MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 plasmid pLC1

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013200	A	6	6	180	185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013200	A	7	7	1366	1372	100 %	0 %	0 %	0 %	258509941
3	NC_013200	A	6	6	1632	1637	100 %	0 %	0 %	0 %	258509942
4	NC_013200	A	6	6	3531	3536	100 %	0 %	0 %	0 %	258509944
5	NC_013200	T	6	6	4171	4176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013200	T	7	7	4733	4739	0 %	100 %	0 %	0 %	258509947
7	NC_013200	T	6	6	6670	6675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013200	A	6	6	8021	8026	100 %	0 %	0 %	0 %	258509951
9	NC_013200	A	7	7	8410	8416	100 %	0 %	0 %	0 %	258509951
10	NC_013200	T	7	7	9652	9658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013200	A	6	6	11150	11155	100 %	0 %	0 %	0 %	258509955
12	NC_013200	T	6	6	11824	11829	0 %	100 %	0 %	0 %	258509956
13	NC_013200	A	6	6	11933	11938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013200	A	6	6	12059	12064	100 %	0 %	0 %	0 %	258509957
15	NC_013200	T	6	6	12848	12853	0 %	100 %	0 %	0 %	258509958
16	NC_013200	A	6	6	14292	14297	100 %	0 %	0 %	0 %	258509959
17	NC_013200	A	6	6	14735	14740	100 %	0 %	0 %	0 %	258509960
18	NC_013200	T	6	6	14867	14872	0 %	100 %	0 %	0 %	258509960
19	NC_013200	A	6	6	15248	15253	100 %	0 %	0 %	0 %	258509960
20	NC_013200	A	6	6	15804	15809	100 %	0 %	0 %	0 %	258509962
21	NC_013200	T	6	6	16200	16205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013200	A	6	6	17822	17827	100 %	0 %	0 %	0 %	258509964
23	NC_013200	A	6	6	19690	19695	100 %	0 %	0 %	0 %	258509964
24	NC_013200	T	6	6	24679	24684	0 %	100 %	0 %	0 %	258509969
25	NC_013200	T	7	7	25921	25927	0 %	100 %	0 %	0 %	258509972
26	NC_013200	A	6	6	26352	26357	100 %	0 %	0 %	0 %	258509973
27	NC_013200	A	6	6	26445	26450	100 %	0 %	0 %	0 %	258509973
28	NC_013200	T	7	7	26729	26735	0 %	100 %	0 %	0 %	258509974
29	NC_013200	T	6	6	27036	27041	0 %	100 %	0 %	0 %	258509975
30	NC_013200	T	6	6	27116	27121	0 %	100 %	0 %	0 %	258509975
31	NC_013200	T	6	6	27334	27339	0 %	100 %	0 %	0 %	258509975
32	NC_013200	T	6	6	27849	27854	0 %	100 %	0 %	0 %	258509976
33	NC_013200	C	6	6	28068	28073	0 %	0 %	0 %	100 %	258509976
34	NC_013200	T	6	6	28585	28590	0 %	100 %	0 %	0 %	258509976
35	NC_013200	A	6	6	29073	29078	100 %	0 %	0 %	0 %	258509976
36	NC_013200	T	6	6	29181	29186	0 %	100 %	0 %	0 %	258509976
37	NC_013200	T	7	7	29461	29467	0 %	100 %	0 %	0 %	258509977
38	NC_013200	T	7	7	31252	31258	0 %	100 %	0 %	0 %	258509977
39	NC_013200	T	7	7	31898	31904	0 %	100 %	0 %	0 %	258509977
40	NC_013200	A	6	6	32497	32502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013200	A	7	7	32583	32589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013200	A	7	7	33771	33777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013200	A	6	6	33916	33921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013200	T	6	6	33962	33967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013200	T	6	6	33969	33974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013200	T	6	6	34130	34135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013200	T	6	6	34990	34995	0 %	100 %	0 %	0 %	258509979
48	NC_013200	A	6	6	35339	35344	100 %	0 %	0 %	0 %	258509980
49	NC_013200	A	6	6	35885	35890	100 %	0 %	0 %	0 %	258509980
50	NC_013200	A	6	6	36094	36099	100 %	0 %	0 %	0 %	258509980
51	NC_013200	A	6	6	36736	36741	100 %	0 %	0 %	0 %	258509981
52	NC_013200	A	7	7	37364	37370	100 %	0 %	0 %	0 %	258509982
53	NC_013200	T	6	6	37982	37987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013200	A	7	7	38065	38071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013200	T	6	6	38092	38097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013200	T	6	6	38180	38185	0 %	100 %	0 %	0 %	258509984
57	NC_013200	T	6	6	39012	39017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013200	A	6	6	39022	39027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013200	T	6	6	39051	39056	0 %	100 %	0 %	0 %	258509985
60	NC_013200	C	7	7	39175	39181	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
61	NC_013200	T	7	7	39515	39521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013200	T	7	7	40184	40190	0 %	100 %	0 %	0 %	258509988
63	NC_013200	T	7	7	40353	40359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013200	T	6	6	40376	40381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013200	T	6	6	41786	41791	0 %	100 %	0 %	0 %	258509989
66	NC_013200	A	7	7	44669	44675	100 %	0 %	0 %	0 %	258509992
67	NC_013200	T	6	6	46366	46371	0 %	100 %	0 %	0 %	258509995
68	NC_013200	A	6	6	48091	48096	100 %	0 %	0 %	0 %	258509996
69	NC_013200	A	7	7	49119	49125	100 %	0 %	0 %	0 %	258509998
70	NC_013200	A	6	6	50058	50063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013200	T	6	6	50268	50273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013200	A	6	6	50490	50495	100 %	0 %	0 %	0 %	258510002
73	NC_013200	A	6	6	50757	50762	100 %	0 %	0 %	0 %	258510002
74	NC_013200	A	6	6	52917	52922	100 %	0 %	0 %	0 %	258510003
75	NC_013200	T	6	6	55087	55092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013200	T	7	7	55922	55928	0 %	100 %	0 %	0 %	258510008
77	NC_013200	A	6	6	57456	57461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013200	A	7	7	58838	58844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013200	T	8	8	58916	58923	0 %	100 %	0 %	0 %	258510013
80	NC_013200	A	6	6	59008	59013	100 %	0 %	0 %	0 %	258510013
81	NC_013200	T	7	7	59650	59656	0 %	100 %	0 %	0 %	258510013
82	NC_013200	T	6	6	60313	60318	0 %	100 %	0 %	0 %	258510013
83	NC_013200	A	6	6	60806	60811	100 %	0 %	0 %	0 %	258510013
84	NC_013200	A	6	6	60909	60914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013200	A	7	7	61118	61124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013200	A	7	7	61209	61215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013200	A	7	7	61297	61303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013200	T	6	6	61307	61312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013200	A	6	6	61452	61457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013200	T	6	6	61465	61470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013200	T	6	6	61519	61524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013200	A	7	7	62521	62527	100 %	0 %	0 %	0 %	258510017
93	NC_013200	T	6	6	63507	63512	0 %	100 %	0 %	0 %	258510019
94	NC_013200	A	6	6	63940	63945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.