MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Repeats of Atopobium parvulum DSM 20469 chromosome

Total Repeats: 571

Go To Repeat Summary Page

< Previous 12Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013203	CGTCCT	2	12	1360469	1360480	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	257785016
502	NC_013203	TCCTTC	2	12	1361137	1361148	0 %	50 %	0 %	50 %	257785016
503	NC_013203	AAAACC	2	12	1361799	1361810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257785017
504	NC_013203	TACCAT	2	12	1370027	1370038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257785022
505	NC_013203	TAGCCG	2	12	1371742	1371753	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_013203	TGAATG	2	12	1374023	1374034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257785025
507	NC_013203	GCATGG	2	12	1374314	1374325	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	257785025
508	NC_013203	CAAGCT	2	12	1384306	1384317	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	257785032
509	NC_013203	ATTACC	2	12	1385222	1385233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257785032
510	NC_013203	GTTAGT	2	12	1386151	1386162	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	257785034
511	NC_013203	TCACCG	2	12	1386641	1386652	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	257785034
512	NC_013203	CTGATT	2	12	1387691	1387702	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	257785035
513	NC_013203	CAAACG	2	12	1387756	1387767	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	257785035
514	NC_013203	CTGCTT	2	12	1388009	1388020	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	257785035
515	NC_013203	AAGCAA	2	12	1389913	1389924	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	257785037
516	NC_013203	TGTTCA	2	12	1401411	1401422	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	257785051
517	NC_013203	TGGCCA	2	12	1402193	1402204	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257785051
518	NC_013203	GAAGCT	2	12	1403015	1403026	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257785052
519	NC_013203	TTATTT	2	12	1405646	1405657	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	257785054
520	NC_013203	AATGAA	2	12	1406572	1406583	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	257785055
521	NC_013203	CGTCAA	2	12	1407932	1407943	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_013203	CGTTTC	2	12	1409805	1409816	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	257785057
523	NC_013203	AGAAGT	2	12	1415492	1415503	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	257785061
524	NC_013203	AATAGT	2	12	1416869	1416880	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	257785062
525	NC_013203	TGATCA	2	12	1417896	1417907	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	257785062
526	NC_013203	TTGTAA	2	12	1417924	1417935	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	257785062
527	NC_013203	TCACAT	2	12	1421741	1421752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_013203	AGCAAT	2	12	1421793	1421804	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
529	NC_013203	AAATTC	2	12	1425871	1425882	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	257785067
530	NC_013203	TCAACC	2	12	1428065	1428076	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	257785069
531	NC_013203	GACGCA	2	12	1433737	1433748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257785074
532	NC_013203	AGTGCA	2	12	1434156	1434167	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257785074
533	NC_013203	ATAGCA	2	12	1436251	1436262	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	257785076
534	NC_013203	ACCAGA	2	12	1437715	1437726	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	257785077
535	NC_013203	TACGTC	2	12	1439839	1439850	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	257785079
536	NC_013203	TGCTTC	2	12	1440109	1440120	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	257785079
537	NC_013203	ATCTTG	2	12	1443494	1443505	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	257785083
538	NC_013203	CAAGAC	2	12	1445833	1445844	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	257785086
539	NC_013203	AAGTTC	2	12	1446999	1447010	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	257785087
540	NC_013203	AATATC	2	12	1450664	1450675	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	257785089
541	NC_013203	CACCCT	2	12	1460880	1460891	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	257785091
542	NC_013203	AAGCAA	2	12	1464114	1464125	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	257785094
543	NC_013203	AGCAGG	2	12	1465539	1465550	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	257785096
544	NC_013203	GTTACC	2	12	1469360	1469371	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	257785099
545	NC_013203	CCCTTA	2	12	1469772	1469783	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	257785100
546	NC_013203	AGTACC	2	12	1471023	1471034	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	257785102
547	NC_013203	AACATA	2	12	1471081	1471092	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	257785102
548	NC_013203	CAATGC	2	12	1472915	1472926	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	257785105
549	NC_013203	GTTACA	2	12	1485148	1485159	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
550	NC_013203	ATTTTT	2	12	1485290	1485301	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	257785119
551	NC_013203	AATGCA	2	12	1489353	1489364	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	257785124
552	NC_013203	TTGCCG	2	12	1489664	1489675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257785124
553	NC_013203	AGTCTG	2	12	1490271	1490282	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	257785125
554	NC_013203	CCTTAG	2	12	1492982	1492993	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	257785126
555	NC_013203	CGATAT	2	12	1497510	1497521	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	257785128
556	NC_013203	CGTGAC	2	12	1499405	1499416	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257785130
557	NC_013203	CGGCCT	2	12	1500162	1500173	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	257785131
558	NC_013203	AACGGT	2	12	1500431	1500442	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257785132
559	NC_013203	AGCCAG	2	12	1509730	1509741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257785139
560	NC_013203	CTGGCA	2	12	1514667	1514678	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257785142
561	NC_013203	GGTAAG	2	12	1516527	1516538	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	257785143
562	NC_013203	CTCACG	2	12	1518075	1518086	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	257785144
563	NC_013203	GAGTAA	2	12	1522101	1522112	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	257785148
564	NC_013203	TTAAGA	2	12	1528342	1528353	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	257785153
565	NC_013203	TAAAAC	2	12	1529182	1529193	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
566	NC_013203	ACGATT	2	12	1530768	1530779	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	257785154
567	NC_013203	CTCAGA	2	12	1531762	1531773	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	257785155
568	NC_013203	TTCTTT	2	12	1535722	1535733	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	257785157
569	NC_013203	CAATAT	2	12	1541173	1541184	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	257785162
570	NC_013203	TCAACA	2	12	1541755	1541766	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	257785163
571	NC_013203	AGTGAA	2	12	1541777	1541788	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	257785163

< Previous 12Next >