MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Halomicrobium mukohataei DSM 12286 plasmid pHmuk01

Total Repeats: 330

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013201	CA	3	6	300	305	50 %	0 %	0 %	50 %	257372909
2	NC_013201	TC	3	6	724	729	0 %	50 %	0 %	50 %	257372909
3	NC_013201	GC	3	6	2344	2349	0 %	0 %	50 %	50 %	257372910
4	NC_013201	CG	3	6	3515	3520	0 %	0 %	50 %	50 %	257372912
5	NC_013201	CG	3	6	6706	6711	0 %	0 %	50 %	50 %	257372913
6	NC_013201	AG	3	6	7031	7036	50 %	0 %	50 %	0 %	257372913
7	NC_013201	CG	3	6	7319	7324	0 %	0 %	50 %	50 %	257372913
8	NC_013201	GT	3	6	7727	7732	0 %	50 %	50 %	0 %	257372913
9	NC_013201	GC	3	6	8401	8406	0 %	0 %	50 %	50 %	257372914
10	NC_013201	GC	3	6	8530	8535	0 %	0 %	50 %	50 %	257372914
11	NC_013201	AG	3	6	8738	8743	50 %	0 %	50 %	0 %	257372914
12	NC_013201	AG	3	6	10518	10523	50 %	0 %	50 %	0 %	257372914
13	NC_013201	CT	3	6	10715	10720	0 %	50 %	0 %	50 %	257372914
14	NC_013201	GC	3	6	11050	11055	0 %	0 %	50 %	50 %	257372914
15	NC_013201	GC	3	6	12088	12093	0 %	0 %	50 %	50 %	257372915
16	NC_013201	GT	3	6	18376	18381	0 %	50 %	50 %	0 %	257372916
17	NC_013201	GC	3	6	19243	19248	0 %	0 %	50 %	50 %	257372917
18	NC_013201	AC	3	6	19576	19581	50 %	0 %	0 %	50 %	257372917
19	NC_013201	CG	4	8	20690	20697	0 %	0 %	50 %	50 %	257372918
20	NC_013201	GC	3	6	22982	22987	0 %	0 %	50 %	50 %	257372919
21	NC_013201	CG	3	6	23055	23060	0 %	0 %	50 %	50 %	257372919
22	NC_013201	GA	3	6	23863	23868	50 %	0 %	50 %	0 %	257372919
23	NC_013201	CA	3	6	24002	24007	50 %	0 %	0 %	50 %	257372920
24	NC_013201	GC	3	6	24227	24232	0 %	0 %	50 %	50 %	257372920
25	NC_013201	GC	3	6	25452	25457	0 %	0 %	50 %	50 %	257372921
26	NC_013201	CG	3	6	26245	26250	0 %	0 %	50 %	50 %	257372922
27	NC_013201	GA	3	6	26554	26559	50 %	0 %	50 %	0 %	257372922
28	NC_013201	AG	3	6	26619	26624	50 %	0 %	50 %	0 %	257372922
29	NC_013201	CG	3	6	28052	28057	0 %	0 %	50 %	50 %	257372924
30	NC_013201	GC	3	6	28215	28220	0 %	0 %	50 %	50 %	257372924
31	NC_013201	GC	3	6	28304	28309	0 %	0 %	50 %	50 %	257372924
32	NC_013201	TC	3	6	28964	28969	0 %	50 %	0 %	50 %	257372925
33	NC_013201	AG	3	6	30747	30752	50 %	0 %	50 %	0 %	257372925
34	NC_013201	AC	3	6	31120	31125	50 %	0 %	0 %	50 %	257372925
35	NC_013201	AG	3	6	31188	31193	50 %	0 %	50 %	0 %	257372925
36	NC_013201	CG	3	6	31360	31365	0 %	0 %	50 %	50 %	257372925
37	NC_013201	TC	3	6	35289	35294	0 %	50 %	0 %	50 %	257372926
38	NC_013201	AC	3	6	37020	37025	50 %	0 %	0 %	50 %	257372930
39	NC_013201	AC	3	6	37090	37095	50 %	0 %	0 %	50 %	257372930
40	NC_013201	CG	3	6	39830	39835	0 %	0 %	50 %	50 %	257372933
41	NC_013201	CG	3	6	41779	41784	0 %	0 %	50 %	50 %	257372934
42	NC_013201	TG	3	6	42124	42129	0 %	50 %	50 %	0 %	257372934
43	NC_013201	TC	3	6	42187	42192	0 %	50 %	0 %	50 %	257372934
44	NC_013201	AG	3	6	43311	43316	50 %	0 %	50 %	0 %	257372934
45	NC_013201	GA	3	6	44087	44092	50 %	0 %	50 %	0 %	257372934
46	NC_013201	CG	3	6	47653	47658	0 %	0 %	50 %	50 %	257372936
47	NC_013201	GC	3	6	47961	47966	0 %	0 %	50 %	50 %	257372936
48	NC_013201	CG	4	8	48342	48349	0 %	0 %	50 %	50 %	257372936
49	NC_013201	CG	3	6	48901	48906	0 %	0 %	50 %	50 %	257372937
50	NC_013201	GC	3	6	49325	49330	0 %	0 %	50 %	50 %	257372937
51	NC_013201	GC	3	6	49473	49478	0 %	0 %	50 %	50 %	257372937
52	NC_013201	GC	3	6	50117	50122	0 %	0 %	50 %	50 %	257372937
53	NC_013201	CG	3	6	50386	50391	0 %	0 %	50 %	50 %	257372938
54	NC_013201	CG	3	6	50418	50423	0 %	0 %	50 %	50 %	257372938
55	NC_013201	GC	3	6	51090	51095	0 %	0 %	50 %	50 %	257372938
56	NC_013201	CG	3	6	51285	51290	0 %	0 %	50 %	50 %	257372938
57	NC_013201	CG	3	6	51606	51611	0 %	0 %	50 %	50 %	257372938
58	NC_013201	GC	3	6	52201	52206	0 %	0 %	50 %	50 %	257372938
59	NC_013201	CG	3	6	52355	52360	0 %	0 %	50 %	50 %	257372938
60	NC_013201	CG	3	6	52594	52599	0 %	0 %	50 %	50 %	257372938
61	NC_013201	GC	3	6	52670	52675	0 %	0 %	50 %	50 %	257372938
62	NC_013201	GC	3	6	52934	52939	0 %	0 %	50 %	50 %	257372938
63	NC_013201	AG	3	6	53004	53009	50 %	0 %	50 %	0 %	257372938
64	NC_013201	CG	3	6	53284	53289	0 %	0 %	50 %	50 %	257372938
65	NC_013201	TG	3	6	53456	53461	0 %	50 %	50 %	0 %	257372938
66	NC_013201	GC	3	6	53786	53791	0 %	0 %	50 %	50 %	257372938
67	NC_013201	CG	3	6	53891	53896	0 %	0 %	50 %	50 %	257372938
68	NC_013201	CG	3	6	53931	53936	0 %	0 %	50 %	50 %	257372938
69	NC_013201	GA	3	6	54609	54614	50 %	0 %	50 %	0 %	257372938
70	NC_013201	TC	3	6	54741	54746	0 %	50 %	0 %	50 %	257372938
71	NC_013201	CG	3	6	55038	55043	0 %	0 %	50 %	50 %	257372939
72	NC_013201	GC	3	6	55053	55058	0 %	0 %	50 %	50 %	257372939
73	NC_013201	TC	3	6	56884	56889	0 %	50 %	0 %	50 %	257372940
74	NC_013201	CG	3	6	56936	56941	0 %	0 %	50 %	50 %	257372940
75	NC_013201	CT	3	6	57259	57264	0 %	50 %	0 %	50 %	257372940
76	NC_013201	TC	4	8	58390	58397	0 %	50 %	0 %	50 %	257372941
77	NC_013201	CT	3	6	59294	59299	0 %	50 %	0 %	50 %	257372942
78	NC_013201	AC	3	6	59378	59383	50 %	0 %	0 %	50 %	257372942
79	NC_013201	GA	3	6	60275	60280	50 %	0 %	50 %	0 %	257372942
80	NC_013201	AG	3	6	61332	61337	50 %	0 %	50 %	0 %	257372944
81	NC_013201	TC	3	6	62019	62024	0 %	50 %	0 %	50 %	257372945
82	NC_013201	GC	3	6	62238	62243	0 %	0 %	50 %	50 %	257372945
83	NC_013201	TC	3	6	62596	62601	0 %	50 %	0 %	50 %	257372946
84	NC_013201	TG	3	6	63347	63352	0 %	50 %	50 %	0 %	257372946
85	NC_013201	GC	3	6	63630	63635	0 %	0 %	50 %	50 %	257372946
86	NC_013201	TC	3	6	63865	63870	0 %	50 %	0 %	50 %	257372946
87	NC_013201	AC	3	6	64174	64179	50 %	0 %	0 %	50 %	257372947
88	NC_013201	CT	3	6	65018	65023	0 %	50 %	0 %	50 %	257372948
89	NC_013201	GA	3	6	66300	66305	50 %	0 %	50 %	0 %	257372948
90	NC_013201	GA	3	6	67080	67085	50 %	0 %	50 %	0 %	257372948
91	NC_013201	TC	3	6	67820	67825	0 %	50 %	0 %	50 %	257372950
92	NC_013201	CT	3	6	68478	68483	0 %	50 %	0 %	50 %	257372951
93	NC_013201	TG	4	8	70008	70015	0 %	50 %	50 %	0 %	257372952
94	NC_013201	AG	3	6	70506	70511	50 %	0 %	50 %	0 %	257372953
95	NC_013201	CT	3	6	70632	70637	0 %	50 %	0 %	50 %	257372953
96	NC_013201	CT	3	6	70908	70913	0 %	50 %	0 %	50 %	257372953
97	NC_013201	CA	3	6	71079	71084	50 %	0 %	0 %	50 %	257372954
98	NC_013201	TC	4	8	72190	72197	0 %	50 %	0 %	50 %	257372955
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101	NC_013201	TC	3	6	75839	75844	0 %	50 %	0 %	50 %	257372960
102	NC_013201	CA	3	6	75875	75880	50 %	0 %	0 %	50 %	257372960
103	NC_013201	TG	3	6	77751	77756	0 %	50 %	50 %	0 %	257372963
104	NC_013201	CG	3	6	77987	77992	0 %	0 %	50 %	50 %	257372963
105	NC_013201	CG	3	6	78137	78142	0 %	0 %	50 %	50 %	257372963
106	NC_013201	GC	3	6	78468	78473	0 %	0 %	50 %	50 %	257372963
107	NC_013201	TC	3	6	78525	78530	0 %	50 %	0 %	50 %	257372963
108	NC_013201	TC	3	6	78855	78860	0 %	50 %	0 %	50 %	257372963
109	NC_013201	TC	3	6	80116	80121	0 %	50 %	0 %	50 %	257372964
110	NC_013201	CG	3	6	80187	80192	0 %	0 %	50 %	50 %	257372964
111	NC_013201	CG	3	6	81153	81158	0 %	0 %	50 %	50 %	257372966
112	NC_013201	AG	3	6	83100	83105	50 %	0 %	50 %	0 %	257372968
113	NC_013201	CG	3	6	83270	83275	0 %	0 %	50 %	50 %	257372968
114	NC_013201	GC	3	6	83510	83515	0 %	0 %	50 %	50 %	257372968
115	NC_013201	GC	3	6	83710	83715	0 %	0 %	50 %	50 %	257372968
116	NC_013201	CG	3	6	83919	83924	0 %	0 %	50 %	50 %	257372968
117	NC_013201	CG	3	6	83985	83990	0 %	0 %	50 %	50 %	257372968
118	NC_013201	GC	3	6	84538	84543	0 %	0 %	50 %	50 %	257372968
119	NC_013201	CA	3	6	84692	84697	50 %	0 %	0 %	50 %	257372968
120	NC_013201	CT	3	6	86411	86416	0 %	50 %	0 %	50 %	257372969
121	NC_013201	CT	3	6	86840	86845	0 %	50 %	0 %	50 %	257372969
122	NC_013201	AG	3	6	88640	88645	50 %	0 %	50 %	0 %	257372971
123	NC_013201	GC	3	6	89522	89527	0 %	0 %	50 %	50 %	257372971
124	NC_013201	GT	3	6	91252	91257	0 %	50 %	50 %	0 %	257372972
125	NC_013201	CG	3	6	91384	91389	0 %	0 %	50 %	50 %	257372972
126	NC_013201	GC	3	6	91611	91616	0 %	0 %	50 %	50 %	257372972
127	NC_013201	CG	3	6	91739	91744	0 %	0 %	50 %	50 %	257372972
128	NC_013201	TG	3	6	92775	92780	0 %	50 %	50 %	0 %	257372973
129	NC_013201	CG	3	6	92994	92999	0 %	0 %	50 %	50 %	257372973
130	NC_013201	CA	3	6	94715	94720	50 %	0 %	0 %	50 %	257372974
131	NC_013201	GC	3	6	95622	95627	0 %	0 %	50 %	50 %	257372975
132	NC_013201	GC	3	6	95674	95679	0 %	0 %	50 %	50 %	257372975
133	NC_013201	TC	3	6	95786	95791	0 %	50 %	0 %	50 %	257372975
134	NC_013201	CG	3	6	96151	96156	0 %	0 %	50 %	50 %	257372975
135	NC_013201	AG	4	8	96294	96301	50 %	0 %	50 %	0 %	257372975
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142	NC_013201	GC	3	6	99619	99624	0 %	0 %	50 %	50 %	257372980
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.