MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Accumulibacter phosphatis clade IIA str. UW-1 plasmid pAph01

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013193	ACCAG	2	10	460	469	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_013193	CGGGC	2	10	9205	9214	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3	NC_013193	TCCCC	2	10	9468	9477	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
4	NC_013193	AGTCC	2	10	14587	14596	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_013193	TTCCA	2	10	18216	18225	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_013193	GCCCG	2	10	37609	37618	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7	NC_013193	GCCCT	2	10	44398	44407	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
8	NC_013193	GCAAC	2	10	49739	49748	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_013193	CACTG	2	10	62690	62699	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_013193	GCTAC	2	10	82553	82562	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_013193	CGCCA	2	10	82597	82606	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_013193	GGTGA	2	10	83039	83048	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013193	GAACA	2	10	87175	87184	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_013193	CAGTT	2	10	89786	89795	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_013193	AGCCC	2	10	97848	97857	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
16	NC_013193	GTGCC	2	10	105177	105186	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_013193	ATGCA	2	10	107660	107669	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_013193	TTAGC	2	10	125077	125086	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_013193	GTCAT	2	10	125216	125225	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_013193	TGCGA	2	10	158550	158559	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.