MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 plasmid pLC1

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013200	GTAT	2	8	3934	3941	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013200	CTTT	2	8	4289	4296	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_013200	GGCA	2	8	9583	9590	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_013200	TATC	2	8	13844	13851	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_013200	TATC	2	8	16003	16010	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_013200	AATG	2	8	17735	17742	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013200	GCAC	2	8	25292	25299	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_013200	GCTA	2	8	32665	32672	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_013200	CTTG	2	8	33792	33799	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013200	TCAA	2	8	34052	34059	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013200	TCTA	2	8	34230	34237	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_013200	AATT	2	8	43236	43243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013200	AGCA	2	8	46640	46647	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_013200	TACT	2	8	46872	46879	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_013200	TAAA	2	8	48547	48554	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013200	TTTG	2	8	48727	48734	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013200	TGGA	2	8	50079	50086	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013200	TTTG	2	8	50174	50181	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013200	TCTG	2	8	57371	57378	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_013200	TTCC	2	8	60924	60931	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_013200	AGAA	2	8	61502	61509	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013200	CAAG	2	8	61747	61754	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_013200	CCCA	2	8	63645	63652	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
24	NC_013200	ATTG	2	8	63767	63774	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013200	GTCC	2	8	64068	64075	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_013200	TAAA	2	8	64441	64448	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.