MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Halomicrobium mukohataei DSM 12286 plasmid pHmuk01

Total Repeats: 3652

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013201	AGC	2	6	77	82	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372909
2	NC_013201	GAG	2	6	224	229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257372909
3	NC_013201	GCT	2	6	391	396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372909
4	NC_013201	CGC	2	6	418	423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372909
5	NC_013201	CGG	2	6	463	468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372909
6	NC_013201	CGA	2	6	493	498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372909
7	NC_013201	CGA	2	6	511	516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372909
8	NC_013201	GTC	2	6	539	544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372909
9	NC_013201	CGA	2	6	637	642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372909
10	NC_013201	ACG	2	6	654	659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372909
11	NC_013201	GAG	2	6	668	673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257372909
12	NC_013201	AAG	2	6	677	682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257372909
13	NC_013201	CGA	2	6	688	693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372909
14	NC_013201	GCT	2	6	700	705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372909
15	NC_013201	GAT	2	6	742	747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257372909
16	NC_013201	CGG	2	6	760	765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372909
17	NC_013201	CGA	2	6	775	780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372909
18	NC_013201	GGC	2	6	786	791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372909
19	NC_013201	GAC	2	6	863	868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372909
20	NC_013201	CAG	2	6	884	889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372909
21	NC_013201	GGC	2	6	976	981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372909
22	NC_013201	GGC	2	6	1022	1027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372909
23	NC_013201	CGG	2	6	1045	1050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372909
24	NC_013201	ACG	2	6	1077	1082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372909
25	NC_013201	TCG	2	6	1110	1115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372909
26	NC_013201	ACG	2	6	1121	1126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372909
27	NC_013201	GAG	2	6	1136	1141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257372909
28	NC_013201	GAG	2	6	1160	1165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257372909
29	NC_013201	GAC	2	6	1196	1201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372909
30	NC_013201	TTC	2	6	1226	1231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257372909
31	NC_013201	CGA	2	6	1270	1275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372909
32	NC_013201	CCG	2	6	1280	1285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372909
33	NC_013201	CGT	2	6	1345	1350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372909
34	NC_013201	GGA	2	6	1381	1386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257372909
35	NC_013201	GCT	2	6	1445	1450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372910
36	NC_013201	GCT	2	6	1457	1462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372910
37	NC_013201	CGC	2	6	1522	1527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372910
38	NC_013201	TGT	2	6	1528	1533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257372910
39	NC_013201	TTC	2	6	1545	1550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257372910
40	NC_013201	CTG	2	6	1551	1556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372910
41	NC_013201	ATC	2	6	1770	1775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257372910
42	NC_013201	TCG	2	6	1777	1782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372910
43	NC_013201	CGC	2	6	1835	1840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372910
44	NC_013201	CCT	2	6	1871	1876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257372910
45	NC_013201	CGG	2	6	1912	1917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372910
46	NC_013201	CGG	2	6	1933	1938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372910
47	NC_013201	CCG	2	6	1980	1985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372910
48	NC_013201	ACA	2	6	2059	2064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257372910
49	NC_013201	ATC	3	9	2067	2075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257372910
50	NC_013201	CGG	2	6	2126	2131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372910
51	NC_013201	CGA	2	6	2134	2139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372910
52	NC_013201	GAC	3	9	2204	2212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372910
53	NC_013201	AAG	2	6	2226	2231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257372910
54	NC_013201	TCA	2	6	2251	2256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257372910
55	NC_013201	CTA	2	6	2294	2299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257372910
56	NC_013201	ATC	2	6	2370	2375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257372910
57	NC_013201	AGG	2	6	2432	2437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257372911
58	NC_013201	CGG	2	6	2451	2456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372911
59	NC_013201	TCG	2	6	2468	2473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372911
60	NC_013201	TGA	2	6	2486	2491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257372911
61	NC_013201	TCG	3	9	2510	2518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372911
62	NC_013201	CGC	2	6	2616	2621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372911
63	NC_013201	CGT	2	6	2673	2678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372911
64	NC_013201	GCT	2	6	2694	2699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372911
65	NC_013201	CGA	2	6	2792	2797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372911
66	NC_013201	CTG	2	6	2800	2805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372911
67	NC_013201	TCC	2	6	2867	2872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257372911
68	NC_013201	TCT	2	6	2897	2902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257372911
69	NC_013201	GCT	2	6	2937	2942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372911
70	NC_013201	TAC	2	6	2983	2988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257372911
71	NC_013201	CGT	2	6	2991	2996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372911
72	NC_013201	GTC	2	6	3012	3017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372911
73	NC_013201	GTG	2	6	3199	3204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257372911
74	NC_013201	CGG	2	6	3243	3248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372911
75	NC_013201	ACG	2	6	3308	3313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372912
76	NC_013201	GAC	2	6	3325	3330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372912
77	NC_013201	TCG	2	6	3347	3352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372912
78	NC_013201	TCG	2	6	3401	3406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372912
79	NC_013201	CGA	2	6	3428	3433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372912
80	NC_013201	CGG	2	6	3468	3473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372912
81	NC_013201	GTC	2	6	3496	3501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372912
82	NC_013201	GAA	2	6	3579	3584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257372912
83	NC_013201	TCG	2	6	3607	3612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372912
84	NC_013201	GAC	2	6	3618	3623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372912
85	NC_013201	GAT	2	6	3660	3665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257372912
86	NC_013201	CCT	2	6	3678	3683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257372912
87	NC_013201	GGC	2	6	3709	3714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372912
88	NC_013201	GAC	2	6	3858	3863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372912
89	NC_013201	ACG	2	6	3926	3931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372912
90	NC_013201	CTC	2	6	3934	3939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257372912
91	NC_013201	CAG	2	6	3940	3945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372912
92	NC_013201	TCG	2	6	3989	3994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372912
93	NC_013201	CTT	2	6	4023	4028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257372912
94	NC_013201	GAC	2	6	4105	4110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372912
95	NC_013201	GAC	2	6	4162	4167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372912
96	NC_013201	GTC	2	6	4237	4242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372912
97	NC_013201	GCG	2	6	4339	4344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372912
98	NC_013201	CGA	2	6	4359	4364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372912
99	NC_013201	GGC	2	6	4377	4382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372912
100	NC_013201	GTC	2	6	4684	4689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372913
101	NC_013201	CGT	2	6	4815	4820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372913
102	NC_013201	CGG	2	6	4848	4853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372913
103	NC_013201	GCT	2	6	4860	4865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372913
104	NC_013201	AGT	2	6	4872	4877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257372913
105	NC_013201	AGC	2	6	4895	4900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372913
106	NC_013201	GAG	2	6	4915	4920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257372913
107	NC_013201	CGT	2	6	5230	5235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372913
108	NC_013201	CGG	2	6	5257	5262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372913
109	NC_013201	TCC	2	6	5297	5302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257372913
110	NC_013201	GAA	2	6	5443	5448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257372913
111	NC_013201	GAC	2	6	5521	5526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372913
112	NC_013201	CGA	2	6	5553	5558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372913
113	NC_013201	GAC	2	6	5602	5607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372913
114	NC_013201	TCG	3	9	5612	5620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372913
115	NC_013201	ACG	2	6	5730	5735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372913
116	NC_013201	CGA	3	9	5757	5765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372913
117	NC_013201	GAC	2	6	5860	5865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372913
118	NC_013201	CGA	3	9	5934	5942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372913
119	NC_013201	CGA	2	6	5985	5990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372913
120	NC_013201	TCG	2	6	6074	6079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372913
121	NC_013201	CGC	2	6	6087	6092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372913
122	NC_013201	GTC	2	6	6122	6127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372913
123	NC_013201	CTC	2	6	6205	6210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257372913
124	NC_013201	GGT	2	6	6264	6269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257372913
125	NC_013201	TCG	2	6	6275	6280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372913
126	NC_013201	CGA	2	6	6324	6329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372913
127	NC_013201	GTG	2	6	6415	6420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257372913
128	NC_013201	ACG	2	6	6458	6463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372913
129	NC_013201	GGT	2	6	6468	6473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257372913
130	NC_013201	GTC	2	6	6532	6537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372913
131	NC_013201	TCA	2	6	6690	6695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257372913
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134	NC_013201	CGT	2	6	6870	6875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372913
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246	NC_013201	ACT	2	6	20554	20559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257372918
247	NC_013201	GAC	2	6	20600	20605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372918
248	NC_013201	ACG	3	9	20620	20628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372918
249	NC_013201	ACC	2	6	20698	20703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257372918
250	NC_013201	CTT	2	6	20792	20797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257372918
251	NC_013201	GCG	2	6	20811	20816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372918
252	NC_013201	AGG	2	6	20908	20913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257372918
253	NC_013201	GCC	2	6	20925	20930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372918
254	NC_013201	CTA	2	6	20942	20947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257372918
255	NC_013201	CGA	2	6	21065	21070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372918
256	NC_013201	CGG	2	6	21526	21531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372919
257	NC_013201	GAC	2	6	21557	21562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372919
258	NC_013201	CGT	2	6	21595	21600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372919
259	NC_013201	GAC	2	6	21650	21655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372919
260	NC_013201	CGA	2	6	21664	21669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372919
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262	NC_013201	CGG	2	6	21805	21810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372919
263	NC_013201	CTC	2	6	21873	21878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257372919
264	NC_013201	TCG	2	6	21961	21966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372919
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266	NC_013201	GTC	2	6	21990	21995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372919
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274	NC_013201	GTC	3	9	22269	22277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372919
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276	NC_013201	CGA	2	6	22334	22339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372919
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285	NC_013201	CGC	2	6	22594	22599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372919
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496	NC_013201	CAG	2	6	36756	36761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372929
497	NC_013201	ACG	2	6	36826	36831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372929
498	NC_013201	ACG	2	6	36919	36924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372930
499	NC_013201	GTC	2	6	36975	36980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372930
500	NC_013201	ACG	2	6	37033	37038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372930

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