MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 34077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013198	GTG	2	6	184	189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258506996
2	NC_013198	TCA	2	6	230	235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258506996
3	NC_013198	CAA	2	6	301	306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258506996
4	NC_013198	CGG	2	6	392	397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258506996
5	NC_013198	CGG	2	6	450	455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258506996
6	NC_013198	AAT	2	6	511	516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258506996
7	NC_013198	TTC	2	6	652	657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258506996
8	NC_013198	AAG	2	6	665	670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258506996
9	NC_013198	AAG	2	6	677	682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258506996
10	NC_013198	TTC	2	6	685	690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258506996
11	NC_013198	CCG	2	6	823	828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258506996
12	NC_013198	AGA	2	6	873	878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258506996
13	NC_013198	GAA	2	6	984	989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258506996
14	NC_013198	GAT	2	6	1042	1047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258506996
15	NC_013198	ACC	2	6	1285	1290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258506996
16	NC_013198	ATG	2	6	1567	1572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258506997
17	NC_013198	GCT	2	6	1698	1703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258506997
18	NC_013198	GCA	2	6	1729	1734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258506997
19	NC_013198	TTC	2	6	1761	1766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258506997
20	NC_013198	CAG	2	6	2095	2100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258506997
21	NC_013198	CAT	3	9	2120	2128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258506997
22	NC_013198	TAT	2	6	2212	2217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258506997
23	NC_013198	CTG	2	6	2331	2336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258506997
24	NC_013198	AGC	2	6	2373	2378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258506997
25	NC_013198	GTG	2	6	2385	2390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258506997
26	NC_013198	GAA	2	6	2460	2465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258506997
27	NC_013198	CGA	3	9	3149	3157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258506998
28	NC_013198	CAC	2	6	3174	3179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258506998
29	NC_013198	GCG	2	6	3230	3235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258506998
30	NC_013198	CGT	2	6	3295	3300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258506998
31	NC_013198	CAA	2	6	3527	3532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258506999
32	NC_013198	TCA	2	6	3629	3634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258506999
33	NC_013198	GCG	2	6	3755	3760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258506999
34	NC_013198	GGC	2	6	3920	3925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258506999
35	NC_013198	TGC	2	6	3961	3966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258506999
36	NC_013198	CAA	2	6	3996	4001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258506999
37	NC_013198	TGC	2	6	4052	4057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258506999
38	NC_013198	AGC	2	6	4114	4119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258506999
39	NC_013198	GAT	2	6	4167	4172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258506999
40	NC_013198	CAG	2	6	4224	4229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258506999
41	NC_013198	CAC	2	6	4232	4237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258506999
42	NC_013198	GAT	2	6	4311	4316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258506999
43	NC_013198	ATC	2	6	4425	4430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258506999
44	NC_013198	GAA	2	6	4540	4545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507000
45	NC_013198	GCA	2	6	4561	4566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507000
46	NC_013198	ATG	2	6	4571	4576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507000
47	NC_013198	CAT	2	6	4663	4668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507000
48	NC_013198	GAT	2	6	4771	4776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507000
49	NC_013198	GTC	2	6	4814	4819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507000
50	NC_013198	GGT	2	6	4855	4860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507000
51	NC_013198	CGG	2	6	4890	4895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507000
52	NC_013198	GTT	2	6	4954	4959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507000
53	NC_013198	CGG	2	6	4962	4967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507000
54	NC_013198	TGA	2	6	5106	5111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507000
55	NC_013198	GCG	2	6	5188	5193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507000
56	NC_013198	GGC	2	6	5224	5229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507000
57	NC_013198	GAA	3	9	5256	5264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507000
58	NC_013198	CTG	2	6	5272	5277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507000
59	NC_013198	GGC	2	6	5398	5403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507000
60	NC_013198	GAT	2	6	5485	5490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507000
61	NC_013198	GTT	2	6	5530	5535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507000
62	NC_013198	GGT	2	6	5607	5612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507000
63	NC_013198	ATT	2	6	5677	5682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507000
64	NC_013198	GCT	2	6	5716	5721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507000
65	NC_013198	AAG	2	6	5746	5751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507000
66	NC_013198	ACA	2	6	5792	5797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507000
67	NC_013198	GAA	2	6	5959	5964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507000
68	NC_013198	ATC	2	6	6043	6048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507000
69	NC_013198	GTT	2	6	6087	6092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507000
70	NC_013198	GCC	2	6	6156	6161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507000
71	NC_013198	ATG	2	6	6187	6192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507000
72	NC_013198	GCC	2	6	6240	6245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507000
73	NC_013198	ACC	2	6	6313	6318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507000
74	NC_013198	CGG	2	6	6418	6423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507000
75	NC_013198	GAA	2	6	6433	6438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507000
76	NC_013198	TTG	2	6	6449	6454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507000
77	NC_013198	AAC	2	6	6460	6465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507000
78	NC_013198	GAT	2	6	6543	6548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507001
79	NC_013198	AAG	2	6	6732	6737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507001
80	NC_013198	TCG	2	6	6748	6753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507001
81	NC_013198	GCG	3	9	6891	6899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507001
82	NC_013198	CAA	2	6	6956	6961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507001
83	NC_013198	GTT	2	6	7011	7016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507001
84	NC_013198	CTG	2	6	7038	7043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507001
85	NC_013198	ACC	2	6	7077	7082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507001
86	NC_013198	CCG	2	6	7089	7094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507001
87	NC_013198	ATC	2	6	7138	7143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507001
88	NC_013198	CCA	2	6	7150	7155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507001
89	NC_013198	TTA	2	6	7318	7323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507001
90	NC_013198	TGG	2	6	7357	7362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507001
91	NC_013198	TGA	2	6	7418	7423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507001
92	NC_013198	CCG	2	6	7460	7465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507001
93	NC_013198	AAT	2	6	7491	7496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507001
94	NC_013198	TGG	2	6	7540	7545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507001
95	NC_013198	CGG	3	9	7626	7634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507001
96	NC_013198	GAA	2	6	7649	7654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507001
97	NC_013198	ATT	2	6	7725	7730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507001
98	NC_013198	ATT	2	6	7938	7943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507001
99	NC_013198	ATG	2	6	7945	7950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507001
100	NC_013198	CTG	2	6	7998	8003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507001
101	NC_013198	AAG	2	6	8047	8052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507001
102	NC_013198	GGT	2	6	8127	8132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507001
103	NC_013198	GAT	2	6	8163	8168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507001
104	NC_013198	TCG	2	6	8170	8175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507001
105	NC_013198	ATG	2	6	8200	8205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507001
106	NC_013198	CTT	2	6	8213	8218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507001
107	NC_013198	CAA	2	6	8222	8227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507001
108	NC_013198	GCA	2	6	8242	8247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507001
109	NC_013198	ATG	2	6	8365	8370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507001
110	NC_013198	GCA	2	6	8443	8448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507001
111	NC_013198	CGG	2	6	8741	8746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507001
112	NC_013198	GAA	2	6	8777	8782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507001
113	NC_013198	TGA	2	6	8833	8838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507001
114	NC_013198	CGA	2	6	8924	8929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507001
115	NC_013198	CGA	2	6	8972	8977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507001
116	NC_013198	CAG	2	6	8987	8992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507001
117	NC_013198	TGA	2	6	9131	9136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507001
118	NC_013198	CTG	3	9	9428	9436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507002
119	NC_013198	ATG	2	6	9845	9850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507003
120	NC_013198	TGG	2	6	9907	9912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507003
121	NC_013198	TAA	2	6	9940	9945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507003
122	NC_013198	TTG	2	6	9963	9968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507003
123	NC_013198	TGG	2	6	9979	9984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507003
124	NC_013198	GGT	2	6	10028	10033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507003
125	NC_013198	TGG	2	6	10067	10072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507003
126	NC_013198	GAC	2	6	10505	10510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507004
127	NC_013198	TGA	2	6	10514	10519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507004
128	NC_013198	ATA	2	6	10588	10593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507004
129	NC_013198	CAA	2	6	10674	10679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507004
130	NC_013198	CTG	3	9	11064	11072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507005
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254	NC_013198	ATT	2	6	22519	22524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507018
255	NC_013198	GCG	2	6	22544	22549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507018
256	NC_013198	TGC	2	6	22557	22562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507018
257	NC_013198	GAC	2	6	22647	22652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507018
258	NC_013198	GCG	2	6	22694	22699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507018
259	NC_013198	AAT	2	6	22740	22745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507018
260	NC_013198	TCG	2	6	22777	22782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507018
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262	NC_013198	TTG	2	6	23181	23186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507019
263	NC_013198	CCA	2	6	23227	23232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507019
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271	NC_013198	GCG	2	6	23879	23884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507020
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373	NC_013198	CCG	2	6	32508	32513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507027
374	NC_013198	GCG	2	6	32667	32672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507027
375	NC_013198	CAC	2	6	32696	32701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507027
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378	NC_013198	GAT	2	6	32855	32860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507027
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498	NC_013198	GAA	2	6	42854	42859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507038
499	NC_013198	TCA	2	6	42873	42878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507038
500	NC_013198	TAT	2	6	42953	42958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507038

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