MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Accumulibacter phosphatis clade IIA str. UW-1 plasmid pAph01

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013193	TTCC	2	8	13	20	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_013193	GAAA	2	8	50	57	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013193	TTGC	2	8	9102	9109	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_013193	AACA	2	8	9158	9165	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_013193	TTCC	2	8	11226	11233	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013193	GAAA	2	8	11263	11270	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013193	CTTG	2	8	12360	12367	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_013193	GCTC	2	8	13231	13238	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_013193	GACA	2	8	18307	18314	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013193	GGAG	2	8	30971	30978	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013193	GGTG	2	8	37397	37404	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013193	GACT	2	8	38258	38265	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_013193	AGAA	2	8	38370	38377	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013193	AGAT	2	8	41290	41297	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013193	GTTT	2	8	41338	41345	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013193	GATT	2	8	44559	44566	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013193	ACGA	2	8	46526	46533	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_013193	CAAC	2	8	46545	46552	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013193	GACG	2	8	48524	48531	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_013193	AGAA	2	8	49232	49239	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013193	GCTT	2	8	49775	49782	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_013193	GGCC	2	8	52011	52018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013193	GTCG	2	8	53559	53566	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_013193	CAGT	2	8	53699	53706	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_013193	GTCG	2	8	53721	53728	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_013193	CAGG	2	8	58771	58778	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_013193	CGCC	2	8	59246	59253	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
28	NC_013193	CGGC	2	8	62655	62662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_013193	GAAC	2	8	62788	62795	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013193	GGGT	2	8	62820	62827	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013193	CCGA	2	8	63097	63104	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013193	ACCG	2	8	63355	63362	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_013193	GCGA	2	8	63475	63482	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_013193	GCGG	2	8	63486	63493	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35	NC_013193	CGAC	2	8	63569	63576	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_013193	CGGC	2	8	67234	67241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013193	GACG	2	8	68857	68864	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_013193	TTAC	2	8	71699	71706	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_013193	TGCA	2	8	71861	71868	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_013193	CAAG	2	8	73804	73811	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_013193	CAAG	2	8	73973	73980	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_013193	CGTC	2	8	82428	82435	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013193	GGCC	2	8	82439	82446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_013193	GACC	2	8	82545	82552	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_013193	ATCA	2	8	82673	82680	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_013193	GAAC	2	8	82907	82914	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_013193	GGGC	2	8	83157	83164	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
48	NC_013193	CGGG	2	8	83250	83257	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
49	NC_013193	GCCA	2	8	83317	83324	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_013193	ATGG	2	8	86661	86668	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013193	TGCT	2	8	86986	86993	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_013193	AGCG	2	8	87365	87372	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_013193	CGAA	2	8	89530	89537	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_013193	AAGG	2	8	97787	97794	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013193	CGGG	2	8	98434	98441	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
56	NC_013193	TCAG	2	8	107645	107652	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_013193	GCCA	2	8	108473	108480	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_013193	CGGC	2	8	110672	110679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013193	GGCG	3	12	110683	110694	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NC_013193	ATGG	2	8	111712	111719	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013193	AAAT	2	8	119924	119931	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013193	TCAG	2	8	143221	143228	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_013193	CGTT	2	8	143739	143746	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_013193	TGCC	2	8	143965	143972	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_013193	ATCG	2	8	144008	144015	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_013193	TGGC	2	8	144112	144119	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_013193	AATA	2	8	148630	148637	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013193	TCCC	2	8	158465	158472	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
69	NC_013193	GCGG	2	8	158695	158702	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
70	NC_013193	GGCT	2	8	163096	163103	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_013193	AGGG	2	8	164356	164363	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013193	ATCG	2	8	164897	164904	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.