MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Halomicrobium mukohataei DSM 12286 chromosome

Total Repeats: 57507

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013202	CGG	2	6	101	106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386086
2	NC_013202	GTG	2	6	129	134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257386086
3	NC_013202	GCT	2	6	258	263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386086
4	NC_013202	ACG	2	6	284	289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386086
5	NC_013202	CGC	2	6	312	317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386086
6	NC_013202	GAC	3	9	324	332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386086
7	NC_013202	CGA	2	6	396	401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386086
8	NC_013202	GCG	2	6	409	414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386086
9	NC_013202	CGG	2	6	503	508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386086
10	NC_013202	GCG	2	6	560	565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386086
11	NC_013202	CCA	2	6	792	797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257386086
12	NC_013202	GAG	2	6	883	888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257386086
13	NC_013202	GAC	2	6	892	897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386086
14	NC_013202	GAC	2	6	916	921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386086
15	NC_013202	GTC	2	6	925	930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386086
16	NC_013202	TCG	2	6	968	973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386086
17	NC_013202	GGA	2	6	1035	1040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257386086
18	NC_013202	GCC	2	6	1122	1127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386086
19	NC_013202	CGA	2	6	1296	1301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386086
20	NC_013202	ACG	2	6	1331	1336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386086
21	NC_013202	CGA	2	6	1398	1403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386086
22	NC_013202	GTC	3	9	1411	1419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386086
23	NC_013202	CGA	2	6	1437	1442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386086
24	NC_013202	CGA	2	6	1476	1481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386086
25	NC_013202	GCC	3	9	1494	1502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386086
26	NC_013202	CCG	2	6	1515	1520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386086
27	NC_013202	CGG	2	6	1595	1600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386086
28	NC_013202	CGC	2	6	1605	1610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386086
29	NC_013202	CGT	2	6	1626	1631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386086
30	NC_013202	CGA	2	6	1632	1637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386086
31	NC_013202	GAC	2	6	1660	1665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386086
32	NC_013202	GCC	2	6	1696	1701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386086
33	NC_013202	CGA	2	6	1722	1727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386086
34	NC_013202	TCG	2	6	1748	1753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386086
35	NC_013202	GTC	2	6	1780	1785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386086
36	NC_013202	ACC	2	6	1802	1807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257386086
37	NC_013202	GCG	2	6	1829	1834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386086
38	NC_013202	CGA	2	6	1851	1856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386086
39	NC_013202	GGC	2	6	1861	1866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386086
40	NC_013202	GAC	2	6	1881	1886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386086
41	NC_013202	GCG	2	6	1958	1963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386086
42	NC_013202	TCC	2	6	1964	1969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386086
43	NC_013202	CTT	2	6	2034	2039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257386086
44	NC_013202	CGA	2	6	2151	2156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386086
45	NC_013202	CGA	2	6	2250	2255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386086
46	NC_013202	TCG	3	9	2264	2272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386086
47	NC_013202	CGA	2	6	2328	2333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386086
48	NC_013202	GCC	3	9	2346	2354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386086
49	NC_013202	CCG	2	6	2367	2372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386086
50	NC_013202	CGC	2	6	2457	2462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386086
51	NC_013202	TCG	2	6	2477	2482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386086
52	NC_013202	CGA	2	6	2484	2489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386086
53	NC_013202	GCC	2	6	2491	2496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386086
54	NC_013202	ACG	2	6	2530	2535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386086
55	NC_013202	CCT	2	6	2538	2543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386086
56	NC_013202	GAC	2	6	2584	2589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386086
57	NC_013202	CAG	2	6	2602	2607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386086
58	NC_013202	GAG	2	6	2836	2841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257386087
59	NC_013202	ATC	2	6	2869	2874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257386087
60	NC_013202	CGG	3	9	2877	2885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386087
61	NC_013202	GCG	2	6	2924	2929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386087
62	NC_013202	GTC	2	6	2941	2946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386087
63	NC_013202	GAA	2	6	2949	2954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257386087
64	NC_013202	CGG	2	6	2964	2969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386087
65	NC_013202	TGA	2	6	2993	2998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386087
66	NC_013202	GCC	2	6	3127	3132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386087
67	NC_013202	ACC	2	6	3194	3199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257386087
68	NC_013202	CGG	2	6	3204	3209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386087
69	NC_013202	ACG	2	6	3311	3316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386087
70	NC_013202	CGA	2	6	3336	3341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386087
71	NC_013202	CGA	2	6	3402	3407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386087
72	NC_013202	CGT	2	6	3477	3482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386087
73	NC_013202	ACG	2	6	3503	3508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386087
74	NC_013202	ACC	2	6	3538	3543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257386087
75	NC_013202	TGC	2	6	3581	3586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386087
76	NC_013202	CGA	2	6	3659	3664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386087
77	NC_013202	GTC	3	9	3864	3872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386088
78	NC_013202	CCT	2	6	3884	3889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386088
79	NC_013202	TCG	2	6	3916	3921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386088
80	NC_013202	TCG	2	6	3928	3933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386088
81	NC_013202	TCG	2	6	4011	4016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386088
82	NC_013202	GTC	2	6	4017	4022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386088
83	NC_013202	TCG	2	6	4072	4077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386088
84	NC_013202	CGC	2	6	4095	4100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386088
85	NC_013202	GAC	2	6	4215	4220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386088
86	NC_013202	CTC	2	6	4221	4226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386088
87	NC_013202	TCT	2	6	4387	4392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257386088
88	NC_013202	TCG	2	6	4527	4532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386088
89	NC_013202	CGA	2	6	4797	4802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386089
90	NC_013202	CGG	2	6	4879	4884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386089
91	NC_013202	TCG	2	6	5000	5005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386089
92	NC_013202	GCG	2	6	5006	5011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386089
93	NC_013202	CAG	2	6	5047	5052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386089
94	NC_013202	CGG	2	6	5259	5264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386090
95	NC_013202	CGA	2	6	5296	5301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386090
96	NC_013202	CGG	2	6	5319	5324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386090
97	NC_013202	CCG	2	6	5352	5357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386090
98	NC_013202	GAC	2	6	5363	5368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386090
99	NC_013202	GCG	2	6	5378	5383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386090
100	NC_013202	GAC	2	6	5432	5437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386090
101	NC_013202	TCG	2	6	5481	5486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386090
102	NC_013202	GAC	2	6	5570	5575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386090
103	NC_013202	CGA	2	6	5581	5586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386090
104	NC_013202	CGA	2	6	5596	5601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386090
105	NC_013202	CGA	2	6	5611	5616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386090
106	NC_013202	TCC	2	6	5720	5725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386091
107	NC_013202	GCC	2	6	5878	5883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386091
108	NC_013202	CGG	2	6	5952	5957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386091
109	NC_013202	ACG	2	6	5975	5980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386092
110	NC_013202	GTC	2	6	5988	5993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386092
111	NC_013202	GCC	2	6	5998	6003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386092
112	NC_013202	CGT	2	6	6020	6025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386092
113	NC_013202	TCG	2	6	6040	6045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386092
114	NC_013202	GAC	2	6	6153	6158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386092
115	NC_013202	CGG	2	6	6176	6181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386092
116	NC_013202	CGA	2	6	6185	6190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386092
117	NC_013202	TCG	2	6	6196	6201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386092
118	NC_013202	GTC	2	6	6207	6212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386092
119	NC_013202	CGC	2	6	6242	6247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386093
120	NC_013202	GCC	2	6	6252	6257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386093
121	NC_013202	GCC	2	6	6270	6275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386093
122	NC_013202	CTG	2	6	6300	6305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386093
123	NC_013202	TCG	2	6	6385	6390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386093
124	NC_013202	TCG	2	6	6464	6469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386093
125	NC_013202	TCG	2	6	6475	6480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386093
126	NC_013202	GTC	2	6	6483	6488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386093
127	NC_013202	TCG	2	6	6493	6498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386093
128	NC_013202	CTG	2	6	6534	6539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386093
129	NC_013202	CTG	2	6	6555	6560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386093
130	NC_013202	CGG	2	6	6609	6614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386093
131	NC_013202	TCG	2	6	6728	6733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386094
132	NC_013202	TCG	2	6	6761	6766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386094
133	NC_013202	GCG	2	6	6782	6787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386094
134	NC_013202	GAG	2	6	6812	6817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257386094
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137	NC_013202	GTC	2	6	6919	6924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386094
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155	NC_013202	CGA	2	6	7752	7757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386095
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160	NC_013202	TAC	2	6	8004	8009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257386096
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162	NC_013202	CGG	2	6	8046	8051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386096
163	NC_013202	TGG	2	6	8058	8063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257386096
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251	NC_013202	CTG	2	6	11917	11922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386100
252	NC_013202	CTT	2	6	11931	11936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257386100
253	NC_013202	CTT	2	6	12000	12005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257386100
254	NC_013202	TCG	2	6	12059	12064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386100
255	NC_013202	ACG	2	6	12073	12078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386100
256	NC_013202	GCT	2	6	12081	12086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386100
257	NC_013202	CGT	2	6	12090	12095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386100
258	NC_013202	CGT	2	6	12125	12130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386101
259	NC_013202	CTT	2	6	12318	12323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257386101
260	NC_013202	GCG	2	6	12337	12342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386101
261	NC_013202	CGA	2	6	12377	12382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386101
262	NC_013202	GCC	2	6	12396	12401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386101
263	NC_013202	TCC	2	6	12409	12414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386101
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265	NC_013202	CGA	2	6	12425	12430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386101
266	NC_013202	CGC	2	6	12446	12451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386101
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270	NC_013202	CGA	2	6	12620	12625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386101
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273	NC_013202	TCG	2	6	12685	12690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386101
274	NC_013202	GAC	2	6	12732	12737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386101
275	NC_013202	CGA	2	6	13040	13045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386102
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277	NC_013202	GCG	2	6	13377	13382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386102
278	NC_013202	TCG	2	6	13405	13410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386102
279	NC_013202	CGC	2	6	13436	13441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386102
280	NC_013202	CGT	2	6	13450	13455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386102
281	NC_013202	GCC	2	6	13560	13565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386102
282	NC_013202	TGC	2	6	13675	13680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386102
283	NC_013202	AGT	2	6	13699	13704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386102
284	NC_013202	TCG	2	6	13725	13730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386102
285	NC_013202	GCG	2	6	13731	13736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386102
286	NC_013202	GAT	2	6	13811	13816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386102
287	NC_013202	GTC	2	6	13855	13860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386102
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373	NC_013202	ACG	2	6	18630	18635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386109
374	NC_013202	CTC	2	6	18674	18679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386109
375	NC_013202	GTC	2	6	18755	18760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386109
376	NC_013202	CGA	2	6	18763	18768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386109
377	NC_013202	TGT	2	6	18840	18845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257386109
378	NC_013202	GTA	2	6	18851	18856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386109
379	NC_013202	CGT	2	6	18946	18951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386109
380	NC_013202	TCG	2	6	19014	19019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386109
381	NC_013202	CGT	2	6	19060	19065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386109
382	NC_013202	CGC	2	6	19072	19077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386109
383	NC_013202	GGT	2	6	19090	19095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257386109
384	NC_013202	GCT	2	6	19105	19110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386109
385	NC_013202	GCG	3	9	19173	19181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386109
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387	NC_013202	CGT	2	6	19295	19300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386109
388	NC_013202	GTC	2	6	19627	19632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386110
389	NC_013202	CGA	2	6	19635	19640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386110
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391	NC_013202	GCC	2	6	19957	19962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386110
392	NC_013202	GTC	2	6	19973	19978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386110
393	NC_013202	CCT	2	6	20022	20027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386110
394	NC_013202	CAG	2	6	20038	20043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386110
395	NC_013202	TCG	2	6	20100	20105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386110
396	NC_013202	TCG	3	9	20111	20119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386110
397	NC_013202	TCG	2	6	20138	20143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386110
398	NC_013202	GCG	3	9	20147	20155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386110
399	NC_013202	GGC	2	6	20190	20195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386110
400	NC_013202	CGT	2	6	20238	20243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386110
401	NC_013202	CGA	2	6	20298	20303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386110
402	NC_013202	CGT	2	6	20332	20337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386110
403	NC_013202	CCT	2	6	20421	20426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386110
404	NC_013202	CGG	2	6	20490	20495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386110
405	NC_013202	CCA	2	6	20502	20507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257386110
406	NC_013202	TCA	2	6	20514	20519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257386110
407	NC_013202	GTC	2	6	20533	20538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386110
408	NC_013202	CAG	2	6	20630	20635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386110
409	NC_013202	GGC	2	6	20659	20664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386110
410	NC_013202	TTC	2	6	20674	20679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257386110
411	NC_013202	TCC	2	6	20783	20788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386110
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413	NC_013202	TCG	2	6	21041	21046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386110
414	NC_013202	GTG	2	6	21089	21094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257386110
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495	NC_013202	CGA	2	6	25840	25845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386115
496	NC_013202	TGA	2	6	25854	25859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386115
497	NC_013202	CGA	3	9	25921	25929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386115
498	NC_013202	CGA	2	6	25969	25974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386115
499	NC_013202	CGT	2	6	26071	26076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386115
500	NC_013202	GCG	2	6	26085	26090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386115

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