MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 1493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013198	GCAAG	2	10	3464	3473	40 %	0 %	40 %	20 %	258506999
2	NC_013198	GATCG	2	10	3654	3663	20 %	20 %	40 %	20 %	258506999
3	NC_013198	AGTTA	2	10	4247	4256	40 %	40 %	20 %	0 %	258506999
4	NC_013198	GAAAA	2	10	7386	7395	80 %	0 %	20 %	0 %	258507001
5	NC_013198	TGTTT	2	10	14600	14609	0 %	80 %	20 %	0 %	258507011
6	NC_013198	CCGGT	2	10	15647	15656	0 %	20 %	40 %	40 %	258507012
7	NC_013198	CTCGA	2	10	17409	17418	20 %	20 %	20 %	40 %	258507015
8	NC_013198	TTGAT	2	10	20548	20557	20 %	60 %	20 %	0 %	258507017
9	NC_013198	GTTGC	2	10	21896	21905	0 %	40 %	40 %	20 %	258507017
10	NC_013198	AGCTA	2	10	23317	23326	40 %	20 %	20 %	20 %	258507019
11	NC_013198	CAAAC	2	10	25027	25036	60 %	0 %	0 %	40 %	258507021
12	NC_013198	GATTT	2	10	25232	25241	20 %	60 %	20 %	0 %	258507021
13	NC_013198	TGGTG	2	10	28236	28245	0 %	40 %	60 %	0 %	258507024
14	NC_013198	GCCGG	2	10	29592	29601	0 %	0 %	60 %	40 %	258507025
15	NC_013198	AACTG	2	10	30895	30904	40 %	20 %	20 %	20 %	258507026
16	NC_013198	GATGC	2	10	31145	31154	20 %	20 %	40 %	20 %	258507026
17	NC_013198	GAATA	2	10	31616	31625	60 %	20 %	20 %	0 %	258507027
18	NC_013198	AAAAC	2	10	34467	34476	80 %	0 %	0 %	20 %	258507028
19	NC_013198	CCGTC	2	10	34531	34540	0 %	20 %	20 %	60 %	258507028
20	NC_013198	ATGAC	2	10	35149	35158	40 %	20 %	20 %	20 %	258507029
21	NC_013198	CTGAT	2	10	35915	35924	20 %	40 %	20 %	20 %	258507030
22	NC_013198	CGCTA	2	10	36446	36455	20 %	20 %	20 %	40 %	258507031
23	NC_013198	AAGAT	2	10	38627	38636	60 %	20 %	20 %	0 %	258507034
24	NC_013198	TTTTC	2	10	42750	42759	0 %	80 %	0 %	20 %	258507038
25	NC_013198	CCGTC	2	10	47754	47763	0 %	20 %	20 %	60 %	258507042
26	NC_013198	GATCG	2	10	50638	50647	20 %	20 %	40 %	20 %	258507045
27	NC_013198	AAAGC	2	10	52073	52082	60 %	0 %	20 %	20 %	258507046
28	NC_013198	AGACA	2	10	55060	55069	60 %	0 %	20 %	20 %	258507046
29	NC_013198	ACAGT	2	10	55743	55752	40 %	20 %	20 %	20 %	258507046
30	NC_013198	CATCG	2	10	59060	59069	20 %	20 %	20 %	40 %	258507049
31	NC_013198	AGCCC	2	10	62054	62063	20 %	0 %	20 %	60 %	258507052
32	NC_013198	TTGGC	2	10	62137	62146	0 %	40 %	40 %	20 %	258507052
33	NC_013198	CCGAT	2	10	63824	63833	20 %	20 %	20 %	40 %	258507053
34	NC_013198	GGCGT	2	10	66301	66310	0 %	20 %	60 %	20 %	258507055
35	NC_013198	AAGTG	2	10	67672	67681	40 %	20 %	40 %	0 %	258507056
36	NC_013198	GCCGG	2	10	70674	70683	0 %	0 %	60 %	40 %	258507059
37	NC_013198	CATAG	2	10	73292	73301	40 %	20 %	20 %	20 %	258507060
38	NC_013198	CTGAG	2	10	76417	76426	20 %	20 %	40 %	20 %	258507063
39	NC_013198	TTGGA	2	10	76899	76908	20 %	40 %	40 %	0 %	258507063
40	NC_013198	AATGG	2	10	78674	78683	40 %	20 %	40 %	0 %	258507064
41	NC_013198	GCGCC	2	10	80024	80033	0 %	0 %	40 %	60 %	258507066
42	NC_013198	GTGGC	2	10	82648	82657	0 %	20 %	60 %	20 %	258507069
43	NC_013198	GCCAA	2	10	83583	83592	40 %	0 %	20 %	40 %	258507070
44	NC_013198	AAACC	2	10	84045	84054	60 %	0 %	0 %	40 %	258507071
45	NC_013198	AAATC	2	10	84080	84089	60 %	20 %	0 %	20 %	258507071
46	NC_013198	AGATC	2	10	86059	86068	40 %	20 %	20 %	20 %	258507073
47	NC_013198	TTCGT	2	10	87163	87172	0 %	60 %	20 %	20 %	258507075
48	NC_013198	GCAAG	2	10	87226	87235	40 %	0 %	40 %	20 %	258507075
49	NC_013198	CGGCC	2	10	89720	89729	0 %	0 %	40 %	60 %	258507077
50	NC_013198	CGTTT	2	10	90935	90944	0 %	60 %	20 %	20 %	258507079
51	NC_013198	AAAAC	2	10	92224	92233	80 %	0 %	0 %	20 %	258507081
52	NC_013198	CGATT	2	10	94976	94985	20 %	40 %	20 %	20 %	258507085
53	NC_013198	TGGGA	2	10	95955	95964	20 %	20 %	60 %	0 %	258507086
54	NC_013198	GAAAA	2	10	96769	96778	80 %	0 %	20 %	0 %	258507088
55	NC_013198	GAATC	2	10	98024	98033	40 %	20 %	20 %	20 %	258507088
56	NC_013198	ATCGC	2	10	101346	101355	20 %	20 %	20 %	40 %	258507090
57	NC_013198	CGAAG	2	10	108974	108983	40 %	0 %	40 %	20 %	258507099
58	NC_013198	AGTCG	2	10	109128	109137	20 %	20 %	40 %	20 %	258507099
59	NC_013198	TGGGC	2	10	117823	117832	0 %	20 %	60 %	20 %	258507107
60	NC_013198	AGGGC	2	10	117876	117885	20 %	0 %	60 %	20 %	258507107
61	NC_013198	GCTTT	2	10	118530	118539	0 %	60 %	20 %	20 %	258507107
62	NC_013198	GCGGA	2	10	121552	121561	20 %	0 %	60 %	20 %	258507109
63	NC_013198	TAACG	2	10	122018	122027	40 %	20 %	20 %	20 %	258507109
64	NC_013198	CCTTG	2	10	122526	122535	0 %	40 %	20 %	40 %	258507110
65	NC_013198	TCTTT	2	10	125624	125633	0 %	80 %	0 %	20 %	258507114
66	NC_013198	GCGTT	2	10	126911	126920	0 %	40 %	40 %	20 %	258507115
67	NC_013198	ATTGT	2	10	127204	127213	20 %	60 %	20 %	0 %	258507115
68	NC_013198	ACCGC	2	10	134328	134337	20 %	0 %	20 %	60 %	258507120
69	NC_013198	GCATC	2	10	135757	135766	20 %	20 %	20 %	40 %	258507121
70	NC_013198	AGGCT	2	10	136010	136019	20 %	20 %	40 %	20 %	258507121
71	NC_013198	GAATC	2	10	136567	136576	40 %	20 %	20 %	20 %	258507122
72	NC_013198	AATCA	2	10	138300	138309	60 %	20 %	0 %	20 %	258507123
73	NC_013198	TTTTC	2	10	138617	138626	0 %	80 %	0 %	20 %	258507123
74	NC_013198	GTTTG	2	10	139356	139365	0 %	60 %	40 %	0 %	258507124
75	NC_013198	GGTCA	2	10	139871	139880	20 %	20 %	40 %	20 %	258507125
76	NC_013198	CAGCT	2	10	140094	140103	20 %	20 %	20 %	40 %	258507125
77	NC_013198	GGGAT	2	10	143998	144007	20 %	20 %	60 %	0 %	258507127
78	NC_013198	GGCTC	2	10	145415	145424	0 %	20 %	40 %	40 %	258507128
79	NC_013198	TGTTC	2	10	150143	150152	0 %	60 %	20 %	20 %	258507132
80	NC_013198	CGGTG	2	10	151471	151480	0 %	20 %	60 %	20 %	258507133
81	NC_013198	GTGAT	2	10	151812	151821	20 %	40 %	40 %	0 %	258507133
82	NC_013198	AGATA	2	10	155916	155925	60 %	20 %	20 %	0 %	258507137
83	NC_013198	GACCA	2	10	159215	159224	40 %	0 %	20 %	40 %	258507139
84	NC_013198	TGCTG	2	10	165905	165914	0 %	40 %	40 %	20 %	258507146
85	NC_013198	ATTGC	2	10	169024	169033	20 %	40 %	20 %	20 %	258507150
86	NC_013198	GCAAT	2	10	170840	170849	40 %	20 %	20 %	20 %	258507152
87	NC_013198	GCGTG	2	10	173829	173838	0 %	20 %	60 %	20 %	258507157
88	NC_013198	GAAGA	2	10	174061	174070	60 %	0 %	40 %	0 %	258507157
89	NC_013198	CAAAC	2	10	175276	175285	60 %	0 %	0 %	40 %	258507158
90	NC_013198	AATTT	2	10	176012	176021	40 %	60 %	0 %	0 %	258507158
91	NC_013198	GGCAA	3	15	177095	177109	40 %	0 %	40 %	20 %	258507159
92	NC_013198	CATAA	2	10	177651	177660	60 %	20 %	0 %	20 %	258507160
93	NC_013198	AATCA	2	10	177888	177897	60 %	20 %	0 %	20 %	258507160
94	NC_013198	TCAGT	2	10	180064	180073	20 %	40 %	20 %	20 %	258507163
95	NC_013198	CAAAC	2	10	181262	181271	60 %	0 %	0 %	40 %	258507166
96	NC_013198	GAATA	2	10	182590	182599	60 %	20 %	20 %	0 %	258507167
97	NC_013198	TGGTT	2	10	182941	182950	0 %	60 %	40 %	0 %	258507168
98	NC_013198	TGAAC	2	10	183675	183684	40 %	20 %	20 %	20 %	258507168
99	NC_013198	ATACG	2	10	184137	184146	40 %	20 %	20 %	20 %	258507169
100	NC_013198	ATATT	2	10	186233	186242	40 %	60 %	0 %	0 %	258507170
101	NC_013198	GTGAA	2	10	186832	186841	40 %	20 %	40 %	0 %	258507171
102	NC_013198	ACACA	2	10	187916	187925	60 %	0 %	0 %	40 %	258507172
103	NC_013198	TCACT	2	10	190863	190872	20 %	40 %	0 %	40 %	258507175
104	NC_013198	GGCGA	2	10	192050	192059	20 %	0 %	60 %	20 %	258507176
105	NC_013198	CGCAA	2	10	192376	192385	40 %	0 %	20 %	40 %	258507176
106	NC_013198	TTCAT	2	10	192414	192423	20 %	60 %	0 %	20 %	258507176
107	NC_013198	TCGAC	2	10	192891	192900	20 %	20 %	20 %	40 %	258507176
108	NC_013198	CAAGC	2	10	195901	195910	40 %	0 %	20 %	40 %	258507179
109	NC_013198	CACAA	2	10	200843	200852	60 %	0 %	0 %	40 %	258507184
110	NC_013198	AATAA	2	10	201536	201545	80 %	20 %	0 %	0 %	258507185
111	NC_013198	TGGTC	2	10	203943	203952	0 %	40 %	40 %	20 %	258507187
112	NC_013198	TTCGG	2	10	206155	206164	0 %	40 %	40 %	20 %	258507188
113	NC_013198	ATGCG	2	10	209173	209182	20 %	20 %	40 %	20 %	258507191
114	NC_013198	GCCGA	2	10	209763	209772	20 %	0 %	40 %	40 %	258507192
115	NC_013198	CCGTT	2	10	209836	209845	0 %	40 %	20 %	40 %	258507192
116	NC_013198	CAGCC	2	10	215940	215949	20 %	0 %	20 %	60 %	258507196
117	NC_013198	TTGCT	2	10	217109	217118	0 %	60 %	20 %	20 %	258507197
118	NC_013198	GCTAT	2	10	217136	217145	20 %	40 %	20 %	20 %	258507197
119	NC_013198	GACGG	2	10	217503	217512	20 %	0 %	60 %	20 %	258507198
120	NC_013198	TTATT	2	10	217690	217699	20 %	80 %	0 %	0 %	258507198
121	NC_013198	CAGAT	2	10	219426	219435	40 %	20 %	20 %	20 %	258507200
122	NC_013198	CTTTT	2	10	222746	222755	0 %	80 %	0 %	20 %	258507204
123	NC_013198	TTCGT	2	10	222888	222897	0 %	60 %	20 %	20 %	258507204
124	NC_013198	TCTTT	2	10	226731	226740	0 %	80 %	0 %	20 %	258507207
125	NC_013198	GATGC	2	10	229736	229745	20 %	20 %	40 %	20 %	258507210
126	NC_013198	TCGCT	2	10	229840	229849	0 %	40 %	20 %	40 %	258507210
127	NC_013198	CAAAG	2	10	232624	232633	60 %	0 %	20 %	20 %	258507214
128	NC_013198	TTCAT	2	10	233243	233252	20 %	60 %	0 %	20 %	258507215
129	NC_013198	GTTGC	2	10	241636	241645	0 %	40 %	40 %	20 %	258507232
130	NC_013198	AGAGA	2	10	246928	246937	60 %	0 %	40 %	0 %	258507238
131	NC_013198	CGATT	2	10	247372	247381	20 %	40 %	20 %	20 %	258507239
132	NC_013198	AAAGC	2	10	255369	255378	60 %	0 %	20 %	20 %	258507248
133	NC_013198	TCCGG	2	10	255446	255455	0 %	20 %	40 %	40 %	258507248
134	NC_013198	GGTTT	2	10	256688	256697	0 %	60 %	40 %	0 %	258507249
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145	NC_013198	GAAAA	2	10	283270	283279	80 %	0 %	20 %	0 %	258507273
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163	NC_013198	GATTG	2	10	321611	321620	20 %	40 %	40 %	0 %	258507315
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260	NC_013198	TCGGT	2	10	487249	487258	0 %	40 %	40 %	20 %	258507470
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