MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Halomicrobium mukohataei DSM 12286 chromosome

Total Repeats: 2446

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013202	GTCGA	2	10	634	643	20 %	20 %	40 %	20 %	257386086
2	NC_013202	GACGG	2	10	1765	1774	20 %	0 %	60 %	20 %	257386086
3	NC_013202	CGATC	2	10	3264	3273	20 %	20 %	20 %	40 %	257386087
4	NC_013202	CGACG	2	10	3297	3306	20 %	0 %	40 %	40 %	257386087
5	NC_013202	AGCGA	2	10	3808	3817	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_013202	GCGAC	2	10	5556	5565	20 %	0 %	40 %	40 %	257386090
7	NC_013202	GGCTA	2	10	7954	7963	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_013202	GGCGA	2	10	8070	8079	20 %	0 %	60 %	20 %	257386096
9	NC_013202	CGATC	2	10	9820	9829	20 %	20 %	20 %	40 %	257386096
10	NC_013202	GGCGA	2	10	10244	10253	20 %	0 %	60 %	20 %	257386096
11	NC_013202	CGTCA	2	10	10816	10825	20 %	20 %	20 %	40 %	257386098
12	NC_013202	AGCGC	2	10	10876	10885	20 %	0 %	40 %	40 %	257386099
13	NC_013202	CGATC	2	10	11222	11231	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_013202	CCGGC	2	10	12364	12373	0 %	0 %	40 %	60 %	257386101
15	NC_013202	CGACA	2	10	12808	12817	40 %	0 %	20 %	40 %	257386101
16	NC_013202	CGTCG	2	10	12985	12994	0 %	20 %	40 %	40 %	257386102
17	NC_013202	GGCTG	2	10	14223	14232	0 %	20 %	60 %	20 %	257386102
18	NC_013202	CGTCG	2	10	15174	15183	0 %	20 %	40 %	40 %	257386104
19	NC_013202	ACGGA	2	10	16337	16346	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_013202	GCGAC	2	10	17512	17521	20 %	0 %	40 %	40 %	257386107
21	NC_013202	GACGC	2	10	18176	18185	20 %	0 %	40 %	40 %	257386108
22	NC_013202	TCGCT	2	10	19535	19544	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_013202	CGTCG	2	10	20914	20923	0 %	20 %	40 %	40 %	257386110
24	NC_013202	GAGCA	2	10	23508	23517	40 %	0 %	40 %	20 %	257386113
25	NC_013202	TGCGC	2	10	23723	23732	0 %	20 %	40 %	40 %	257386114
26	NC_013202	CGGAC	2	10	23813	23822	20 %	0 %	40 %	40 %	257386114
27	NC_013202	GATCG	2	10	23993	24002	20 %	20 %	40 %	20 %	257386114
28	NC_013202	CCACG	2	10	25240	25249	20 %	0 %	20 %	60 %	257386115
29	NC_013202	GACCG	2	10	26036	26045	20 %	0 %	40 %	40 %	257386115
30	NC_013202	ATCGA	2	10	26463	26472	40 %	20 %	20 %	20 %	257386116
31	NC_013202	GCACA	2	10	26657	26666	40 %	0 %	20 %	40 %	257386116
32	NC_013202	GATCG	2	10	26682	26691	20 %	20 %	40 %	20 %	257386116
33	NC_013202	GCGAC	2	10	27160	27169	20 %	0 %	40 %	40 %	257386116
34	NC_013202	GCGCC	2	10	27194	27203	0 %	0 %	40 %	60 %	257386116
35	NC_013202	TCGCC	2	10	27728	27737	0 %	20 %	20 %	60 %	257386116
36	NC_013202	GACGA	2	10	27994	28003	40 %	0 %	40 %	20 %	257386116
37	NC_013202	GGCTA	2	10	28225	28234	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_013202	GATCG	2	10	28412	28421	20 %	20 %	40 %	20 %	257386117
39	NC_013202	AGGTC	2	10	28745	28754	20 %	20 %	40 %	20 %	257386117
40	NC_013202	CCGTC	2	10	29889	29898	0 %	20 %	20 %	60 %	257386119
41	NC_013202	GCGGT	2	10	30461	30470	0 %	20 %	60 %	20 %	257386119
42	NC_013202	CGCGA	2	10	32136	32145	20 %	0 %	40 %	40 %	257386121
43	NC_013202	TCGGT	2	10	35313	35322	0 %	40 %	40 %	20 %	257386123
44	NC_013202	CGTGG	2	10	36187	36196	0 %	20 %	60 %	20 %	257386123
45	NC_013202	TCGAG	2	10	40429	40438	20 %	20 %	40 %	20 %	257386128
46	NC_013202	CGGTG	2	10	41868	41877	0 %	20 %	60 %	20 %	257386131
47	NC_013202	GCGCC	2	10	42552	42561	0 %	0 %	40 %	60 %	257386131
48	NC_013202	GAACG	2	10	42954	42963	40 %	0 %	40 %	20 %	257386132
49	NC_013202	AGGTC	2	10	45189	45198	20 %	20 %	40 %	20 %	257386134
50	NC_013202	GTCGT	2	10	47094	47103	0 %	40 %	40 %	20 %	257386135
51	NC_013202	ACAGC	2	10	48197	48206	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_013202	GTCGT	2	10	54413	54422	0 %	40 %	40 %	20 %	257386140
53	NC_013202	AGGTG	2	10	54780	54789	20 %	20 %	60 %	0 %	257386140
54	NC_013202	CGGCG	2	10	57156	57165	0 %	0 %	60 %	40 %	257386141
55	NC_013202	GACCG	2	10	57935	57944	20 %	0 %	40 %	40 %	257386141
56	NC_013202	AGTCG	2	10	57966	57975	20 %	20 %	40 %	20 %	257386141
57	NC_013202	CGTGG	2	10	58022	58031	0 %	20 %	60 %	20 %	257386141
58	NC_013202	CGCGA	2	10	60198	60207	20 %	0 %	40 %	40 %	257386145
59	NC_013202	GACCG	2	10	61430	61439	20 %	0 %	40 %	40 %	257386146
60	NC_013202	GGCCT	2	10	61910	61919	0 %	20 %	40 %	40 %	257386146
61	NC_013202	GTACC	2	10	63701	63710	20 %	20 %	20 %	40 %	257386146
62	NC_013202	AATAT	2	10	67658	67667	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013202	TTCGG	2	10	71851	71860	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_013202	CGACG	2	10	72516	72525	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
65	NC_013202	GTGAG	2	10	72769	72778	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013202	TCTAC	2	10	74213	74222	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_013202	CCTAT	2	10	75720	75729	20 %	40 %	0 %	40 %	257386155
68	NC_013202	TTACT	2	10	76200	76209	20 %	60 %	0 %	20 %	257386155
69	NC_013202	TTCAC	2	10	79201	79210	20 %	40 %	0 %	40 %	257386157
70	NC_013202	TTCCG	2	10	80219	80228	0 %	40 %	20 %	40 %	257386157
71	NC_013202	TTCGA	2	10	84698	84707	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_013202	TGTTC	2	10	86018	86027	0 %	60 %	20 %	20 %	257386161
73	NC_013202	TCATA	2	10	86108	86117	40 %	40 %	0 %	20 %	257386161
74	NC_013202	CGTCG	2	10	86770	86779	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
75	NC_013202	GGCTC	2	10	86894	86903	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_013202	CGCGG	2	10	88579	88588	0 %	0 %	60 %	40 %	257386163
77	NC_013202	CGTTC	2	10	90262	90271	0 %	40 %	20 %	40 %	257386163
78	NC_013202	ACGGC	2	10	91441	91450	20 %	0 %	40 %	40 %	257386165
79	NC_013202	TCGAG	2	10	92042	92051	20 %	20 %	40 %	20 %	257386165
80	NC_013202	TCGAT	2	10	93444	93453	20 %	40 %	20 %	20 %	257386167
81	NC_013202	GTCCC	2	10	95637	95646	0 %	20 %	20 %	60 %	257386169
82	NC_013202	GTCGA	2	10	102254	102263	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_013202	CCAGG	2	10	105653	105662	20 %	0 %	40 %	40 %	257386179
84	NC_013202	GCGCC	2	10	106027	106036	0 %	0 %	40 %	60 %	257386180
85	NC_013202	TCGCT	2	10	107490	107499	0 %	40 %	20 %	40 %	257386180
86	NC_013202	GGCGA	2	10	107621	107630	20 %	0 %	60 %	20 %	257386180
87	NC_013202	CGGCG	2	10	107776	107785	0 %	0 %	60 %	40 %	257386180
88	NC_013202	CGGTC	2	10	108188	108197	0 %	20 %	40 %	40 %	257386181
89	NC_013202	CGGTC	2	10	110722	110731	0 %	20 %	40 %	40 %	257386183
90	NC_013202	GATCG	2	10	110900	110909	20 %	20 %	40 %	20 %	257386183
91	NC_013202	GCGTC	2	10	110971	110980	0 %	20 %	40 %	40 %	257386183
92	NC_013202	CGCGA	2	10	111778	111787	20 %	0 %	40 %	40 %	257386184
93	NC_013202	CGCCC	2	10	113915	113924	0 %	0 %	20 %	80 %	257386186
94	NC_013202	GGCGA	2	10	117511	117520	20 %	0 %	60 %	20 %	257386188
95	NC_013202	GCCGG	2	10	118782	118791	0 %	0 %	60 %	40 %	257386190
96	NC_013202	CGGCA	2	10	119195	119204	20 %	0 %	40 %	40 %	257386190
97	NC_013202	CGTCC	2	10	120484	120493	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
98	NC_013202	GCGGG	2	10	121280	121289	0 %	0 %	80 %	20 %	257386192
99	NC_013202	CGGCC	2	10	121550	121559	0 %	0 %	40 %	60 %	257386192
100	NC_013202	CCAGC	2	10	121710	121719	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
101	NC_013202	GGGGT	2	10	127449	127458	0 %	20 %	80 %	0 %	257386197
102	NC_013202	TTCCG	2	10	128455	128464	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_013202	CGCGG	2	10	129324	129333	0 %	0 %	60 %	40 %	257386198
104	NC_013202	CCGAT	2	10	129776	129785	20 %	20 %	20 %	40 %	257386198
105	NC_013202	CGATC	2	10	130473	130482	20 %	20 %	20 %	40 %	257386198
106	NC_013202	CGCTC	2	10	131730	131739	0 %	20 %	20 %	60 %	257386199
107	NC_013202	GGCCG	2	10	132110	132119	0 %	0 %	60 %	40 %	257386199
108	NC_013202	GCAGA	2	10	132161	132170	40 %	0 %	40 %	20 %	257386199
109	NC_013202	GCTGG	2	10	134161	134170	0 %	20 %	60 %	20 %	257386202
110	NC_013202	GACCG	2	10	134688	134697	20 %	0 %	40 %	40 %	257386203
111	NC_013202	CTTCG	2	10	137501	137510	0 %	40 %	20 %	40 %	257386208
112	NC_013202	CGGGT	2	10	138458	138467	0 %	20 %	60 %	20 %	257386209
113	NC_013202	GTCAC	2	10	140367	140376	20 %	20 %	20 %	40 %	257386210
114	NC_013202	CCGTT	2	10	140515	140524	0 %	40 %	20 %	40 %	257386210
115	NC_013202	GGCCG	2	10	141254	141263	0 %	0 %	60 %	40 %	257386210
116	NC_013202	AGTCG	2	10	142950	142959	20 %	20 %	40 %	20 %	257386212
117	NC_013202	GCAGC	2	10	142964	142973	20 %	0 %	40 %	40 %	257386212
118	NC_013202	CGACG	2	10	144780	144789	20 %	0 %	40 %	40 %	257386214
119	NC_013202	CCGGG	2	10	145945	145954	0 %	0 %	60 %	40 %	257386216
120	NC_013202	ACGGC	2	10	146498	146507	20 %	0 %	40 %	40 %	257386216
121	NC_013202	GCGTC	2	10	146993	147002	0 %	20 %	40 %	40 %	257386217
122	NC_013202	CGGTT	2	10	147441	147450	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_013202	CAGCG	2	10	147704	147713	20 %	0 %	40 %	40 %	257386218
124	NC_013202	ACCCG	2	10	148516	148525	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
125	NC_013202	CGGCG	2	10	148823	148832	0 %	0 %	60 %	40 %	257386219
126	NC_013202	TCGCA	2	10	148888	148897	20 %	20 %	20 %	40 %	257386219
127	NC_013202	ACGCC	2	10	149218	149227	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
128	NC_013202	ACGCC	2	10	149378	149387	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
129	NC_013202	CGGCG	2	10	150294	150303	0 %	0 %	60 %	40 %	257386220
130	NC_013202	GCGTC	2	10	150326	150335	0 %	20 %	40 %	40 %	257386220
131	NC_013202	GGACA	2	10	150664	150673	40 %	0 %	40 %	20 %	257386220
132	NC_013202	GGACG	2	10	151599	151608	20 %	0 %	60 %	20 %	257386221
133	NC_013202	TCCCG	2	10	152019	152028	0 %	20 %	20 %	60 %	257386221
134	NC_013202	TATGA	2	10	155865	155874	40 %	40 %	20 %	0 %	257386225
135	NC_013202	GACTG	2	10	157003	157012	20 %	20 %	40 %	20 %	257386226
136	NC_013202	TCGCT	2	10	157231	157240	0 %	40 %	20 %	40 %	257386226
137	NC_013202	CCAGT	2	10	158018	158027	20 %	20 %	20 %	40 %	257386227
138	NC_013202	CTCGT	2	10	158859	158868	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_013202	AGAAC	2	10	159889	159898	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_013202	GGGGT	2	10	163795	163804	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013202	AGACG	2	10	164734	164743	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_013202	TTACC	2	10	165437	165446	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
143	NC_013202	CCGAT	2	10	167287	167296	20 %	20 %	20 %	40 %	257386241
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146	NC_013202	GCTCG	2	10	170156	170165	0 %	20 %	40 %	40 %	257386243
147	NC_013202	AGACG	2	10	170904	170913	40 %	0 %	40 %	20 %	257386244
148	NC_013202	TCCGG	2	10	171397	171406	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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156	NC_013202	GAGCG	2	10	177026	177035	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
157	NC_013202	CTCGG	2	10	177501	177510	0 %	20 %	40 %	40 %	257386251
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162	NC_013202	TCCCC	2	10	182693	182702	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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164	NC_013202	CCGGA	2	10	184196	184205	20 %	0 %	40 %	40 %	257386259
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197	NC_013202	CGGCG	2	10	224143	224152	0 %	0 %	60 %	40 %	257386296
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203	NC_013202	GTCGA	2	10	229034	229043	20 %	20 %	40 %	20 %	257386301
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215	NC_013202	GTCGA	2	10	246441	246450	20 %	20 %	40 %	20 %	257386320
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241	NC_013202	AATTG	2	10	279488	279497	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
242	NC_013202	AGCGA	2	10	280031	280040	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
243	NC_013202	AGTCG	2	10	281791	281800	20 %	20 %	40 %	20 %	257386356
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246	NC_013202	CGACG	2	10	284072	284081	20 %	0 %	40 %	40 %	257386359
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249	NC_013202	CGCGC	2	10	288065	288074	0 %	0 %	40 %	60 %	257386363
250	NC_013202	GGACG	2	10	288505	288514	20 %	0 %	60 %	20 %	257386364
251	NC_013202	TTCGA	2	10	288806	288815	20 %	40 %	20 %	20 %	257386364
252	NC_013202	GGTCG	2	10	289352	289361	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
253	NC_013202	CGTCG	2	10	291466	291475	0 %	20 %	40 %	40 %	257386367
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258	NC_013202	GGATC	2	10	302459	302468	20 %	20 %	40 %	20 %	257386383
259	NC_013202	CGCCA	2	10	303921	303930	20 %	0 %	20 %	60 %	257386386
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261	NC_013202	GCCGG	2	10	305659	305668	0 %	0 %	60 %	40 %	257386387
262	NC_013202	CCGTC	2	10	305828	305837	0 %	20 %	20 %	60 %	257386387
263	NC_013202	CGCGA	2	10	309863	309872	20 %	0 %	40 %	40 %	257386390
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266	NC_013202	TCGCC	2	10	313680	313689	0 %	20 %	20 %	60 %	257386392
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400	NC_013202	CGACG	2	10	493310	493319	20 %	0 %	40 %	40 %	257386590
401	NC_013202	GGCGA	2	10	496650	496659	20 %	0 %	60 %	20 %	257386594
402	NC_013202	TCGCT	2	10	498048	498057	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
403	NC_013202	CGACG	2	10	499379	499388	20 %	0 %	40 %	40 %	257386597
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433	NC_013202	GGGTA	2	10	536615	536624	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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497	NC_013202	CAGAC	2	10	607769	607778	40 %	0 %	20 %	40 %	257386717
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