MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 1270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013199	GCAA	2	8	2987	2994	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013199	TTTA	2	8	3045	3052	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013199	TAAT	2	8	3450	3457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013199	AAAT	2	8	9866	9873	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013199	GAAA	2	8	10128	10135	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013199	CTAA	2	8	17049	17056	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013199	TTTA	2	8	17664	17671	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013199	ATTT	2	8	18304	18311	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013199	ATAC	2	8	19093	19100	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013199	AGTG	2	8	19195	19202	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013199	ATTC	2	8	19226	19233	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_013199	TTTC	2	8	21043	21050	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_013199	GGGC	2	8	21389	21396	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14	NC_013199	TGCG	2	8	21431	21438	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_013199	TTTG	2	8	21652	21659	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013199	TTAT	2	8	24092	24099	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013199	GGGT	2	8	24156	24163	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013199	TTAA	3	12	25434	25445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013199	TTGC	2	8	30952	30959	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_013199	CAAA	2	8	32715	32722	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013199	GTAT	2	8	33809	33816	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013199	AGAA	2	8	35554	35561	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013199	GTTT	2	8	36454	36461	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013199	AAGT	2	8	37262	37269	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013199	CCGG	2	8	37296	37303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_013199	TGGG	2	8	37721	37728	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013199	AGAA	2	8	37820	37827	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013199	ATGA	2	8	38215	38222	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013199	TCTA	2	8	38258	38265	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013199	CCTT	2	8	38531	38538	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013199	TAGT	2	8	38553	38560	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013199	TATT	2	8	38629	38636	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013199	ATTT	2	8	39218	39225	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013199	CTTT	2	8	43009	43016	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_013199	CAAA	2	8	43072	43079	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_013199	TGCG	2	8	45097	45104	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_013199	AAAG	2	8	45366	45373	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013199	TAAA	2	8	49962	49969	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013199	TAAG	2	8	59248	59255	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013199	AAAT	2	8	59265	59272	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013199	CAGT	2	8	59406	59413	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_013199	GAAG	2	8	59622	59629	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013199	AAGG	2	8	60385	60392	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013199	CGTG	2	8	64733	64740	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_013199	AGAA	2	8	64785	64792	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013199	TGAA	2	8	66880	66887	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013199	ATAC	2	8	66920	66927	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_013199	ATTG	2	8	69004	69011	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013199	AAAC	2	8	69166	69173	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_013199	TTCA	2	8	73636	73643	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_013199	TAAT	2	8	73692	73699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013199	TAAA	2	8	77192	77199	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013199	CAGT	2	8	77756	77763	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_013199	TGAT	2	8	77778	77785	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013199	TTTG	2	8	81481	81488	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013199	TTGA	2	8	81614	81621	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013199	GGGA	2	8	81678	81685	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013199	CGAT	2	8	84722	84729	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_013199	CTGT	2	8	84742	84749	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_013199	AAAT	2	8	86962	86969	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013199	AGGT	2	8	88511	88518	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013199	TTTA	2	8	94876	94883	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013199	TGAT	2	8	100243	100250	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013199	CAAA	2	8	106797	106804	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_013199	ATTT	2	8	107004	107011	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013199	GTAA	2	8	108501	108508	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013199	ATCA	2	8	111264	111271	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_013199	CAAA	2	8	114564	114571	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_013199	ATTT	2	8	114638	114645	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013199	ATTG	2	8	119068	119075	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013199	CCTG	2	8	119614	119621	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_013199	GATT	2	8	124076	124083	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013199	CAAG	2	8	124996	125003	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_013199	TAGC	2	8	127906	127913	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_013199	AGCC	2	8	130787	130794	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_013199	AGCC	2	8	130909	130916	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_013199	ATAA	2	8	132604	132611	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013199	CTTT	2	8	136854	136861	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_013199	ATAA	2	8	145367	145374	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013199	TTCG	2	8	145376	145383	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_013199	ATTA	2	8	145504	145511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013199	TTAA	2	8	146810	146817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013199	CGAA	2	8	149888	149895	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_013199	GAAT	2	8	154520	154527	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013199	AAAT	2	8	158585	158592	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013199	CAAA	2	8	158903	158910	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_013199	CCAC	2	8	158938	158945	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
88	NC_013199	CACC	2	8	159013	159020	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
89	NC_013199	TCCC	2	8	160027	160034	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
90	NC_013199	CTTT	2	8	161243	161250	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_013199	TGAA	2	8	161390	161397	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013199	CAAA	2	8	163795	163802	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_013199	ATTC	2	8	170288	170295	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_013199	GAAT	2	8	170412	170419	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013199	GAAT	2	8	170428	170435	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013199	ACGA	2	8	174719	174726	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_013199	GTGA	2	8	174729	174736	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013199	TAGA	2	8	178333	178340	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013199	TTAC	2	8	178369	178376	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_013199	GGGC	2	8	178391	178398	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101	NC_013199	AGTA	2	8	179862	179869	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013199	TTTG	2	8	180452	180459	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013199	TTAA	2	8	181309	181316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013199	GTTT	2	8	181411	181418	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013199	TTTA	2	8	187770	187777	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013199	TAAT	2	8	192484	192491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013199	TTTA	2	8	198265	198272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013199	CCGA	2	8	201877	201884	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_013199	AAGC	2	8	201923	201930	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_013199	TTAT	2	8	204117	204124	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013199	AAAG	2	8	204212	204219	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013199	ATAA	2	8	204248	204255	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013199	ATTA	2	8	209392	209399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013199	TAAA	2	8	209461	209468	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013199	AAAT	2	8	209516	209523	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013199	ATTT	2	8	209524	209531	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013199	CTTT	2	8	213803	213810	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_013199	TTAA	2	8	222531	222538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013199	AAAG	2	8	226421	226428	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013199	ACTG	2	8	227271	227278	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_013199	GATG	2	8	227556	227563	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013199	CGCT	2	8	232727	232734	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_013199	TTTG	2	8	232797	232804	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013199	TGAT	2	8	233598	233605	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013199	TGTT	2	8	234585	234592	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013199	TTTC	2	8	240293	240300	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_013199	GTGC	2	8	250772	250779	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_013199	ATTT	2	8	251856	251863	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013199	ATTT	2	8	253520	253527	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013199	GTTT	2	8	253890	253897	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013199	TACA	2	8	266751	266758	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_013199	AAGA	2	8	266773	266780	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013199	GATT	2	8	266881	266888	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013199	CGCA	2	8	266920	266927	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_013199	AGTT	2	8	280438	280445	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013199	GATG	2	8	281821	281828	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013199	AGAC	2	8	281977	281984	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_013199	CATG	2	8	286643	286650	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_013199	CTAG	2	8	286801	286808	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_013199	GTCA	2	8	289540	289547	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_013199	TGGA	2	8	290024	290031	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013199	GTGA	2	8	290203	290210	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013199	AGCG	2	8	290373	290380	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_013199	ATGG	2	8	291038	291045	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013199	AGAA	2	8	291783	291790	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013199	GCGA	2	8	291812	291819	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_013199	GCTT	2	8	291844	291851	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_013199	GTAG	2	8	292263	292270	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013199	ATGT	2	8	292346	292353	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013199	GAGC	2	8	293254	293261	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_013199	TAGG	2	8	293700	293707	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013199	CTGC	2	8	294687	294694	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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