MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 2634

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013199	GA	3	6	1184	1189	50 %	0 %	50 %	0 %	258538192
2	NC_013199	AT	4	8	1493	1500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013199	GC	3	6	1755	1760	0 %	0 %	50 %	50 %	258538193
4	NC_013199	GC	3	6	3882	3887	0 %	0 %	50 %	50 %	258538196
5	NC_013199	GC	3	6	3939	3944	0 %	0 %	50 %	50 %	258538196
6	NC_013199	GC	3	6	7395	7400	0 %	0 %	50 %	50 %	258538198
7	NC_013199	TG	3	6	12412	12417	0 %	50 %	50 %	0 %	258538204
8	NC_013199	AT	3	6	13999	14004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013199	AT	3	6	14145	14150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013199	TA	3	6	14199	14204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013199	GC	3	6	14688	14693	0 %	0 %	50 %	50 %	258538207
12	NC_013199	CG	4	8	14806	14813	0 %	0 %	50 %	50 %	258538207
13	NC_013199	CG	3	6	15680	15685	0 %	0 %	50 %	50 %	258538207
14	NC_013199	CA	3	6	17079	17084	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_013199	GT	3	6	18505	18510	0 %	50 %	50 %	0 %	258538211
16	NC_013199	AT	4	8	18530	18537	50 %	50 %	0 %	0 %	258538211
17	NC_013199	GA	3	6	18595	18600	50 %	0 %	50 %	0 %	258538211
18	NC_013199	AT	3	6	18920	18925	50 %	50 %	0 %	0 %	258538211
19	NC_013199	GA	3	6	19466	19471	50 %	0 %	50 %	0 %	258538212
20	NC_013199	AT	3	6	21239	21244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013199	AC	3	6	21626	21631	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_013199	TG	3	6	22442	22447	0 %	50 %	50 %	0 %	258538214
23	NC_013199	CG	3	6	23158	23163	0 %	0 %	50 %	50 %	258538215
24	NC_013199	AC	3	6	23482	23487	50 %	0 %	0 %	50 %	258538215
25	NC_013199	AG	3	6	26207	26212	50 %	0 %	50 %	0 %	258538217
26	NC_013199	AT	3	6	28896	28901	50 %	50 %	0 %	0 %	258538218
27	NC_013199	CA	3	6	29357	29362	50 %	0 %	0 %	50 %	258538219
28	NC_013199	AT	3	6	32548	32553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013199	AG	3	6	33837	33842	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013199	CG	3	6	35258	35263	0 %	0 %	50 %	50 %	258538226
31	NC_013199	AC	3	6	35460	35465	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013199	CG	3	6	35964	35969	0 %	0 %	50 %	50 %	258538227
33	NC_013199	TA	3	6	36519	36524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013199	TG	3	6	37086	37091	0 %	50 %	50 %	0 %	258538228
35	NC_013199	AG	4	8	37482	37489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013199	TA	3	6	37691	37696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013199	TA	3	6	38162	38167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013199	AT	3	6	40138	40143	50 %	50 %	0 %	0 %	258538230
39	NC_013199	AT	3	6	40337	40342	50 %	50 %	0 %	0 %	258538230
40	NC_013199	TA	3	6	41693	41698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013199	AC	3	6	41733	41738	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013199	AT	3	6	43051	43056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013199	CG	3	6	44100	44105	0 %	0 %	50 %	50 %	258538233
44	NC_013199	AT	3	6	45289	45294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013199	GC	3	6	46639	46644	0 %	0 %	50 %	50 %	258538234
46	NC_013199	CG	3	6	47199	47204	0 %	0 %	50 %	50 %	258538234
47	NC_013199	AC	3	6	50388	50393	50 %	0 %	0 %	50 %	258538235
48	NC_013199	CG	3	6	50636	50641	0 %	0 %	50 %	50 %	258538235
49	NC_013199	CG	3	6	50957	50962	0 %	0 %	50 %	50 %	258538236
50	NC_013199	CG	3	6	52353	52358	0 %	0 %	50 %	50 %	258538237
51	NC_013199	CG	4	8	52946	52953	0 %	0 %	50 %	50 %	258538237
52	NC_013199	CG	3	6	53823	53828	0 %	0 %	50 %	50 %	258538238
53	NC_013199	GT	3	6	55278	55283	0 %	50 %	50 %	0 %	258538239
54	NC_013199	GC	3	6	55561	55566	0 %	0 %	50 %	50 %	258538239
55	NC_013199	TA	3	6	56122	56127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013199	AT	3	6	56131	56136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013199	CA	3	6	56143	56148	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_013199	TG	3	6	56712	56717	0 %	50 %	50 %	0 %	258538240
59	NC_013199	CG	3	6	58489	58494	0 %	0 %	50 %	50 %	258538241
60	NC_013199	TG	3	6	59017	59022	0 %	50 %	50 %	0 %	258538241
61	NC_013199	AC	3	6	59312	59317	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_013199	CG	3	6	59444	59449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_013199	AT	3	6	59474	59479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013199	GC	3	6	59743	59748	0 %	0 %	50 %	50 %	258538242
65	NC_013199	GC	3	6	60592	60597	0 %	0 %	50 %	50 %	258538243
66	NC_013199	GT	3	6	61325	61330	0 %	50 %	50 %	0 %	258538243
67	NC_013199	GC	3	6	61702	61707	0 %	0 %	50 %	50 %	258538244
68	NC_013199	GT	3	6	65196	65201	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013199	CG	3	6	65950	65955	0 %	0 %	50 %	50 %	258538247
70	NC_013199	GT	3	6	66008	66013	0 %	50 %	50 %	0 %	258538247
71	NC_013199	GC	3	6	67118	67123	0 %	0 %	50 %	50 %	258538248
72	NC_013199	GC	4	8	67208	67215	0 %	0 %	50 %	50 %	258538248
73	NC_013199	TG	3	6	67335	67340	0 %	50 %	50 %	0 %	258538248
74	NC_013199	AT	3	6	68144	68149	50 %	50 %	0 %	0 %	258538248
75	NC_013199	AC	4	8	68716	68723	50 %	0 %	0 %	50 %	258538249
76	NC_013199	CG	3	6	69765	69770	0 %	0 %	50 %	50 %	258538251
77	NC_013199	GT	3	6	70193	70198	0 %	50 %	50 %	0 %	258538251
78	NC_013199	CG	3	6	71932	71937	0 %	0 %	50 %	50 %	258538251
79	NC_013199	CG	3	6	72587	72592	0 %	0 %	50 %	50 %	258538251
80	NC_013199	CG	3	6	72759	72764	0 %	0 %	50 %	50 %	258538251
81	NC_013199	AT	3	6	73645	73650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013199	GT	3	6	73709	73714	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013199	GT	3	6	73930	73935	0 %	50 %	50 %	0 %	258538253
84	NC_013199	AT	3	6	77052	77057	50 %	50 %	0 %	0 %	258538256
85	NC_013199	GC	3	6	79591	79596	0 %	0 %	50 %	50 %	258538260
86	NC_013199	GC	3	6	81001	81006	0 %	0 %	50 %	50 %	258538261
87	NC_013199	TG	3	6	81178	81183	0 %	50 %	50 %	0 %	258538261
88	NC_013199	AC	4	8	83470	83477	50 %	0 %	0 %	50 %	258538262
89	NC_013199	GA	3	6	84734	84739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013199	AT	3	6	85920	85925	50 %	50 %	0 %	0 %	258538267
91	NC_013199	TA	3	6	86272	86277	50 %	50 %	0 %	0 %	258538267
92	NC_013199	CG	3	6	90019	90024	0 %	0 %	50 %	50 %	258538270
93	NC_013199	AC	3	6	94396	94401	50 %	0 %	0 %	50 %	258538274
94	NC_013199	TC	3	6	94504	94509	0 %	50 %	0 %	50 %	258538274
95	NC_013199	GC	3	6	95940	95945	0 %	0 %	50 %	50 %	258538276
96	NC_013199	TG	3	6	97521	97526	0 %	50 %	50 %	0 %	258538278
97	NC_013199	GC	3	6	98746	98751	0 %	0 %	50 %	50 %	258538280
98	NC_013199	GC	3	6	98959	98964	0 %	0 %	50 %	50 %	258538280
99	NC_013199	CG	3	6	99402	99407	0 %	0 %	50 %	50 %	258538280
100	NC_013199	CT	3	6	100179	100184	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_013199	GC	3	6	100187	100192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_013199	CG	3	6	100426	100431	0 %	0 %	50 %	50 %	258538282
103	NC_013199	CA	3	6	101609	101614	50 %	0 %	0 %	50 %	258538282
104	NC_013199	GT	3	6	101994	101999	0 %	50 %	50 %	0 %	258538282
105	NC_013199	TG	3	6	102199	102204	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013199	GC	3	6	102332	102337	0 %	0 %	50 %	50 %	258538283
107	NC_013199	TG	3	6	104503	104508	0 %	50 %	50 %	0 %	258538285
108	NC_013199	GA	3	6	107085	107090	50 %	0 %	50 %	0 %	258538288
109	NC_013199	AT	3	6	107289	107294	50 %	50 %	0 %	0 %	258538288
110	NC_013199	TG	3	6	107408	107413	0 %	50 %	50 %	0 %	258538288
111	NC_013199	CT	3	6	108002	108007	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_013199	CA	3	6	109849	109854	50 %	0 %	0 %	50 %	258538290
113	NC_013199	GC	3	6	110739	110744	0 %	0 %	50 %	50 %	258538291
114	NC_013199	GC	3	6	111723	111728	0 %	0 %	50 %	50 %	258538293
115	NC_013199	GT	3	6	113001	113006	0 %	50 %	50 %	0 %	258538294
116	NC_013199	GT	3	6	113375	113380	0 %	50 %	50 %	0 %	258538295
117	NC_013199	GT	3	6	114011	114016	0 %	50 %	50 %	0 %	258538295
118	NC_013199	CG	3	6	114557	114562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_013199	CG	3	6	115023	115028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_013199	TG	3	6	117070	117075	0 %	50 %	50 %	0 %	258538297
121	NC_013199	GC	3	6	119280	119285	0 %	0 %	50 %	50 %	258538299
122	NC_013199	TA	3	6	119597	119602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013199	AT	3	6	121196	121201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013199	AT	3	6	122296	122301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013199	AT	3	6	124225	124230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013199	AC	3	6	126176	126181	50 %	0 %	0 %	50 %	258538307
127	NC_013199	GA	3	6	126383	126388	50 %	0 %	50 %	0 %	258538307
128	NC_013199	GC	3	6	129085	129090	0 %	0 %	50 %	50 %	258538309
129	NC_013199	CA	3	6	134679	134684	50 %	0 %	0 %	50 %	258538313
130	NC_013199	GT	3	6	137617	137622	0 %	50 %	50 %	0 %	258538315
131	NC_013199	CA	4	8	144263	144270	50 %	0 %	0 %	50 %	258538320
132	NC_013199	CA	3	6	145535	145540	50 %	0 %	0 %	50 %	258538321
133	NC_013199	GT	3	6	148043	148048	0 %	50 %	50 %	0 %	258538324
134	NC_013199	GC	3	6	148491	148496	0 %	0 %	50 %	50 %	258538324
135	NC_013199	TC	3	6	148899	148904	0 %	50 %	0 %	50 %	258538324
136	NC_013199	TA	3	6	151213	151218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013199	TA	3	6	151236	151241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013199	GC	3	6	152928	152933	0 %	0 %	50 %	50 %	258538329
139	NC_013199	GT	3	6	153110	153115	0 %	50 %	50 %	0 %	258538329
140	NC_013199	AC	3	6	154128	154133	50 %	0 %	0 %	50 %	258538330
141	NC_013199	TA	3	6	154615	154620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013199	CG	3	6	154857	154862	0 %	0 %	50 %	50 %	258538331
143	NC_013199	GC	3	6	155036	155041	0 %	0 %	50 %	50 %	258538331
144	NC_013199	GC	3	6	157538	157543	0 %	0 %	50 %	50 %	258538333
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