MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Candidatus Accumulibacter phosphatis clade IIA str. UW-1 plasmid pAph01

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013193	GCCGAC	2	12	1487	1498	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	257091508
2	NC_013193	GCGGAC	2	12	4139	4150	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	257091511
3	NC_013193	AGCGCT	2	12	5311	5322	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257091511
4	NC_013193	TGGCCG	2	12	7651	7662	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	257091512
5	NC_013193	CATGCC	2	12	8460	8471	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	257091513
6	NC_013193	CCAAAT	2	12	11843	11854	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	257091518
7	NC_013193	TGGTCG	2	12	22208	22219	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	257091528
8	NC_013193	CGGCCC	2	12	22371	22382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257091529
9	NC_013193	CCCTTG	2	12	24473	24484	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	257091529
10	NC_013193	TCTCTG	2	12	26808	26819	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	257091530
11	NC_013193	TCGCTG	2	12	27696	27707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091532
12	NC_013193	GCGAGT	2	12	28590	28601	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	257091532
13	NC_013193	TGAGAT	2	12	28945	28956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257091532
14	NC_013193	GGCCGG	2	12	29615	29626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091532
15	NC_013193	CCGCGA	2	12	31094	31105	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	257091533
16	NC_013193	AGCTCA	2	12	32101	32112	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	257091533
17	NC_013193	GCCAAC	2	12	32133	32144	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	257091533
18	NC_013193	CCTCGA	2	12	32341	32352	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	257091534
19	NC_013193	GCCATC	2	12	32489	32500	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	257091534
20	NC_013193	CTGGCG	2	12	32813	32824	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	257091534
21	NC_013193	GTCCTC	2	12	33086	33097	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	257091534
22	NC_013193	TGGACG	2	12	33473	33484	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	257091534
23	NC_013193	CTGGCG	2	12	34572	34583	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	257091535
24	NC_013193	CGCTCG	2	12	39252	39263	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	257091538
25	NC_013193	TCGACA	2	12	40273	40284	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	257091540
26	NC_013193	TCTGGA	2	12	51036	51047	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	257091552
27	NC_013193	TTGATG	2	12	59610	59621	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	257091560
28	NC_013193	TCTCGC	2	12	60194	60205	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	257091560
29	NC_013193	ACCATC	2	12	72275	72286	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	257091570
30	NC_013193	CAGGAT	2	12	72451	72462	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257091570
31	NC_013193	CGTCGG	2	12	74136	74147	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	257091573
32	NC_013193	ACCTGC	2	12	74751	74762	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	257091574
33	NC_013193	CATGGC	2	12	75808	75819	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257091574
34	NC_013193	CCAGCC	2	12	76334	76345	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	257091574
35	NC_013193	GTCACC	2	12	76589	76600	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	257091574
36	NC_013193	TCCACG	2	12	78500	78511	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	257091575
37	NC_013193	GCCAGG	2	12	78747	78758	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	257091576
38	NC_013193	CACAGC	2	12	88276	88287	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	257091584
39	NC_013193	CCAAAT	2	12	89491	89502	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013193	GGCCGG	2	12	90297	90308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_013193	ACGGCG	2	12	90770	90781	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	257091585
42	NC_013193	GTCGCG	2	12	91057	91068	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	257091585
43	NC_013193	CATGGT	2	12	93733	93744	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	257091586
44	NC_013193	CCTTGG	2	12	94314	94325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091586
45	NC_013193	TGATCT	2	12	94893	94904	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	257091586
46	NC_013193	TCGGCC	2	12	96289	96300	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	257091587
47	NC_013193	CGAGCG	2	12	100418	100429	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	257091593
48	NC_013193	CCCGAT	2	12	100830	100841	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	257091594
49	NC_013193	TTGCTC	2	12	101994	102005	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013193	CACAGC	2	12	103929	103940	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	257091599
51	NC_013193	TTCGAC	2	12	107929	107940	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013193	GCAGCG	2	12	109027	109038	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	257091603
53	NC_013193	CGTCAC	2	12	114460	114471	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	257091608
54	NC_013193	GATGGC	2	12	114742	114753	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	257091608
55	NC_013193	GCCGCT	2	12	116854	116865	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	257091609
56	NC_013193	AGTTCG	2	12	117274	117285	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	257091610
57	NC_013193	ACGCGC	2	12	117771	117782	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	257091611
58	NC_013193	GCGCTC	2	12	117806	117817	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	257091611
59	NC_013193	CCCATA	2	12	121753	121764	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	257091618
60	NC_013193	GAAGGC	2	12	128743	128754	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	257091625
61	NC_013193	CGGTGC	2	12	128865	128876	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	257091625
62	NC_013193	TGCCGA	2	12	130335	130346	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257091625
63	NC_013193	CTCTGC	2	12	130699	130710	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	257091625
64	NC_013193	CGCCTG	2	12	132345	132356	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	257091629
65	NC_013193	GGCAAG	2	12	132417	132428	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_013193	ACACCA	2	12	133071	133082	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_013193	CGATGG	2	12	136124	136135	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	257091633
68	NC_013193	ATTCGA	2	12	137027	137038	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	257091633
69	NC_013193	TGCTTG	2	12	141242	141253	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	257091638
70	NC_013193	AGCCTC	2	12	142810	142821	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	257091639
71	NC_013193	CTCGGC	2	12	143542	143553	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	257091640
72	NC_013193	GAAGTC	2	12	146875	146886	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257091642
73	NC_013193	CACCAT	2	12	151373	151384	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	257091645
74	NC_013193	GCAATT	2	12	152654	152665	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	257091646
75	NC_013193	GCCGCA	2	12	154996	155007	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	257091649
76	NC_013193	GCGTCG	2	12	156076	156087	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	257091651
77	NC_013193	ATGTTC	2	12	156303	156314	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	257091652
78	NC_013193	TGGCCG	2	12	159328	159339	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	257091654
79	NC_013193	GCCACG	2	12	159489	159500	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	257091654
80	NC_013193	GTCAGC	2	12	161894	161905	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257091655
81	NC_013193	AGGACG	2	12	164395	164406	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	257091659
82	NC_013193	TCTTGC	2	12	165366	165377	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	257091660

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.