MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 144

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013198	CTATTA	2	12	1463	1474	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_013198	TGATCT	2	12	108085	108096	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_013198	GTGAGC	2	12	115417	115428	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_013198	TGGATA	2	12	155412	155423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013198	GCTCAC	2	12	201384	201395	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013198	GCTCAC	2	12	201506	201517	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_013198	TGGCGA	2	12	261786	261797	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_013198	GCTCAC	2	12	264796	264807	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_013198	GCAAAG	2	12	282565	282576	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_013198	AATCGT	2	12	289998	290009	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_013198	CTGACA	2	12	298190	298201	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013198	CGGAGC	2	12	310198	310209	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013198	TGGAAG	2	12	312394	312405	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013198	GTAGTT	2	12	324656	324667	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013198	GCTCAC	2	12	342140	342151	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013198	AATATT	2	12	366275	366286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013198	TTTAAA	2	12	387271	387282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013198	AGAAGT	2	12	394285	394296	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013198	CGTTAT	2	12	398732	398743	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_013198	ATTAAG	2	12	417207	417218	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013198	AATTAA	2	12	435827	435838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013198	TAAAAA	2	12	493843	493854	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013198	TATCGA	2	12	495718	495729	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_013198	GCTCAC	2	12	501063	501074	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25	NC_013198	CTCTAT	2	12	502592	502603	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013198	GAAAAA	2	12	507039	507050	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013198	AAAACA	2	12	528643	528654	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_013198	AAGGTA	2	12	533464	533475	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013198	CGGCAG	2	12	588682	588693	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013198	ATAACA	2	12	589038	589049	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_013198	GCTCAC	2	12	591389	591400	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013198	ATTTAA	2	12	611699	611710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013198	CAAGGA	2	12	612541	612552	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_013198	AGACTT	2	12	660836	660847	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_013198	TGAGCA	2	12	705347	705358	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_013198	ATTTTT	2	12	722979	722990	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013198	GTTTTT	2	12	781796	781807	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013198	GTTCTG	2	12	803064	803075	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_013198	ATTTTC	2	12	803107	803118	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_013198	GGAATT	2	12	822867	822878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013198	CGGAGC	2	12	825691	825702	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013198	TGGAAG	2	12	827887	827898	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013198	TCGCTT	2	12	831098	831109	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013198	TATACT	2	12	834204	834215	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_013198	CGGAGC	2	12	845732	845743	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_013198	TGGAAG	2	12	847928	847939	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013198	AAAACA	2	12	863939	863950	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_013198	GCTCAC	2	12	868087	868098	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
49	NC_013198	AATGCA	2	12	877847	877858	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_013198	CAGAAG	2	12	903803	903814	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_013198	GCTCAC	2	12	927610	927621	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
52	NC_013198	TCGCAG	2	12	945844	945855	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_013198	ATTTTA	2	12	967720	967731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013198	GCATAA	2	12	994557	994568	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_013198	ATTTAA	2	12	996986	996997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013198	AATGAA	2	12	1030646	1030657	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013198	ATCAGT	2	12	1045274	1045285	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_013198	GCTCAC	2	12	1053972	1053983	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013198	GCTCAC	2	12	1055476	1055487	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
60	NC_013198	AGCTGC	2	12	1059669	1059680	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_013198	GCTCAC	2	12	1062645	1062656	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_013198	GCTCAC	2	12	1062767	1062778	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_013198	GCTCAC	2	12	1072148	1072159	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
64	NC_013198	TAAAAT	2	12	1080009	1080020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013198	TCCATT	2	12	1115137	1115148	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013198	GCTCAC	2	12	1181328	1181339	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
67	NC_013198	GCTCAC	2	12	1181575	1181586	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
68	NC_013198	ACTTCG	2	12	1207159	1207170	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013198	TGTTAT	2	12	1240235	1240246	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013198	TCACAC	2	12	1366000	1366011	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_013198	GATAGT	2	12	1385349	1385360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013198	ATCAAT	2	12	1407426	1407437	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_013198	GTTTTT	2	12	1408052	1408063	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013198	ACGATT	2	12	1486567	1486578	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_013198	AGGTTG	2	12	1488804	1488815	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013198	TGCAGA	2	12	1489512	1489523	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_013198	TGTATT	2	12	1555506	1555517	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013198	GTTTGT	2	12	1567088	1567099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013198	CATCAA	2	12	1570570	1570581	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013198	CGCCCA	2	12	1574664	1574675	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_013198	ACTACC	2	12	1619989	1620000	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_013198	CTGTCA	2	12	1654853	1654864	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_013198	CCTGCC	2	12	1714059	1714070	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_013198	ATTTTT	2	12	1714652	1714663	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013198	TCCTTG	2	12	1717858	1717869	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_013198	TATTTT	2	12	1722767	1722778	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013198	AATTCG	2	12	1780092	1780103	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_013198	GTGAGC	2	12	1872893	1872904	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_013198	ACCCCA	2	12	1892213	1892224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_013198	CACTTC	2	12	1926102	1926113	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_013198	GCTCCG	2	12	1928300	1928311	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
92	NC_013198	TCGCAG	2	12	1938542	1938553	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_013198	GCTCAC	2	12	1938648	1938659	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
94	NC_013198	GCTCAC	2	12	1952511	1952522	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_013198	GCTATT	2	12	1965590	1965601	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_013198	GCTCAC	2	12	1972015	1972026	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
97	NC_013198	GCTCAC	2	12	1972141	1972152	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
98	NC_013198	TGCACA	2	12	1983796	1983807	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_013198	AGCTGA	2	12	2000723	2000734	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_013198	AAGTGT	2	12	2122040	2122051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013198	GGCTGG	2	12	2122115	2122126	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_013198	ATCAAT	2	12	2125627	2125638	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_013198	GTATCG	2	12	2130366	2130377	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_013198	GCTTTG	2	12	2175060	2175071	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_013198	TCGCAG	2	12	2185324	2185335	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_013198	TCATTT	2	12	2217090	2217101	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_013198	GCTTGT	2	12	2239893	2239904	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_013198	TCGCAG	2	12	2285637	2285648	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_013198	AAAAGA	2	12	2362740	2362751	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013198	GTTGCA	2	12	2380722	2380733	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_013198	AATTTT	2	12	2401000	2401011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013198	CTTACC	2	12	2404459	2404470	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_013198	GATTTA	2	12	2411203	2411214	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013198	GCCAAG	2	12	2434699	2434710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_013198	TTTTCA	2	12	2435577	2435588	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_013198	GTGAGC	2	12	2437097	2437108	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_013198	CCTGCT	2	12	2437369	2437380	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
118	NC_013198	GCAACT	2	12	2470890	2470901	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_013198	CCGACA	2	12	2495710	2495721	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
120	NC_013198	ATTCAC	2	12	2548556	2548567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_013198	TTTGAC	2	12	2564110	2564121	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_013198	CACTTC	2	12	2565391	2565402	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_013198	GCTCCG	2	12	2567589	2567600	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
124	NC_013198	TTGTGA	2	12	2609657	2609668	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013198	GCTTAT	2	12	2610700	2610711	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_013198	AAAAAC	2	12	2614389	2614400	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_013198	GTGAGC	2	12	2638418	2638429	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_013198	CAGTTT	2	12	2661906	2661917	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_013198	GCATCA	2	12	2711095	2711106	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_013198	CAGCAT	2	12	2770245	2770256	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_013198	ACTTCA	2	12	2781128	2781139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_013198	TCTGCT	2	12	2824961	2824972	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_013198	ACGATG	2	12	2854265	2854276	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_013198	TCGTTG	2	12	2855696	2855707	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_013198	ATCAAA	2	12	2862859	2862870	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_013198	TCGCAG	2	12	2866163	2866174	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_013198	CGATTA	2	12	2910768	2910779	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_013198	TTCGTC	2	12	2948772	2948783	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_013198	TTATAA	2	12	2956107	2956118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013198	ATAGTC	2	12	2962040	2962051	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_013198	CGGCCG	2	12	2963310	2963321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_013198	GAAAAA	2	12	2972385	2972396	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013198	ATTTTT	2	12	2974520	2974531	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013198	AACGAC	2	12	3007067	3007078	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.