MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Halomicrobium mukohataei DSM 12286 plasmid pHmuk01

Total Repeats: 4161

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013201	AGC	2	6	77	82	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372909
2	NC_013201	GAG	2	6	224	229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257372909
3	NC_013201	GCT	2	6	391	396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372909
4	NC_013201	CGC	2	6	418	423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372909
5	NC_013201	CGG	2	6	463	468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372909
6	NC_013201	CGA	2	6	493	498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372909
7	NC_013201	CGA	2	6	511	516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372909
8	NC_013201	GTC	2	6	539	544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372909
9	NC_013201	CGA	2	6	637	642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372909
10	NC_013201	ACG	2	6	654	659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372909
11	NC_013201	GAG	2	6	668	673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257372909
12	NC_013201	AAG	2	6	677	682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257372909
13	NC_013201	CGA	2	6	688	693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372909
14	NC_013201	GCT	2	6	700	705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372909
15	NC_013201	GAT	2	6	742	747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257372909
16	NC_013201	CGG	2	6	760	765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372909
17	NC_013201	CGA	2	6	775	780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372909
18	NC_013201	GGC	2	6	786	791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372909
19	NC_013201	GAC	2	6	863	868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372909
20	NC_013201	CAG	2	6	884	889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372909
21	NC_013201	GGC	2	6	976	981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372909
22	NC_013201	GGC	2	6	1022	1027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372909
23	NC_013201	CGG	2	6	1045	1050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372909
24	NC_013201	ACG	2	6	1077	1082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372909
25	NC_013201	TCG	2	6	1110	1115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372909
26	NC_013201	ACG	2	6	1121	1126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372909
27	NC_013201	GAG	2	6	1136	1141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257372909
28	NC_013201	GAG	2	6	1160	1165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257372909
29	NC_013201	GAC	2	6	1196	1201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372909
30	NC_013201	TTC	2	6	1226	1231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257372909
31	NC_013201	CGA	2	6	1270	1275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372909
32	NC_013201	CCG	2	6	1280	1285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372909
33	NC_013201	CGT	2	6	1345	1350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372909
34	NC_013201	GGA	2	6	1381	1386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257372909
35	NC_013201	GCT	2	6	1445	1450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372910
36	NC_013201	GCT	2	6	1457	1462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372910
37	NC_013201	CGC	2	6	1522	1527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372910
38	NC_013201	TGT	2	6	1528	1533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257372910
39	NC_013201	TTC	2	6	1545	1550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257372910
40	NC_013201	CTG	2	6	1551	1556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372910
41	NC_013201	ATC	2	6	1770	1775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257372910
42	NC_013201	TCG	2	6	1777	1782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372910
43	NC_013201	CGC	2	6	1835	1840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372910
44	NC_013201	CCT	2	6	1871	1876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257372910
45	NC_013201	CGG	2	6	1912	1917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372910
46	NC_013201	CGG	2	6	1933	1938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372910
47	NC_013201	CCG	2	6	1980	1985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372910
48	NC_013201	ACA	2	6	2059	2064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257372910
49	NC_013201	ATC	3	9	2067	2075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257372910
50	NC_013201	CGG	2	6	2126	2131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372910
51	NC_013201	CGA	2	6	2134	2139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372910
52	NC_013201	GAC	3	9	2204	2212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372910
53	NC_013201	AAG	2	6	2226	2231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257372910
54	NC_013201	TCA	2	6	2251	2256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257372910
55	NC_013201	CTA	2	6	2294	2299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257372910
56	NC_013201	ATC	2	6	2370	2375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257372910
57	NC_013201	AGG	2	6	2432	2437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257372911
58	NC_013201	CGG	2	6	2451	2456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372911
59	NC_013201	TCG	2	6	2468	2473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372911
60	NC_013201	TGA	2	6	2486	2491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257372911
61	NC_013201	TCG	3	9	2510	2518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372911
62	NC_013201	CGC	2	6	2616	2621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372911
63	NC_013201	CGT	2	6	2673	2678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372911
64	NC_013201	GCT	2	6	2694	2699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372911
65	NC_013201	CGA	2	6	2792	2797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372911
66	NC_013201	CTG	2	6	2800	2805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372911
67	NC_013201	TCC	2	6	2867	2872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257372911
68	NC_013201	TCT	2	6	2897	2902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257372911
69	NC_013201	GCT	2	6	2937	2942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372911
70	NC_013201	TAC	2	6	2983	2988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257372911
71	NC_013201	CGT	2	6	2991	2996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372911
72	NC_013201	GTC	2	6	3012	3017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372911
73	NC_013201	GTG	2	6	3199	3204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257372911
74	NC_013201	CGG	2	6	3243	3248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372911
75	NC_013201	ACG	2	6	3308	3313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372912
76	NC_013201	GAC	2	6	3325	3330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372912
77	NC_013201	TCG	2	6	3347	3352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372912
78	NC_013201	TCG	2	6	3401	3406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372912
79	NC_013201	CGA	2	6	3428	3433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372912
80	NC_013201	CGG	2	6	3468	3473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372912
81	NC_013201	GTC	2	6	3496	3501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372912
82	NC_013201	GAA	2	6	3579	3584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257372912
83	NC_013201	TCG	2	6	3607	3612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372912
84	NC_013201	GAC	2	6	3618	3623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372912
85	NC_013201	GAT	2	6	3660	3665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257372912
86	NC_013201	CCT	2	6	3678	3683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257372912
87	NC_013201	GGC	2	6	3709	3714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372912
88	NC_013201	GAC	2	6	3858	3863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372912
89	NC_013201	ACG	2	6	3926	3931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372912
90	NC_013201	CTC	2	6	3934	3939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257372912
91	NC_013201	CAG	2	6	3940	3945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372912
92	NC_013201	TCG	2	6	3989	3994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372912
93	NC_013201	CTT	2	6	4023	4028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257372912
94	NC_013201	GAC	2	6	4105	4110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372912
95	NC_013201	GAC	2	6	4162	4167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372912
96	NC_013201	GTC	2	6	4237	4242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372912
97	NC_013201	GCG	2	6	4339	4344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372912
98	NC_013201	CGA	2	6	4359	4364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372912
99	NC_013201	GGC	2	6	4377	4382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372912
100	NC_013201	TCG	2	6	4394	4399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_013201	GAC	2	6	4447	4452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_013201	GGC	2	6	4592	4597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_013201	ATT	2	6	4607	4612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013201	CGA	2	6	4646	4651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_013201	GTC	2	6	4684	4689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372913
106	NC_013201	CGT	2	6	4815	4820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372913
107	NC_013201	CGG	2	6	4848	4853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372913
108	NC_013201	GCT	2	6	4860	4865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372913
109	NC_013201	AGT	2	6	4872	4877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257372913
110	NC_013201	AGC	2	6	4895	4900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372913
111	NC_013201	GAG	2	6	4915	4920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257372913
112	NC_013201	CGT	2	6	5230	5235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372913
113	NC_013201	CGG	2	6	5257	5262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372913
114	NC_013201	TCC	2	6	5297	5302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257372913
115	NC_013201	GAA	2	6	5443	5448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257372913
116	NC_013201	GAC	2	6	5521	5526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372913
117	NC_013201	CGA	2	6	5553	5558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372913
118	NC_013201	GAC	2	6	5602	5607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372913
119	NC_013201	TCG	3	9	5612	5620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372913
120	NC_013201	ACG	2	6	5730	5735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372913
121	NC_013201	CGA	3	9	5757	5765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372913
122	NC_013201	GAC	2	6	5860	5865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372913
123	NC_013201	CGA	3	9	5934	5942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372913
124	NC_013201	CGA	2	6	5985	5990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372913
125	NC_013201	TCG	2	6	6074	6079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372913
126	NC_013201	CGC	2	6	6087	6092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372913
127	NC_013201	GTC	2	6	6122	6127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372913
128	NC_013201	CTC	2	6	6205	6210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257372913
129	NC_013201	GGT	2	6	6264	6269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257372913
130	NC_013201	TCG	2	6	6275	6280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372913
131	NC_013201	CGA	2	6	6324	6329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372913
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151	NC_013201	GTT	2	6	7888	7893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013201	AGT	2	6	7970	7975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_013201	CGA	2	6	7993	7998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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249	NC_013201	GGT	2	6	14411	14416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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251	NC_013201	CGG	2	6	14725	14730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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255	NC_013201	CGC	2	6	15082	15087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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257	NC_013201	AGA	2	6	15346	15351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
258	NC_013201	TTC	2	6	15559	15564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_013201	CCA	2	6	15634	15639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
260	NC_013201	GGC	2	6	15640	15645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_013201	TCA	2	6	15729	15734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
262	NC_013201	AGT	2	6	15791	15796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
263	NC_013201	GCT	2	6	15855	15860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_013201	CCG	2	6	15874	15879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
265	NC_013201	TTG	2	6	15966	15971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
266	NC_013201	CAG	2	6	15993	15998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_013201	AGG	2	6	16033	16038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_013201	TAC	2	6	16209	16214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
270	NC_013201	CGG	2	6	16395	16400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_013201	CGG	2	6	16502	16507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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275	NC_013201	GGC	2	6	16678	16683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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280	NC_013201	CTG	2	6	17168	17173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_013201	CAC	2	6	17228	17233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
282	NC_013201	GCG	2	6	17520	17525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_013201	CGG	2	6	17621	17626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_013201	ACC	2	6	17666	17671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
285	NC_013201	GGC	2	6	17676	17681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
286	NC_013201	TCG	2	6	17708	17713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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301	NC_013201	GTC	2	6	18599	18604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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384	NC_013201	CGG	2	6	22996	23001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372919
385	NC_013201	CGT	2	6	23015	23020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372919
386	NC_013201	TAC	2	6	23079	23084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257372919
387	NC_013201	CGG	2	6	23150	23155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372919
388	NC_013201	CGT	2	6	23159	23164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372919
389	NC_013201	GAC	2	6	23193	23198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372919
390	NC_013201	GTC	2	6	23253	23258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372919
391	NC_013201	TCG	2	6	23260	23265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372919
392	NC_013201	CGT	2	6	23288	23293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372919
393	NC_013201	CGA	2	6	23303	23308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372919
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397	NC_013201	CGA	2	6	23456	23461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372919
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400	NC_013201	CGA	2	6	23627	23632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372919
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402	NC_013201	CTT	2	6	23849	23854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257372919
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405	NC_013201	CAC	2	6	24031	24036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257372920
406	NC_013201	CCA	2	6	24042	24047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257372920
407	NC_013201	CGC	2	6	24072	24077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372920
408	NC_013201	TCC	2	6	24118	24123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257372920
409	NC_013201	TCG	2	6	24124	24129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372920
410	NC_013201	TCC	2	6	24170	24175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257372920
411	NC_013201	CGG	2	6	24207	24212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372920
412	NC_013201	CGA	2	6	24213	24218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372920
413	NC_013201	GAG	2	6	24247	24252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257372920
414	NC_013201	GCC	3	9	24292	24300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372920
415	NC_013201	GCC	2	6	24304	24309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372920
416	NC_013201	GCT	2	6	24321	24326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372920
417	NC_013201	CGT	3	9	24360	24368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372920
418	NC_013201	CTA	2	6	24438	24443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257372920
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420	NC_013201	CTT	2	6	24483	24488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257372920
421	NC_013201	GTC	2	6	24493	24498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372920
422	NC_013201	GTC	2	6	24532	24537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372920
423	NC_013201	CCG	2	6	24655	24660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
424	NC_013201	GTC	2	6	24745	24750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372921
425	NC_013201	CGA	2	6	24757	24762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372921
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431	NC_013201	CGA	2	6	24960	24965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372921
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434	NC_013201	CGA	2	6	25035	25040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372921
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449	NC_013201	GGA	2	6	25965	25970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
450	NC_013201	GTG	2	6	26013	26018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257372922
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458	NC_013201	CGA	2	6	26236	26241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372922
459	NC_013201	CGG	2	6	26305	26310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372922
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478	NC_013201	AAC	2	6	27023	27028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257372923
479	NC_013201	TCG	2	6	27087	27092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372923
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482	NC_013201	CGA	2	6	27326	27331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372924
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485	NC_013201	CGG	2	6	27516	27521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372924
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490	NC_013201	CGC	2	6	27666	27671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372924
491	NC_013201	CGA	2	6	27729	27734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372924
492	NC_013201	TCG	2	6	27809	27814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372924
493	NC_013201	CCG	2	6	27827	27832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372924
494	NC_013201	TCG	2	6	27842	27847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372924
495	NC_013201	GCC	2	6	27901	27906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372924
496	NC_013201	GGC	2	6	27966	27971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372924
497	NC_013201	CGA	2	6	27996	28001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372924
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499	NC_013201	TCC	2	6	28082	28087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257372924
500	NC_013201	CGA	2	6	28098	28103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372924

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