MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 plasmid pLC1

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013200	CAATTT	2	12	3297	3308	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	258509944
2	NC_013200	ATGGAA	2	12	8033	8044	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	258509951
3	NC_013200	GCTTGT	2	12	10604	10615	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	258509953
4	NC_013200	TGCCTC	2	12	10694	10705	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	258509954
5	NC_013200	TCATCG	2	12	10761	10772	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	258509954
6	NC_013200	GGCGAT	2	12	16754	16765	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258509963
7	NC_013200	AATTTT	2	12	17561	17572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509963
8	NC_013200	GCAATT	2	12	19510	19521	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	258509964
9	NC_013200	TGATAC	2	12	20986	20997	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	258509967
10	NC_013200	TTATCT	2	12	24496	24507	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	258509969
11	NC_013200	AGCGAT	2	12	24917	24928	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	258509969
12	NC_013200	GAACCA	2	12	28463	28474	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	258509976
13	NC_013200	GTTGCG	2	12	29608	29619	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	258509977
14	NC_013200	ATAATC	2	12	29753	29764	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	258509977
15	NC_013200	GTTATT	2	12	32234	32245	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	258509977
16	NC_013200	CCCATC	2	12	34943	34954	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	258509979
17	NC_013200	TGCCGA	2	12	35028	35039	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258509979
18	NC_013200	CATGCA	2	12	42916	42927	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	258509990
19	NC_013200	TGTGAA	2	12	45475	45486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509994
20	NC_013200	GATTGG	2	12	54087	54098	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	258510004
21	NC_013200	TTGATT	2	12	59267	59278	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	258510013

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.