MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Candidatus Accumulibacter phosphatis clade IIA str. UW-1 chromosome

Total Repeats: 90160

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013194	TGC	2	6	6	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013194	CCG	2	6	28	33	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_013194	CAA	2	6	64	69	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013194	GTC	2	6	135	140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013194	TAA	2	6	167	172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013194	TGA	2	6	237	242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257091664
7	NC_013194	CAG	2	6	293	298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091664
8	NC_013194	GAG	2	6	335	340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257091664
9	NC_013194	CTG	2	6	362	367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091664
10	NC_013194	CGC	2	6	484	489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257091664
11	NC_013194	CGG	2	6	552	557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091664
12	NC_013194	GAA	2	6	595	600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257091664
13	NC_013194	TGG	2	6	609	614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257091664
14	NC_013194	CGC	2	6	706	711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257091664
15	NC_013194	GTT	2	6	757	762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257091664
16	NC_013194	ACT	3	9	870	878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257091664
17	NC_013194	CAG	2	6	899	904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091664
18	NC_013194	CTA	2	6	928	933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257091664
19	NC_013194	CTC	2	6	953	958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257091664
20	NC_013194	TTC	2	6	971	976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257091664
21	NC_013194	AAC	2	6	1041	1046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257091664
22	NC_013194	GAA	2	6	1072	1077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257091664
23	NC_013194	AAG	3	9	1175	1183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257091664
24	NC_013194	CGA	3	9	1207	1215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091664
25	NC_013194	AAG	2	6	1277	1282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257091664
26	NC_013194	ACA	2	6	1386	1391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257091664
27	NC_013194	AGA	2	6	1395	1400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257091664
28	NC_013194	AAG	2	6	1445	1450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257091664
29	NC_013194	ACC	2	6	1559	1564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257091664
30	NC_013194	TGC	2	6	1566	1571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091664
31	NC_013194	CGA	2	6	1588	1593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091664
32	NC_013194	ACG	2	6	1623	1628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091664
33	NC_013194	TGG	2	6	1698	1703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013194	CTT	2	6	1872	1877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257091665
35	NC_013194	CTG	2	6	1899	1904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091665
36	NC_013194	TCG	2	6	1930	1935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091665
37	NC_013194	TGC	2	6	1969	1974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091665
38	NC_013194	CGA	2	6	2147	2152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091665
39	NC_013194	GAC	2	6	2211	2216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091665
40	NC_013194	AAG	2	6	2250	2255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257091665
41	NC_013194	CTA	2	6	2330	2335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257091665
42	NC_013194	TGT	2	6	2660	2665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257091665
43	NC_013194	CTG	2	6	2682	2687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091665
44	NC_013194	GAT	2	6	2696	2701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257091665
45	NC_013194	GGC	2	6	2777	2782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091665
46	NC_013194	GAA	2	6	2796	2801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257091665
47	NC_013194	AGG	2	6	2806	2811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257091665
48	NC_013194	CTG	2	6	2868	2873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091665
49	NC_013194	AAC	2	6	2883	2888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257091665
50	NC_013194	GAC	2	6	2895	2900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091665
51	NC_013194	ACG	2	6	2920	2925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091665
52	NC_013194	CTG	2	6	2940	2945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091665
53	NC_013194	ACG	2	6	3090	3095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091666
54	NC_013194	CAC	2	6	3185	3190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257091666
55	NC_013194	GTC	2	6	3203	3208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091666
56	NC_013194	CGA	2	6	3220	3225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091666
57	NC_013194	TCA	2	6	3255	3260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257091666
58	NC_013194	CGA	2	6	3328	3333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091666
59	NC_013194	GCC	2	6	3356	3361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257091666
60	NC_013194	TGC	2	6	3378	3383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091666
61	NC_013194	CGG	2	6	3388	3393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091666
62	NC_013194	GGT	2	6	3425	3430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257091666
63	NC_013194	GGT	2	6	3471	3476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257091666
64	NC_013194	CGC	2	6	3491	3496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257091666
65	NC_013194	AAG	2	6	3503	3508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257091666
66	NC_013194	CGT	2	6	3535	3540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091666
67	NC_013194	CGC	2	6	3579	3584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257091666
68	NC_013194	GTC	2	6	3590	3595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091666
69	NC_013194	GCA	2	6	3596	3601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091666
70	NC_013194	CGA	2	6	3637	3642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091666
71	NC_013194	ATC	2	6	3677	3682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257091666
72	NC_013194	AGG	3	9	3756	3764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257091666
73	NC_013194	TTC	2	6	3825	3830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257091666
74	NC_013194	GCG	2	6	3852	3857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091666
75	NC_013194	CGG	2	6	3861	3866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091666
76	NC_013194	AAC	2	6	3944	3949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257091666
77	NC_013194	GAA	2	6	4025	4030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257091666
78	NC_013194	AAG	2	6	4043	4048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257091666
79	NC_013194	TGA	2	6	4069	4074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257091666
80	NC_013194	TCG	2	6	4157	4162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091666
81	NC_013194	CGG	2	6	4173	4178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091666
82	NC_013194	GTC	2	6	4187	4192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091666
83	NC_013194	GCG	2	6	4193	4198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091666
84	NC_013194	ATC	2	6	4256	4261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257091666
85	NC_013194	GCG	2	6	4265	4270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091666
86	NC_013194	CGG	2	6	4413	4418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091666
87	NC_013194	ACC	2	6	4602	4607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257091666
88	NC_013194	ATC	2	6	4613	4618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257091666
89	NC_013194	CTG	3	9	4658	4666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091666
90	NC_013194	TCT	2	6	4671	4676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257091666
91	NC_013194	AAC	2	6	4875	4880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257091666
92	NC_013194	CCT	2	6	4894	4899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257091666
93	NC_013194	TGA	2	6	5025	5030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257091666
94	NC_013194	GCA	2	6	5040	5045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091666
95	NC_013194	TGA	2	6	5146	5151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257091666
96	NC_013194	TCT	2	6	5155	5160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257091666
97	NC_013194	GCG	2	6	5166	5171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091666
98	NC_013194	CGG	2	6	5193	5198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091666
99	NC_013194	GTC	2	6	5231	5236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091666
100	NC_013194	GAA	2	6	5248	5253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257091666
101	NC_013194	CAG	2	6	5263	5268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091666
102	NC_013194	GCG	2	6	5392	5397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091666
103	NC_013194	TCT	2	6	5398	5403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257091666
104	NC_013194	CGA	2	6	5434	5439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091666
105	NC_013194	GCC	2	6	5507	5512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257091666
106	NC_013194	GAA	2	6	5649	5654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257091667
107	NC_013194	ATC	2	6	5658	5663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257091667
108	NC_013194	CGG	2	6	5674	5679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091667
109	NC_013194	AGC	2	6	5742	5747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091667
110	NC_013194	GCC	2	6	5909	5914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257091667
111	NC_013194	GAT	2	6	5939	5944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257091667
112	NC_013194	TGC	2	6	6061	6066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091667
113	NC_013194	CAC	2	6	6073	6078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257091667
114	NC_013194	TGG	2	6	6117	6122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257091667
115	NC_013194	GCG	2	6	6165	6170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091667
116	NC_013194	AGC	2	6	6193	6198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091667
117	NC_013194	CGA	2	6	6220	6225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091667
118	NC_013194	TGC	2	6	6261	6266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091667
119	NC_013194	AAG	2	6	6311	6316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257091667
120	NC_013194	GGC	2	6	6335	6340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091667
121	NC_013194	AGA	2	6	6375	6380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013194	GCA	2	6	6392	6397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_013194	ATG	2	6	6436	6441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013194	CTG	2	6	6455	6460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_013194	GGC	2	6	6486	6491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_013194	GCC	2	6	6503	6508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_013194	TGC	2	6	6642	6647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091668
128	NC_013194	GTT	2	6	6670	6675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257091668
129	NC_013194	GCG	2	6	6740	6745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091668
130	NC_013194	CGG	2	6	6863	6868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091668
131	NC_013194	TCG	2	6	6921	6926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091668
132	NC_013194	GCG	2	6	6942	6947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091668
133	NC_013194	GTG	2	6	6977	6982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257091668
134	NC_013194	CGA	2	6	7242	7247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_013194	TGT	2	6	7251	7256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013194	TGA	2	6	7284	7289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013194	CGC	2	6	7317	7322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_013194	GAT	2	6	7512	7517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257091669
139	NC_013194	GCG	2	6	7541	7546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091669
140	NC_013194	AGT	2	6	7649	7654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257091669
141	NC_013194	TCG	2	6	7801	7806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091669
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149	NC_013194	GCC	2	6	8286	8291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_013194	TGC	2	6	8382	8387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091670
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153	NC_013194	CTG	2	6	8594	8599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091670
154	NC_013194	CTG	2	6	8645	8650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091670
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253	NC_013194	CAT	2	6	13498	13503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257091676
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381	NC_013194	ATC	2	6	19353	19358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257091679
382	NC_013194	CGC	2	6	19366	19371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257091679
383	NC_013194	TCA	2	6	19387	19392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257091679
384	NC_013194	CAC	2	6	19433	19438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257091679
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390	NC_013194	CGC	2	6	19772	19777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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441	NC_013194	CGA	2	6	22571	22576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
442	NC_013194	ACG	2	6	22705	22710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
443	NC_013194	TCG	3	9	22747	22755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
444	NC_013194	TTC	2	6	22767	22772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
445	NC_013194	CGT	2	6	22790	22795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
446	NC_013194	ACT	2	6	22892	22897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
447	NC_013194	CAA	2	6	23063	23068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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455	NC_013194	CGG	2	6	24197	24202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091681
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462	NC_013194	CGT	2	6	24985	24990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091682
463	NC_013194	ATC	2	6	24992	24997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257091682
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470	NC_013194	GAG	2	6	25271	25276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
471	NC_013194	GCA	2	6	25297	25302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091683
472	NC_013194	GTG	2	6	25462	25467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257091683
473	NC_013194	ATC	2	6	25468	25473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257091683
474	NC_013194	ACG	2	6	25475	25480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091683
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476	NC_013194	GGA	2	6	25644	25649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
477	NC_013194	GTG	2	6	25681	25686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257091684
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480	NC_013194	TCT	2	6	25769	25774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257091684
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487	NC_013194	ATC	2	6	26155	26160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257091684
488	NC_013194	CGG	2	6	26185	26190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091684
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491	NC_013194	GCC	2	6	26446	26451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257091684
492	NC_013194	AGA	2	6	26632	26637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257091685
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497	NC_013194	CGC	2	6	26892	26897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257091686
498	NC_013194	TCT	2	6	26900	26905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257091686
499	NC_013194	CGA	2	6	26909	26914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091686
500	NC_013194	TAA	2	6	26967	26972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257091686

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