CGATGA	2	12	1209819	1209830	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_013203	TCCTTC	2	12	1292034	1292045	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013203	CTACTC	2	12	1296381	1296392	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_013203	TAGCCG	2	12	1371742	1371753	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013203	CGTCAA	2	12	1407932	1407943	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013203	TCACAT	2	12	1421741	1421752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013203	AGCAAT	2	12	1421793	1421804	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_013203	GTTACA	2	12	1485148	1485159	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_013203	TAAAAC	2	12	1529182	1529193	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.