MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 plasmid pLC1

Total Repeats: 30

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013200	CGTCA	2	10	1757	1766	20 %	20 %	20 %	40 %	258509942
2	NC_013200	ACAAG	2	10	3824	3833	60 %	0 %	20 %	20 %	258509944
3	NC_013200	TACCG	2	10	6462	6471	20 %	20 %	20 %	40 %	258509949
4	NC_013200	CCGTT	2	10	9539	9548	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_013200	TCGAA	2	10	18246	18255	40 %	20 %	20 %	20 %	258509964
6	NC_013200	TGAAT	2	10	25055	25064	40 %	40 %	20 %	0 %	258509969
7	NC_013200	CTTGG	2	10	30818	30827	0 %	40 %	40 %	20 %	258509977
8	NC_013200	CTCGA	2	10	32864	32873	20 %	20 %	20 %	40 %	258509978
9	NC_013200	ACTTG	2	10	33746	33755	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_013200	GAACA	2	10	38144	38153	60 %	0 %	20 %	20 %	258509984
11	NC_013200	TTTTC	2	10	38188	38197	0 %	80 %	0 %	20 %	258509984
12	NC_013200	TTTGT	2	10	38644	38653	0 %	80 %	20 %	0 %	258509984
13	NC_013200	GCATG	2	10	39269	39278	20 %	20 %	40 %	20 %	258509986
14	NC_013200	ATTTG	2	10	40944	40953	20 %	60 %	20 %	0 %	258509989
15	NC_013200	CATAT	2	10	43179	43188	40 %	40 %	0 %	20 %	258509990
16	NC_013200	GCCGC	2	10	45244	45253	0 %	0 %	40 %	60 %	258509994
17	NC_013200	CCTCA	2	10	46503	46512	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
18	NC_013200	AGTCA	2	10	46821	46830	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_013200	AATTT	2	10	47082	47091	40 %	60 %	0 %	0 %	258509996
20	NC_013200	ATTAT	2	10	47627	47636	40 %	60 %	0 %	0 %	258509996
21	NC_013200	CGTGT	2	10	48658	48667	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_013200	ATAAA	2	10	50134	50143	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013200	CAAAT	2	10	51587	51596	60 %	20 %	0 %	20 %	258510003
24	NC_013200	CCATG	2	10	52394	52403	20 %	20 %	20 %	40 %	258510003
25	NC_013200	GAAGT	2	10	53508	53517	40 %	20 %	40 %	0 %	258510004
26	NC_013200	CAGAA	2	10	58965	58974	60 %	0 %	20 %	20 %	258510013
27	NC_013200	TTGCT	2	10	61032	61041	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_013200	CAAAG	2	10	62083	62092	60 %	0 %	20 %	20 %	258510016
29	NC_013200	CTTCT	2	10	63432	63441	0 %	60 %	0 %	40 %	258510019
30	NC_013200	TGTCA	2	10	63676	63685	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.