MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 38696

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013199	GTG	2	6	184	189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538192
2	NC_013199	TCA	2	6	230	235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538192
3	NC_013199	CAA	2	6	301	306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538192
4	NC_013199	CGG	2	6	392	397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538192
5	NC_013199	CGG	2	6	450	455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538192
6	NC_013199	AAT	2	6	511	516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258538192
7	NC_013199	TTC	2	6	652	657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538192
8	NC_013199	AAG	2	6	665	670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538192
9	NC_013199	AAG	2	6	677	682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538192
10	NC_013199	TTC	2	6	685	690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538192
11	NC_013199	CCG	2	6	823	828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538192
12	NC_013199	AGA	2	6	873	878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538192
13	NC_013199	GAA	2	6	984	989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538192
14	NC_013199	CGA	2	6	1041	1046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538192
15	NC_013199	ACC	2	6	1285	1290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538192
16	NC_013199	ACG	2	6	1504	1509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013199	AGG	2	6	1513	1518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013199	GCT	2	6	1698	1703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538193
19	NC_013199	GCA	2	6	1729	1734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538193
20	NC_013199	TTC	2	6	1761	1766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538193
21	NC_013199	AAC	2	6	1881	1886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538193
22	NC_013199	CAG	2	6	2095	2100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538193
23	NC_013199	CAT	3	9	2120	2128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538193
24	NC_013199	TAT	2	6	2212	2217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538193
25	NC_013199	AGC	2	6	2373	2378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538193
26	NC_013199	CGT	2	6	2384	2389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538193
27	NC_013199	GAA	2	6	2460	2465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538193
28	NC_013199	CAA	2	6	2477	2482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538193
29	NC_013199	GCA	2	6	2809	2814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538194
30	NC_013199	ATG	2	6	2878	2883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538194
31	NC_013199	TCC	2	6	2959	2964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_013199	ATT	2	6	3024	3029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013199	TAA	2	6	3035	3040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013199	GAT	2	6	3127	3132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013199	TGG	2	6	3488	3493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013199	CGA	3	9	3521	3529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538195
37	NC_013199	CAC	2	6	3546	3551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538195
38	NC_013199	GCG	2	6	3602	3607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538195
39	NC_013199	CGT	2	6	3667	3672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538195
40	NC_013199	GAT	2	6	3691	3696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538195
41	NC_013199	CAA	2	6	3899	3904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538196
42	NC_013199	ATT	2	6	3993	3998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538196
43	NC_013199	TCA	2	6	4001	4006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538196
44	NC_013199	CGG	2	6	4131	4136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538196
45	NC_013199	GGC	2	6	4292	4297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538196
46	NC_013199	TGC	2	6	4333	4338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538196
47	NC_013199	TGC	3	9	4355	4363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538196
48	NC_013199	CAA	2	6	4368	4373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538196
49	NC_013199	AGC	2	6	4486	4491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538196
50	NC_013199	GAT	2	6	4539	4544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538196
51	NC_013199	CAG	2	6	4596	4601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538196
52	NC_013199	CAC	2	6	4604	4609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538196
53	NC_013199	GAC	3	9	4763	4771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538196
54	NC_013199	ATC	2	6	4797	4802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538196
55	NC_013199	GAG	2	6	4874	4879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013199	GAA	2	6	4912	4917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538197
57	NC_013199	GCA	2	6	4933	4938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538197
58	NC_013199	ATG	2	6	4943	4948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538197
59	NC_013199	CAT	2	6	5035	5040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538197
60	NC_013199	GTC	2	6	5186	5191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538197
61	NC_013199	GGT	2	6	5227	5232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538197
62	NC_013199	CGG	2	6	5262	5267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538197
63	NC_013199	GTT	2	6	5326	5331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538197
64	NC_013199	CGG	2	6	5334	5339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538197
65	NC_013199	TGA	2	6	5478	5483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538197
66	NC_013199	GCG	2	6	5560	5565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538197
67	NC_013199	GGC	2	6	5596	5601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538197
68	NC_013199	GAA	3	9	5628	5636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538197
69	NC_013199	CTG	2	6	5644	5649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538197
70	NC_013199	GAT	2	6	5857	5862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538197
71	NC_013199	GTT	2	6	5902	5907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538197
72	NC_013199	GGT	2	6	5979	5984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538197
73	NC_013199	CAA	2	6	6009	6014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538197
74	NC_013199	ATT	2	6	6049	6054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538197
75	NC_013199	GCT	2	6	6088	6093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538197
76	NC_013199	AAG	2	6	6118	6123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538197
77	NC_013199	ACA	2	6	6164	6169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538197
78	NC_013199	GGC	2	6	6223	6228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538197
79	NC_013199	GAA	2	6	6331	6336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538197
80	NC_013199	ATC	2	6	6415	6420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538197
81	NC_013199	GTT	2	6	6459	6464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538197
82	NC_013199	ATG	2	6	6559	6564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538197
83	NC_013199	GCC	2	6	6612	6617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538197
84	NC_013199	ACC	2	6	6685	6690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538197
85	NC_013199	CGG	2	6	6790	6795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538197
86	NC_013199	GAA	2	6	6805	6810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538197
87	NC_013199	TTG	2	6	6821	6826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538197
88	NC_013199	AAC	2	6	6832	6837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538197
89	NC_013199	GAG	2	6	6894	6899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013199	GAT	2	6	6915	6920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538198
91	NC_013199	AAG	2	6	7104	7109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538198
92	NC_013199	TCG	2	6	7120	7125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538198
93	NC_013199	GCG	3	9	7263	7271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538198
94	NC_013199	CAA	2	6	7328	7333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538198
95	NC_013199	GTT	2	6	7383	7388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538198
96	NC_013199	CTG	2	6	7410	7415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538198
97	NC_013199	ACC	2	6	7449	7454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538198
98	NC_013199	CCG	2	6	7461	7466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538198
99	NC_013199	ATC	2	6	7510	7515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538198
100	NC_013199	CCA	2	6	7522	7527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538198
101	NC_013199	CCG	2	6	7528	7533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538198
102	NC_013199	GGT	2	6	7572	7577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538198
103	NC_013199	TTA	2	6	7690	7695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538198
104	NC_013199	CAA	2	6	7715	7720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538198
105	NC_013199	TGG	2	6	7729	7734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538198
106	NC_013199	TGA	2	6	7790	7795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538198
107	NC_013199	CCG	2	6	7832	7837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538198
108	NC_013199	AAT	2	6	7863	7868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258538198
109	NC_013199	TGG	2	6	7912	7917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538198
110	NC_013199	CGG	3	9	7998	8006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538198
111	NC_013199	GAA	2	6	8021	8026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538198
112	NC_013199	TGA	2	6	8081	8086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538198
113	NC_013199	ATT	2	6	8097	8102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538198
114	NC_013199	ATT	2	6	8310	8315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538198
115	NC_013199	ATG	2	6	8317	8322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538198
116	NC_013199	CTG	2	6	8370	8375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538198
117	NC_013199	AAG	2	6	8419	8424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538198
118	NC_013199	GGT	2	6	8499	8504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538198
119	NC_013199	GAT	2	6	8535	8540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538198
120	NC_013199	TCG	2	6	8542	8547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538198
121	NC_013199	ATG	2	6	8572	8577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538198
122	NC_013199	CTT	2	6	8585	8590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538198
123	NC_013199	CAA	2	6	8594	8599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538198
124	NC_013199	GCA	2	6	8614	8619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538198
125	NC_013199	ATG	2	6	8737	8742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538198
126	NC_013199	GCA	2	6	8815	8820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538198
127	NC_013199	CGG	2	6	9113	9118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538198
128	NC_013199	GAA	2	6	9149	9154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538198
129	NC_013199	CGA	2	6	9296	9301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538198
130	NC_013199	CGA	2	6	9344	9349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538198
131	NC_013199	GAC	2	6	9354	9359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538198
132	NC_013199	AGC	2	6	9360	9365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538198
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139	NC_013199	TAT	2	6	10109	10114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_013199	ATT	2	6	11120	11125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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258	NC_013199	ATC	2	6	18715	18720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538211
259	NC_013199	TTC	2	6	18750	18755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538211
260	NC_013199	GAA	2	6	18791	18796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538211
261	NC_013199	TGG	2	6	18892	18897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538211
262	NC_013199	GTT	2	6	18926	18931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538211
263	NC_013199	TAA	2	6	19003	19008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258538211
264	NC_013199	TTG	2	6	19011	19016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538211
265	NC_013199	TAT	2	6	19029	19034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538211
266	NC_013199	CAG	2	6	19266	19271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_013199	CTT	2	6	19342	19347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538212
268	NC_013199	TTC	2	6	19497	19502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538212
269	NC_013199	ATA	2	6	19560	19565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258538212
270	NC_013199	GCG	2	6	19622	19627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538212
271	NC_013199	GTA	2	6	19677	19682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538212
272	NC_013199	ATG	2	6	19760	19765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538212
273	NC_013199	GTT	2	6	19775	19780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538212
274	NC_013199	GAT	2	6	19969	19974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538212
275	NC_013199	GAC	2	6	19981	19986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538212
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278	NC_013199	TTG	2	6	20189	20194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538213
279	NC_013199	GTC	2	6	20217	20222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538213
280	NC_013199	CGT	2	6	20233	20238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538213
281	NC_013199	ATT	2	6	20261	20266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538213
282	NC_013199	AGA	2	6	20309	20314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538213
283	NC_013199	TTC	2	6	20330	20335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538213
284	NC_013199	GAA	2	6	20345	20350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538213
285	NC_013199	AAG	2	6	20372	20377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538213
286	NC_013199	CAT	2	6	20380	20385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538213
287	NC_013199	CAA	2	6	20488	20493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538213
288	NC_013199	AGT	2	6	20695	20700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538213
289	NC_013199	TAA	2	6	20852	20857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258538213
290	NC_013199	CTT	2	6	20917	20922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538213
291	NC_013199	TCT	2	6	21195	21200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_013199	AAT	2	6	21202	21207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_013199	TCA	2	6	21215	21220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
294	NC_013199	GGC	2	6	21265	21270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_013199	AAT	3	9	21295	21303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_013199	AAC	2	6	21322	21327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
297	NC_013199	CTG	2	6	21370	21375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
298	NC_013199	CAA	2	6	21405	21410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
299	NC_013199	TCC	2	6	21452	21457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
300	NC_013199	ATG	2	6	21475	21480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
301	NC_013199	CAA	2	6	21483	21488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
302	NC_013199	TTG	2	6	21608	21613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
303	NC_013199	GGC	2	6	21696	21701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
304	NC_013199	GAT	2	6	21774	21779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538214
305	NC_013199	CTG	2	6	21793	21798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538214
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319	NC_013199	TGA	2	6	22793	22798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538214
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321	NC_013199	GGT	2	6	22863	22868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538215
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332	NC_013199	AGA	2	6	23542	23547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538215
333	NC_013199	ACG	2	6	23619	23624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538215
334	NC_013199	ATT	2	6	23684	23689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538215
335	NC_013199	ATG	2	6	23698	23703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538215
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338	NC_013199	TGA	2	6	23912	23917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538215
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340	NC_013199	AGG	2	6	23968	23973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
341	NC_013199	GTT	2	6	24079	24084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
342	NC_013199	GCT	2	6	24190	24195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538216
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350	NC_013199	CTG	2	6	24632	24637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538216
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359	NC_013199	GTT	2	6	25500	25505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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369	NC_013199	GTT	2	6	26188	26193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538217
370	NC_013199	CAG	2	6	26275	26280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538217
371	NC_013199	TCG	2	6	26281	26286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538217
372	NC_013199	TGC	2	6	26470	26475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538217
373	NC_013199	CCG	2	6	26676	26681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538217
374	NC_013199	GCG	2	6	26835	26840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538217
375	NC_013199	CAC	2	6	26864	26869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538217
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378	NC_013199	GAT	2	6	27023	27028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538217
379	NC_013199	ACC	2	6	27029	27034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538217
380	NC_013199	GCA	2	6	27051	27056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538217
381	NC_013199	CTT	2	6	27130	27135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538217
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383	NC_013199	GAA	3	9	27182	27190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538217
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