MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Halomicrobium mukohataei DSM 12286 plasmid pHmuk01

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013201	GT	3	6	4514	4519	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013201	CA	3	6	11770	11775	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013201	AG	3	6	11788	11793	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013201	TC	3	6	11891	11896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_013201	CA	3	6	11964	11969	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013201	CA	4	8	12392	12399	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_013201	GT	3	6	12745	12750	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013201	GC	3	6	13354	13359	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_013201	TC	3	6	14675	14680	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013201	CT	3	6	15015	15020	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_013201	GT	3	6	16159	16164	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013201	CG	3	6	16188	16193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_013201	GA	3	6	17794	17799	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013201	CA	3	6	18611	18616	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_013201	GT	3	6	21401	21406	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013201	TG	3	6	24568	24573	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013201	TG	3	6	25732	25737	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013201	CT	3	6	31965	31970	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013201	GA	3	6	32307	32312	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013201	TC	3	6	33472	33477	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_013201	CA	3	6	33739	33744	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_013201	CA	3	6	33949	33954	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013201	CA	4	8	34197	34204	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013201	AC	3	6	34783	34788	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_013201	TG	3	6	35658	35663	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013201	CA	3	6	36082	36087	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_013201	AC	3	6	37465	37470	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_013201	CA	3	6	37565	37570	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_013201	AC	3	6	38972	38977	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_013201	AC	3	6	39134	39139	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013201	AC	3	6	39205	39210	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013201	GA	3	6	39261	39266	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013201	CG	3	6	39310	39315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013201	GT	3	6	40836	40841	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013201	CA	3	6	40994	40999	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_013201	AG	3	6	41044	41049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013201	CT	4	8	41461	41468	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_013201	CT	3	6	41538	41543	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_013201	CT	3	6	54786	54791	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_013201	TC	3	6	56054	56059	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013201	TG	3	6	59151	59156	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013201	GC	3	6	61904	61909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013201	TC	3	6	68369	68374	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_013201	GT	3	6	68435	68440	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013201	CT	3	6	68729	68734	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_013201	CG	3	6	68884	68889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_013201	CT	3	6	72576	72581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_013201	AC	3	6	73539	73544	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_013201	GT	3	6	73684	73689	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013201	TC	3	6	74993	74998	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013201	AT	3	6	75094	75099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013201	GC	3	6	75506	75511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_013201	CG	3	6	76649	76654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_013201	TC	3	6	80334	80339	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_013201	TC	3	6	80341	80346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013201	GC	3	6	80799	80804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013201	CT	3	6	80889	80894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_013201	AC	3	6	80988	80993	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013201	GA	3	6	81386	81391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013201	CT	3	6	87849	87854	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_013201	GA	3	6	87855	87860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013201	CT	3	6	90805	90810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_013201	TA	4	8	93581	93588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013201	GC	3	6	98739	98744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_013201	TG	3	6	98746	98751	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013201	TC	3	6	102798	102803	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_013201	AG	3	6	104881	104886	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013201	TC	3	6	108129	108134	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_013201	AC	3	6	115164	115169	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_013201	TC	3	6	119241	119246	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_013201	TC	3	6	123066	123071	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_013201	CG	3	6	123594	123599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_013201	GA	3	6	132337	132342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013201	AG	3	6	133240	133245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013201	GT	3	6	152978	152983	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013201	AT	3	6	153806	153811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013201	TG	3	6	153897	153902	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013201	TC	3	6	153988	153993	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_013201	AC	3	6	154001	154006	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_013201	CT	3	6	154064	154069	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_013201	GA	3	6	154875	154880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013201	AT	3	6	158797	158802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013201	GT	4	8	160110	160117	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013201	AT	3	6	163155	163160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013201	AC	3	6	169217	169222	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_013201	TG	3	6	169726	169731	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013201	CT	3	6	170061	170066	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_013201	AG	3	6	172711	172716	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013201	TC	3	6	179827	179832	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_013201	CT	3	6	179944	179949	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_013201	GA	4	8	187394	187401	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013201	CG	3	6	187419	187424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_013201	GC	3	6	187601	187606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_013201	TG	3	6	189858	189863	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013201	CA	3	6	189877	189882	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_013201	CG	3	6	194002	194007	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_013201	AG	3	6	194115	194120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013201	CA	3	6	194189	194194	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_013201	TA	3	6	198376	198381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013201	AC	4	8	201371	201378	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_013201	TC	3	6	202454	202459	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_013201	GC	3	6	202506	202511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_013201	CG	3	6	208262	208267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_013201	TG	3	6	208290	208295	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013201	GA	4	8	208913	208920	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013201	CG	3	6	209642	209647	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_013201	GT	3	6	210506	210511	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013201	CG	3	6	212786	212791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_013201	GT	4	8	218450	218457	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.