MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 1295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013198	TAAT	2	8	3078	3085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013198	AAAT	2	8	9494	9501	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013198	GAAA	2	8	9756	9763	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013198	GGTA	2	8	12881	12888	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013198	CTAA	2	8	16778	16785	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_013198	GCTA	2	8	17206	17213	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013198	AAGA	2	8	18439	18446	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013198	TTTA	2	8	18586	18593	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013198	ATAC	2	8	20016	20023	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013198	TAAT	2	8	22913	22920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013198	TGCT	2	8	23000	23007	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_013198	TTTA	2	8	23019	23026	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013198	GGAA	2	8	26943	26950	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013198	GGGC	2	8	27216	27223	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15	NC_013198	TGCG	2	8	27257	27264	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_013198	TTTG	2	8	27484	27491	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013198	GGGT	2	8	29988	29995	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013198	TTAA	3	12	31266	31277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013198	ATTA	2	8	35491	35498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013198	TTGC	2	8	36785	36792	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013198	GTTT	2	8	42292	42299	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013198	AAGT	2	8	43100	43107	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013198	TGGG	2	8	43559	43566	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013198	AGAA	2	8	43658	43665	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013198	ATGA	2	8	44053	44060	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013198	TCTA	2	8	44096	44103	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_013198	CCTT	2	8	44370	44377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_013198	AGTC	2	8	44393	44400	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_013198	TATT	2	8	44470	44477	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013198	ATTT	2	8	45059	45066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013198	AAGA	2	8	46800	46807	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013198	AAAT	2	8	46823	46830	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013198	CTTT	2	8	49658	49665	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_013198	TGCG	2	8	51746	51753	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_013198	TAAA	2	8	56610	56617	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013198	GAAG	2	8	64695	64702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013198	AAGG	2	8	65458	65465	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013198	CTTG	2	8	69043	69050	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_013198	CAGA	2	8	69321	69328	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_013198	CGTG	2	8	69813	69820	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_013198	AGAA	2	8	69865	69872	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013198	ATAA	2	8	70434	70441	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013198	TGAA	2	8	71960	71967	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013198	ATTG	2	8	74084	74091	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013198	AAAC	2	8	74247	74254	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_013198	TTCA	2	8	78717	78724	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_013198	TAAT	2	8	78773	78780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013198	TAAA	2	8	82274	82281	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013198	CAGT	2	8	82838	82845	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_013198	TGAT	2	8	82860	82867	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013198	TTTG	2	8	86563	86570	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013198	AATA	2	8	87872	87879	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013198	CGAT	2	8	91182	91189	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_013198	CTGT	2	8	91202	91209	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_013198	CTTC	2	8	92559	92566	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013198	GCCT	2	8	93547	93554	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013198	AAAT	2	8	94738	94745	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013198	TAGG	2	8	96286	96293	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013198	TTTA	2	8	102651	102658	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013198	GGCT	2	8	107791	107798	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_013198	TGAT	2	8	108131	108138	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013198	GCTT	2	8	111742	111749	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_013198	ATTT	2	8	112291	112298	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013198	GTAA	2	8	112828	112835	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013198	CAAA	2	8	118932	118939	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_013198	ATTG	2	8	123640	123647	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013198	TAAC	2	8	124260	124267	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_013198	CCTG	2	8	124902	124909	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_013198	TAAT	2	8	127618	127625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013198	ACAA	2	8	132276	132283	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_013198	CTTT	2	8	136526	136533	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_013198	ATAA	2	8	145022	145029	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013198	TTCG	2	8	145031	145038	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_013198	ATTA	2	8	145159	145166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013198	GAAT	2	8	150830	150837	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013198	GCAA	2	8	150898	150905	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_013198	ATGT	2	8	154621	154628	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013198	CTAG	2	8	155015	155022	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_013198	CTAA	2	8	155372	155379	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_013198	TACT	2	8	155440	155447	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_013198	TCAC	2	8	157003	157010	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_013198	GATG	2	8	157034	157041	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013198	TTTG	2	8	158599	158606	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013198	AAAC	2	8	160094	160101	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_013198	CCAC	2	8	160133	160140	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
86	NC_013198	CACC	2	8	160208	160215	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
87	NC_013198	TCCC	2	8	161222	161229	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
88	NC_013198	AATT	2	8	162419	162426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013198	CTTT	2	8	162438	162445	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_013198	TGAT	2	8	162507	162514	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013198	TGAA	2	8	162585	162592	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013198	CAAA	2	8	164989	164996	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_013198	ATTC	2	8	172341	172348	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_013198	GAAT	2	8	172465	172472	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013198	GAAT	2	8	172481	172488	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013198	ACGA	2	8	176774	176781	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_013198	TTAC	2	8	180423	180430	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_013198	TAAG	2	8	180439	180446	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013198	TAAA	2	8	180967	180974	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013198	AGTA	2	8	190003	190010	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013198	TTTG	2	8	190594	190601	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013198	TTAA	2	8	191451	191458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013198	GTTT	2	8	191553	191560	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013198	TTTA	2	8	197912	197919	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013198	TAAT	2	8	202870	202877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013198	TTGC	2	8	211440	211447	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_013198	TAAA	2	8	216222	216229	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013198	AAAT	2	8	216277	216284	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013198	ATTT	2	8	216285	216292	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013198	CTTT	2	8	220563	220570	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_013198	TTAA	2	8	223518	223525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013198	TCAG	2	8	224527	224534	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_013198	TTAA	2	8	232315	232322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013198	AAAG	2	8	236204	236211	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013198	GATC	2	8	237046	237053	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_013198	GATG	2	8	237339	237346	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013198	GTTT	2	8	243336	243343	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013198	CGCT	2	8	243383	243390	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_013198	TTTG	2	8	243455	243462	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013198	TGAT	2	8	244256	244263	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013198	TCCA	2	8	245160	245167	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_013198	TGTT	2	8	245336	245343	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013198	TTTC	2	8	251044	251051	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_013198	GTGC	2	8	261775	261782	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_013198	ATTT	2	8	262858	262865	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013198	ATTT	2	8	264522	264529	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013198	GTTT	2	8	264820	264827	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013198	TACA	2	8	277678	277685	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_013198	AAGA	2	8	277700	277707	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013198	ATTG	2	8	277809	277816	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013198	CGCA	2	8	277847	277854	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_013198	GTTG	2	8	286797	286804	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013198	TGTT	2	8	291557	291564	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013198	AGTT	2	8	298301	298308	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013198	ATCA	2	8	298416	298423	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_013198	GATG	2	8	299676	299683	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013198	AGAC	2	8	299941	299948	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_013198	CATG	2	8	304605	304612	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_013198	CTAG	2	8	304763	304770	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_013198	GTCA	2	8	307514	307521	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_013198	TGGA	2	8	307998	308005	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013198	GTGA	2	8	308177	308184	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013198	AGCG	2	8	308347	308354	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_013198	ATGG	2	8	309012	309019	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013198	AGAA	2	8	309757	309764	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013198	GCGA	2	8	309786	309793	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_013198	GCTT	2	8	309818	309825	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_013198	GTAG	2	8	310237	310244	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013198	ATGT	2	8	310320	310327	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013198	GAGC	2	8	311228	311235	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_013198	TAGG	2	8	311674	311681	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013198	CTGC	2	8	312655	312662	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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