MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 7560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013199	TTTA	2	8	442	449	25 %	75 %	0 %	0 %	258538192
2	NC_013199	TCCA	2	8	574	581	25 %	25 %	0 %	50 %	258538192
3	NC_013199	GTTG	2	8	633	640	0 %	50 %	50 %	0 %	258538192
4	NC_013199	GCCT	2	8	746	753	0 %	25 %	25 %	50 %	258538192
5	NC_013199	ATAG	2	8	2895	2902	50 %	25 %	25 %	0 %	258538194
6	NC_013199	GCAA	2	8	2987	2994	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013199	TTTA	2	8	3045	3052	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013199	TAAT	2	8	3450	3457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013199	TGAT	2	8	3593	3600	25 %	50 %	25 %	0 %	258538195
10	NC_013199	TTTG	2	8	4079	4086	0 %	75 %	25 %	0 %	258538196
11	NC_013199	AAGA	2	8	4897	4904	75 %	0 %	25 %	0 %	258538197
12	NC_013199	AAGA	2	8	4918	4925	75 %	0 %	25 %	0 %	258538197
13	NC_013199	GCCA	2	8	6667	6674	25 %	0 %	25 %	50 %	258538197
14	NC_013199	ACGT	2	8	7021	7028	25 %	25 %	25 %	25 %	258538198
15	NC_013199	ATGA	2	8	7068	7075	50 %	25 %	25 %	0 %	258538198
16	NC_013199	GATT	2	8	7340	7347	25 %	50 %	25 %	0 %	258538198
17	NC_013199	TATT	2	8	8748	8755	25 %	75 %	0 %	0 %	258538198
18	NC_013199	GCAC	2	8	8905	8912	25 %	0 %	25 %	50 %	258538198
19	NC_013199	AAAT	2	8	9866	9873	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013199	GAAA	2	8	10128	10135	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013199	CGAA	2	8	10302	10309	50 %	0 %	25 %	25 %	258538200
22	NC_013199	GCCG	2	8	11597	11604	0 %	0 %	50 %	50 %	258538202
23	NC_013199	CTGG	2	8	11680	11687	0 %	25 %	50 %	25 %	258538202
24	NC_013199	TTCA	2	8	12342	12349	25 %	50 %	0 %	25 %	258538204
25	NC_013199	TTGG	2	8	12469	12476	0 %	50 %	50 %	0 %	258538204
26	NC_013199	AGCG	2	8	13134	13141	25 %	0 %	50 %	25 %	258538205
27	NC_013199	GGAC	2	8	13600	13607	25 %	0 %	50 %	25 %	258538206
28	NC_013199	TGAA	2	8	13651	13658	50 %	25 %	25 %	0 %	258538206
29	NC_013199	TTTG	2	8	13856	13863	0 %	75 %	25 %	0 %	258538206
30	NC_013199	TCAA	2	8	13876	13883	50 %	25 %	0 %	25 %	258538206
31	NC_013199	TCGG	2	8	14462	14469	0 %	25 %	50 %	25 %	258538207
32	NC_013199	CTGG	2	8	15500	15507	0 %	25 %	50 %	25 %	258538207
33	NC_013199	CAAT	2	8	16081	16088	50 %	25 %	0 %	25 %	258538208
34	NC_013199	TGTT	2	8	16128	16135	0 %	75 %	25 %	0 %	258538208
35	NC_013199	TTTA	2	8	16562	16569	25 %	75 %	0 %	0 %	258538208
36	NC_013199	CTAA	2	8	17049	17056	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_013199	GTTT	2	8	17273	17280	0 %	75 %	25 %	0 %	258538210
38	NC_013199	AAGA	2	8	17517	17524	75 %	0 %	25 %	0 %	258538210
39	NC_013199	TTTA	2	8	17664	17671	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013199	ATTT	2	8	18304	18311	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013199	CAAC	2	8	18733	18740	50 %	0 %	0 %	50 %	258538211
42	NC_013199	ATAC	2	8	19093	19100	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_013199	AGTG	2	8	19195	19202	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013199	ATTC	2	8	19226	19233	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_013199	TACA	2	8	19384	19391	50 %	25 %	0 %	25 %	258538212
46	NC_013199	TAAA	2	8	20052	20059	75 %	25 %	0 %	0 %	258538212
47	NC_013199	GAAA	2	8	20273	20280	75 %	0 %	25 %	0 %	258538213
48	NC_013199	TTGA	2	8	20447	20454	25 %	50 %	25 %	0 %	258538213
49	NC_013199	GCTG	2	8	20663	20670	0 %	25 %	50 %	25 %	258538213
50	NC_013199	ATCA	2	8	20840	20847	50 %	25 %	0 %	25 %	258538213
51	NC_013199	TTTC	2	8	21043	21050	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_013199	GGGC	2	8	21389	21396	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_013199	TGCG	2	8	21431	21438	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_013199	TTTG	2	8	21652	21659	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013199	TTGT	2	8	21749	21756	0 %	75 %	25 %	0 %	258538214
56	NC_013199	GTTG	2	8	21878	21885	0 %	50 %	50 %	0 %	258538214
57	NC_013199	GGCA	2	8	22302	22309	25 %	0 %	50 %	25 %	258538214
58	NC_013199	AGTT	2	8	22754	22761	25 %	50 %	25 %	0 %	258538214
59	NC_013199	GACG	2	8	23604	23611	25 %	0 %	50 %	25 %	258538215
60	NC_013199	TTAT	2	8	24092	24099	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013199	GGGT	2	8	24156	24163	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013199	TGCC	2	8	24450	24457	0 %	25 %	25 %	50 %	258538216
63	NC_013199	GTTG	2	8	24601	24608	0 %	50 %	50 %	0 %	258538216
64	NC_013199	CTTT	2	8	25077	25084	0 %	75 %	0 %	25 %	258538216
65	NC_013199	TTAA	3	12	25434	25445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013199	ACGA	2	8	26147	26154	50 %	0 %	25 %	25 %	258538217
67	NC_013199	TGAA	2	8	26752	26759	50 %	25 %	25 %	0 %	258538217
68	NC_013199	GGCA	2	8	27383	27390	25 %	0 %	50 %	25 %	258538217
69	NC_013199	CAGG	2	8	27598	27605	25 %	0 %	50 %	25 %	258538217
70	NC_013199	GATT	2	8	27859	27866	25 %	50 %	25 %	0 %	258538217
71	NC_013199	TGAC	2	8	27961	27968	25 %	25 %	25 %	25 %	258538217
72	NC_013199	AGCC	2	8	28576	28583	25 %	0 %	25 %	50 %	258538218
73	NC_013199	ATCC	2	8	28736	28743	25 %	25 %	0 %	50 %	258538218
74	NC_013199	GTCC	2	8	29424	29431	0 %	25 %	25 %	50 %	258538219
75	NC_013199	GAAA	2	8	29669	29676	75 %	0 %	25 %	0 %	258538220
76	NC_013199	TCAA	2	8	29773	29780	50 %	25 %	0 %	25 %	258538220
77	NC_013199	CCGG	2	8	30170	30177	0 %	0 %	50 %	50 %	258538220
78	NC_013199	CTTA	2	8	30585	30592	25 %	50 %	0 %	25 %	258538221
79	NC_013199	TTGC	2	8	30952	30959	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_013199	CAAT	2	8	31478	31485	50 %	25 %	0 %	25 %	258538222
81	NC_013199	AACC	2	8	31586	31593	50 %	0 %	0 %	50 %	258538222
82	NC_013199	ATTT	2	8	32295	32302	25 %	75 %	0 %	0 %	258538223
83	NC_013199	GCGA	2	8	32321	32328	25 %	0 %	50 %	25 %	258538223
84	NC_013199	TTAT	2	8	32402	32409	25 %	75 %	0 %	0 %	258538223
85	NC_013199	CAAA	2	8	32715	32722	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_013199	TTCA	2	8	32978	32985	25 %	50 %	0 %	25 %	258538224
87	NC_013199	GTAT	2	8	33809	33816	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013199	GATT	2	8	34600	34607	25 %	50 %	25 %	0 %	258538226
89	NC_013199	GCAG	2	8	34723	34730	25 %	0 %	50 %	25 %	258538226
90	NC_013199	CTGG	2	8	35029	35036	0 %	25 %	50 %	25 %	258538226
91	NC_013199	AGAA	2	8	35554	35561	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013199	TTAT	2	8	35815	35822	25 %	75 %	0 %	0 %	258538227
93	NC_013199	TTGG	2	8	35870	35877	0 %	50 %	50 %	0 %	258538227
94	NC_013199	GTTT	2	8	36454	36461	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013199	AAGT	2	8	37262	37269	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013199	CCGG	2	8	37296	37303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_013199	TGGG	2	8	37721	37728	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013199	AGAA	2	8	37820	37827	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013199	AAAT	2	8	38046	38053	75 %	25 %	0 %	0 %	258538229
100	NC_013199	ATGA	2	8	38215	38222	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013199	TCTA	2	8	38258	38265	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_013199	CCTT	2	8	38531	38538	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_013199	TAGT	2	8	38553	38560	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013199	TATT	2	8	38629	38636	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013199	ATTT	2	8	39218	39225	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013199	AGCT	2	8	39750	39757	25 %	25 %	25 %	25 %	258538230
107	NC_013199	AGTC	2	8	39780	39787	25 %	25 %	25 %	25 %	258538230
108	NC_013199	AAAC	2	8	40265	40272	75 %	0 %	0 %	25 %	258538230
109	NC_013199	CGAC	2	8	40613	40620	25 %	0 %	25 %	50 %	258538230
110	NC_013199	ATGA	2	8	41900	41907	50 %	25 %	25 %	0 %	258538231
111	NC_013199	GATC	2	8	42449	42456	25 %	25 %	25 %	25 %	258538231
112	NC_013199	CTGT	2	8	42568	42575	0 %	50 %	25 %	25 %	258538231
113	NC_013199	CTGC	2	8	42825	42832	0 %	25 %	25 %	50 %	258538232
114	NC_013199	CTTT	2	8	43009	43016	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_013199	CAAA	2	8	43072	43079	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_013199	TGGA	2	8	43231	43238	25 %	25 %	50 %	0 %	258538233
117	NC_013199	GCCG	2	8	43613	43620	0 %	0 %	50 %	50 %	258538233
118	NC_013199	AAAG	2	8	44123	44130	75 %	0 %	25 %	0 %	258538233
119	NC_013199	GGCT	2	8	44633	44640	0 %	25 %	50 %	25 %	258538233
120	NC_013199	AAGT	2	8	44982	44989	50 %	25 %	25 %	0 %	258538233
121	NC_013199	TGCG	2	8	45097	45104	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_013199	AAAG	2	8	45366	45373	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013199	AAAC	2	8	45948	45955	75 %	0 %	0 %	25 %	258538234
124	NC_013199	TATC	2	8	46456	46463	25 %	50 %	0 %	25 %	258538234
125	NC_013199	TTGG	2	8	46602	46609	0 %	50 %	50 %	0 %	258538234
126	NC_013199	AGTA	2	8	46772	46779	50 %	25 %	25 %	0 %	258538234
127	NC_013199	TCAA	2	8	46964	46971	50 %	25 %	0 %	25 %	258538234
128	NC_013199	CGGG	2	8	47334	47341	0 %	0 %	75 %	25 %	258538234
129	NC_013199	CAGT	3	12	47545	47556	25 %	25 %	25 %	25 %	258538234
130	NC_013199	GGCA	2	8	48708	48715	25 %	0 %	50 %	25 %	258538234
131	NC_013199	GGCA	2	8	48924	48931	25 %	0 %	50 %	25 %	258538234
132	NC_013199	ACCA	2	8	49106	49113	50 %	0 %	0 %	50 %	258538234
133	NC_013199	AGCA	2	8	49587	49594	50 %	0 %	25 %	25 %	258538234
134	NC_013199	TAAA	2	8	49962	49969	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013199	TTAC	2	8	50230	50237	25 %	50 %	0 %	25 %	258538235
136	NC_013199	TTAA	2	8	50846	50853	50 %	50 %	0 %	0 %	258538235
137	NC_013199	GGCT	2	8	51073	51080	0 %	25 %	50 %	25 %	258538236
138	NC_013199	TTGA	2	8	51269	51276	25 %	50 %	25 %	0 %	258538236
139	NC_013199	CGAT	2	8	51349	51356	25 %	25 %	25 %	25 %	258538236
140	NC_013199	CAGC	2	8	51487	51494	25 %	0 %	25 %	50 %	258538236
141	NC_013199	GCCA	2	8	51821	51828	25 %	0 %	25 %	50 %	258538236
142	NC_013199	CATT	2	8	51915	51922	25 %	50 %	0 %	25 %	258538236
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