MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 2736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013198	AT	4	8	1493	1500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013198	GC	3	6	1755	1760	0 %	0 %	50 %	50 %	258506997
3	NC_013198	GT	3	6	2767	2772	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013198	AT	3	6	2873	2878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013198	GC	3	6	3510	3515	0 %	0 %	50 %	50 %	258506999
6	NC_013198	GC	3	6	3567	3572	0 %	0 %	50 %	50 %	258506999
7	NC_013198	GC	3	6	7023	7028	0 %	0 %	50 %	50 %	258507001
8	NC_013198	TG	3	6	12040	12045	0 %	50 %	50 %	0 %	258507007
9	NC_013198	AT	3	6	13728	13733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013198	AT	3	6	13874	13879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013198	TA	3	6	13928	13933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013198	GC	3	6	14417	14422	0 %	0 %	50 %	50 %	258507011
13	NC_013198	CG	4	8	14535	14542	0 %	0 %	50 %	50 %	258507011
14	NC_013198	GC	3	6	15182	15187	0 %	0 %	50 %	50 %	258507011
15	NC_013198	CG	3	6	15409	15414	0 %	0 %	50 %	50 %	258507011
16	NC_013198	CA	3	6	16808	16813	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_013198	CG	3	6	17560	17565	0 %	0 %	50 %	50 %	258507015
18	NC_013198	GT	3	6	19427	19432	0 %	50 %	50 %	0 %	258507016
19	NC_013198	AT	4	8	19452	19459	50 %	50 %	0 %	0 %	258507016
20	NC_013198	GA	3	6	19517	19522	50 %	0 %	50 %	0 %	258507016
21	NC_013198	AT	3	6	19986	19991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013198	AG	3	6	20873	20878	50 %	0 %	50 %	0 %	258507017
23	NC_013198	CG	3	6	21524	21529	0 %	0 %	50 %	50 %	258507017
24	NC_013198	TG	3	6	21600	21605	0 %	50 %	50 %	0 %	258507017
25	NC_013198	TA	3	6	22091	22096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013198	GA	3	6	23723	23728	50 %	0 %	50 %	0 %	258507020
27	NC_013198	CT	3	6	24352	24357	0 %	50 %	0 %	50 %	258507021
28	NC_013198	CT	3	6	25011	25016	0 %	50 %	0 %	50 %	258507021
29	NC_013198	AC	3	6	25331	25336	50 %	0 %	0 %	50 %	258507021
30	NC_013198	AT	3	6	27066	27071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013198	TG	3	6	28274	28279	0 %	50 %	50 %	0 %	258507024
32	NC_013198	CG	3	6	28990	28995	0 %	0 %	50 %	50 %	258507025
33	NC_013198	AG	3	6	32039	32044	50 %	0 %	50 %	0 %	258507027
34	NC_013198	AT	3	6	34728	34733	50 %	50 %	0 %	0 %	258507028
35	NC_013198	CA	3	6	35189	35194	50 %	0 %	0 %	50 %	258507029
36	NC_013198	AT	3	6	38390	38395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013198	AG	3	6	39672	39677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013198	CG	3	6	41093	41098	0 %	0 %	50 %	50 %	258507036
39	NC_013198	AC	3	6	41295	41300	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_013198	CG	3	6	41800	41805	0 %	0 %	50 %	50 %	258507037
41	NC_013198	TA	3	6	42357	42362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013198	AG	4	8	43320	43327	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013198	TA	3	6	43529	43534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013198	TA	3	6	44000	44005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013198	AT	3	6	45979	45984	50 %	50 %	0 %	0 %	258507040
46	NC_013198	AT	3	6	47259	47264	50 %	50 %	0 %	0 %	258507042
47	NC_013198	AT	3	6	49700	49705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013198	CG	3	6	50749	50754	0 %	0 %	50 %	50 %	258507045
49	NC_013198	AT	3	6	51937	51942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013198	GC	3	6	53287	53292	0 %	0 %	50 %	50 %	258507046
51	NC_013198	CG	3	6	53847	53852	0 %	0 %	50 %	50 %	258507046
52	NC_013198	AC	3	6	57037	57042	50 %	0 %	0 %	50 %	258507047
53	NC_013198	CG	3	6	57285	57290	0 %	0 %	50 %	50 %	258507047
54	NC_013198	CG	3	6	57605	57610	0 %	0 %	50 %	50 %	258507048
55	NC_013198	CG	3	6	59001	59006	0 %	0 %	50 %	50 %	258507049
56	NC_013198	CG	4	8	59559	59566	0 %	0 %	50 %	50 %	258507050
57	NC_013198	CG	3	6	60436	60441	0 %	0 %	50 %	50 %	258507051
58	NC_013198	GT	3	6	61891	61896	0 %	50 %	50 %	0 %	258507052
59	NC_013198	GC	3	6	62174	62179	0 %	0 %	50 %	50 %	258507052
60	NC_013198	TA	3	6	62735	62740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013198	AT	3	6	62744	62749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013198	CA	3	6	62756	62761	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_013198	CG	3	6	63562	63567	0 %	0 %	50 %	50 %	258507053
64	NC_013198	TG	3	6	64090	64095	0 %	50 %	50 %	0 %	258507053
65	NC_013198	AC	3	6	64385	64390	50 %	0 %	0 %	50 %	258507053
66	NC_013198	CG	3	6	64517	64522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_013198	AT	3	6	64547	64552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013198	GC	3	6	64816	64821	0 %	0 %	50 %	50 %	258507054
69	NC_013198	GC	3	6	65665	65670	0 %	0 %	50 %	50 %	258507055
70	NC_013198	GT	3	6	66392	66397	0 %	50 %	50 %	0 %	258507055
71	NC_013198	TG	3	6	70275	70280	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013198	GT	3	6	71088	71093	0 %	50 %	50 %	0 %	258507059
73	NC_013198	GT	3	6	71608	71613	0 %	50 %	50 %	0 %	258507059
74	NC_013198	GC	4	8	72288	72295	0 %	0 %	50 %	50 %	258507060
75	NC_013198	TG	3	6	72415	72420	0 %	50 %	50 %	0 %	258507060
76	NC_013198	AT	3	6	73224	73229	50 %	50 %	0 %	0 %	258507060
77	NC_013198	AC	4	8	73796	73803	50 %	0 %	0 %	50 %	258507061
78	NC_013198	CG	3	6	74846	74851	0 %	0 %	50 %	50 %	258507063
79	NC_013198	GT	3	6	75274	75279	0 %	50 %	50 %	0 %	258507063
80	NC_013198	CG	3	6	77013	77018	0 %	0 %	50 %	50 %	258507063
81	NC_013198	CG	3	6	77668	77673	0 %	0 %	50 %	50 %	258507063
82	NC_013198	CG	3	6	77840	77845	0 %	0 %	50 %	50 %	258507063
83	NC_013198	AT	3	6	78726	78731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013198	GT	3	6	79012	79017	0 %	50 %	50 %	0 %	258507065
85	NC_013198	GC	3	6	80250	80255	0 %	0 %	50 %	50 %	258507066
86	NC_013198	GC	3	6	80323	80328	0 %	0 %	50 %	50 %	258507066
87	NC_013198	AT	3	6	82134	82139	50 %	50 %	0 %	0 %	258507068
88	NC_013198	GC	3	6	84673	84678	0 %	0 %	50 %	50 %	258507072
89	NC_013198	GC	3	6	86083	86088	0 %	0 %	50 %	50 %	258507073
90	NC_013198	TG	3	6	86260	86265	0 %	50 %	50 %	0 %	258507073
91	NC_013198	AC	3	6	87495	87500	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_013198	TA	3	6	87886	87891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013198	CG	3	6	89623	89628	0 %	0 %	50 %	50 %	258507077
94	NC_013198	AC	4	8	90011	90018	50 %	0 %	0 %	50 %	258507077
95	NC_013198	GA	3	6	91194	91199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013198	CA	3	6	93143	93148	50 %	0 %	0 %	50 %	258507082
97	NC_013198	AT	3	6	93361	93366	50 %	50 %	0 %	0 %	258507083
98	NC_013198	AT	3	6	93696	93701	50 %	50 %	0 %	0 %	258507084
99	NC_013198	TA	3	6	94048	94053	50 %	50 %	0 %	0 %	258507084
100	NC_013198	GC	3	6	97796	97801	0 %	0 %	50 %	50 %	258507088
101	NC_013198	AC	3	6	102171	102176	50 %	0 %	0 %	50 %	258507091
102	NC_013198	TC	3	6	102279	102284	0 %	50 %	0 %	50 %	258507091
103	NC_013198	GC	3	6	103715	103720	0 %	0 %	50 %	50 %	258507093
104	NC_013198	CG	3	6	105289	105294	0 %	0 %	50 %	50 %	258507095
105	NC_013198	TG	3	6	105296	105301	0 %	50 %	50 %	0 %	258507095
106	NC_013198	GC	3	6	106734	106739	0 %	0 %	50 %	50 %	258507097
107	NC_013198	CT	3	6	108067	108072	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_013198	GC	3	6	108075	108080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_013198	CG	3	6	108359	108364	0 %	0 %	50 %	50 %	258507099
110	NC_013198	CA	3	6	109542	109547	50 %	0 %	0 %	50 %	258507099
111	NC_013198	GT	3	6	109927	109932	0 %	50 %	50 %	0 %	258507099
112	NC_013198	TG	3	6	110132	110137	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013198	GC	3	6	110265	110270	0 %	0 %	50 %	50 %	258507100
114	NC_013198	CA	3	6	114179	114184	50 %	0 %	0 %	50 %	258507103
115	NC_013198	GC	3	6	115069	115074	0 %	0 %	50 %	50 %	258507104
116	NC_013198	GC	3	6	116091	116096	0 %	0 %	50 %	50 %	258507105
117	NC_013198	GT	3	6	117369	117374	0 %	50 %	50 %	0 %	258507106
118	NC_013198	TG	3	6	117744	117749	0 %	50 %	50 %	0 %	258507107
119	NC_013198	GT	3	6	118379	118384	0 %	50 %	50 %	0 %	258507107
120	NC_013198	CG	3	6	118925	118930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_013198	TG	3	6	121642	121647	0 %	50 %	50 %	0 %	258507109
122	NC_013198	GC	3	6	123852	123857	0 %	0 %	50 %	50 %	258507111
123	NC_013198	TC	3	6	124569	124574	0 %	50 %	0 %	50 %	258507112
124	NC_013198	AT	3	6	124591	124596	50 %	50 %	0 %	0 %	258507112
125	NC_013198	GC	3	6	125877	125882	0 %	0 %	50 %	50 %	258507114
126	NC_013198	AT	3	6	126496	126501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013198	AT	3	6	127599	127604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013198	GC	3	6	128931	128936	0 %	0 %	50 %	50 %	258507116
129	NC_013198	AT	3	6	130759	130764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013198	CA	3	6	134351	134356	50 %	0 %	0 %	50 %	258507120
131	NC_013198	GT	3	6	137273	137278	0 %	50 %	50 %	0 %	258507122
132	NC_013198	AG	3	6	143665	143670	50 %	0 %	50 %	0 %	258507126
133	NC_013198	CA	4	8	143918	143925	50 %	0 %	0 %	50 %	258507127
134	NC_013198	CA	3	6	144148	144153	50 %	0 %	0 %	50 %	258507127
135	NC_013198	CA	3	6	145190	145195	50 %	0 %	0 %	50 %	258507128
136	NC_013198	GC	3	6	148022	148027	0 %	0 %	50 %	50 %	258507130
137	NC_013198	TC	3	6	148430	148435	0 %	50 %	0 %	50 %	258507130
138	NC_013198	GC	3	6	150705	150710	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_013198	TA	3	6	150925	150930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013198	CG	3	6	151167	151172	0 %	0 %	50 %	50 %	258507133
141	NC_013198	GC	3	6	151346	151351	0 %	0 %	50 %	50 %	258507133
142	NC_013198	GC	3	6	153844	153849	0 %	0 %	50 %	50 %	258507134
143	NC_013198	TA	3	6	154232	154237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013198	TA	3	6	154336	154341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013198	TA	3	6	154569	154574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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