MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Accumulibacter phosphatis clade IIA str. UW-1 plasmid pAph01

Total Repeats: 351

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013193	GCAA	2	8	2094	2101	50 %	0 %	25 %	25 %	257091508
2	NC_013193	CGGC	2	8	2494	2501	0 %	0 %	50 %	50 %	257091509
3	NC_013193	GGGT	2	8	3050	3057	0 %	25 %	75 %	0 %	257091510
4	NC_013193	CCGG	2	8	3963	3970	0 %	0 %	50 %	50 %	257091511
5	NC_013193	TCCT	2	8	4449	4456	0 %	50 %	0 %	50 %	257091511
6	NC_013193	GTCG	2	8	4844	4851	0 %	25 %	50 %	25 %	257091511
7	NC_013193	ACGT	2	8	5408	5415	25 %	25 %	25 %	25 %	257091511
8	NC_013193	TTCG	2	8	6039	6046	0 %	50 %	25 %	25 %	257091511
9	NC_013193	TCGC	2	8	6620	6627	0 %	25 %	25 %	50 %	257091511
10	NC_013193	ATGA	2	8	7099	7106	50 %	25 %	25 %	0 %	257091511
11	NC_013193	GATC	2	8	7643	7650	25 %	25 %	25 %	25 %	257091512
12	NC_013193	CGCT	2	8	8123	8130	0 %	25 %	25 %	50 %	257091512
13	NC_013193	GCGG	2	8	8842	8849	0 %	0 %	75 %	25 %	257091514
14	NC_013193	CGAC	2	8	9014	9021	25 %	0 %	25 %	50 %	257091514
15	NC_013193	GGGA	2	8	9837	9844	25 %	0 %	75 %	0 %	257091515
16	NC_013193	ATGC	2	8	9948	9955	25 %	25 %	25 %	25 %	257091516
17	NC_013193	TGCA	2	8	10213	10220	25 %	25 %	25 %	25 %	257091516
18	NC_013193	CGTC	2	8	10544	10551	0 %	25 %	25 %	50 %	257091516
19	NC_013193	GTTG	2	8	11790	11797	0 %	50 %	50 %	0 %	257091517
20	NC_013193	ACCG	2	8	12930	12937	25 %	0 %	25 %	50 %	257091519
21	NC_013193	GAGC	2	8	13399	13406	25 %	0 %	50 %	25 %	257091520
22	NC_013193	AATG	2	8	13456	13463	50 %	25 %	25 %	0 %	257091520
23	NC_013193	GCGG	2	8	14085	14092	0 %	0 %	75 %	25 %	257091522
24	NC_013193	CTCG	2	8	14878	14885	0 %	25 %	25 %	50 %	257091524
25	NC_013193	AGCG	2	8	15125	15132	25 %	0 %	50 %	25 %	257091524
26	NC_013193	CGGC	2	8	15682	15689	0 %	0 %	50 %	50 %	257091524
27	NC_013193	CGGT	2	8	16742	16749	0 %	25 %	50 %	25 %	257091524
28	NC_013193	GATT	2	8	17475	17482	25 %	50 %	25 %	0 %	257091525
29	NC_013193	GGCG	2	8	17684	17691	0 %	0 %	75 %	25 %	257091525
30	NC_013193	CAAG	2	8	17804	17811	50 %	0 %	25 %	25 %	257091525
31	NC_013193	CGAG	2	8	18403	18410	25 %	0 %	50 %	25 %	257091526
32	NC_013193	CTGG	2	8	19378	19385	0 %	25 %	50 %	25 %	257091528
33	NC_013193	GGCA	2	8	19468	19475	25 %	0 %	50 %	25 %	257091528
34	NC_013193	GGCC	2	8	20184	20191	0 %	0 %	50 %	50 %	257091528
35	NC_013193	CGGC	2	8	20367	20374	0 %	0 %	50 %	50 %	257091528
36	NC_013193	AGCG	2	8	20576	20583	25 %	0 %	50 %	25 %	257091528
37	NC_013193	TCGA	2	8	20639	20646	25 %	25 %	25 %	25 %	257091528
38	NC_013193	GGGC	2	8	20899	20906	0 %	0 %	75 %	25 %	257091528
39	NC_013193	GTTC	2	8	20994	21001	0 %	50 %	25 %	25 %	257091528
40	NC_013193	CAGC	2	8	21742	21749	25 %	0 %	25 %	50 %	257091528
41	NC_013193	AGCC	2	8	21781	21788	25 %	0 %	25 %	50 %	257091528
42	NC_013193	GCGG	2	8	22531	22538	0 %	0 %	75 %	25 %	257091529
43	NC_013193	GTGC	2	8	22847	22854	0 %	25 %	50 %	25 %	257091529
44	NC_013193	CGGG	2	8	24621	24628	0 %	0 %	75 %	25 %	257091529
45	NC_013193	GGGC	2	8	25590	25597	0 %	0 %	75 %	25 %	257091530
46	NC_013193	CGGC	2	8	25619	25626	0 %	0 %	50 %	50 %	257091530
47	NC_013193	GGGC	2	8	25826	25833	0 %	0 %	75 %	25 %	257091530
48	NC_013193	GCCC	2	8	26398	26405	0 %	0 %	25 %	75 %	257091530
49	NC_013193	GGTC	2	8	26472	26479	0 %	25 %	50 %	25 %	257091530
50	NC_013193	GCCC	2	8	26843	26850	0 %	0 %	25 %	75 %	257091530
51	NC_013193	CAGC	2	8	26922	26929	25 %	0 %	25 %	50 %	257091530
52	NC_013193	GCCT	2	8	26936	26943	0 %	25 %	25 %	50 %	257091530
53	NC_013193	CGGC	2	8	26949	26956	0 %	0 %	50 %	50 %	257091530
54	NC_013193	CACG	2	8	28384	28391	25 %	0 %	25 %	50 %	257091532
55	NC_013193	GTCG	2	8	28412	28419	0 %	25 %	50 %	25 %	257091532
56	NC_013193	CGGT	2	8	29013	29020	0 %	25 %	50 %	25 %	257091532
57	NC_013193	GTCG	2	8	29111	29118	0 %	25 %	50 %	25 %	257091532
58	NC_013193	TGCG	2	8	29128	29135	0 %	25 %	50 %	25 %	257091532
59	NC_013193	AATG	2	8	29141	29148	50 %	25 %	25 %	0 %	257091532
60	NC_013193	GCGG	2	8	29774	29781	0 %	0 %	75 %	25 %	257091532
61	NC_013193	TCGC	2	8	30078	30085	0 %	25 %	25 %	50 %	257091532
62	NC_013193	CGCA	2	8	31379	31386	25 %	0 %	25 %	50 %	257091533
63	NC_013193	GAAG	2	8	31625	31632	50 %	0 %	50 %	0 %	257091533
64	NC_013193	GTCG	2	8	32175	32182	0 %	25 %	50 %	25 %	257091533
65	NC_013193	CCGG	2	8	32612	32619	0 %	0 %	50 %	50 %	257091534
66	NC_013193	GACG	2	8	32692	32699	25 %	0 %	50 %	25 %	257091534
67	NC_013193	CGCT	2	8	32756	32763	0 %	25 %	25 %	50 %	257091534
68	NC_013193	GAAC	2	8	32834	32841	50 %	0 %	25 %	25 %	257091534
69	NC_013193	CCGG	2	8	32855	32862	0 %	0 %	50 %	50 %	257091534
70	NC_013193	TCGA	2	8	34109	34116	25 %	25 %	25 %	25 %	257091535
71	NC_013193	ATCG	2	8	34614	34621	25 %	25 %	25 %	25 %	257091535
72	NC_013193	TCGC	2	8	35904	35911	0 %	25 %	25 %	50 %	257091535
73	NC_013193	CCAA	2	8	35934	35941	50 %	0 %	0 %	50 %	257091535
74	NC_013193	CTGG	2	8	36196	36203	0 %	25 %	50 %	25 %	257091535
75	NC_013193	TCGG	2	8	36706	36713	0 %	25 %	50 %	25 %	257091535
76	NC_013193	GGTC	2	8	38071	38078	0 %	25 %	50 %	25 %	257091536
77	NC_013193	AGAC	2	8	38107	38114	50 %	0 %	25 %	25 %	257091536
78	NC_013193	GGCA	2	8	38122	38129	25 %	0 %	50 %	25 %	257091536
79	NC_013193	CGGC	2	8	39108	39115	0 %	0 %	50 %	50 %	257091538
80	NC_013193	CGGC	2	8	39723	39730	0 %	0 %	50 %	50 %	257091538
81	NC_013193	GTGC	2	8	39900	39907	0 %	25 %	50 %	25 %	257091538
82	NC_013193	GAGC	2	8	41502	41509	25 %	0 %	50 %	25 %	257091542
83	NC_013193	AGGG	2	8	41906	41913	25 %	0 %	75 %	0 %	257091542
84	NC_013193	CTGG	2	8	42029	42036	0 %	25 %	50 %	25 %	257091543
85	NC_013193	GCGG	2	8	42422	42429	0 %	0 %	75 %	25 %	257091543
86	NC_013193	GCAC	2	8	42624	42631	25 %	0 %	25 %	50 %	257091543
87	NC_013193	GGCA	2	8	43445	43452	25 %	0 %	50 %	25 %	257091544
88	NC_013193	ACCG	2	8	44159	44166	25 %	0 %	25 %	50 %	257091545
89	NC_013193	CCAG	2	8	45163	45170	25 %	0 %	25 %	50 %	257091546
90	NC_013193	CGGC	2	8	45657	45664	0 %	0 %	50 %	50 %	257091546
91	NC_013193	TCCG	2	8	46769	46776	0 %	25 %	25 %	50 %	257091547
92	NC_013193	TCCT	2	8	46806	46813	0 %	50 %	0 %	50 %	257091547
93	NC_013193	GACA	2	8	46950	46957	50 %	0 %	25 %	25 %	257091547
94	NC_013193	CATC	2	8	47221	47228	25 %	25 %	0 %	50 %	257091547
95	NC_013193	CTTC	2	8	47928	47935	0 %	50 %	0 %	50 %	257091548
96	NC_013193	GAAC	2	8	47958	47965	50 %	0 %	25 %	25 %	257091548
97	NC_013193	CCAG	2	8	51078	51085	25 %	0 %	25 %	50 %	257091552
98	NC_013193	GGGC	2	8	51782	51789	0 %	0 %	75 %	25 %	257091552
99	NC_013193	GAAG	2	8	51819	51826	50 %	0 %	50 %	0 %	257091552
100	NC_013193	GCAG	2	8	52224	52231	25 %	0 %	50 %	25 %	257091553
101	NC_013193	AGCC	2	8	53278	53285	25 %	0 %	25 %	50 %	257091554
102	NC_013193	CCCG	2	8	54534	54541	0 %	0 %	25 %	75 %	257091555
103	NC_013193	GCCT	2	8	55079	55086	0 %	25 %	25 %	50 %	257091555
104	NC_013193	GGAT	2	8	55377	55384	25 %	25 %	50 %	0 %	257091556
105	NC_013193	CTTG	2	8	55884	55891	0 %	50 %	25 %	25 %	257091556
106	NC_013193	AGCT	2	8	55942	55949	25 %	25 %	25 %	25 %	257091556
107	NC_013193	AGCC	2	8	56572	56579	25 %	0 %	25 %	50 %	257091557
108	NC_013193	AGCG	2	8	56702	56709	25 %	0 %	50 %	25 %	257091557
109	NC_013193	GGGA	2	8	58044	58051	25 %	0 %	75 %	0 %	257091559
110	NC_013193	GCTG	2	8	58496	58503	0 %	25 %	50 %	25 %	257091559
111	NC_013193	GCCG	2	8	58538	58545	0 %	0 %	50 %	50 %	257091559
112	NC_013193	GAAA	2	8	58586	58593	75 %	0 %	25 %	0 %	257091559
113	NC_013193	GGCT	2	8	59976	59983	0 %	25 %	50 %	25 %	257091560
114	NC_013193	TTCT	2	8	60402	60409	0 %	75 %	0 %	25 %	257091560
115	NC_013193	CCGG	2	8	61078	61085	0 %	0 %	50 %	50 %	257091560
116	NC_013193	CGCC	2	8	61362	61369	0 %	0 %	25 %	75 %	257091560
117	NC_013193	GACC	2	8	61373	61380	25 %	0 %	25 %	50 %	257091560
118	NC_013193	CAAC	2	8	64251	64258	50 %	0 %	0 %	50 %	257091563
119	NC_013193	CGTT	2	8	64259	64266	0 %	50 %	25 %	25 %	257091563
120	NC_013193	GATC	2	8	64315	64322	25 %	25 %	25 %	25 %	257091563
121	NC_013193	GCGG	2	8	64390	64397	0 %	0 %	75 %	25 %	257091563
122	NC_013193	CGCT	2	8	66323	66330	0 %	25 %	25 %	50 %	257091565
123	NC_013193	ACCG	2	8	66367	66374	25 %	0 %	25 %	50 %	257091565
124	NC_013193	TCGC	2	8	66552	66559	0 %	25 %	25 %	50 %	257091565
125	NC_013193	ACCG	2	8	66622	66629	25 %	0 %	25 %	50 %	257091565
126	NC_013193	TTGC	2	8	66851	66858	0 %	50 %	25 %	25 %	257091565
127	NC_013193	TTCG	2	8	66901	66908	0 %	50 %	25 %	25 %	257091565
128	NC_013193	GACG	2	8	66971	66978	25 %	0 %	50 %	25 %	257091565
129	NC_013193	GTTT	2	8	68122	68129	0 %	75 %	25 %	0 %	257091566
130	NC_013193	TGCG	2	8	69270	69277	0 %	25 %	50 %	25 %	257091568
131	NC_013193	GCGT	2	8	69457	69464	0 %	25 %	50 %	25 %	257091568
132	NC_013193	GCCG	2	8	70257	70264	0 %	0 %	50 %	50 %	257091569
133	NC_013193	GGCC	2	8	70360	70367	0 %	0 %	50 %	50 %	257091569
134	NC_013193	GGAT	2	8	70481	70488	25 %	25 %	50 %	0 %	257091569
135	NC_013193	CCAG	2	8	70539	70546	25 %	0 %	25 %	50 %	257091569
136	NC_013193	CGCC	2	8	70839	70846	0 %	0 %	25 %	75 %	257091569
137	NC_013193	GCCA	2	8	71042	71049	25 %	0 %	25 %	50 %	257091569
138	NC_013193	CGGT	2	8	71150	71157	0 %	25 %	50 %	25 %	257091569
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.