MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 plasmid pLC1

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013200	TA	4	8	23	30	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013200	AG	3	6	326	331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013200	TG	3	6	377	382	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013200	CT	3	6	576	581	0 %	50 %	0 %	50 %	258509941
5	NC_013200	GC	3	6	850	855	0 %	0 %	50 %	50 %	258509941
6	NC_013200	GC	3	6	904	909	0 %	0 %	50 %	50 %	258509941
7	NC_013200	AC	3	6	2866	2871	50 %	0 %	0 %	50 %	258509943
8	NC_013200	AT	3	6	5062	5067	50 %	50 %	0 %	0 %	258509948
9	NC_013200	AT	3	6	6451	6456	50 %	50 %	0 %	0 %	258509949
10	NC_013200	TA	3	6	6686	6691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013200	GC	3	6	7009	7014	0 %	0 %	50 %	50 %	258509951
12	NC_013200	CG	4	8	7908	7915	0 %	0 %	50 %	50 %	258509951
13	NC_013200	TC	3	6	10879	10884	0 %	50 %	0 %	50 %	258509954
14	NC_013200	TC	3	6	11311	11316	0 %	50 %	0 %	50 %	258509955
15	NC_013200	TC	4	8	11666	11673	0 %	50 %	0 %	50 %	258509956
16	NC_013200	GA	3	6	12249	12254	50 %	0 %	50 %	0 %	258509957
17	NC_013200	AC	3	6	12834	12839	50 %	0 %	0 %	50 %	258509958
18	NC_013200	AT	4	8	14050	14057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013200	AC	3	6	14429	14434	50 %	0 %	0 %	50 %	258509959
20	NC_013200	GT	3	6	15236	15241	0 %	50 %	50 %	0 %	258509960
21	NC_013200	TA	3	6	15273	15278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013200	TA	3	6	15930	15935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013200	AT	3	6	16135	16140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013200	GT	3	6	17888	17893	0 %	50 %	50 %	0 %	258509964
25	NC_013200	GA	3	6	17921	17926	50 %	0 %	50 %	0 %	258509964
26	NC_013200	AT	3	6	18081	18086	50 %	50 %	0 %	0 %	258509964
27	NC_013200	AG	3	6	19007	19012	50 %	0 %	50 %	0 %	258509964
28	NC_013200	CG	3	6	19065	19070	0 %	0 %	50 %	50 %	258509964
29	NC_013200	AT	3	6	19091	19096	50 %	50 %	0 %	0 %	258509964
30	NC_013200	GA	3	6	19436	19441	50 %	0 %	50 %	0 %	258509964
31	NC_013200	TC	3	6	20072	20077	0 %	50 %	0 %	50 %	258509965
32	NC_013200	CA	3	6	20228	20233	50 %	0 %	0 %	50 %	258509966
33	NC_013200	CT	3	6	21579	21584	0 %	50 %	0 %	50 %	258509967
34	NC_013200	AC	3	6	21900	21905	50 %	0 %	0 %	50 %	258509968
35	NC_013200	TC	3	6	22884	22889	0 %	50 %	0 %	50 %	258509968
36	NC_013200	AG	3	6	22922	22927	50 %	0 %	50 %	0 %	258509968
37	NC_013200	GT	3	6	23268	23273	0 %	50 %	50 %	0 %	258509968
38	NC_013200	GA	3	6	23658	23663	50 %	0 %	50 %	0 %	258509968
39	NC_013200	AT	3	6	24342	24347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013200	TA	3	6	24357	24362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013200	GT	3	6	24562	24567	0 %	50 %	50 %	0 %	258509969
42	NC_013200	GT	3	6	24594	24599	0 %	50 %	50 %	0 %	258509969
43	NC_013200	TC	3	6	24796	24801	0 %	50 %	0 %	50 %	258509969
44	NC_013200	GA	3	6	25284	25289	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013200	GT	3	6	29394	29399	0 %	50 %	50 %	0 %	258509977
46	NC_013200	TA	3	6	30145	30150	50 %	50 %	0 %	0 %	258509977
47	NC_013200	CG	3	6	33015	33020	0 %	0 %	50 %	50 %	258509978
48	NC_013200	TC	3	6	33590	33595	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_013200	AT	3	6	40337	40342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013200	GC	3	6	41517	41522	0 %	0 %	50 %	50 %	258509989
51	NC_013200	AC	3	6	41897	41902	50 %	0 %	0 %	50 %	258509989
52	NC_013200	AT	3	6	42012	42017	50 %	50 %	0 %	0 %	258509989
53	NC_013200	TC	3	6	42621	42626	0 %	50 %	0 %	50 %	258509990
54	NC_013200	AC	3	6	42851	42856	50 %	0 %	0 %	50 %	258509990
55	NC_013200	CA	3	6	42958	42963	50 %	0 %	0 %	50 %	258509990
56	NC_013200	AC	3	6	43073	43078	50 %	0 %	0 %	50 %	258509990
57	NC_013200	CT	3	6	43602	43607	0 %	50 %	0 %	50 %	258509991
58	NC_013200	AC	3	6	45215	45220	50 %	0 %	0 %	50 %	258509994
59	NC_013200	CG	3	6	46173	46178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_013200	AT	3	6	51354	51359	50 %	50 %	0 %	0 %	258510003
61	NC_013200	TG	3	6	52742	52747	0 %	50 %	50 %	0 %	258510003
62	NC_013200	TA	3	6	53662	53667	50 %	50 %	0 %	0 %	258510004
63	NC_013200	CG	3	6	54032	54037	0 %	0 %	50 %	50 %	258510004
64	NC_013200	GT	3	6	55123	55128	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013200	TA	3	6	56837	56842	50 %	50 %	0 %	0 %	258510011
66	NC_013200	TC	3	6	57233	57238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_013200	AT	3	6	57314	57319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013200	AT	3	6	57342	57347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013200	AG	3	6	57508	57513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013200	AC	3	6	57817	57822	50 %	0 %	0 %	50 %	258510012
71	NC_013200	AT	3	6	58927	58932	50 %	50 %	0 %	0 %	258510013
72	NC_013200	TA	3	6	61280	61285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013200	TA	3	6	61414	61419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013200	CA	3	6	61648	61653	50 %	0 %	0 %	50 %	258510014
75	NC_013200	AC	3	6	63075	63080	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_013200	GA	3	6	63797	63802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.