MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Atopobium parvulum DSM 20469 chromosome

Total Repeats: 3089

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013203	TACG	2	8	1490934	1490941	25 %	25 %	25 %	25 %	257785125
3002	NC_013203	CTTC	2	8	1492409	1492416	0 %	50 %	0 %	50 %	257785126
3003	NC_013203	GACC	2	8	1494308	1494315	25 %	0 %	25 %	50 %	257785126
3004	NC_013203	CCAG	2	8	1495871	1495878	25 %	0 %	25 %	50 %	257785127
3005	NC_013203	ACAA	2	8	1496196	1496203	75 %	0 %	0 %	25 %	257785127
3006	NC_013203	GTTG	2	8	1496684	1496691	0 %	50 %	50 %	0 %	257785128
3007	NC_013203	TTTA	2	8	1499316	1499323	25 %	75 %	0 %	0 %	257785130
3008	NC_013203	CATG	2	8	1499742	1499749	25 %	25 %	25 %	25 %	257785131
3009	NC_013203	ATGA	2	8	1499911	1499918	50 %	25 %	25 %	0 %	257785131
3010	NC_013203	TTGC	2	8	1502018	1502025	0 %	50 %	25 %	25 %	257785133
3011	NC_013203	TGTC	2	8	1502298	1502305	0 %	50 %	25 %	25 %	257785133
3012	NC_013203	TGCG	2	8	1504246	1504253	0 %	25 %	50 %	25 %	257785134
3013	NC_013203	AACT	2	8	1505388	1505395	50 %	25 %	0 %	25 %	257785135
3014	NC_013203	TCTT	2	8	1505409	1505416	0 %	75 %	0 %	25 %	257785135
3015	NC_013203	GCCT	2	8	1506294	1506301	0 %	25 %	25 %	50 %	257785136
3016	NC_013203	ATCA	2	8	1506312	1506319	50 %	25 %	0 %	25 %	257785136
3017	NC_013203	CTTC	2	8	1506659	1506666	0 %	50 %	0 %	50 %	257785136
3018	NC_013203	AATA	2	8	1507190	1507197	75 %	25 %	0 %	0 %	257785137
3019	NC_013203	GTGA	2	8	1507460	1507467	25 %	25 %	50 %	0 %	257785138
3020	NC_013203	CTGC	2	8	1507731	1507738	0 %	25 %	25 %	50 %	257785138
3021	NC_013203	CCTA	2	8	1507797	1507804	25 %	25 %	0 %	50 %	257785138
3022	NC_013203	GCTT	2	8	1508023	1508030	0 %	50 %	25 %	25 %	257785138
3023	NC_013203	TGCT	2	8	1508771	1508778	0 %	50 %	25 %	25 %	257785138
3024	NC_013203	GGAT	2	8	1509038	1509045	25 %	25 %	50 %	0 %	257785138
3025	NC_013203	TGGA	2	8	1509104	1509111	25 %	25 %	50 %	0 %	257785138
3026	NC_013203	TGTA	2	8	1509178	1509185	25 %	50 %	25 %	0 %	257785138
3027	NC_013203	CGCT	2	8	1510618	1510625	0 %	25 %	25 %	50 %	257785140
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3030	NC_013203	GCTA	2	8	1512776	1512783	25 %	25 %	25 %	25 %	257785142
3031	NC_013203	CCTT	2	8	1513173	1513180	0 %	50 %	0 %	50 %	257785142
3032	NC_013203	CAGT	2	8	1514044	1514051	25 %	25 %	25 %	25 %	257785142
3033	NC_013203	GCTC	2	8	1514249	1514256	0 %	25 %	25 %	50 %	257785142
3034	NC_013203	CCAG	2	8	1515434	1515441	25 %	0 %	25 %	50 %	257785143
3035	NC_013203	ACCA	2	8	1515569	1515576	50 %	0 %	0 %	50 %	257785143
3036	NC_013203	ACAA	2	8	1516139	1516146	75 %	0 %	0 %	25 %	257785143
3037	NC_013203	ACAG	2	8	1516267	1516274	50 %	0 %	25 %	25 %	257785143
3038	NC_013203	CGCA	2	8	1518036	1518043	25 %	0 %	25 %	50 %	257785144
3039	NC_013203	TCTT	2	8	1518253	1518260	0 %	75 %	0 %	25 %	257785144
3040	NC_013203	CTTC	2	8	1518672	1518679	0 %	50 %	0 %	50 %	257785145
3041	NC_013203	TCGC	2	8	1519121	1519128	0 %	25 %	25 %	50 %	257785145
3042	NC_013203	ACGC	2	8	1519446	1519453	25 %	0 %	25 %	50 %	257785146
3043	NC_013203	ATTC	2	8	1520055	1520062	25 %	50 %	0 %	25 %	257785146
3044	NC_013203	CGAG	2	8	1520077	1520084	25 %	0 %	50 %	25 %	257785146
3045	NC_013203	AAAG	2	8	1520662	1520669	75 %	0 %	25 %	0 %	257785146
3046	NC_013203	CAGC	2	8	1520862	1520869	25 %	0 %	25 %	50 %	257785147
3047	NC_013203	TCCT	2	8	1522972	1522979	0 %	50 %	0 %	50 %	257785149
3048	NC_013203	TGAG	2	8	1523825	1523832	25 %	25 %	50 %	0 %	257785149
3049	NC_013203	GTTA	2	8	1523944	1523951	25 %	50 %	25 %	0 %	257785149
3050	NC_013203	CGCA	2	8	1524084	1524091	25 %	0 %	25 %	50 %	257785149
3051	NC_013203	CAGA	2	8	1525590	1525597	50 %	0 %	25 %	25 %	257785150
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3053	NC_013203	ACTT	2	8	1527236	1527243	25 %	50 %	0 %	25 %	257785153
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3056	NC_013203	TCGC	2	8	1528855	1528862	0 %	25 %	25 %	50 %	257785153
3057	NC_013203	ATTT	2	8	1529131	1529138	25 %	75 %	0 %	0 %	257785153
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3059	NC_013203	GAAC	2	8	1529388	1529395	50 %	0 %	25 %	25 %	257785154
3060	NC_013203	ATAG	2	8	1530558	1530565	50 %	25 %	25 %	0 %	257785154
3061	NC_013203	AGGA	2	8	1530626	1530633	50 %	0 %	50 %	0 %	257785154
3062	NC_013203	GTAC	2	8	1530706	1530713	25 %	25 %	25 %	25 %	257785154
3063	NC_013203	AGTG	2	8	1530896	1530903	25 %	25 %	50 %	0 %	257785154
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3073	NC_013203	GACA	2	8	1535449	1535456	50 %	0 %	25 %	25 %	257785157
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3084	NC_013203	CCAA	2	8	1542399	1542406	50 %	0 %	0 %	50 %	257785164
3085	NC_013203	GAAG	2	8	1542598	1542605	50 %	0 %	50 %	0 %	257785164
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3087	NC_013203	AAGC	2	8	1543048	1543055	50 %	0 %	25 %	25 %	257785165
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3089	NC_013203	GGTA	2	8	1543676	1543683	25 %	25 %	50 %	0 %	257785167

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.