MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Candidatus Accumulibacter phosphatis clade IIA str. UW-1 chromosome

Total Repeats: 3814

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013194	CCGCG	2	10	2702	2711	0 %	0 %	40 %	60 %	257091665
2	NC_013194	GTGCT	2	10	3929	3938	0 %	40 %	40 %	20 %	257091666
3	NC_013194	GCCGC	2	10	5473	5482	0 %	0 %	40 %	60 %	257091666
4	NC_013194	CCGCT	2	10	6442	6451	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5	NC_013194	GTTTG	2	10	7000	7009	0 %	60 %	40 %	0 %	257091668
6	NC_013194	CAAGA	2	10	7184	7193	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_013194	CGGCG	2	10	7400	7409	0 %	0 %	60 %	40 %	257091669
8	NC_013194	GCGCC	2	10	8251	8260	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9	NC_013194	GGCGC	2	10	10746	10755	0 %	0 %	60 %	40 %	257091673
10	NC_013194	GCGTC	2	10	14784	14793	0 %	20 %	40 %	40 %	257091677
11	NC_013194	TGCGA	2	10	16761	16770	20 %	20 %	40 %	20 %	257091678
12	NC_013194	GAATC	2	10	17237	17246	40 %	20 %	20 %	20 %	257091678
13	NC_013194	GGTCA	2	10	17930	17939	20 %	20 %	40 %	20 %	257091679
14	NC_013194	GATCT	2	10	18602	18611	20 %	40 %	20 %	20 %	257091679
15	NC_013194	CGACT	2	10	18692	18701	20 %	20 %	20 %	40 %	257091679
16	NC_013194	GCACG	2	10	20505	20514	20 %	0 %	40 %	40 %	257091680
17	NC_013194	ATGGC	2	10	22163	22172	20 %	20 %	40 %	20 %	257091680
18	NC_013194	CGGCG	2	10	22191	22200	0 %	0 %	60 %	40 %	257091680
19	NC_013194	GCATG	2	10	22401	22410	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_013194	CGGCG	2	10	23844	23853	0 %	0 %	60 %	40 %	257091681
21	NC_013194	GTAGC	2	10	24729	24738	20 %	20 %	40 %	20 %	257091681
22	NC_013194	TCGCA	2	10	24903	24912	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_013194	CGGGG	2	10	25377	25386	0 %	0 %	80 %	20 %	257091683
24	NC_013194	TGCGC	2	10	26076	26085	0 %	20 %	40 %	40 %	257091684
25	NC_013194	GATGG	2	10	26573	26582	20 %	20 %	60 %	0 %	257091685
26	NC_013194	CACAA	2	10	28458	28467	60 %	0 %	0 %	40 %	257091689
27	NC_013194	GACGG	2	10	31036	31045	20 %	0 %	60 %	20 %	257091691
28	NC_013194	CGGGT	2	10	32023	32032	0 %	20 %	60 %	20 %	257091691
29	NC_013194	TCGAA	2	10	32810	32819	40 %	20 %	20 %	20 %	257091692
30	NC_013194	GCCGC	2	10	33518	33527	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
31	NC_013194	GGAGT	2	10	35696	35705	20 %	20 %	60 %	0 %	257091694
32	NC_013194	CTGGC	2	10	36118	36127	0 %	20 %	40 %	40 %	257091694
33	NC_013194	TATGC	2	10	37244	37253	20 %	40 %	20 %	20 %	257091694
34	NC_013194	CGCGA	2	10	38451	38460	20 %	0 %	40 %	40 %	257091694
35	NC_013194	CACGC	2	10	40722	40731	20 %	0 %	20 %	60 %	257091697
36	NC_013194	AGCGG	2	10	42031	42040	20 %	0 %	60 %	20 %	257091699
37	NC_013194	TTCGC	2	10	44521	44530	0 %	40 %	20 %	40 %	257091700
38	NC_013194	TTGAA	2	10	44873	44882	40 %	40 %	20 %	0 %	257091700
39	NC_013194	CTGCG	2	10	46134	46143	0 %	20 %	40 %	40 %	257091702
40	NC_013194	GTGGC	2	10	46498	46507	0 %	20 %	60 %	20 %	257091702
41	NC_013194	TGTGG	2	10	46740	46749	0 %	40 %	60 %	0 %	257091702
42	NC_013194	CGGGT	2	10	46826	46835	0 %	20 %	60 %	20 %	257091702
43	NC_013194	TTGCG	2	10	47043	47052	0 %	40 %	40 %	20 %	257091702
44	NC_013194	GCCAC	2	10	47634	47643	20 %	0 %	20 %	60 %	257091703
45	NC_013194	GATGC	2	10	47920	47929	20 %	20 %	40 %	20 %	257091703
46	NC_013194	TGGCG	2	10	49158	49167	0 %	20 %	60 %	20 %	257091705
47	NC_013194	CCAGG	2	10	51585	51594	20 %	0 %	40 %	40 %	257091707
48	NC_013194	CGAAG	2	10	51629	51638	40 %	0 %	40 %	20 %	257091707
49	NC_013194	GCGAG	2	10	52194	52203	20 %	0 %	60 %	20 %	257091708
50	NC_013194	CGGGC	2	10	52825	52834	0 %	0 %	60 %	40 %	257091709
51	NC_013194	GCGCC	2	10	53220	53229	0 %	0 %	40 %	60 %	257091709
52	NC_013194	GCGCC	2	10	53516	53525	0 %	0 %	40 %	60 %	257091709
53	NC_013194	GGCCA	2	10	55870	55879	20 %	0 %	40 %	40 %	257091711
54	NC_013194	GCACG	2	10	57014	57023	20 %	0 %	40 %	40 %	257091712
55	NC_013194	GACCA	2	10	58288	58297	40 %	0 %	20 %	40 %	257091713
56	NC_013194	TCGCG	2	10	58797	58806	0 %	20 %	40 %	40 %	257091713
57	NC_013194	ACGCG	2	10	59669	59678	20 %	0 %	40 %	40 %	257091714
58	NC_013194	GCGCT	2	10	60409	60418	0 %	20 %	40 %	40 %	257091714
59	NC_013194	TGTCG	2	10	60432	60441	0 %	40 %	40 %	20 %	257091714
60	NC_013194	CTTCG	2	10	64334	64343	0 %	40 %	20 %	40 %	257091716
61	NC_013194	CCCTG	2	10	66000	66009	0 %	20 %	20 %	60 %	257091720
62	NC_013194	CGATG	2	10	66090	66099	20 %	20 %	40 %	20 %	257091720
63	NC_013194	CGGCG	2	10	76950	76959	0 %	0 %	60 %	40 %	257091728
64	NC_013194	ATCGG	2	10	77220	77229	20 %	20 %	40 %	20 %	257091728
65	NC_013194	CTTGA	2	10	77547	77556	20 %	40 %	20 %	20 %	257091728
66	NC_013194	GCCAA	2	10	78045	78054	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_013194	CGGAC	2	10	79627	79636	20 %	0 %	40 %	40 %	257091729
68	NC_013194	CTTGG	2	10	82656	82665	0 %	40 %	40 %	20 %	257091732
69	NC_013194	TGTGC	2	10	83078	83087	0 %	40 %	40 %	20 %	257091732
70	NC_013194	TACTT	2	10	83208	83217	20 %	60 %	0 %	20 %	257091732
71	NC_013194	CGCGG	2	10	88249	88258	0 %	0 %	60 %	40 %	257091735
72	NC_013194	TTGCC	2	10	90194	90203	0 %	40 %	20 %	40 %	257091735
73	NC_013194	GTGGC	2	10	91091	91100	0 %	20 %	60 %	20 %	257091735
74	NC_013194	GTGAT	2	10	91986	91995	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013194	CCGGG	2	10	92065	92074	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
76	NC_013194	GTCGG	2	10	94439	94448	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
77	NC_013194	TGCGT	2	10	96022	96031	0 %	40 %	40 %	20 %	257091739
78	NC_013194	GCTGG	2	10	96307	96316	0 %	20 %	60 %	20 %	257091740
79	NC_013194	TTTTG	2	10	96941	96950	0 %	80 %	20 %	0 %	257091740
80	NC_013194	CGAAG	2	10	97397	97406	40 %	0 %	40 %	20 %	257091740
81	NC_013194	CGAGA	2	10	98486	98495	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_013194	CAAAA	2	10	99070	99079	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_013194	CGGCC	2	10	99259	99268	0 %	0 %	40 %	60 %	257091741
84	NC_013194	TGGGC	2	10	99691	99700	0 %	20 %	60 %	20 %	257091741
85	NC_013194	GCAGC	2	10	100161	100170	20 %	0 %	40 %	40 %	257091742
86	NC_013194	GTGGC	2	10	100480	100489	0 %	20 %	60 %	20 %	257091742
87	NC_013194	CGCGC	2	10	101411	101420	0 %	0 %	40 %	60 %	257091743
88	NC_013194	GCGCC	2	10	102480	102489	0 %	0 %	40 %	60 %	257091745
89	NC_013194	CCGAA	2	10	105295	105304	40 %	0 %	20 %	40 %	257091747
90	NC_013194	CGGGG	2	10	105356	105365	0 %	0 %	80 %	20 %	257091747
91	NC_013194	CCGCC	2	10	105532	105541	0 %	0 %	20 %	80 %	257091747
92	NC_013194	CCGGG	2	10	106623	106632	0 %	0 %	60 %	40 %	257091748
93	NC_013194	TTGCC	2	10	109920	109929	0 %	40 %	20 %	40 %	257091749
94	NC_013194	GGAAT	2	10	112122	112131	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013194	AAACC	2	10	113583	113592	60 %	0 %	0 %	40 %	257091750
96	NC_013194	CGATG	2	10	113856	113865	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_013194	TGGGC	2	10	118322	118331	0 %	20 %	60 %	20 %	257091752
98	NC_013194	GCCTC	2	10	120142	120151	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
99	NC_013194	GGTTT	2	10	120441	120450	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013194	GTCGA	2	10	120802	120811	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_013194	GTTGG	2	10	121732	121741	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013194	CAGCG	2	10	122493	122502	20 %	0 %	40 %	40 %	257091753
103	NC_013194	TGGGC	2	10	123510	123519	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
104	NC_013194	GGTTT	2	10	123613	123622	0 %	60 %	40 %	0 %	257091754
105	NC_013194	GCTGG	2	10	124937	124946	0 %	20 %	60 %	20 %	257091755
106	NC_013194	GCATT	2	10	127933	127942	20 %	40 %	20 %	20 %	257091757
107	NC_013194	AAGGA	2	10	128139	128148	60 %	0 %	40 %	0 %	257091757
108	NC_013194	CGACA	2	10	128465	128474	40 %	0 %	20 %	40 %	257091757
109	NC_013194	ATGCC	2	10	132541	132550	20 %	20 %	20 %	40 %	257091761
110	NC_013194	GCTGG	2	10	132669	132678	0 %	20 %	60 %	20 %	257091761
111	NC_013194	GGGCT	2	10	136883	136892	0 %	20 %	60 %	20 %	257091765
112	NC_013194	ACAGC	2	10	137110	137119	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_013194	TGGCG	2	10	140582	140591	0 %	20 %	60 %	20 %	257091769
114	NC_013194	GAAGA	2	10	141285	141294	60 %	0 %	40 %	0 %	257091769
115	NC_013194	GGCTT	2	10	142075	142084	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_013194	CTGCG	2	10	142133	142142	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
117	NC_013194	GCGCG	2	10	143297	143306	0 %	0 %	60 %	40 %	257091770
118	NC_013194	TGGCC	2	10	143531	143540	0 %	20 %	40 %	40 %	257091770
119	NC_013194	GCGCC	2	10	145052	145061	0 %	0 %	40 %	60 %	257091773
120	NC_013194	TGCTC	2	10	147104	147113	0 %	40 %	20 %	40 %	257091774
121	NC_013194	GCGCA	2	10	147631	147640	20 %	0 %	40 %	40 %	257091774
122	NC_013194	CCTTC	2	10	149187	149196	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
123	NC_013194	GGCCT	2	10	151657	151666	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
124	NC_013194	CACGG	2	10	153210	153219	20 %	0 %	40 %	40 %	257091778
125	NC_013194	CGCGG	2	10	154918	154927	0 %	0 %	60 %	40 %	257091780
126	NC_013194	CAACG	2	10	156372	156381	40 %	0 %	20 %	40 %	257091780
127	NC_013194	CGCTG	2	10	156914	156923	0 %	20 %	40 %	40 %	257091780
128	NC_013194	GCTCG	2	10	158288	158297	0 %	20 %	40 %	40 %	257091783
129	NC_013194	CGGCT	2	10	158306	158315	0 %	20 %	40 %	40 %	257091783
130	NC_013194	CGCGC	2	10	159049	159058	0 %	0 %	40 %	60 %	257091784
131	NC_013194	GCATC	2	10	159537	159546	20 %	20 %	20 %	40 %	257091784
132	NC_013194	CGTGC	2	10	160383	160392	0 %	20 %	40 %	40 %	257091785
133	NC_013194	GTGAC	2	10	161817	161826	20 %	20 %	40 %	20 %	257091786
134	NC_013194	CCAGT	2	10	163394	163403	20 %	20 %	20 %	40 %	257091786
135	NC_013194	AAGCG	2	10	168689	168698	40 %	0 %	40 %	20 %	257091789
136	NC_013194	GCGAC	2	10	172034	172043	20 %	0 %	40 %	40 %	257091791
137	NC_013194	GTACG	2	10	176012	176021	20 %	20 %	40 %	20 %	257091795
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139	NC_013194	CGCGC	2	10	179290	179299	0 %	0 %	40 %	60 %	257091797
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197	NC_013194	TGACC	2	10	263738	263747	20 %	20 %	20 %	40 %	257091861
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249	NC_013194	TGCGC	2	10	339550	339559	0 %	20 %	40 %	40 %	257091922
250	NC_013194	GGCGT	2	10	340449	340458	0 %	20 %	60 %	20 %	257091923
251	NC_013194	GCGAA	2	10	340600	340609	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
252	NC_013194	CACGC	2	10	340775	340784	20 %	0 %	20 %	60 %	257091924
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254	NC_013194	ATCGC	2	10	342567	342576	20 %	20 %	20 %	40 %	257091926
255	NC_013194	GCCAC	2	10	343901	343910	20 %	0 %	20 %	60 %	257091928
256	NC_013194	GCACC	2	10	344640	344649	20 %	0 %	20 %	60 %	257091928
257	NC_013194	ACCTG	2	10	346367	346376	20 %	20 %	20 %	40 %	257091930
258	NC_013194	ACCGC	2	10	346481	346490	20 %	0 %	20 %	60 %	257091930
259	NC_013194	GCCGC	2	10	349363	349372	0 %	0 %	40 %	60 %	257091933
260	NC_013194	GGGCG	2	10	350980	350989	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
261	NC_013194	GCACA	2	10	351279	351288	40 %	0 %	20 %	40 %	257091936
262	NC_013194	GCCCG	2	10	351735	351744	0 %	0 %	40 %	60 %	257091937
263	NC_013194	GGCGC	2	10	352181	352190	0 %	0 %	60 %	40 %	257091937
264	NC_013194	GGCCT	2	10	354775	354784	0 %	20 %	40 %	40 %	257091939
265	NC_013194	CGATG	2	10	355507	355516	20 %	20 %	40 %	20 %	257091940
266	NC_013194	TCGCG	2	10	357107	357116	0 %	20 %	40 %	40 %	257091941
267	NC_013194	AGCGA	2	10	357394	357403	40 %	0 %	40 %	20 %	257091941
268	NC_013194	TGGTC	2	10	360239	360248	0 %	40 %	40 %	20 %	257091944
269	NC_013194	TTCAT	2	10	361111	361120	20 %	60 %	0 %	20 %	257091944
270	NC_013194	GCGTC	2	10	365189	365198	0 %	20 %	40 %	40 %	257091946
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276	NC_013194	CAGGG	2	10	372152	372161	20 %	0 %	60 %	20 %	257091953
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280	NC_013194	GCCGA	2	10	377942	377951	20 %	0 %	40 %	40 %	257091961
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283	NC_013194	TGCCG	2	10	380252	380261	0 %	20 %	40 %	40 %	257091964
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297	NC_013194	CGCGA	2	10	404192	404201	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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392	NC_013194	TCGAA	2	10	553321	553330	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
393	NC_013194	CGACG	2	10	555025	555034	20 %	0 %	40 %	40 %	257092103
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395	NC_013194	TCGCT	2	10	559697	559706	0 %	40 %	20 %	40 %	257092108
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399	NC_013194	TGATC	2	10	564187	564196	20 %	40 %	20 %	20 %	257092110
400	NC_013194	GACCT	2	10	565608	565617	20 %	20 %	20 %	40 %	257092112
401	NC_013194	GGCTG	2	10	566137	566146	0 %	20 %	60 %	20 %	257092113
402	NC_013194	TCGGG	2	10	568167	568176	0 %	20 %	60 %	20 %	257092115
403	NC_013194	CGCGG	2	10	569238	569247	0 %	0 %	60 %	40 %	257092116
404	NC_013194	GCATG	2	10	570086	570095	20 %	20 %	40 %	20 %	257092116
405	NC_013194	GACCG	2	10	572118	572127	20 %	0 %	40 %	40 %	257092118
406	NC_013194	CCGAC	2	10	572231	572240	20 %	0 %	20 %	60 %	257092118
407	NC_013194	ATGCG	2	10	572426	572435	20 %	20 %	40 %	20 %	257092118
408	NC_013194	CTGGT	2	10	576226	576235	0 %	40 %	40 %	20 %	257092121
409	NC_013194	CACGC	2	10	578996	579005	20 %	0 %	20 %	60 %	257092122
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412	NC_013194	GCGCA	2	10	583816	583825	20 %	0 %	40 %	40 %	257092125
413	NC_013194	GCTGC	2	10	583999	584008	0 %	20 %	40 %	40 %	257092125
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456	NC_013194	TCGGC	2	10	641764	641773	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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499	NC_013194	CGGAT	2	10	701089	701098	20 %	20 %	40 %	20 %	257092221
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